华中农大发布异源四倍体棉最新基因组
2018年12月4日，英国《自然-遗传学》杂志在线发表了华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室张献龙教授团队的一项最近研究成果。该研究利用三代测序组装技术、Hi-C染色体挂载技术以及光学图谱完成了异源四倍体棉基因组从二代向三代的升级。与二代异源四倍体棉基因组相比，最新的三代基因组在连续性以及高度重复区的完整性方面都有极大的改进。 据介绍，棉花是一种重要的经济作物，是世界上重要的天然纺织纤维来源，在国民经济中占据着重要地位。目前，生产上主要棉花栽培种为异源四倍体棉，超过90%的纤维产量来自四倍体棉。陆地棉具有高产的优点，而海岛棉的纤维质量高，具有长、细和强韧等优点。为培育高产、优质的陆地棉品种，一个重要的方法是将海岛棉优良纤维性状引入陆地棉，因此，了解陆地棉和海岛棉详细的基因组信息将有助于优良异源四倍体棉花品种的培育。 该项最新研究通过比较基因组学分析，确定了广泛的结构变异可能发生在棉花多倍化事件后。该研究还构建了渐渗系......阅读全文
南京农大棉花遗传育种研究发权威期刊
棉花是重要的经济作物，也是纺织工业的主导原料，在世界及我国国民经济中占重要地位。随着植物基因组计划的不断发展，对作物进行分子设计和基因工程改良是21世纪植物科学领域中的重要课题。目前，国内外研究人员在棉花遗传育种工作中取得了一定的进展。 五月二十四日，南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验
科研人员绘制出陆地棉和海岛棉的参考基因组
解码棉花基因组能深入了解棉花种的起源进化及棉花重要农艺性状形成的遗传基础，华中农业大学棉花遗传改良团队联合海外研究团队，共同解析了异源四倍体栽培种陆地棉和海岛棉的参考基因组序列，为棉花基因组进化和功能基因研究提供了重要参考。国际权威期刊《自然-遗传学》3日在线发表了这一最新研究成果。 陆地棉和
浙大张天真团队揭示陆地棉与海岛棉的基因差别
陆地棉产量高、适应性强；海岛棉产量低，纤维品质较优。长久以来，人们一直想解析陆地棉和海岛棉在产量、适应性和品质方面差异的原因，并试图培育出综合二者高产、纤维优良、适应性强的棉花新品种，但是一直没有成功。 近日，浙江大学农业与生物技术学院教授张天真团队在《自然—遗传学》发表研究论文，报道了高质量
华中农大发布异源四倍体棉最新基因组
2018年12月4日，英国《自然-遗传学》杂志在线发表了华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室张献龙教授团队的一项最近研究成果。该研究利用三代测序组装技术、Hi-C染色体挂载技术以及光学图谱完成了异源四倍体棉基因组从二代向三代的升级。与二代异源四倍体棉基因组相比，最新的三代基因组在连续性以及高
利用PacBioRS绘制出棉花四倍体栽培种的参考基因组
来自华中农业大学棉花遗传改良团队的研究人员发表了题为“Referencegenome sequences of two cultivated allotetraploid cottons, Gossypiumhirsutum and Gossypium barbadense”的文章，介绍了整合多
转座子活动与染色质高级结构进化奥秘
近日，华中农业大学棉花遗传改良团队发表相关研究论文，首次公布了棉属中比四倍体棉花基因组更大的K2基因组，并对A2基因组和D5基因组进行了升级，发现基因组特异的转座子扩增导致了基因组扩张，通过比较三维基因组研究揭示了年轻的转座子扩增伴随着棉属特异的染色质高级结构形成。 棉花（Gossypium）
两院院士Nature子刊携手发表基因组研究新成果
来自中国农业科学院棉花研究所、深圳华大基因研究所、北京大学等机构的研究人员，报告称他们成功对栽培陆地棉（TM-1）进行了基因组测序，揭示出了其基因组进化的一些重要见解。研究论文发表在4月20日的《自然生物技术》（Nature Biotechnology）杂志上。 中国工程院院士、农业科学院棉花
南京农大2项科研成果获2020高等学校科学研究优秀成果奖
近日，教育部印发《关于2020年度高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）奖励的决定》（教科信〔2021〕1号），以南京农业大学为第一完成单位获奖2项，其中一等奖1项。 张天真教授团队以异源四倍体栽培棉花为研究对象，突破了棉花基因组组装的难点，首次组装出高质量的异源四倍体棉花基因组，阐明了异源四
南京农业大学2项科研成果荣获教育部2020年度高等学校科学研究优秀成果奖
原文地址：https://www.cingta.com/detail/19840近日，教育部印发《关于2020年度高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）奖励的决定》（教科信〔2021〕1号），以南京农业大学为第一完成单位获奖2项，其中一等奖1项。 张天真教授团队以异源四倍体栽培棉花为研究对象，突破
研究揭示棉花异源四倍体重复基因组的进化分歧
棉田丰收 中国农科院棉花所供图 近日，中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室研究员刘方团队联合国内外多家研究单位在全基因组水平探讨了四倍体棉种的多倍化、适应性进化与驯化，揭示了棉花多倍化及人工驯化过程的遗传变异基础，为其他农作物多倍化研究提供了理论基础，为棉花育种创新提供了
研究揭示棉花异源四倍体重复基因组的进化分歧
近日，中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室研究员刘方团队联合国内外多家研究单位在全基因组水平探讨了四倍体棉种的多倍化、适应性进化与驯化，揭示了棉花多倍化及人工驯化过程的遗传变异基础，为其他农作物多倍化研究提供了理论基础，为棉花育种创新提供了重要的种质资源。相关成果在线发表于《美国国
1个月3项重磅成果，事关农业“芯片”！
9月23日，是第五个“中国农民丰收节”。农民是否取得丰收，作为农业“芯片”的种子至关重要。不仅如此，种子的质量与安全还关系到农村稳定、农业增效的大局。 随着分子设计育种成为引领作物遗传改良的前沿技术，越来越多的研究者希望借助基因组测序、多组学分析、生物信息学的利器探索基因调控奥秘，提高育种效率。
中美首次联合开展棉花基因组测序
中美两国联合主持开展的陆地棉基因组测序研究取得重大进展，已从两条染色体上找到363个基因，这为棉花育种实现从传统育种向分子育种的跨越展示出光明前景。 这是记者今天从中国农科院棉花研究所主办的国际棉花基因组大会了解到的信息，来自美国、印度、巴基斯坦、澳大利亚、巴西、乌兹别克斯坦、法国、比利时等30多
作物基因组学研究进展（三）
⑸棉花基因组研究棉花是重要的天然纤维和油料作物，也是研究多倍体进化和作物驯化的重要模式植物。南京农业大学张天真等课题组通过将栽培棉与野生棉对比，绘制出了棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”，对野生棉和栽培棉之间超过１２００万个的差异甲基化胞嘧啶进行分析，鉴定出５１９个表观等位基因（ｅｐｉａｌｌｅｌｅ
Nature最新基因组研究成果
无论是接收礼物的圣诞袜，还是橱窗里的漂亮衣服，棉花的作用渗透在即将到来的这个节日的方方面面中，然而对于生物能源研究人员来说，棉花纤维成分比其颜色和质地更为重要。 由来自31个研究机构组成的一个国际研究小组近期完成了基因组最简单的棉花品种：Gossypium raimondii的详细图谱
PNAS最新介绍测序组装染色体技术
你有没有试过在不知道最终图案的情况下玩拼图游戏?这正是一些基因组研究人员在尝试通过新一代DNA测序数据，拼接成染色体时所面临的同样问题。这些染色体能提供基因组组织和结构变异方面的信息，有助于解析进化历史。为了能拼凑出这些染色体来，科学家们可以通过物理或者遗传图谱完成，但是对于许多物种而言，这种指
“深度”探寻棉花的秘密
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454915.shtm 袁道军（左）与Jonathan F. Wendel（右）在实验室，画板展示了棉花多样性。 袁道军供图 棉花是非常重要的天然纺织纤维，但实际上现今看到的棉花已与其“
农科院棉花所开放棉花资源和基因数据共享
12月31日，由中国农业科学院棉花研究所生物信息与分子设计中心构建的棉花资源和网络数据库网站正式上线。用户可在该网站上进行数据挖掘和分析、可视化展示等，操作简单快捷，结果准确易懂。 该数据库网站（Gossypium Resource And Network Database，GRAND）目前主
454测序参与棉花基因组进化研究工作
棉花是全球重要的经济作物之一。它的纤维，俗称皮棉，是纺织工业主要的天然原料。全世界棉花种植面积约5亿亩，我国常年种植面积近8千万亩。棉花不但是重要的纤维和油料植物，而且是重要的植物蛋白来源。在食用油中，棉籽油的亚油酸含量最高，达到55.6%。除此以外，棉花种子中还含有极为丰富的蛋白质和脂肪等物质
作物基因组学研究进展
摘要：农作物基因组学研究的发展，对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展，已经实现对重要农作物，如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序，在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了２０１７年度主要农作物基因组
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章，介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为，单分子测序数据能降低测序费用，并带来更多完整的基因组，改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降，测序项目的数量也在不断上升。G
长读长测序技术：拯救基因组组装项目
随着高精度长读长测序技术的出现，基因组难以组装的状态正在改变。《Nature Methods》杂志上近日发表了一篇文章，介绍了基因组组装项目如何受益于这种技术。 自测序技术问世以来，利用DNA序列的片段来组装人类、动植物或微生物的基因组就一直是难题。许多参考基因组都存在缺陷，如组装错误或存在缺
刘少军教授团队揭示了人工异源四倍体鱼基因组
9月14日，中国工程院院士、湖南师范大学省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室主任刘少军教授团队在《BMC生物学》（BMC Biology）上在线发表论文，揭示了人工异源四倍体鱼的基因组。刘少军为通讯作者，湖南师范大学副教授任力、高鑫博士、崔佳琳博士、张纯教授和北京百迈客生物科技有限公司戴鹤为该文
10年，他们打磨棉花育种“金钥匙”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510433.shtm 团队在新疆的棉花试验田。受访者供图 ■本报记者 李晨 通讯员 蒋朝常 2013年夏天的一个傍晚，华中农业大学教授、棉花团队带头人张献龙把博士一年级学生王茂军叫到
三代基因测序组装算法和软件研发获突破
DNA基因测序技术从上世纪70年代起，历经三代技术后，目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域，并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计，2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿，按最近几年增长
10年，他们打磨棉花育种“金钥匙”
2013年夏天的一个傍晚，华中农业大学教授、棉花团队带头人张献龙把博士一年级学生王茂军叫到办公室，向他提出了一个“灵魂之问”：“棉花是个异源四倍体，有两套不同来源的亚基因组，它们究竟是怎么调控纤维发育与品质形成的呢？” 此后10年，王茂军在张献龙带领下一步步解开这个问题，在《自然-遗传学》连续
国际花生基因组计划首次完成
2014年4月2日，由多国农作物遗传学家参与的国际花生基因组计划(International Peanut Genome Initiative，IPGI)终获喜报。他们在历经数年研究后，成功完成世界上首个花生全基因组图谱的绘制工作。花生基因组测序的完成和序列的公布将为全球研究人员和植物育种专
中国花生基因组计划取得阶段性研究成果
近日，由山东圣丰种业科技有限公司、广东省农业科学院、山东省农业科学院和Macrogen千年基因联合启动的中国花生基因组计划取得了阶段性研究成果，该成果报告会于Macrogen千年基因圆满举办。本次会议总结了中国花生基因组计划的阶段性研究成果及国际上花生基因组研究的进展，并讨论了花生基因组计划后期
10年4发《自然—遗传学》－为回答这个“灵魂拷问”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510534.shtm2013年夏天的一个傍晚，华中农业大学棉花团队带头人、教授张献龙把博士一年级学生王茂军叫到办公室，对他提出了一个“灵魂之问”：“棉花是个异源四倍体，有两套不同来源的亚基因组，它们究竟
10年4发《自然—遗传学》－为回答这个“灵魂拷问”
2013年夏天的一个傍晚，华中农业大学棉花团队带头人、教授张献龙把博士一年级学生王茂军叫到办公室，对他提出了一个“灵魂之问”：“棉花是个异源四倍体，有两套不同来源的亚基因组，它们究竟是怎么调控纤维发育与品质形成呢？” 此后10年，王茂军在张献龙带领下一步步解开这个问题的答案，连续发表了4篇《自