NatureBiotechnology定义病毒基因组标准：何谓高质量基因组
据说，地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量，而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上，美国能源部（DOE）联合基因组研究所（JGI）构建了重要的病毒序列数据库，同时提出了病毒基因组标准，指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未知，或者未在实验室培养，但基因组测序和分析方面技术的机制，让研究人员能够从宏基因组和元转录组数据集中识别出超过750,000种未培养的病毒基因组。 质量和分析指南 “病毒是每个微生物生态系统中的关键组成部分，由于JGI生成了大量这些数据，因此对开发病毒基因组标准特别感兴趣，”JGI研究人员，第一作者Simon Roux说，“我们只是部分研究人员，我们庞大的研究机构详细审查了这些数据，并提供指导以帮助确定数据质量。此外，在本文中，我们希望提供的不仅仅是标准，而是包括了对这些数据进行何种类型的分析，帮助想要描述自己实验室新型病毒的研究......阅读全文
PNAS：让病毒“吐出”基因组
病毒感染导致的手足口病，会使儿童出现可能致命的脑肿胀和麻痹，现在科学家们找到了治疗这种疾病的潜在途径，这一发现也为对抗其他相关病毒提供了宝贵线索。 在中国和东南亚国家，每年都会出现手足口病的爆发，这种疾病是由肠道病毒71型(EV71)引起的。在一些受到感染的儿童中，病毒会引发脑炎造成永久性
Science：人巨细胞病毒病毒基因组测序
人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒，感染约50-100%的成人，但通常没有不良影响，并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的，发展中国家感染人数比发达国家人数多。 该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损，可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋
树懒基因组中发现“化石”病毒
二趾树懒(Choloepus hoffmanni，如上图)的基因组中隐藏着一个“化石”病毒。 据美国《科学》杂志在线新闻报道，就像恐龙在焦油中留下的脚印一样，逆转录酶病毒会将其DNA中的一些片段插入到一种动物的基因组中。研究人员在树懒的基因组中发现了泡沫病毒的古老片段。研究人
关于病毒基因组的基本介绍
病毒是最简单的生物，完整的病毒颗粒包括外壳蛋白和内部的基因组DNA或RNA（有些病毒的外壳蛋白外面有一层由宿主细胞构成的被膜（envelope），被膜内含有病毒基因编码的糖蛋白。病毒不能独立地复制，必需进入宿主细胞中借助细胞内的一些酶类和细胞器才能使病毒得以复制。外壳蛋白（或被膜）的功能是识别和
病毒基因组的结构特点介绍
1.病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比，病毒的基因组很小，但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小，所含信息量也较小，只能编码4种蛋白质，而痘病毒的基因组有300kb之大，可以编码几百种蛋白质，不但为病毒复制所涉及的酶类编码，甚至为核苷酸代谢的酶类编码，因此
未知基因组的神秘“巨型病毒”揭示病毒世界变异性
据国外媒体报道，目前，科学家最新发现一种具有未知基因组的神秘巨型病毒。 该病毒被称为“Yaravirus”，是在巴西贝洛哈里桑塔城帕普哈人工湖中发现的，它是以巴西神话传说中“水仙（Yara）”的名字命名的。尽管该病毒可能不是什么超自然警报，但它可能像神话中的“水仙（Yara）”一样神秘。 因
Nature－Biotechnology定义病毒基因组标准：何谓高质量基因组
据说，地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量，而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上，美国能源部（DOE）联合基因组研究所（JGI）构建了重要的病毒序列数据库，同时提出了病毒基因组标准，指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未
中国新型冠状病毒的基因组序列
《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒的基因组序列（论文：A new coronavirus associated with human respiratory disease in China），病毒样本系从一名曾在最先爆发疫情的海鲜市场工作过的患者体内分离得到。基因组分析显示，该病毒与此前在
牛乳头瘤病毒基因组结构和功能
乳头瘤病毒（papillomavirus）是感染人和动物皮肤、粘膜并引起乳头状瘤病变的一种DNA病毒，属于乳多空泡病毒（papovavirus）科。根据病毒感染的宿主不同可以分为牛乳头瘤病毒（BPV），人乳头瘤病毒（HPV）等。已发现的乳头瘤病毒基因组都具有相似的结构。下面以BPV为例说明乳头瘤
SARS病毒基因组复制机制研究获突破
近日，武汉大学生命科学学院教授郭德银领导的研究组以选择冠状病毒特有的多个RNA加工酶作为主要研究目标，通过酵母菌系统的功能筛选和体外生物化学分析，发现SARS病毒基因组1b区编码的一种非结构蛋白nsp14同时具有两种RNA加工酶活性，一是参与RNA 5’-端加帽的N7-甲基转移酶，二是进行RNA
酵母还能快速“重建”新冠病毒基因组？
据《自然》杂志6日发表的一项合成生物学研究，瑞士一个研究团队开发出一种可以快速重建新冠病毒的方法。重建病毒有助于研究人员开发诊疗方法和疫苗，同时，拥有合成能力也被认为是未来防治相关疫情的重要一环。 在实验室重建病毒，是一种有效的研究疾病暴发所涉病原体的方法。发生疫情时，将病毒样本送至研究机构可
我国首次完成寨卡病毒全基因组序列测定
2月22日，记者从军事医学科学院获悉，该院与广州市第八人民医院、出入境检验检疫系统相关单位密切合作，在获得从委内瑞拉归国患者临床标本后，采用高通量测序技术，于2月21日直接从尿液中获得病毒全基因组序列。 寨卡病毒属黄病毒科，是一种主要由伊蚊传播的虫媒病毒。1947年首次在乌干达寨卡丛林中的恒河
PNAs：人类基因组中藏着病毒的“灵魂”
研究者们发现，从远古时期开始，我们的祖先的DNA中就藏有病毒的"灵魂"。其中一些病毒一旦被唤醒，将会是十分危险的。最近一项研究中，科学家们找到了新的藏在我们DNA中的病毒"灵魂"。 通过筛查2500份人类基因组，研究者们发现有36种病毒随着进化过程在不断地累积。其中有19种病毒此前从未见过，其
中国疾控中心已完成测序MERS病毒基因组
中国疾控中心近日透露，该中心病毒病所与广东省及惠州市疾控中心合作，已完成我国首例MERS病例的病毒全基因组序列测定。 6月10日信息显示，韩国目前中东呼吸综合征（MERS）确诊病例为108人，死亡9人，死亡率在7%左右。韩国病例数仅次于沙特，列世界第二。近期MERS在韩国连续报告多例病例，被隔
新冠病毒源自哪里？基因组分析解读秒懂
研究小组分析了2019年12月至2020年3月间测定的各国患者感染的新冠病毒基因组。结果发现全球新冠病毒分为三个有密切“血缘关系”的不同“变体”，分别标记为“A”、“B”和“C”。 美国和澳大利亚的患者主要感染的是A型病毒，在武汉居住的美国人中也发现了A的变异版本。 武汉甚至整个东亚地区主要
研究人员首次破译艾滋病病毒完整基因组
新华网华盛顿8月6日电 美国北卡罗来纳大学6日报告说，该校的一个科研小组成功破译了艾滋病病毒的完整基因组。这对于人类理解艾滋病病毒感染人体的机制，寻找抗“艾”新疗法提供了有力帮助。 相关论文发表在6日出版的英国《自然》杂志上。研究小组负责人凯文·威克斯介绍说，艾滋病病毒的遗传信息由单链核糖
英国发布新型冠状病毒完整基因组测序结果
前段时间一种与“非典”病毒相近的新型冠状病毒的出现曾引起各方高度关注，英国卫生部门日前发布了这种病毒的完整基因组测序结果，希望有助于对其研究和防治。 新型冠状病毒之所以引起高度关注，是因为曾造成极大恐慌的“非典”（ＳＡＲＳ）病毒与它同属冠状病毒。但基因分析显示，与新型冠状病毒
Nature重大成果：揭示125000个病毒基因组
在地球的内部、地球之上以及地球的周围，微生物的数量达到了10^30，估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定，维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用，但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标，更好地了解地球微生物的多样性，收集
Nature重大成果：揭示125000个病毒基因组
在地球的内部、地球之上以及地球的周围，微生物的数量达到了10^30，估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定，维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用，但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标，更好地了解地球微生物的多样性，收集
破解埃博拉病毒基因组从头起始复制的分子机制
9月12日，中国科学院微生物研究所施一、齐建勋、高福院士团队，在《自然》（Nature）上，发表了题为Molecular mechanism of de novo replication by the Ebola virus polymerase的研究文章，首次报道了nsNSV聚合酶识别3’-l
eLIFE：艾滋病毒，人类基因组编辑新工具
丹麦奥胡斯大学开发出了一项新技术利用HIV病毒来作为对抗遗传性疾病的一种工具。 研究人员首次成功地改造了HIV病毒颗粒，使得它们能够通过一些生物学过程（可以说是）同时“剪切和粘贴”我们的基因组。由奥胡斯大学生物医学系开发的这项新技术，使得以一种新的方式修复基因组变为可能（延伸阅读：2014值得
我国解析首例输入性寨卡病例病毒全基因组信息
新华社北京２月２３日电 记者２３日从中国疾病预防控制中心了解到，中国疾控中心病毒病预防控制所专家团队与江西省疾控中心合作，对我国首例寨卡病毒感染病例血液标本中的寨卡病毒基因组进行了全面解析，已成功获得病毒全基因组序列。 寨卡病毒近来引起国际社会广泛关注。２０１５年５月，巴西出现首例寨卡病毒本地
人类肠道宏基因组的古菌病毒研究新进展
2022年12月30日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在《自然-通讯》（Nature Communications）上，发表了题为Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in
新冠病毒基因组测序的方法有哪几种？
新冠病毒基因组测序的方法有宏基因组测序和靶向测序。
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒使用说明
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒一、简介病毒总核酸提取试剂盒适合于从血清、血浆、组织匀浆等样品中提取病毒总核酸。试剂盒基于硅胶柱纯化技术，提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提，也无需进行耗时的醇类沉淀。该产品已经成功地提取了乙肝A/C、丙肝、以及诺如病毒标准品等的核酸。获得的DNA/RNA可直接用于
新冠病毒全基因组大小和序列的研究进展
2月3日，《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示，该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。 通过对从患者收集的
便携式基因组测序装置可快速检测埃博拉病毒
[导读] 本周出版的英国《自然》杂志上发表的一项传染病学研究论文,描述了一个可以被装入行李箱并运输到现场使用的埃博拉病毒基因组测序监测系统,这个系统在收集样本后24小时内就可以得出结果。 该便携式基因组测序装置可插入笔记本电脑USB接口 科技日报北京2月4日电 （记者张梦然）本周出版的英
我国首例输入性裂谷热病毒全基因组序列测定完成
记者从国家质量监督检验检疫总局获悉：7月24日凌晨，该局和军事医学科学院微生物流行病研究所联合攻关，获得了我国首例输入性裂谷热病例的病毒全基因组序列。 “测序结果确认了该输入性病例为非洲流行的裂谷热病毒感染所致。”军事医学科学院微生物流行病研究所研究员童贻刚告诉科技日报记者，经测定，该病毒基因
乙肝病毒基因组的结构特点和功能介绍
乙肝病毒（HBV）的基因组DNA结构很奇特，是一环状的部分双螺旋结构,长约3.2kb。其中的2/3为双螺旋结构，1/3为单链，这就是说，DNA中的两条链不等长。长链的5'端与3'端无共价连接，而是与一种蛋白质共价相连。长链的5'端以250-300对碱基互补结合。长链为负链
宏基因组测序帮助科学家增加12倍海洋病毒种类
你知道吗？当你在海里游泳时吞下一口海水，就可能吞下了数以亿计的病毒。 尽管海洋中的病毒数量惊人，并且在自然界的碳循环等过程中发挥着关键作用，但自海洋病毒首次被发现以来的几十年里，科学家仍然对其多样性及遗传信息知之甚少。近年来，随着基因组学技术的进步，科学家开始着手分析海洋病毒的功能与多样性，特