华中农大发布异源四倍体棉最新基因组
2018年12月4日,英国《自然-遗传学》杂志在线发表了华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室张献龙教授团队的一项最近研究成果。该研究利用三代测序组装技术、Hi-C染色体挂载技术以及光学图谱完成了异源四倍体棉基因组从二代向三代的升级。与二代异源四倍体棉基因组相比,最新的三代基因组在连续性以及高度重复区的完整性方面都有极大的改进。 据介绍,棉花是一种重要的经济作物,是世界上重要的天然纺织纤维来源,在国民经济中占据着重要地位。目前,生产上主要棉花栽培种为异源四倍体棉,超过90%的纤维产量来自四倍体棉。陆地棉具有高产的优点,而海岛棉的纤维质量高,具有长、细和强韧等优点。为培育高产、优质的陆地棉品种,一个重要的方法是将海岛棉优良纤维性状引入陆地棉,因此,了解陆地棉和海岛棉详细的基因组信息将有助于优良异源四倍体棉花品种的培育。 该项最新研究通过比较基因组学分析,确定了广泛的结构变异可能发生在棉花多倍化事件后。该研究还构建了渐渗系......阅读全文
我国科学家完成大蒜基因组测序和组装
近日,中国农业科学院麻类研究所南方蛋白饲料植物资源开发与利用团队联合有关高校和企业,历时4年完成了大蒜基因组的测序和组装工作。相关研究成果在线发表在《分子植物》上。 据课题组成员刘头明研究员介绍,大蒜是重要的蔬菜作物之一,我国大蒜的年播种面积达到1000万亩以上。大蒜具有膨大的鳞茎,富含大
海洋所首次完成仿刺参基因组测序和组装
日前,我国科学家在国际上首次完成仿刺参基因组测序和组装,对刺参生物学和遗传育种研究具有重要科学意义,将对我国刺参产业发展产生重要推动作用。 该成果由中国科学院海洋研究所研究员杨红生团队和相建海团队共同完成,在天津生物芯片技术公司的技术支撑下,突破了刺参复杂基因组测序和组装技术瓶颈,采用新一代测
《自然—方法学》发表媲美基因组测序速度的组装算法。
10年前,Illumina基因组测序技术进入市场时,前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。 历史总是重演。如今,第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。 12月10日,《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。 论文作者、中国农业科学院农业
联合研究发现调控棉花纤维伸长的新基因
利用基因编辑技术鉴定到影响棉花纤维伸长的GhMAH1基因。中国农科院供图 棉花是世界上重要的天然纤维作物。陆地棉和海岛棉(又称长绒棉)是棉花的两个主栽四倍体棉种,陆海种间杂交为棉花纤维长度性状改良提供重要资源,但关于陆海群体纤维动态伸长的遗传机理却鲜有报道。因此,研究棉花纤维快速伸长时期表达基因的
mESCs四倍体胚胎嵌合
实验概要mESCs四倍体胚胎嵌合主要试剂PMSG、H-CZB、hCG、电融合液、CZB培养液、含葡萄糖的CZB培养液实验材料注射器、手术剪、手术镊、35 mm培养皿、15 mL离心管、持卵针、体视显微镜、显微操作仪、电融合仪实验步骤(1)二倍体二细胞期胚胎准备①超数排卵。采用8~12周龄的雌性小鼠,
异源四倍体的概念
1:首先解释什么是四倍体先从二倍体和多倍体入手,由受精卵发育而来,且体细胞中含有两个染色体组(如男性XY色体)生物个体,称为二倍体。可用2n表示。人和几乎全部的高等动物,还有一半以上的高等植物都是二倍体。 接着讲多倍体,多倍体是指体细胞中含有三个以上染色体组(AAA)的个体,多倍体在生物界广泛存在,
研究揭示海湾扇贝两个亚种基因组测序和组装
日前,青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展,海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析,相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前,王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装,紫扇贝和海湾扇贝两个
四种测序技术实现了胡椒染色体级别的组装
胡椒为什么辣?胡椒碱含量的高低决定了胡椒的辛辣程度。10月16日,中国科学家宣布找到胡椒碱的来源,以及哪些基因对胡椒“辣”味机制至关重要。 《自然-通讯》杂志发表的这项最新成果由中国热带农业科学院香饮所联合华中农业大学、马来西亚科学院等7家单位完成。他们绘制了我国胡椒栽培种“热引1号”染色体级
科学家首绘“植物界大熊猫”中华水韭基因组图谱
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510559.shtm北京农学院、中国农业科学院生物技术研究所团队首次绘制了高质量的中华水韭基因组图谱,这也是报道的首个非种子植物染色体水平组装的四倍体基因组,该研究为进一步解析石松植物的进化和环境适应性
科学家首绘“植物界大熊猫”中华水韭基因组图谱
北京农学院、中国农业科学院生物技术研究所团队首次绘制了高质量的中华水韭基因组图谱,这也是报道的首个非种子植物染色体水平组装的四倍体基因组,该研究为进一步解析石松植物的进化和环境适应性以及中华水韭的保护提供了重要基础。 近日,相关研究以《通过染色体水平四倍体中华水韭基因组揭示石松植物的进化和适应
我国棉花重要性状遗传基础研究跃居国际领先行列
中国农业科学院棉花研究所联合国内多家科研机构开展的亚洲棉和陆地棉2项研究成果5月7日同时在线发表于《自然遗传学(Nature Genetics)》,两项研究揭示了亚洲棉在中国的演化历史。图片来源于网络 其中,“亚洲棉多样性及演化的遗传学基础研究”由中国农业科学院棉花所李付广团队与中国农业科学院
科研人员揭示水生作物菱角起源驯化之谜
12月14日菱角在我国栽培驯化历史十分悠久。史料记载,在南宋时期菱角已成为江南地区居民重要的食物来源,这种水生作物起源于何处?何时被人类驯化?科研人员的最新研究给出了答案。 记者14日从中国科学院武汉植物园了解到,国际学术期刊《植物生物技术杂志》近日在线发表了中科院武汉植物园邱英雄研究员团队关
南京农业大学Nature子刊发布遗传学新成果
来自南京农业大学、中科院上海生命科学研究院的研究人员,在新研究中揭示出了棉花腺毛(glandular trichome)形成的遗传基础。这项研究工作发布在1月22日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 南京农业大学的张天真(Tian-Zhen Zhang)教授,
研究人员揭示棉花驯化历程
华中农业大学张献龙教授棉花研究团队的一项最新研究不仅首次提出了棉花纤维驯化的遗传学基础,而且阐述了驯化对基因转录调控的影响。日前,《自然·遗传学》在线发表了他们的这一成果,认为该研究对棉花功能基因组研究和遗传改良具有重要指导作用。 棉花纤维是重要的天然纺织纤维,生产上主要棉花栽培种为异源四倍体
四倍体的概念和典型
高等生物体的遗传物质的载体主要是染色体,比如说人就是有46条染色体,这些染色体分为两组,一组来自父方,如精子中的染色体;一组来自母方,如卵子中的染色体。精子和卵子就是单倍体,因为他们都只有一组染色体(23个),人就是二倍体,具有两组46个染色体。同理可以推出四倍体就是成体细胞中含有的染色体是最小染色
棉花塞制作实验
实验材料棉花试剂、试剂盒水仪器、耗材试管实验步骤加塞时,应使棉塞长度的1/3在试管口外, 2/3在试管口内,如图1所示,做塞的棉花要选纤维较长的,一般不用脱脂棉做棉塞。因为 它容易吸水变湿,造成污染,而且价格也贵,做棉塞过程如图2。图1 棉塞 图2 棉塞制作过程 此外在微生物实验和科研中,往往要用到
棉花塞制作实验
实验材料 棉花试剂、试剂盒 水仪器、耗材 试管实验步骤 加塞时,应使棉塞长度的1/3在试管口外, 2/3在试管口内,如图1所示,做塞的棉花要选纤维较长的,一般不用脱脂棉做棉塞。因为 它容易吸水变湿,造成污染,而且价格也贵,做棉塞过程如图2。此外在微生物实验和科研中,往往要用到通气塞,所谓通气塞,就是
Nature子刊:“五谷”之一重要作物糜子的高质量基因组组装
糜子是起源于中国的古老作物,相关文献报道糜子在中国已经有超过1万年的栽培历史,是少数最古老的农作物之一。糜子是中国传统“五谷”中的一种。古代文献中出现的黍和稷分别为糥性和非糯性的糜子,在中华农耕文化中具有重要地位。同时,糜子具有较短的生长周期以及极强的非生物胁迫抗性,也是典型C4高光效作物。然而
我国科学家成功绘制出高质量木本棉基因组图谱
我国科学家成功绘制出高质量的木本棉基因组图谱,并对棉属进化机制及重要经济性状功能基因进行了分析。对四倍体棉种及其它多倍体物种的形成过程的揭示,为研究棉花纤维质量和抗病虫灾害等重要农艺性状奠定了遗传学基础。研究成果近日发表在《自然·遗传学》杂志上。 棉花是全球最重要的经济作物之一,棉花属共
我国科学家成功绘出高质量木本棉基因组图谱
我国科学家成功绘制出高质量的木本棉基因组图谱,并对棉属进化机制及重要经济性状功能基因进行了分析。对四倍体棉种及其它多倍体物种的形成过程的揭示,为研究棉花纤维质量和抗病虫灾害等重要农艺性状奠定了遗传学基础。研究成果近日发表在《自然·遗传学》杂志上。 棉花是全球最重要的经济作物之一,棉花属共包括4
联合研究揭示六倍体栽培燕麦的起源与演化
燕麦(Avena sativa L., 2n = 6x = 42, AACCDD)作为谷物中最好的营养食品之一,因富含蛋白质、不饱和脂肪酸及可溶性膳食纤维而广受消费者青睐。7月18日,Nature Genetics在线发表了题为Reference genome assemblies reveal
小麦基因组测序-为第三代育种绘制“高清地图”
不久前,中国科学院遗传与发育生物学研究所发表于国际著名期刊《自然》的论文称,该所研究团队已完成小麦A基因组测序和染色体精细图谱绘制。这是继2013年,该团队成功绘制出小麦A基因组祖先种乌拉尔图小麦基因组草图并发表于《自然》之后,在此领域的又一项重大成果。图片来源于网络 中国科学院遗传与发育生
我国学者采用混合组装策略和软件技术大幅降低测序深度
近日,中国科学院昆明动物研究所张亚平院士和马占山研究员领导的团队发布了以“10x Genomics测序”辅助“三代测序”的混合组装策略和软件技术。研究人员采用美国加州大学Jain等人2018年发表在 Nature Biotechnology(doi: 10.1038/nbt.4060.)的人类基
中国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序组装
近日,记者从中国科学院海洋研究所获悉,我国科学家正式完成仿刺参基因组测序和组装,这在国际上尚属首次。该研究成果对刺参生物学和遗传育种研究具有重要科学意义,对我国刺参产业发展将产生重要推动作用。 据了解,该项研究得到了国家科技部973 、863计划,国家基金委,中国科学院和山东省科技厅、青岛市
棉花株型相关基因的发掘和调控机制实现棉花株型改良
棉花是世界上重要的纤维和油料作物。我国是世界棉花生产、消费和进口第一大国,棉花在国民经济中发挥重要作用。株型是影响棉花机械化和产量的关键因素。棉花为多年生,无限生长,其侧枝较长,株型松散,不利于单产提高和机械化采摘。棉花株型相关基因的发掘和调控机制的解析是实现棉花株型改良的重要途径。 中国农业
中科院李家洋团队开辟水稻育种新途径
“今年5月,我们的水稻材料就要在北京实验田里试种了,未来有望推广到更多地方。”说起手头的工作,余泓眼睛里都是喜悦。余泓是中科院遗传与发育生物学研究所李家洋院士团队的一员。他说的水稻材料,是该团队快速从头驯化的全新水稻品种。去年初,这一成果发表在科学期刊《细胞》上,被业界认为有望开辟一条野生植物驯化新
首个棉花纤维高清动态3D基因组结构图谱建成
近日,华中农业大学棉花遗传改良团队首次构建了棉花纤维的高分辨率三维基因组结构图谱,揭示了亚基因组协作调控异源四倍体棉花纤维发育的拓扑结构基础,对棉花功能基因组研究具有重要推动作用。棉花纤维是纯净的植物单细胞类型,该研究为解析其他植物单细胞分化的转录调控机制提供了参考。相关研究成果在线发表于国际
“棉花”真能变“肉松”吗?
民以食为天。这些年,我国食品安全监管不断加强,但一些似是而非的食品谣言仍在网上不断传播,影响消费信心。治理食品谣言,既要从源头上打击恶意造谣的不法分子,也要普及食品安全知识,引导人们增强识别谣言的能力,不信谣不传谣。从今天起,我们推出“揭穿食品谣言”专题,采访权威专家,对一些网上传播的食品谣言进
木棉花的介绍
木棉花(拉丁学名:Bombax ceiba L.,别名:斑芝树),木棉科木棉属植物。 木棉花树皮灰白色,分枝平展,掌状复叶,喜生于海拔1400-1700米以下的干热河谷及稀树草原,也可生长在沟谷季雨林内,分布在海南、中国台湾、广西、云南和四川南部等地。
棉花根的简介
棉花根(《上海常用中草药》) 【异名】 草棉根皮(《中国药植图鉴》),蜜根(《上海常用中草药》)。 【来源】为 锦葵科植物草棉等的根或根皮。植物形态详"棉花"条。 【化学成分】草棉根皮中含 棉酚1.8%(干燥棉根)、 黄酮类、香荚兰乙酮、 酚酸、 水杨酸、无色 酚类物质、黄色酸类物质、 甜