中科院青岛生物能源所发布单细胞拉曼分选测序耦合系统

2018年10月20日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会,发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合(RACS-SEQ)系统。 RACS-SEQ系统通过拉曼组(Ramanome)分析原理、拉曼光镊液滴单细胞分选(RAGE)、流式微液滴单细胞拉曼分选(RADS)等关键器件的创新,在单细胞水平实现了非标记式拉曼表型识别与功能分选,为功能单细胞研究提供拉曼表型组与基因组的整体解决方案,以免标多维的表型组识别、精准简捷的单细胞获取,以及高效低噪的核酸扩增等为系统的三大创新特色,具有单细胞拉曼成像、单细胞表型组识别、单细胞功能分选,以及单细胞测序文库制备等四大功能。 RACS-SEQ搭载了智能信息系统,自动化采集软件(RamLIS)可快速、准确地获取单个细胞内部所有化合物的拉曼光谱信息,一站式分析软件(RamEX)可进行在线式数据处理与挖掘,通过结合多层次/易扩展的多维......阅读全文

青岛能源所发布首台单细胞拉曼分选及测序耦合系统

  10月20日,在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会上,中国科学院青岛生物能源与过程研究所发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合系统(RACS-SEQ)。该系统无需标记即可获知细胞种系发生、生理状态及所处的微环境变化等关键表型,并在单细胞水平精度对接表型组与基因组。  RACS-

中科院青岛生物能源所发布单细胞拉曼分选测序耦合系统

  2018年10月20日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会,发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合(RACS-SEQ)系统。  RACS-SEQ系统通过拉曼组(Ramanome)分析原理、拉曼光镊液滴单细胞分选(RAGE)、流式微液

青岛能源所单细胞拉曼流式分选技术研究获进展

  日前,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心在基于微流控的单细胞拉曼流式分选技术研究中取得新进展,相关成果于2月5日在线发表在Analytical Chemistry (Zhang PR, et al, Anal Chem, 2015)。  单细胞拉曼分选(RACS)是一种极具潜力的活

Science-Advances:我国科研人员研发高通量流式拉曼分选仪

  单细胞拉曼光谱(SCRS)能非标记、非侵入性、无损、全景式地揭示细胞代谢状态,因此基于拉曼光谱的单细胞分选(Raman-Activated Cell Sorting,RACS),在单细胞研究中有广阔的应用前景(Biotechnol Adv,2019)。但是,拉曼谱图采集时间长、分选通量低等问题,

青岛能源所发明拉曼激活单细胞液滴分选技术

  单个细胞是地球上细胞生命体功能和进化的基本单元。单细胞精度的高通量功能分选是解析生命体系异质性机制、探索自然界微生物暗物质的重要工具。单细胞拉曼光谱(SCRS)能够在无标记、无损的前提下揭示细胞固有的化学组成,因此拉曼激活细胞分选技术(RACS)日益受到关注。但分选通量是当前限制其广泛应用的瓶颈

口腔根管冲洗液抑菌效能评价新技术问世

 基于重水饲喂单细胞拉曼的CAST-R为消毒与抑菌产品的效能评价提供了新方法  青岛能源所供图 “牙疼不是病,疼起来真要命”。日常生活中,牙髓及根尖周组织内的微生物感染可引起系列口腔疾病,如牙髓炎、根尖牙周炎甚至持续炎症反应,而口腔根管治疗其中常见的一种治疗方法。在口腔根管治疗过程中,根管

“拉曼组内关联分析”揭示代谢物转化网络

  细胞内代谢物之间是否正在发生相互转化,是细胞代谢活动最重要的动态特征之一,但其检测方法繁琐。为此,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心提出名为“拉曼组内关联分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis; IRCA)的理论框架与算法,并示范了细胞工厂功能测

青岛能源所开发单细胞表型筛选液滴打印平台

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516569.shtm随着基因组合成与编辑技术的迅猛发展,基于液滴的单细胞表型筛选的意义显得尤为重要。然而,如何精准、高通量地将目标单液滴分配到特定的宏观介质中,进而完成下游多组学分析,仍然是一个技术挑战。

自动化拉曼病原药敏快检新系统研发问世

 自动化CAST-R系统服务临床精准抗感染治疗   单细胞中心供图多重耐药菌(MDR)和其耐药性的传播已成为全球公共卫生问题,MDR引起的血流感染往往病情较重,快速完成药敏检测并采取有针对性的治疗措施,对于降低患者的死亡率至关重要。但是,目前病原药敏试验耗时很长,导致临床医生主要依赖经验进行治疗。开

《分析化学》:基于拉曼组的肿瘤单细胞药敏检测新方法

   肿瘤药敏性检测方法学是抗癌药物评价和筛选的前提,也是临床化疗方案设计的基础。青岛能源所单细胞中心开发了基于拉曼组的肿瘤单细胞药敏检测新方法D2O-CANST-R,具有快速、低成本、单细胞器精度、识别耐药细胞、体现抗癌机制、可对接单细胞分选和测序等特色,为癌细胞-药物互作研究、抗癌药物筛选等提供

全球每年约1500万人死于感染!微生物耐药有多可怕?

  2015年11月,世界卫生组织(WHO)开展了第一届的世界提高抗生素认识周(World Antibiotics Awareness Week)。此后,每年11月,世卫组织皆举办了该项活动。2020年,该活动更名为世界提高抗微生物药物认识周(World Antimicrobial Awarenes

全球每年约1500万人死于感染!微生物耐药有多可怕?

  2015年11月,世界卫生组织(WHO)开展了第一届的世界提高抗生素认识周(World Antibiotics Awareness Week)。此后,每年11月,世卫组织皆举办了该项活动。2020年,该活动更名为世界提高抗微生物药物认识周(World Antimicrobial Awarenes

拉曼介导靶向单细胞基因组原创技术研发成功

  单细胞精度的海洋微生物组功能靶向性拉曼分选与测序技术(scRACS-Seq)  刘阳供图  海洋是地球上最大的活跃碳库,海洋微生物在全球碳循环中起着至关重要的作用,然而由于大部分海洋微生物尚难以培养、原位代谢功能难以测量等技术瓶颈,业界对于海洋微生物光合固碳的原位功能机制等重要问题,仍然存在争议

拉曼介导靶向单细胞基因组原创技术研发成功

   单细胞精度的海洋微生物组功能靶向性拉曼分选与测序技术(scRACS-Seq)  刘阳供图   海洋是地球上最大的活跃碳库,海洋微生物在全球碳循环中起着至关重要的作用,然而由于大部分海洋微生物尚难以培养、原位代谢功能难以测量等技术瓶颈,业界对于海洋微生物光合固碳的原位功能机制等重要

青岛能源所发布首台“临床单细胞拉曼耐药性快检仪”样机

  抗生素的滥用导致了细菌耐药性蔓延这一“世纪危机”。为了推动全社会合理使用抗生素,世界卫生组织(WHO)自2015年以来将每年11月的第三周确定为“世界提高抗生素认识周(World Antibiotic Awareness Week, WAAW)”。在2018年WAAW来临之际,中国科学院青岛生物

首创拉曼云平台!轻松分析复杂数据!

成千上万条拉曼光谱数据,到底蕴含了哪些生物学意义?代码不熟、理论知识不足、终端算力不够,也想轻松徜徉拉曼数据瀚海?人工智能时代,一切皆有可能!在刚刚落幕的2024中国生命科学大会上,青岛星赛生物科技有限公司(以下简称“星赛生物”)正式发布了一站式拉曼组智能云专家系统——拉曼智云(RamanAI;ww

科学家发明光镊辅助静态池成像分选技术

OPSI技术服务单细胞多组学研究   课题组供图 单细胞多组学技术已成为生命科学的有力工具,但一个精准、低损伤、广谱适用、简捷的目标表型单细胞获取手段,是靶向性单细胞基因组、转录组、蛋白质组或代谢物组分析的先决条件。 近日,中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了光镊辅助静态池成

微观世界的追光者

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503168.shtm仰望夜空,闪闪的星辰让人心驰神往,在生命科学领域,瀚如星海的细胞世界更是科学家们孜孜不倦的追求。中国科学院青岛生物能源与过程研究所研究员、单细胞中心主任徐健便是万千“追星”科学家中的一

青岛能源所单细胞功能分选技术取得新进展

  现有基于荧光染色的活体单细胞分选技术(Fluorescence-Activated Cell Sorting; FACS)一般需要外加荧光标记,在单位时间只能获得个别分子所代表的表型,且通常难以直接进行“原位”观测。而基于拉曼显微光谱技术的单细胞分选方法无需外加标记,可无损获得整个单细胞的化

青岛能源所基于pDEPRADS推出首台高通量流式拉曼分选仪

  单个细胞是生命活动的基本单元,也是生物进化的基本单位。因此单细胞技术正在推动生命起源、细胞功能异质性机制、生命暗物质挖掘与利用等领域的一系列重大突破。单细胞拉曼光谱(SCRS)能非标记、非侵入性、无损、全景式地揭示细胞代谢状态,因此基于拉曼光谱的单细胞分选(Raman-Activated Cel

首台自主研制的单细胞拉曼药敏快检仪推进更多临床实践

  在第五个世界提高抗生素认识周之际,国产先进体外诊断产品生物医学创新平台——单细胞拉曼创新技术研讨会在广州举行。此次会议由南方医科大学检验医学部和中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心共同发起,中科院科技服务网络计划(STS)和基金委国家重大科研仪器研制项目提供支持。来自南方医科大学、中山大

“所见即所得”,单细胞分选有了新技术

  单细胞多组学技术已成为生命科学的有力工具,但一个精准、低损伤、广谱适用、简捷的目标表型单细胞获取手段,是靶向性单细胞基因组、转录组、蛋白质组或代谢物组分析的先决条件。近日,青岛能源所单细胞中心发明了光镊辅助静态池成像分选技术(OPSI),能“所见即所得”、保持细胞原位活性、高通量地分选明场、荧光

基于可寻址动态液滴阵列的单细胞测序技术发布

  单细胞基因组测序是生命科学与生物技术的共性使能技术之一,但其推广应用面临诸多瓶颈。一方面,单个细胞的核酸含量低,为满足测序所需核酸量通常须大幅增加扩增循环数,这将极度放大基因组DNA扩增的偏好性,从而大幅度降低单细胞全基因组覆盖率;同时,单细胞的分离获取、裂解、扩增等过程通常十分繁琐,其操作困难

青岛能源所发明简易高效的单细胞分选与测序对接技术

  为了满足考察自然界中细胞“原位功能”这一共性科学需求,“现场”、“实时”的单细胞分选与测序已成为生命科学装备研制领域的一个重要发展趋势。尽管第三代测序技术已实现仪器微型化,但与测序对接的单细胞精准分选装备却仍然相当笨重和昂贵,难以支撑各种科学考察中针对微生物组功能的现场分析。最近,中国科学院青岛

青岛能源所研制出活体单细胞淀粉含量检测方法

  近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心助理研究员籍月彤、硕士研究生何曰辉等利用该中心研制的活体单细胞拉曼分选仪原型机,通过单细胞拉曼光谱的快速采集和分析,发明了一种快速、非侵入性、不需标记、以单个活体细胞为单位的淀粉定量检测方法,为富含淀粉的种质资源选育提供了一种崭新手段。  据

探讨应用前景-单细胞拉曼创新技术研讨会在广州举办

  11月15日,由南方医科大学检验医学部、中国科学院青岛生物能源与过程研究所共同发起的单细胞拉曼创新技术研讨会在广州举办。  会议研讨了单细胞拉曼技术在临床医学检验、微生态、肿瘤细胞等领域的应用前景。南方医科大学江医院检验医学部主任周宏伟表示,耐药性的广泛传播与滥用抗生素密不可分,快速检测病原菌药

益生菌单细胞质检新技术助力产业发展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502913.shtm近日,记者从中国科学院青岛生物能源与过程研究所获悉,该所单细胞中心联合中国食品发酵工业研究院等单位,开发出了基于拉曼组原理的益生菌单细胞质检技术SCIVVS,为益生菌质检提供了全新的解

国内外首套高通量检测、分选单细胞拉曼系统在我国问世

  3月26日,由中国科学院科技服务网络计划(STS计划)项目支持、中科院青岛生物能源与过程研究所、北京生命科学研究院、天津工业生物技术研究所、微生物研究所共同承担的“生物高通量检测分析服务网络”项目结题验收。  经过两年的实施,该项目研制出了单细胞拉曼分选仪工程化样机(RACS-Mini),开发了

“生物高通量检测分析服务网络”项目通过验收

  3月26日,由中国科学院科技服务网络计划(STS计划)项目支持,中科院青岛生物能源与过程研究所、北京生命科学研究院、天津工业生物技术研究所、微生物研究所共同承担的“生物高通量检测分析服务网络”项目结题验收。  经过5年的实施,该项目研制出了单细胞拉曼分选仪工程化样机(RACS-Mini),开发了

生物高通量检测分析服务网络

  近日,由中国科学院科技服务网络计划(STS计划)项目支持,中科院青岛生物能源与过程研究所、北京生命科学研究院、天津工业生物技术研究所、微生物研究所共同承担的“生物高通量检测分析服务网络”项目结题验收。   经过5年的实施,该项目研制出了单细胞拉曼分选仪工程化样机(RACS-Mini),开发了单