中科院青岛生物能源所发布单细胞拉曼分选测序耦合系统
2018年10月20日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会，发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合（RACS-SEQ）系统。 RACS-SEQ系统通过拉曼组（Ramanome）分析原理、拉曼光镊液滴单细胞分选（RAGE）、流式微液滴单细胞拉曼分选（RADS）等关键器件的创新，在单细胞水平实现了非标记式拉曼表型识别与功能分选，为功能单细胞研究提供拉曼表型组与基因组的整体解决方案，以免标多维的表型组识别、精准简捷的单细胞获取，以及高效低噪的核酸扩增等为系统的三大创新特色，具有单细胞拉曼成像、单细胞表型组识别、单细胞功能分选，以及单细胞测序文库制备等四大功能。 RACS-SEQ搭载了智能信息系统，自动化采集软件（RamLIS）可快速、准确地获取单个细胞内部所有化合物的拉曼光谱信息，一站式分析软件（RamEX）可进行在线式数据处理与挖掘，通过结合多层次/易扩展的多维......阅读全文
基于拉曼组与机器学习的微藻种质挖掘新技术
微藻是地球上代谢功能较为多样化的生物类群，在全球碳循环中发挥关键作用，也是生物技术产业中重要的一类光合细胞工厂。但微藻的种质鉴定和代谢功能检测繁琐，且自然界大部分微藻难以培养。近日，中国科学院青岛能源研究所单细胞中心发表了首个微藻拉曼组数据库，并结合机器学习示范了单细胞精度、快速的微藻种类鉴定和
能源所发明简易高效的单细胞分选与测序对接技术
为了满足考察自然界中细胞“原位功能”这一共性科学需求，“现场”、“实时”的单细胞分选与测序已成为生命科学装备研制领域的一个重要发展趋势。尽管第三代测序技术已实现仪器微型化，但与测序对接的单细胞精准分选装备却仍然相当笨重和昂贵，难以支撑各种科学考察中针对微生物组功能的现场分析。最近，中国科学院青岛
iMicroCare从最“小”处呵护人体健康
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/482237.shtm 世界广袤，除了目之所及的山山水水、鱼虫花鸟，指缝间、鼻息处、每一寸肌肤、每一丝空气中，都存在万万千千的微生物。它们穿越数亿年时光，静静地生活，却深刻影响、改变、甚至塑造着我们的世
我国首台活体单细胞拉曼分选仪成功问世
我国首台活体单细胞拉曼分选仪成功问世 将广泛应用于生物技术、食品检测和药物研究等 近日，中科院青岛生物能源与过程研究所功能基因组团队与北京惟馨雨生物科技公司联合承担的科技部创新方法工作专项——“拉曼光钳筛选新方法在活体单细胞高通量分离中的应用”通过了评审验收，这标志着全球首台活体单细胞拉曼分选仪
益生菌单细胞技术联盟正式成立
近日，在2023中国肠道产业大会上，由中国科学院青岛生物能源与过程研究所（以下简称青岛能源所）牵头发起的益生菌单细胞技术联盟正式成立。益生菌单细胞技术联盟启动仪式 青岛能源所供图目前，市场上有大量的益生菌品牌和产品，但质量参差不齐，给消费者带来了极大的困扰，也阻碍了产业的健康发展。产生这一问题的根
他们的研究与所有人的健康相关，你却容易忽略！
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510694.shtm文 | 廖洋 刘阳秋高气爽，玉露生凉。刚刚度过了炎炎夏日，你有没有衣物发霉的困扰？明明是洗干净的衣服，为什么还是会发霉、发臭呢？近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所（以下简称“青
临床单细胞拉曼耐药性快检仪面世－全流程3小时内完成
抗生素的滥用导致了细菌耐药性蔓延这一“世纪危机”。为了推动全社会合理使用抗生素，世界卫生组织（WHO）自2015年以来将每年11月的第三周确定为“世界提高抗生素认识周（World Antibiotic Awareness Week, WAAW）”。在2018年WAAW来临之际，青岛能源所发布了自
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月，Namocell与CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞，并且将其进行单细胞测序，为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序（scRNA-s
青岛能源所建立工业产油微藻基因组编辑技术
自然界的一些真核微藻能够通过光合作用固定二氧化碳，并将其转化和存储为油脂。因此，作为一种潜在可规模化的清洁能源生产和固碳减排方案，微藻能源近年来受到了广泛关注。然而，高效遗传工具的匮乏，极大限制了工业产油微藻的机制研究和分子育种。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心以微拟球藻为
青岛能源所开发新技术助力工业菌株快速筛选
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498816.shtm近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所（以下简称“青岛能源所”）单细胞中心开发一种低成本、非标记的微型液滴微流控平台，可通过单细胞微液滴培养、液滴自荧光检测、目标微液滴自动分选等步骤
单细胞拉曼光谱发力－土壤解磷微生物获进展
磷作为促进植物生长的三大元素之一，对植物的根、花、果实都有益处，它能使树木生长良好发育，同时还能提高植物抗寒、抗旱的能力。合理施用磷肥，可增加作物产量，改善作物品质，因此磷是农作物养殖中要重点添加的养分。但是随着磷肥的大量施用，土壤中积累了很多固定态磷，大大降低了磷素的生物有效性。这不仅造成了磷肥的
基于拉曼组的单细胞快检技术可同时定量检测
通过光合作用固定的二氧化碳与太阳能在生物体内有三种主要的存储形式：多糖、油脂和蛋白质，共同构成了生物碳存储与生物能源产业的物质基础。目前，对细胞中这三类高含能储碳分子的识别、表征和定量极为繁琐，通常难以在单个细胞精度测量，这限制了光合固碳细胞工厂的筛选与改造效率。中国科学院青岛生物能源与过程研究
拉曼组有望成为普适性的新一代细胞功能测试仪器平台
通过光合作用固定的二氧化碳与太阳能在生物体内有三种主要的存储形式：多糖、油脂和蛋白质，共同构成了生物碳存储与生物能源产业的物质基础。目前，对细胞中这三类高含能储碳分子的识别、表征和定量极为繁琐，通常难以在单个细胞精度测量，这限制了光合固碳细胞工厂的筛选与改造效率。中国科学院青岛生物能源与过程研究
中德藻类生物能源实验室在青岛市启动
记者从青岛市科技局获悉，日前，德国波鸿鲁尔大学光生物技术团队、生物信息团队与中科院青岛生物能源所单细胞中心团队签署了合作协议，共同启动了由德国联邦政府资助、首期五年的“中德藻类生物能源联合实验室”。 实验室将充分发挥德方在莱茵衣藻光合作用、蛋白质组学、细胞图像处理等方面的专长，以及中方
科学家开发出物种代谢双靶向的微生物细胞及酶资源挖掘新技术
微生物及其合成的各种酶支撑着生物圈中较多关键的生态过程。在环境中高效识别与挖掘具有特定原位代谢功能的细胞和酶是微生物组科学与产业的热点。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所联合自然资源部第一海洋研究所、山东大学等，开发了荧光原位杂交介导的拉曼激活单细胞分选与测序（FISH-scRACS-seq）
单细胞分离对单细胞测序领域的作用
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来，然后移到合适的培养基进行培养，分离法对操作技术有比较高的要求，多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞，还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选，对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞至
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
Nature：单细胞测序（下）
随着技术的飞速发展，成本大大降低，使得基因组测序成为常规技术。然而，大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序，它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。 该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序，研究小
什么是单细胞测序？
单细胞测序是一种能够在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行分析的技术。通过单细胞测序，可以：揭示细胞的异质性：了解即使是看似相同的细胞群体中，每个细胞在基因表达、染色质可及性等方面的独特特征。发现新的细胞类型和状态：识别出传统方法难以区分的稀有细胞类型以及细胞在不同生理或病理条件下的特殊
单细胞测序方法介绍
单细胞RNA测序（scRNA-seq）作为一种全基因组测序的方式，在单细胞层面广泛用于确定细胞类型和细胞变异的鉴定。Namocell单细胞分离仪可以通过细胞标记CD27以及一种细胞活性的染料，来分选出单个活的B细胞。通过分析分离后的单细胞基因表达情况，对比静息记忆B细胞，可以从单细胞层面研究基因表达
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。
单细胞测序方法汇总
单细胞生物学研究一直是当今的热门话题，而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了（scRNA-seq）。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序，并给出平均差异，但并没有两个细胞是完全一样的，而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变，甚至这种技术还能够阐明完整
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
Nature：单细胞测序（上）
Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年，冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织，一并将这些DNA进行测序，生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序
拉曼技术立功！我国自主抗生素耐药性快检设备问世！
日前，中国科学院青岛生物能源所发布了自主研发的国际首台套“临床单细胞拉曼耐药性快检仪”。该设备可以在3小时内快速检验抗生素耐药性，耗时仅为传统方法的八分之一左右。 临床上，抗生素的合理使用是遏制耐药性蔓延的前提与关键。但长期以来，由于无法摆脱病菌的培养与纯化过程，传统病原菌耐药性检测方法需要2
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别：空间信息获取传统单细胞测序：通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序：能够在测定单细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序：难以直观地揭示基于
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别：空间信息获取普通单细胞测序技术：通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术：能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术：难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作
青岛能源所等开发微生物组内部代谢互作示踪新技术
微生物组（Microbiome）是微生物在自然界中的存在形式，它们无处不在、无所不能，与我们每个人乃至海洋、土壤、大气的健康都息息相关。在微生物组的内部，不同种类的微生物之间存在着复杂、精妙的相互作用与影响，这一跨物种的细胞间代谢互作网络是群落功能和进化的基础。然而由于自然界中绝大部分微生物尚难
中科院青岛能源所开发微型液滴微流控平台
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498099.shtm微生物生长表型筛选是工业育种、酶定向进化和合成生物学等领域面临的限速步骤，精准的单细胞精度生长表型测量是突破上述瓶颈的关键。近日，中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心开发了一种低成