北京基因组所合作揭示RNAm6A修饰调控抗肿瘤免疫机制

免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地,其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原,难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点,提高免疫治疗效果。 中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、美国芝加哥大学何川团队合作发现,RNA m6A修饰通过调控树突状细胞的溶酶体组织蛋白酶翻译效率,影响肿瘤抗原特异性的T细胞免疫应答新机制,相关研究成果2月7日在线发表于《自然》杂志。 m6A修饰是mRNA上丰度最高的修饰类型,负责对mRNA分子进行转录后调控。m6A修饰通过其结合蛋白YTHDF1影响下游基因的翻译效率。韩大力及其合作者发现,RNA m6A修饰通过YTHDF1调控肿瘤抗原特异性免疫反应。相比于野生型小鼠,YTHDF1敲除小鼠展现出较强的肿瘤抗原特异性CD8+T细胞应答。进一步研究表明,体内删除树突细胞中的YTHDF1会......阅读全文

云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用

  导读   RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The

利用ssDRIPseqRNA揭示甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高

最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇

  一个月发表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。   m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个

曹雪涛Nature子刊再发文-揭示m6A修饰促进树突状细胞活化

  近日,曹雪涛院士在Nature子刊再发文章,首次揭示了m6A修饰通过改变mRNA翻译水平调节DC的功能活化,对于深入理解RNA表观修饰调控免疫基因表达的机制,进一步阐明m6A修饰在免疫应答及炎症反应中的功能具有重要意义。  免疫应答的表观调控机制是近年来免疫学研究的前沿热点。RNA的N6-甲基腺

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...2

2. m6A甲基转移酶METTL3的泛素化调节其功能  发表期刊:Nucleic Acids Research影响因子:11.147发表日期:2018.06.01实验方法: m6A-seq,RNA-seq,MeRIP-PCR,RIP等(云序提供)  上海交通大学医学院余健秀组在著名期刊《核酸研究》发

RNA加工修饰

中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰,主要加工方式是切断和碱基修饰,真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。

化学所在RNA表观遗传修饰的化学调控研究方面取得进展

  RNA的表观遗传修饰是RNA调节基因表达的化学基础,利用新反应技术和新分子工具对RNA修饰进行精准调控对揭示RNA介导的遗传信息表达网络具有重要意义。然而由于RNA本身的不稳定性,使得在活细胞水平进行化学调控变得异常艰难。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物最常见和最丰富的一种修饰,占甲基化修饰

中国学者发表RNA甲基化重要成果

  基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。  西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普

RNA甲基化(m6A)研究:最前沿表观遗传研究热点(一)

随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和DNA甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布Nature, Cell和Science等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...3

5. m6A修饰调控新生小鼠β细胞的成熟 发表期刊:Diabetes影响因子:7.2发表日期:2020.05.13实验方法:m6A-seq、mRNA-seq、MeRIP-PCR、整体m6A修饰水平等(云序提供) 近期Diabetes杂志(IF=7.2)发表了m6A修饰调控新生小鼠β细胞的成熟机制相关

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

中国学者发表RNA甲基化重要成果

  基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。  西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普

表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究

随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗

表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究

随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存

科学家揭示生物钟调控代谢新方式

  近日,南京农业大学动物科技学院教授王恬团队与芝加哥大学合作在《细胞—报告》上在线发表研究论文,揭示了生物钟调控代谢的新方式,拓展了人们对生物钟、m6ARNA甲基化修饰和代谢相互关系的认识。  N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物RNA上最丰富的一种转录后修饰,在基因表达、RNA剪切、mRNA运输

广州生物院m6A修饰调控体细胞重编程机理研究获进展

  9月8日,中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组在Cell Reprots杂志在线发表了题为YTHDF2/3 are required for somatic reprogramming through different RNA deadenylation pathways的文章。该研

Nature遗传学综述:何川教授详解RNA甲基化

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现, mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。   RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,它

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

跨学科合作将成为解码植物表观转录组的加速器

  近日,中国热带农业科学院热带生物技术研究所教授吕培涛在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统阐述了RNA修饰在植物生命活动中的调控作用,深入解析了N6—甲基腺苷(m6A)等修饰对植物发育及果实成熟的分子机制。  真核生物RNA上存在170多种化学修饰,形成动态可逆的

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

脂肪含量和肥胖相关蛋白在哺乳动物发育中的功能底物

  N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物mRNA内部最常见、最丰富的修饰,受多种蛋白的调控。其中,脂肪含量和肥胖相关蛋白(FTO)作为首个被鉴定的RNA去甲基化酶,可以擦除mRNA内部的m6A,但FTO在哺乳动物发育中的主要功能底物仍不清楚。近日,美国芝加哥大学和同济大学合作在《Science》杂志

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(三)

总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法,研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性,改善了体内肿 瘤生长,而ALK

《科学》发表同济大学高亚威团队联合研究成果

  摘要:1月17日,同济大学生命科学与技术学院、附属东方医院高亚威教授联合美国芝加哥大学教授何川、中科院北京基因组研究所研究员韩大力合作完成的研究成果“N6-methyladenosine of chromosome-associated regulatory RNA regulates chro

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇

  RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化

m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇

RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化研究

Cell-Research-肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制

  肠道菌群微生物组学是近年来研究热点,肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用,在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明,肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现,特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表文章最多的RNA甲基化测

生物钟调控代谢新方式揭示

   人体内有一个很酷的时钟——生物钟。然而,生物钟调控生理、代谢和行为等生命活动的机制十分复杂,仍需要进一步深入探究。记者15日从南京农业大学获悉,该校王恬教授团队与芝加哥大学合作在《细胞通讯》上刊发研究成果,揭示了生物钟调控代谢的新方式。  生物钟由基因和蛋白质打造,是生物进化的礼物。生物钟掌控