天津工生所等发表Bfactor综述论文
B-factor(又称Debye-Waller factor或temperature factor)是用来描述X-射线衍射蛋白晶体结构时由于原子热运动造成的射线衰减或散射现象。由于B-factor所体现的数值(B值)可用于识别蛋白结构中的原子、氨基酸侧链及loop区域的运动性及柔性,因而广泛应用于研究蛋白动力学、筛选生物活性小分子以及蛋白质工程领域,具有极为重要的科学研究意义。然而目前缺少对B-factor研究工作全面而深入的分析及评述。B-factor应用领域 近日,中国科学院天津工业生物技术研究所研究员孙周通带领的酶分子工程与工业生物催化研究团队与德国马普煤炭所/天津工生所教授Manfred T. Reetz及上海交通大学教授冯雁联合在国际综述类期刊Chemical Reviews 发表综述文章“Utility of B-Factors in Protein Science: Interpreting Rigidit......阅读全文
天津工生所等发表Bfactor综述论文
B-factor(又称Debye-Waller factor或temperature factor)是用来描述X-射线衍射蛋白晶体结构时由于原子热运动造成的射线衰减或散射现象。由于B-factor所体现的数值(B值)可用于识别蛋白结构中的原子、氨基酸侧链及loop区域的运动性及柔性,因而广泛应用
X射线晶体定向衍射历史介绍
射线晶体衍射是人们了解原子世界的利器,这一技术为人们解析了大量的重要生物学结构。今年是这一技术的百年诞辰,本期Nature杂志以特刊形式,介绍了X射线晶体衍射的过去、现在和将来。1914年,德国科学家Max von Laue因为发现晶体中的X射线衍射现象,获得了诺贝尔物理学奖,这一发现直接催生了X射
X射线单晶体衍射仪
X射线单晶体衍射仪(X-ray single crystal diffractometer)。本仪器分析的对象是一粒单晶体,如一粒砂糖或一粒盐。在一粒单晶体中原子或原子团均是周期排列的。将X射线(如Cu的Kα辐射)射到一粒单晶体上会发生衍射,由对衍射线的分析可以解析出原子在晶体中的排列规律,也即解出
x射线单晶体衍射仪
X射线单晶体衍射仪X射线单晶体衍射仪(X-ray single crystal diffractometer,简写为XRD)。本仪器分析的对象是一粒单晶体,如一粒砂糖或一粒盐。在一粒单晶体中原子或原子团均是周期排列的。将X射线(如Cu的Kα辐射)射到一粒单晶体上会发生衍射,由对衍射线的分析可以解
X射线晶体衍射学的概述
X射线望远镜光学系统一般采用沃尔特Ⅰ型──抛物面焦点与双曲面的后焦点重合的同轴光学系统。其焦平面通过双曲面的前焦点。按照制作工艺来划分,X射线望远镜的研制已经历三代。第一代镜面是铝制的,效率为1%,1963年用这种望远镜拍摄到分辨率为几角分的照片,可看出太阳上存在着X射线发射区。第二代镜面是在光
晶体,准晶体,非晶体X一射线衍射实验的区别
晶体,准晶体,非晶体这三种物质,如果仅用肉眼是难以分辨的。固体物质是否为晶体,一般用X射线衍射法予以鉴定。晶体会对X射线发生衍射,非晶体不会对X射线发生衍射。可以通过有无衍射现象来区分晶体和非晶体。至于准晶体,它是一种介于晶体和非晶体之间的固体。用X光对固体进行结构分析,它和晶体、非晶体的结构截然不
晶体,准晶体,非晶体X一射线衍射实验的区别
晶体,准晶体,非晶体这三种物质,如果仅用肉眼是难以分辨的。固体物质是否为晶体,一般用X射线衍射法予以鉴定。晶体会对X射线发生衍射,非晶体不会对X射线发生衍射。可以通过有无衍射现象来区分晶体和非晶体。至于准晶体,它是一种介于晶体和非晶体之间的固体。用X光对固体进行结构分析,它和晶体、非晶体的结构截然不
X射线粉末衍射仪送检样品的要求
送检样品可为粉末状、块状、薄膜及其它形状。 粉末样品需要量约为0.2g(视其密度和衍射能力而定); 块状样品要求具有一个面积小于45px×45px的近似平面; 薄膜样品要求有一定的厚度,面积小于45px×45px;其它样品可咨询实验室。
X射线粉末衍射仪对样品的要求
送检样品可为粉末状、块状、薄膜及其它形状。粉末样品需要量约为0.2g(视其密度和衍射能力而定);块状样品要求具有一个面积小于45px x45px的近似平面;薄膜样品要求有一定的厚度,面积小于45px x 45px;其它样品可咨询实验室。
晶体结构的衍射测量有哪些辐射源
有些回答说X-射线激光是因为"射线强度高"就能"得到好的衍射图样"这个结论是怎么来的... 稍微了解一些衍射的物理常识也知道传统X-射线衍射中, 提升射线强度也很容易的. X-射线激光之所以牛逼, 绝对不是因为它的强度高.基本物理背景知识:X-射线衍射之所以能测定晶体结构是利用了晶体结构的周期性.
x射线单晶体衍射仪同步辐射
是一种大科学装置,设备大投资高,一般都需要政府投资,不是一般实验室所能具备的,需要 申请立项才能使用。因此,如果能发展出高强度的实验室光源和极高灵敏度的探测器,使在一般实验室中也能测定生物大分子结构,则绝对是有益的。 有许多生物反应的速度是相当快的, 如血红蛋白与一氧化碳的结合,速度在纳秒级(
X射线单晶体衍射仪的介绍
X射线单晶体衍射仪(X-ray single crystal diffractometer)。本仪器分析的对象是一粒单晶体,如一粒砂糖或一粒盐。在一粒单晶体中原子或原子团均是周期排列的。将X射线(如Cu的Kα辐射)射到一粒单晶体上会发生衍射,由对衍射线的分析可以解析出原子在晶体中的排列规律,也即解出
x射线单晶体衍射仪的应用
晶体结构的测定对学科的发展、物体性能的解释、新产品的生产和研究等方面都有很大的作用,其应用面很宽,不能尽述,略谈几点如下: (一).晶体结构的成功测定,在 晶体学学科的发展上起了决定的作用。因为他将晶体具有周期性结构这一推测得到了证实,使晶体的许多特性得到了解释:如晶体能自发长成 多面体外形(
X射线单晶体衍射仪的应用
晶体结构的测定对学科的发展、物体性能的解释、新产品的生产和研究等方面都有很大的作用,其应用面很宽,不能尽述,略谈几点如下:(一).晶体结构的成功测定,在晶体学学科的发展上起了决定的作用。因为他将晶体具有周期性结构这一推测得到了证实,使晶体的许多特性得到了解释:如晶体能自发长成多面体外形(自范性),如
X射线晶体衍射学的发现与历史
1912 年在人类的科学史上是一个重要的年份、一个里程碑式的年份,因为德国科学家劳厄(Maxvon Laue, 1879-1960)在这一年发现了X 射线晶体衍射现象,并开创了X 射线衍射物理学的研究。紧接着,英国科学家小布拉格(William LawrenceBragg,1890-1971)在
X射线晶体衍射学的理论依据
对于X 射线衍射理论的研究, 目前有两种理论:运动学和动力学衍射理论 [2] 。 运动学衍射理论 达尔文(Darwin)的理论称为X 射线衍射运动学理论。该理论把衍射现象作为三维Frannhofer 衍射问题来处理, 认为晶体的每个体积元的散射与其它体积元的散射无关, 而且散射线通过晶体时不
x射线单晶体衍射仪数据的积累
数据的积累 从前述的应用已经看出,晶体结构的测定及结构与性能关系的研究, 是今后走上人类按需设计新材料的基础。今日虽已测了许多晶体的结构,但还有许多未能测定,而且还不断有新化合物,新晶体出现, 因此不断的测定他们的结构,加以总结分析是十分必要的。当今已有多个晶体结构数据库,如: 1、剑桥结构
x射线单晶体衍射仪的应用简介
晶体结构的测定对学科的发展、物体性能的解释、新产品的生产和研究等方面都有很大的作用,其应用面很宽,不能尽述,略谈几点如下: (一).晶体结构的成功测定,在 晶体学学科的发展上起了决定的作用。因为他将晶体具有周期性结构这一推测得到了证实,使晶体的许多特性得到了解释:如晶体能自发长成 多面体外形(
X射线单晶体衍射仪的基本公式
由于晶体中原子是周期排列的,其周期性可用点阵表示。而一个三维点阵可简单地用一个由八个相邻点构成的平行六面体(称晶胞)在三维方向重复得到。一个晶胞形状由它的三个边(a,b,c)及它们间的夹角(γ,α,β)所规定,这六个参数称点阵参数或晶胞参数,见图1。这样一个三维点阵也可以看成是许多相同的平面点阵平行
x射线单晶体衍射仪的基本公式
由于晶体中原子是周期排列的,其周期性可用点阵表示。而一个三维点阵可简单地用一个由八个相邻点构成的 平行六面体(称 晶胞)在三维方向重复得到。一个晶胞形状由它的三个边(a,b,c)及它们间的夹角(γ,α,β)所规定,这六个参数称点阵参数或 晶胞参数,见图1。这样一个三维点阵也可以看成是许多相同的平
x射线单晶体衍射仪四圆衍射仪法
四圆衍射仪法 常用闪烁计数器作探测器。入射光和探测器在一个平面内(称 赤道平面), 晶体位于入射光与探测器的轴线的交点,探测器可在此平面内绕交点旋转,因此只有那些法线在此平面内的晶面族才可能通过样品和探测器的旋转在适当位置发生衍射并被记录。如何让那些法线不在赤道平面内的面族也会发生衍射并能被记
X光晶体衍射方法解析细胞炎性坏死研究新进展
来自复旦大学生命科学学院的研究人员发表了题为“Structure insight of GSDMD reveals the basis of GSDMD autoinhibition in cell pyroptosis”的文章,通过X-光晶体衍射方法解析了GSDMD-C的三维精细结构,揭示了细
x射线单晶体衍射仪衍射数据的处理一般步骤
1. 选择大小适度,晶质良好的 单晶体作试样, 收集衍射数据。 2. 指标化衍射图,求出晶胞常数,依据全部衍射线的衍射指标,总结出消光规律,推断晶体所属的 空间群。 3. 将测得的衍射强度作吸收校正,LP校正等各种处理以得出结构振幅|F|。 4. 相角和初结构的推测。常用推测相角的方法有派
简述X射线单晶体衍射仪的基本公式
由于晶体中原子是周期排列的,其周期性可用点阵表示。而一个三维点阵可简单地用一个由八个相邻点构成的平行六面体(称晶胞)在三维方向重复得到。一个晶胞形状由它的三个边(a,b,c)及它们间的夹角(γ,α,β)所规定,这六个参数称点阵参数或晶胞参数。这样一个三维点阵也可以看成是许多相同的平面点阵平行等距
简述X射线单晶体衍射仪的同步辐射
是一种大科学装置,设备大投资高,一般都需要政府投资,不是一般实验室所能具备的,需要申请立项才能使用。因此,如果能发展出高强度的实验室光源和极高灵敏度的探测器,使在一般实验室中也能测定生物大分子结构,则绝对是有益的。 有许多生物反应的速度是相当快的,如血红蛋白与一氧化碳的结合,速度在纳秒级(10
X射线在晶体上产生衍射的条件是什么
一个小晶体衍射X射线,其衍射方向是与晶体的周期性(d)有关的。一个衍射总可找到一个晶面族HKL,使它与入射线在此面族上符合反射关系,就以此面族的符号HKL作为此衍射之指数。其间关系用布拉格方程(式1)来表示。 2dHKLsinθHKL=nλ ⑴ 式中,θHKL为入射线或反射线与晶面族之间的夹角(
x射线单晶体衍射仪相关的基本公式
由于晶体中原子是周期排列的,其周期性可用点阵表示。而一个三维点阵可简单地用一个由八个相邻点构成的 平行六面体(称 晶胞)在三维方向重复得到。一个晶胞形状由它的三个边(a,b,c)及它们间的夹角(γ,α,β)所规定,这六个参数称点阵参数或 晶胞参数,这样一个三维点阵也可以看成是许多相同的平面点阵平
X射线单晶体衍射仪的发展方向
数据的积累从前述的应用已经看出,晶体结构的测定及结构与性能关系的研究,是今后走上人类按需设计新材料的基础。今日虽已测了许多晶体的结构,但还有许多未能测定,而且还不断有新化合物,新晶体出现,因此不断的测定他们的结构,加以总结分析是十分必要的。当今已有多个晶体结构数据库,如:⑴剑桥结构数据库(CSD)。
晶体结构鉴定手段或方法
X射线衍射分析、红外光谱分析X-射线粉末衍射法是利用单色X-射线照射到粉末晶体或多晶样品上,所得的衍射图称为粉末图。用粉末图谱解决有关晶体结构等问题的方法称为X-射线粉末衍射法;通常用Debye-Scherrer照相法。其优点是所需样品少,甚至0.1mg也可以测定,收集的衍生数据完全,仪器设备和试验
多晶体与单晶体的x射线衍射图有什么区别
多晶体与单晶体的x射线衍射图有什么区别单晶体固态物质分为晶体和非晶体.晶体分为单晶体,多晶体. 单晶体是指样品中所含分子(原子或离子)在三维空间中呈规则、周期排列的一种固体状态.化学药物中的原料药(一般由单一成分组成)在合适的溶剂系统中经重结晶可得到适合X射线衍射使用的单晶样品,其大小约为05mm