去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制
研究揭示酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制 11月10日,Biochemical Journal在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所丁建平组关于酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制的研究成果。 人和酵母等真核生物中存在一类含有JmjC结构域的蛋白家族,研究表明它们中的许多成员具有组蛋白去甲基化酶活性,并且都利用Fe2+和α-酮戊二酸为辅因子。人源JMJD2A可以特异性的去甲基化H3K36me3/2和H3K9me3/2。Rph1是人源JMJD2A在酿酒酵母中的同源物,可以特异性的去甲基化H3K36me3/2,这种活性在某些转录激活基因的转录延伸过程中发挥重要的促进作用。 丁建平组的博士生常媛媛等人解析了Rph1催化核心区域的结构,以及与Ni2+和α-酮戊二酸的复合物的结构。其中,Ni2+用来模拟Fe2+的结合形式。Rph1的催化核心区域具有与全长蛋白一......阅读全文
去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制
研究揭示酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制 11月10日,Biochemical Journal在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所丁建平组关于酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制的研究成果。 人和酵母等真核生物中存在一类含有
科学家揭示相关组蛋白甲基化活性的串扰调控机制
上海交通大学医学院附属第九人民医院上海精准医学研究院黄晶课题组首次揭示了染色质的核小体结构对组蛋白修饰酶MLL(Mixed Lineage Leukemia)复合物的酶活调控及其分子机制,阐明了组蛋白H2B第120位赖氨酸(H2BK120)的单泛素化修饰对MLL甲基化活性的串扰调控机制,并发
组蛋白的简介
组蛋白(histone)是指所有真核生物的细胞核中,与DNA结合存在的碱性蛋白质的总称。其分子量约10000~20000。 真核生物体细胞染色质中的碱性蛋白质,含精氨酸和赖氨酸等碱性氨基酸特别多,二者加起来约为所有氨基酸残基的1/4。组蛋白与带负电荷的双螺旋DNA结合成DNA-组蛋白复合物。因
Oncogene:组蛋白去甲基化酶如何影响癌症相关的糖酵解
糖酵解途径(glycolysis)是肿瘤细胞中重要的能量来源途径,然而,目前对于这条代谢相关途径的调控方式的了解,还十分有限。来自厦门大学生命科学学院,南京大学等处的研究人员发现JMJD1A作为一个组蛋白去甲基化酶,它能够影响膀胱肿瘤细胞糖代谢途径关键酶的启动子上组蛋白甲基化修饰水平,从而影响酶
组蛋白甲基化修饰研究再获突破
日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。 组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是
关于组蛋白的内容简介
组蛋白(histone)是指所有真核生物的细胞核中,与DNA结合存在的碱性蛋白质的总称。其分子量约10000~20000Kda。 真核生物体细胞染色质中的碱性蛋白质,含精氨酸和赖氨酸等碱性氨基酸特别多,二者加起来约为所有氨基酸残基的1/4。组蛋白与带负电荷的双螺旋DNA结合成DNA-组蛋白复合
组蛋白的相关信息介绍
组蛋白(histone)是指所有真核生物的细胞核中,与DNA结合存在的碱性蛋白质的总称。其分子量约10000~20000Kda。 真核生物体细胞染色质中的碱性蛋白质,含精氨酸和赖氨酸等碱性氨基酸特别多,二者加起来约为所有氨基酸残基的1/4。组蛋白与带负电荷的双螺旋DNA结合成DNA-组蛋白复合
HDAC组蛋白去乙酰化酶活性测定及药物筛选方案
组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)是一类蛋白酶,对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用。一般情况下,组蛋白的乙酰化有利于DNA与组蛋白八聚体的解离,核小体结构松弛,从而使各种转录因子和协同转录因子能与DNA结合位点特异性结合,激活基因的转录。在细胞核内
HDAC组蛋白去乙酰化酶活性测定及药物筛选方案
选方案组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)是一类蛋白酶,对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用。一般情况下,组蛋白的乙酰化有利于DNA与组蛋白八聚体的解离,核小体结构松弛,从而使各种转录因子和协同转录因子能与DNA结合位点特异性结合,激活基因的转录。在细胞核
简述组蛋白修饰种类、位点及其意义
1、种类:染色质的共价修饰主要是组蛋白的修饰。2、组成核小体的组蛋白八聚体的组蛋白H3和H4是蛋白酶修饰的主要位点。3、意义:Mi22NHRD由核心(HDAC1、HDAC2、RBAP46öRBAP48)+Mi2、MTA1öMTA2、MBD3组成,其中MBD3含有MBD样序列,与甲基化DNA有低亲和力
我科学家发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理
陈德桂研究组发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理 继4个月前生化与细胞所陈德桂研究组与景乃禾研究组合作发表一个新的组蛋白去甲基化酶KIAA1718(KDM7A)的发现及其在胚胎干细胞神经分化过程中的功能,及两周前陈德桂研究组与基因敲除与转基因小鼠平台合作发表另一个新的组蛋白去
研究揭示拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ13的结构功能
3月21日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组和河北师范大学孙大业研究组合作完成的题为The Arabidopsis H3
组蛋白脱乙酰酶
中文名称组蛋白脱乙酰酶英文名称histone deacetylase定 义从组蛋白上水解N-乙酰基,抑制转录的酰胺水解酶。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
遗传发育所发现植物组蛋白去甲基化酶招募的新机制
核小体作为真核生物染色质的基本单位,由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白N端存在多种共价修饰,这些翻译后修饰通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态,在动植物细胞命运决定以及发育中起着重要的调控作用。实验室前期研究
PLoS-Genet:何新建等模式植物拟南芥研究获进展
2014年1月22日,北京生命科学研究所何新建实验室在《PLOS Genetics》杂志在线发表题为“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—
Science新文章解析癌症表观遗传
目前大多数癌症治疗的效果并不理想。在力图根除肿瘤之时,肿瘤学家们往往借助于放疗或化疗,这使得在遏制癌性生长的同时也导致了健康组织受损。来自洛克菲勒大学C. David Allis实验室的一项新研究,或许可以使科学家们朝着高精确度靶向肿瘤的癌症治疗更近一步。他们的研究结果在线发表在3月2
简化ChIP分析的新方法
最近,美国普渡大学的研究人员开发出一种方法,称为ZipChip,可大大降低ChIP分析的时间和成本,同时还能提高灵敏度。 染色质免疫沉淀(ChIP)研究,对于染色质相关蛋白和组蛋白修饰在基因组中的定位,提供了深入的见解。然而,标准的ChIP方法耗时、昂贵、费力,由于涉及大量的步骤,易受实验误差
我国揭示KDM5亚家族组蛋白去甲基化酶的底物识别机制
12月12日,中国科学院植物逆境生物学研究中心杜嘉木课题组,中科院院士、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风课题组合作完成的论文,以Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substr
朱冰研究组继Science后再发PNAS文章
北京生命科学研究所朱冰实验室今年8月在Science杂志上发表了题为“Dense Chromatin Activates Polycomb Repressive Complex 2 to Regulate H3 Lysine 27 Methylation”的研究论文,发现组蛋白甲基化酶P
组蛋白乙酰转移酶
组蛋白乙酰转移酶根据底物性质的不同可以分为两个家族, GNAT 家族(GCN5-related nacetyltrans-ferases family) 和 MYST(MOZ、Ybf2/Sas3、Sas2 和Tip60)家族 。虽然二者都含有乙酰辅酶 A 同源序列, 但是其核心区域存在差异。在功能上
NIBS朱冰实验室JBC报道表观遗传新发现
2013年9月10日,北京生命科学研究所的朱冰实验室在The Journal of Biological Chemistry杂志上在线发表题为《Histone H2A ubiquitination inhibits the enzymatic activity of H3 Lysine
酶活性定义
酶活性指的是有机体的生命活动表现了它内部化学反应历程的有序性,这种有序性是受多方面因素调节的,一旦破坏了这种有序性,就会导致代谢紊乱,产生疾病,甚至死亡。酶活力受到调节和控制是区别于一般催化剂的重要特征。
酶活性单位
1.酶活性单位 20世纪50年代以前通常用惯用单位,即用先报道某种酶测定方法的临床酶学家的姓氏来命名其单位。例如,测定AMY的Somogyi单位,转氨酶的赖氏单位(Reitman-Frankel)等。不仅酶不同,单位不同,即使是同一种酶也因方法不同而可有数种活性单位,参考值差别也很大,给临床
研究人员使用双药夹击力敌儿童脑癌
弥漫性中线胶质瘤(DMG)是一种致命的儿童实体瘤,每年都有数百名儿童深受其害。但是,近50年来相关研究进展寥寥,患者多只能依赖于放疗缓解症状,然而绝大多数儿童皆在诊断后一年内死亡,治疗效果差强人意,早日寻得有效的靶向药已成为当务之急。 近日,美国斯坦福大学的研究人员将组蛋白去乙酰化酶(HDAC
组蛋白的合成修饰的相关介绍
这是形成组蛋白各组分微不均一性的主要原因。修饰的方式有: ①乙酰化。有两种: 一种是H1、H2A、H4组蛋白的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰丝氨酸,组蛋白在细胞质内合成后输入细胞核之前发生这一修饰。 另一种是在H2A、H2B、H3、H4的氨基末端区域的某些专一位置形成N6-乙酰赖氨酸。 ②
生物物理所等揭示组蛋白乙酰转移酶活性调节的新机制
8月9日,中国科学院生物物理研究所许瑞明课题组与美国哥伦比亚大学张志国课题组合作完成的研究论文,以Multisite substrate recognition in Asf1-dependent acetylation of histone H3K56 by Rtt109为题,发表在Cell上
支架蛋白BRPF2如何调控组蛋白乙酰转移酶HBO1的活性?
2月24日,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)丁建平研究组的最新研究成果:Structural and mechanistic insights into regulation of H
复旦大学发表Nature表观遗传学新文章
来自复旦大学、中国科学院等机构的研究人员在新研究中揭示出了,从头甲基化转移酶DNMT3A自抑制以及组蛋白H3诱导DNMT3A激活的机制。研究结果发表在11月10日的《自然》(Nature)杂志上。 领导这一研究的是复旦大学上海医学院,生科院的徐彦辉(Yanhui Xu)教授,其早年毕业于清华大
染色质,解锁癌症表观遗传学的钥匙
表观遗传学指基因序列不变化的前提下,基因表达发生了可遗传的变化,包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色质改型调控基因表达的过程,涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。 众多研究已经证明,染色体畸变和染色质异