DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制
9月28日，国际学术期刊《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting of DOGL4 and seed dormancy in Arabidopsis thaliana 的研究论文。该研究发现了拟南芥DNA去甲基化酶ROS1负调控DOGL4基因的印记和种子休眠的新机制。 基因印记是指父母本来源等位基因之间发生显著表达差异的一种表观遗传现象。在植物中，基因的印记表达主要出现在胚乳中。拟南芥中含有4个DNA去甲基化酶，其中DME特异在雌配子的中心细胞中表达，它通过去甲基化作用调控了胚乳的基因组印记。然而，其它更广泛表达的去甲基化酶是否参与了基因组印记的调控仍未知。此研究发现另一个DNA去甲基化酶ROS......阅读全文
DNA去甲基化酶催化作用介绍
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脱掉甲基化碱基的反应，等同于被损伤的DNA在糖苷酶及无碱基核酸酶酶切偶联催化下的修复反应。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是体内侯选去甲基化酶。此外，甲基化CpG结合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
DNA甲基化酶的分类
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
DNA去甲基化酶TET3调控I型干扰素表达新机制
7月14日，国际学术期刊《细胞-报告》（Cell Reports）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王红艳研究组的最新研究成果：TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。
阿片类药物与DNA去甲基化酶相互作用新机制被发现了
3月17日，中国科学院广州生物医药与健康研究院/广州再生医学与健康广东省实验室郑辉课题组在国际学术期刊Cell Reports 在线发表了题为Morphine and Naloxone Facilitate Neural Stem Cells Proliferation via a TET1-d
郑辉课题组揭示阿片类药物与DNA去甲基化酶相互作用机制
3月17日，中国科学院广州生物医药与健康研究院/广州再生医学与健康广东省实验室郑辉课题组在国际学术期刊Cell Reports 在线发表了题为Morphine and Naloxone Facilitate Neural Stem Cells Proliferation via a TET1-d
DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制
9月28日，国际学术期刊《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting
DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制
国际学术期刊《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting of DO
DNA甲基化酶的基本信息
大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶，即DNA甲基化酶，它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统（R-M系统）Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化，形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中，常用的甲基化酶属于Ⅱ型，它与相应的
DNA甲基化酶的基本信息
大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶，即DNA甲基化酶，它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统（R-M系统）Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化，形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中，常用的甲基化酶属于Ⅱ型，它与相应的
DNA甲基化酶的主要类型介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
DNA甲基化酶的主要类型介绍
DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中，主要特征
DNA甲基化酶的作用和种类
DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中，主要特征
DNA纯化去杂质实验
这周我们来讨论一项常用的技术，即使常用但仍引起部分人核酸分离焦虑症。那就是基因组DNA的纯化去杂质。场景是这样的：你有一份采自南太平洋中部一个偏僻小岛上首次发现的古老兰花品种根际土壤样品。你使用了非PowerSoil Kit法提取其中的微生物DNA。最终DNA含有太多杂质，无法PCR扩增。因此需要去
上生科院揭示DNA去甲基化酶TET3调控I型干扰素表达新机制
7月14日，国际学术期刊《细胞-报告》（Cell Reports）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王红艳研究组的最新研究成果：TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。
DNA甲基化酶的类型和作用介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息
中文名称Ⅱ型DNA甲基化酶英文名称type Ⅱ DNA methylase定 义编号：EC 2.1.1.37。三类甲基化酶之一，包括内切酶和甲基化酶两种成分，作用在识别位点(回文结构)内或其附近，反应不需要ATP；而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的双功能酶，在距不对称的识别序列较远处使DNA甲基化，又能
Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息
中文名称Ⅱ型DNA甲基化酶英文名称type Ⅱ DNA methylase定 义编号：EC 2.1.1.37。三类甲基化酶之一，包括内切酶和甲基化酶两种成分，作用在识别位点(回文结构)内或其附近，反应不需要ATP；而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的双功能酶，在距不对称的识别序列较远处使DNA甲基化，又能
中国农大JBC解析RNA去甲基化酶晶体结构
2014年3月10日，在百年老牌杂志《生物化学杂志》（Journal of Biological Chemistry）发表的一项最新研究中，中国农业大学、清华大学和多伦多大学的研究人员，报道了RNA去甲基化酶Alkbh5催化核心的5个高分辨率晶体结构。该研究的通讯作者为中国农业大学的陈忠周教
科学家揭示去甲基化酶在肿瘤中的致病机理
11月21日，肿瘤学研究领域的国际权威杂志《癌症研究》在线发表了武汉大学李枫教授团队和中国科学院北京基因组所吕雪梅研究员最新合作研究成果。该研究以“KDM4B通过激活LINE-1促进DNA损伤”为题，解析了组蛋白去甲基化酶（KDM4B）在肿瘤中所扮演的新角色，从全新角度揭示了KDM4B在肿瘤细
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular
Oncogene：组蛋白去甲基化酶如何影响癌症相关的糖酵解
糖酵解途径（glycolysis）是肿瘤细胞中重要的能量来源途径，然而，目前对于这条代谢相关途径的调控方式的了解，还十分有限。来自厦门大学生命科学学院，南京大学等处的研究人员发现JMJD1A作为一个组蛋白去甲基化酶，它能够影响膀胱肿瘤细胞糖代谢途径关键酶的启动子上组蛋白甲基化修饰水平，从而影响酶
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
文章导读 表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
DNA的去甲基化过程
DNA的去甲基化由基因内部的片段及与其结合的因子所调控。有两种假说可以解释DNA去甲基化的分子机制。一种假说与DNA半保留复制联系在一起，为被动去甲基化。如果甲基化的DNA经半保留复制后不被甲基化，其DNA则处于半甲基化状态，半甲基化的DNA如再次发生DNA半保留复制，而DNA甲基化活性仍被抑制，则
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（一）
文章导读表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制
研究揭示酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制 11月10日，Biochemical Journal在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所丁建平组关于酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制的研究成果。 人和酵母等真核生物中存在一类含有
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（三）
总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法，研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性，改善了体内肿 瘤生长，而ALK
我科学家发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理
陈德桂研究组发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理 继4个月前生化与细胞所陈德桂研究组与景乃禾研究组合作发表一个新的组蛋白去甲基化酶KIAA1718(KDM7A)的发现及其在胚胎干细胞神经分化过程中的功能，及两周前陈德桂研究组与基因敲除与转基因小鼠平台合作发表另一个新的组蛋白去
研究揭示拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ13的结构功能
3月21日，《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组和河北师范大学孙大业研究组合作完成的题为The Arabidopsis H3
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（二）
4.ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移将过表达ALKBH5的ai细胞移植到裸鼠体内，发现过表达ALKBH5的ai细胞生成的肿 瘤体积明显小于对照组，并且细胞生长的指示分子Ki-67的表达也明显降低。染色显示过表达ALKBH5的组织中侵袭和转移的指示分子MMP-2和MMP-9表达降低，敲
质粒DNA的去磷酸化实验
去除 5' 端的磷酸基可防止质粒 DNA 的自身连接和环化。在体外连接反应中，DNA 连接酶可在邻近的两个分子间形成磷酸二酯键。但只有当一个分子的 5' 端带有磷酸基另一分子的 3' 端带有羟基时，这一反应才能完成。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理