中国学者发表RNA甲基化重要成果
基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普渡大学研究团队,通过全转录组高通量深度m6A测序,揭示了拟南芥不同器官之间差异性的m6A甲基化模式。这项研究发表在十二月十四日的Genome Biology杂志上,文章的通讯作者是Zhaobo Lang和Yizhen Wan。 RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,兼具信息分子和调控分子双重功能,不仅将DNA的遗传信息传递给蛋白,也调节着许多生物学过程。RNA的转录后修饰为其多样化的功能奠定了基础。据估计RNA上有一百多种化学修饰,但绝大多数修饰的功能还鲜为人知。 m6A是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰,介导了超过80......阅读全文
表观遗传学关于DNA甲基化
表观遗传学是研究表观遗传变异的遗传学分支学科从目前的研究来看,X 染色体剂量补偿、DNA 甲基化、组蛋白密码、基因组印记、表观基因组学和人类表观基因组计划等问题都是表观遗传学研究的内容。其中甲基化是基因组DNA 的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。在脊椎动物中,CpG二核
表观遗传学分子生物学软件——DNA甲基化分析工具
第一类:基于引物设计功能的软件。此类软件主要是针对重亚硫酸盐序列进行甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP)和重亚硫酸盐测序(bisulfite sequencing, BS)引物的设计。由于重亚酸盐修饰的特殊性,使常规的分子生物学
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。CpG岛的异常甲基化是导致基因沉默和过度表
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。 CpG岛的异常甲基化是导致基
中国学者发表RNA甲基化重要成果
基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普
中国学者发表RNA甲基化重要成果
基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普
PNAS首次评估表观遗传学突变率
Groningen大学的科学家们在重要模式生物拟南芥中,精确评估了表观遗传学标志出现或消失的频率,有助于深入理解表观遗传学改变在植物进化中的重要性。这项研究发表在五月十一日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下影响基因的活性。大多数动物(包括人类)的
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的,近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析,从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
Science:表观遗传学的“神秘花园”
许多研究者都在探寻各种复杂性状背后的遗传学基础。然而,大家往往忽视了天然表观遗传学变化为表型带来的多样性。表观遗传学突变发生在DNA序列之外,将其与DNA序列突变区分开是一项富有挑战性的工作。 在本期Science杂志上Cortijo等人向人们展示,表观等位基因( epialleles
“RNA-甲基化”研究汇总——拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育
上海生科院发现调控种子印迹基因表达的新机制
图A:ape1l 和zdp双突变对种子发育的影响图B:APE1L蛋白调控拟南芥中DNA主动去甲基化途径的工作模型 1月8日,中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组与科尔多瓦大学合作研究发现,拟南芥主动去甲基化途径中的新组件APE1L蛋白不仅是DNA主动去甲基化途径中的一
华南植物园表观遗传相关研究取得新进展
近年来,随着大量表观遗传现象的发现与报道,植物表观遗传学已经成为植物分子生物学的研究热点。表观遗传修饰不改变生物体DNA的序列,通过DNA的甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑等途径调节基因的表达。其中,组蛋白修饰方式包括组蛋白的乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化等。组蛋白甲基化水平受组蛋白甲基转移酶和组
中科院参与发表Nature表观遗传学新成果
在动植物的发育过程中,配子和胚胎会发生表观遗传学状态的重编程,这是正确发育必不可少的一步。 植物的生殖细胞来自于花的体细胞组织,需要消除植物发育或应答外界刺激时积累的染色质修饰。如果这一过程不能有效进行,那么上一代的表观遗传学状态就会错误的遗传下去。不过在绝大多数情况下,上述表观遗传学修饰都能
上海生科院揭示等位遗传调控机制
5月14日,国际学术期刊Cell Reports在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Involvement of multiple gene silencing pathways in a paramutation-like phenomenon in A
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。研究背景肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,由于环境的污染,肺癌
什么是表观遗传学
是研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传修饰,即探索从基因演绎为表型的过程和机制的一门新兴学科。遗传学是指基于基因序列改变所 致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等。而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化和染色质构象变化等;表观基因组
植物DNA去甲基化的机理和功能
10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation i
遗传发育所植物组蛋白H3K27me3去甲基化酶研究获进展
PcG介导的组蛋白H3第27位赖氨酸上三甲基化(H3K27me3)在基因沉默和发育调控中起着至关重要的作用。小鼠胚胎干细胞中超过10%的基因受该种修饰调控,拟南芥中超过7,000个基因受该修饰调控。拟南芥中H3K27me3主要由CLF和SWN两个甲基转移酶催化,并招募LHP1结合以有效抑制基因表
著名学者朱健康院士Cell-Research发表表观遗传学研究成果
生物通报道:转座子通常是通过表观遗传学机制(包括DNA甲基化)保持沉默的。12月9日,在《Cell Research》杂志上发表的一项研究中,来自中科院上海生命科学研究院、美国普渡大学以及中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员,在拟南芥中将一对Harbinger转座子衍生蛋白(HDPs)——HD
Nature发表表观遗传学重要发现-决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。 伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A
Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A在Sxl
《Nature》子刊:植物“永生”细胞甲基化重编程机制
生殖细胞通常被认为是“不朽的”,因为它们的遗传物质可被后代完全继承。 DNA甲基化是DNA的一种修饰,能在不改变基因序列的前提下改变DNA活性。以DNA甲基化等修饰为核心的表观遗传学是当代生命科学发展最快的领域之一,在改善人类和植物健康等方面具有很高潜力。 DNA甲基化重编程是动物体内最常见
研究发现植物印迹基因有较强物种特异性
记者日前从中科院昆明植物所获悉,该所刘爱忠研究组博士生徐伟利用典型双子叶胚乳型种子蓖麻,发展了崭新的研究体系,并鉴别出大量新颖的印迹基因。相关成果在线发表于《核酸研究》杂志。 据介绍,基因组印记是一种非常重要的表观遗传学现象。在配子或合子发育过程中, 来自亲本的等位基因或染色体发生差异性的表观
著名遗传学家表观遗传学新成果
可卡因成瘾性的一个主要挑战在于,在戒断期之后的高复发率。但新的研究表明,在药物戒断过程中,我们DNA的变化可能为更有效的成瘾疗法开发,提供了有希望的方法。 加拿大麦吉尔大学和以色列巴尔依兰大学的研究人员,将这项研究结果发表在最近的《Journal of Neuroscience》。他们指出,戒
昆明植物所在植物基因组印迹研究中取得进展
蓖麻基因组印迹以及其甲基化分析 基因组印记 (genetic imprinting)是一种非常重要的表观遗传学现象之一。在配子或合子发育过程中,来自亲本的等位基因或染色体发生了差异的表观修饰,导致了亲本等位基因的差异表达(即印迹基因)。在植物中基因组印迹主要发生在被子植物的三倍体胚乳组织
表观遗传学和人类疾病
上个世纪50年代初,Watson和Crick建立了DNA分子结构模型,极大程度地促进了生命科学的发展。自此遗传学便成为现代医学研究领域中一个重要的分支。人类已经认识到基因突变可以导致疾病的发生,如慢性进行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纤维化等。近年来
表观遗传学名词解释
表观遗传学(英语:epigenetics)又译为表征遗传学、拟遗传学、表遗传学、外遗传学以及后遗传学,在生物学和特定的遗传学领域,其研究的是在不改变DNA序列的前提下,通过某些机制引起可遗传的基因表达或细胞表现型的变化。表征遗传学是1980年代逐渐兴起的一门学科,是在研究与经典的孟德尔遗传学遗传法则
《科学》推出“表观遗传学”专题
10月29日出版的《科学》杂志刊登专题——《表观遗传学》(Epigenetics)。专题导言文章《什么是表观遗传学》(What Is Epigenetics?)说,多细胞有机体的细胞名义上拥有同样的DNA序列(因而拥有同样的遗传指令系统),但是它们却维持着不同的显型。这种记录了发育和环