人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。 Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human 发表期刊:Nucleic Acids Research 影响因子:11.147 发表时间: 202......阅读全文

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化(一)

文章导读m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Aci

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化(二)

5.进化角度分析人类m6A修饰位点作者通过比较人鼠之间保守m6A位点比例和保守对照A比例,来评估CDS区域m6A位点面临的自然选择压力,发现发生于第 一个密码子处的m6A的周围序列保守程度低,可能由于此处的m6A会带来不利的影响比如影响tRNA结合,而发生于第三个密码子处的m6A则受到进化选

揭示了m6A-RNA修饰的新的进化意义

  无义介导的RNA降解(Nonsense-mediated decay, NMD)是真核生物一种重要的mRNA质量控制方式,细胞通过检验终止密码子与最后一个剪接接头的距离是否超过55nt来判断该终止密码子是否为提前终止密码子(Premature Termination Codon, PTC)从而决

Nature-Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制

m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰,其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶(writer)、结合蛋白(reader)以及去甲基化酶(eraser)的动态可逆调控。研究表明,m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动,参与调控机体的诸多生理或病理进程,包

持续进化中的现代人类

  很多人认为进化需要几千年甚至上百万,但生物学家知道,进化也可能会发生的很快。现在,由于基因组操作技术的革命,研究人员可以追踪种群水平的遗传变化,这些遗传变化可能最终会表现出进化的特征。在刚过去的基因组生物学大会上,新的研究指出,人类的基因组在近几百年来发生了很大变化。这种基因组层面的变化,最终导

Nature:人类早期胚胎发育过程中的染色体结构动态变化

   染色体三维结构是重要的表观遗传因素,与基因的表达调控密切相关。研究染色体三维结构在人类精子及早期胚胎中的动态变化和调控分子对于深入理解人类胚胎发育有重要的理论和临床意义。  人类个体发育从精卵结合形成受精卵开始,经历早期胚胎发育过程,由一个细胞逐渐分裂分化形成一个含有上百种细胞类型、多种器官的

RNA甲基化促进草莓成熟

  果实中富含的营养成分是人类膳食结构的重要组成部分,对人体健康不可或缺。果实品质在成熟过程中逐渐形成,受到精确调控。解析果实成熟调控机制,将为果实品质改良和新品种选育提供理论基础。根据成熟机制的不同,果实可分为两种类型:呼吸跃变型(如番茄、苹果、香蕉)和非呼吸跃变型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素

我国学者发现m6A修饰小脑发育中的新功能

  N6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰是RNA上分布最广泛的一种化学修饰,参与调控RNA的翻译、降解以及可变剪接等多个过程,在胚胎干细胞干性维持、胚胎发育、配子发生等生命活动中均发挥重要作用。m6A修饰是由METTL3、METTL14以及WTAP等构成的m6A甲基转移酶复合物催化形成的,其中METTL3

首次揭示人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化

  《自然》杂志刊发了中国科学院北京基因组研究所研究员刘江团队与中国科学院院士、山东大学附属生殖医院教授陈子江团队合作研究成果。  该研究首次揭示了人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化,并发现CTCF蛋白对于早期胚胎发育中拓扑相关结构域(TAD结构)有着重要的调控功能,为进一步揭示人类胚胎发育机

Cell-Research-肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制

  肠道菌群微生物组学是近年来研究热点,肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用,在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明,肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现,特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发

m6A修饰在头颈鳞癌免疫微环境调控中的作用机制

N6-甲基腺苷(m6A)修饰是RNA上丰度最高的修饰方式,属于转录后调控的重要机制,在各种生理和病理条件下发挥着关键作用,也给疾病治疗提供了崭新的靶点。然而,m6A在头颈鳞癌中的修饰状态以及作用模式尚不清楚。2022年4月,张志愿院士/何悦教授团队在肿瘤学权威期刊《分子癌症》(IF=41)在线发表题

小小甲基化修饰让小菜蛾“百毒不侵”

  小菜蛾作为一种世界性为害的重大农业害虫,也是世界上第一个被报道在田间对Bt生物杀虫剂产生高抗性的农业害虫。  小菜蛾能在不影响其自身生长发育的前提下对Bt杀虫剂进化出完美的高抗性。  近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所(以下简称蔬菜所)研究员张友军团队解析了小菜蛾Bt抗性的适合度代价补偿机制,首

Cell-Research发现“勤能补拙”的生物机制

研究人员利用胚后敲除Mettl3(m6A甲基转移酶)的小鼠模型系统研究了m6A修饰在成体动物高级神经系统中的功能,发现了“勤能补拙”的生物机制。长时记忆的形成是哺乳动物适应环境变化,智力发展所必需的,对于人类社会活动尤其重要。虽然以往研究已经揭示了一些与记忆形成相关的基因,但关于记忆形成效率的调控因

m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性

m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所韩大力和同济

新型RNA修饰m1A与m7G的物种保守性和动态调控条件

表观转录组学”是通过转录后修饰影响RNA的结构和功能,是近几年来生物学科里最热门的研究领域之一,目前已知的RNA修饰类型超过150种,其中包括m6A、m5C、m1A、m7G、2’-氧-甲基化、ac4C RNA乙酰化等。近期小编发现在探究RNA修饰领域中,各位m6A研究领域的鼻祖们又有了新的动作。

草莓通过调节ABA途径的方式影响果实成熟

  近日,中国科学院植物研究所研究员秦国政团队发现,RNA甲基化(m6A)修饰在不同类型果实的成熟调控中均发挥重要作用,但是作用机制有所不同。在番茄果实中,m6A修饰主要通过反馈调控DNA甲基化来发挥作用,而在草莓果实中,m6A修饰则通过调节ABA途径的方式影响果实成熟,这为阐明果实成熟调控网络提供

著名华人科学家Nature发布表观遗传重大发现

  发表在2月10日《自然》(Nature)杂志上的一项新研究,描绘了可显著促进基因转换为蛋白质的一种小化学修饰。这一研究发现与近期其他的研究结果一起,为分子生物学“中心法则”增添了一个关键的新层面:表观转录组(epitranscriptome)。  论文的资深作者、芝加哥大学化学系教授、霍华德休斯

研究发现m6A修饰增强长时记忆形成效率

  长时记忆的形成是哺乳动物适应环境变化、智力发展所必需的,对于人类社会活动尤其重要。虽然以往研究已经揭示了一些与记忆形成相关的基因,但关于记忆形成效率的调控因素与机制仍然未知。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是哺乳动物细胞中mRNA上最为普遍的修饰,自2012年以来逐渐受到广泛关注。已有多项研究表明m6

植物所揭示莱茵衣藻m6A表观转录组图谱

  m6A是广泛存在于真核生物mRNA中的表观修饰,与RNA命运相关。近年来,m6A修饰在植物胚胎发育、茎尖分生组织的命运决定、表皮毛发生、根部发育、叶形态发生、开花转变、胁迫响应、果实成熟及孢子发生等多个生物学过程中发挥重要功能。然而,m6A在藻类中的功能尚不清楚。藻类包含从单细胞到多细胞的多种细

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

综述:化学干预靶向致癌m6A修饰蛋白

  RNA表观遗传学为基因表达调控提供了一个新的切入点,以RNA m6A甲基化修饰为代表开辟了RNA表观遗传的研究新方向。首个m6A去甲基化酶FTO的发现证实了m6A修饰的动态可逆性,成为推动m6A领域发展的标志性事件。m6A修饰影响着RNA代谢的每个环节,在众多生理病理过程中有着关键作用,包括癌症

人类进化过程中诸多难点有望破解

   说一个人很“顺从”或“温顺”,或许他不会将此看作是一种恭维。不过,我们每个人,无论男人还是女人,可能都不得不适应这种称呼:一些科学家认为,“自我驯化”是人类进化的关键。在最近举行的一次会议上,他们声称“我们拥有缩小的下巴、扁平的面孔和较少的男性攻击行为,而这和与人类共同生存的很多温顺动物并无二

核酸进化相关量的变化

核酸是遗传物质,可以明显地看到在生物进化过程中各种生物每一基因组的核酸的量在总的趋势上逐渐增加。从总的趋势来看,愈是低等生物DNA量愈少,愈是高等则愈多。但是这规律对于某些生物显然并不适用,原因是多方面的。一般生物愈是高等则所需要的基因愈多(见基因),可是进化达到某一阶段以后,基因的数目便不再相应地

核酸进化相关质的变化

生物进化过程中 DNA的质也在发生变化。用分子杂交方法可以分析各种生物的DNA的相似程度(表2)。对于某一类生物来讲,例如在灵长类动物和细菌等生物中都可以用同样的方法来测定它们的亲缘关系(图1)。进化中的保守性  分子杂交测定的结果只能说明两种生物的DNA的相同或不同程度,通过DNA顺序分析才能知道

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

“RNA-甲基化”研究汇总——拟南芥篇

关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育

研究人员揭示了T细胞中m6A修饰的基本功能

由LMU和Helmholtz Munich免疫学家Vigo Heissmeyer和Taku Ito-Kureha组成的研究小组揭示了T细胞中m6A修饰的基本功能。甲基化是核酸的化学修饰,不仅存在于DNA上,也存在于RNA上。这种甲基化对某些类型的细胞是否重要,以及它对体内细胞的相互作用有什么影响,根

上海生科院发现RNA-m6A修饰和果蝇性别决定新因子

  3月19日,中国科学院上海生命科学研究院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所严冬研究组,与美国哈佛大学Norbert Perrimon研究组合作,以Xio is a component of the Drosophila sex determination pathway and RNA