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B-factor（又称Debye-Waller factor或temperature factor）是用来描述X-射线衍射蛋白晶体结构时由于原子热运动造成的射线衰减或散射现象。由于B-factor所体现的数值（B值）可用于识别蛋白结构中的原子、氨基酸侧链及loop区域的运动性及柔性，因而广泛应用于研究蛋白动力学、筛选生物活性小分子以及蛋白质工程领域，具有极为重要的科学研究意义。然而目前缺少对B-factor研究工作全面而深入的分析及评述。B-factor应用领域 近日，中国科学院天津工业生物技术研究所研究员孙周通带领的酶分子工程与工业生物催化研究团队与德国马普煤炭所/天津工生所教授Manfred T. Reetz及上海交通大学教授冯雁联合在国际综述类期刊Chemical Reviews 发表综述文章“Utility of B-Factors in Protein Science: Interpreting Rigidit......阅读全文
1 X射线的产生 X射线本质上是电磁波，其波长范围大致从0.01 nm 到 10 nm，与可见光(400—700 nm)不同，X 射线的短波长可以探测物质内部的精细结构，因此自从被伦琴发现以来就被用来观测物质的内部结构。随着人造 X射线光源的亮度和稳定性的提高，其应用范围涵盖物理、化学、生物、
X射线晶体衍射技术（X-RAY CRYSTALLOGRAPHY）即将成为历史，低温电子显微技术（CRYO-ELECTRON MICROSCOPY）引起了揭示细胞内隐秘机制的革命。 在剑桥大学一幢建筑的地下室里，一场技术革命正在酝酿。 一个笨重的、大约3米高的金属盒子通过连接细胞的橙色缆线，
X射线晶体衍射技术（X-RAY CRYSTALLOGRAPHY）即将成为历史，低温电子显微技术（CRYO-ELECTRON MICROSCOPY）引起了揭示细胞内隐秘机制的革命。 在剑桥大学一幢建筑的地下室里，一场技术革命正在酝酿。 一个笨重的、大约3米高的金属盒子通过连接细胞的橙色缆线，安
2017年10月4日/生物谷BIOON/---在人们的一片猜测中，2017年诺贝尔化学奖终于揭晓了！当地时间2017年10月4日，瑞典皇家科学院在斯德哥尔摩宣布将2017年度诺贝尔化学奖授予给瑞士洛桑大学的Jacques Dubochet、美国哥伦比亚大学的Joachim
来自北卡罗莱纳州大学化学系，俄勒冈州大学生态与进化生物学中心的研究人员“复活”了4亿5千万年前的一个蛋白：脊椎动物糖皮质激素和盐皮质激素受体（glucocorticoid (GR) and mineralocorticoid (MR) receptors），寻找引起这类受体进化的变化，这一研究成果公
诺贝尔奖是以瑞典著名的化学家 阿尔弗雷德·贝恩哈德·诺贝尔的部分遗产（3100万瑞典克朗）作为基金在1900年创立的。该奖项授予世界上在物理、化学、生理学或医学、文学、和平和经济学六个领域对人类做出重大贡献的人，于1901年首次颁发，截止2016年共授予了881位个人和23个团体。今天我们将盘点
利用微细管蛋白结晶系统(MPCS)进行蛋白质晶体生长的纳升体积优化Cory J. Gerdts,a,b,c Glenn L. Stahl,a Alberto Napuli,d,e Bart Staker,a,d Jan Abendroth,a,d Thomas E. Edwards,a,d
到目前为止，蛋白质结构解析的方法主要是两种，x射线衍射和NMR。近年来还出现了一种新的方法，叫做Electron Microscopy。其中X射线的方法产生的更早，也更加的成熟，解析的数量也更多，我们知道，第一个解析的蛋白的结构，就是用x晶体衍射的方法解析的。而NMR方法则是在90年代才成熟并发展起
细胞生物膜所含的蛋白称为膜蛋白，其参与和行使了众多细胞功能，包括细胞与外界进行物质运输、信息传递、能量交换等。膜蛋白担任了各种神经信号分子、激素和其他底物的受体，构成了各种离子跨膜的通道，以及构成各类转运蛋白。在人体蛋白中，有大约 30% 是膜蛋白。FDA 批准的新药中，绝大多数都以膜蛋白为靶点
随着技术进步，发现的步伐也在加速：每年数以万计的新结构留下影像。 1914年，德国科学家Max von Laue因发现晶体如何衍射X射线而摘得诺贝尔物理学奖桂冠，这一发现直接推动了X射线晶体学的出现。从那时以来，研究人员利用衍射推算出了越来越多复杂分子的晶体结构，从简单矿物到
2019年开年不到1个月，上海科技大学迎来“开门红”——北京时间1月25日凌晨，国际顶尖期刊《Cell》同时发表了上海科技大学的两项重大科研成果，分别是：上科大免疫化学研究所领衔的科研团队率先在国际上成功解析分枝杆菌关键药靶蛋白MmpL3以及“药靶─药物”复合物的三维空间结构，揭示了创新药物杀死
外行看热闹 前两年听说低温冷冻电镜在测量蛋白质结构方面有大的突破，分辨率已经可以和最好的X射线晶体结构测定不相上下，而且不用再辛辛苦苦培养蛋白晶体，很可能近期会有人得诺贝尔奖之类。 维基百科上关于Cryo-EM的介绍链接：http://en.wikipedia.org/wiki/Cryo-e
细胞里面的生命活动井然有序，每一个部分都有其特定的结构，承担不同的功能。生物大分子则是一切生命活动的最终执行者，它们主要是核酸和蛋白。核酸携带了生命体的遗传信息，而蛋白是生命活动的主要执行者。自现代分子生物学诞生以来的半个世纪里，解析和分析生物大分子的结构、进而阐释其功能机制一直都是现代生命科学
与其他结构生物学家一样，Eva Nogales赶上了好时机。这位美国加州大学伯克利分校的教员现在可以利用新工具，解决几年前根本无法解答的细胞分子机制问题。 最近，Nogales和同事、分子生物学家、CRISPR-Cas9的联合发明人Jennifer Doudna的合作项目正是个好例子。她们都对
RNA聚合酶 与其他结构生物学家一样，Eva Nogales赶上了好时机。这位美国加州大学伯克利分校的教员现在可以利用新工具，解决几年前根本无法解答的细胞分子机制问题。 最近，Nogales和同事、分子生物学家、CRISPR-Cas9的联合发明人Jennifer Doudna的合作项目正是个好例
与其他结构生物学家一样，Eva Nogales赶上了好时机。这位美国加州大学伯克利分校的教员现在可以利用新工具，解决几年前根本无法解答的细胞分子机制问题。RNA聚合酶 图片来源：美国斯坦福大学 最近，Nogales和同事、分子生物学家、CRISPR-Cas9的联合发明人Jennifer Dou
1. Cell：中科院生物物理所王艳丽/章新政课题组从结构上揭示Cas13a切割RNA机制 doi:10.1016/j.cell.2017.06.050 CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统，被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CR
生活中的乌云总是不期而至。一位正值花季的美国女孩，突然被告知患上了一种非常难治的癌症。基因检测结果显示，她所患癌症的亚型发生率极低。 在患同一大类癌症的人群中，只有2%的人所患亚型和她一样。幸运的是，针对这一亚型恰好有一种特效药。经过不到3个月的治疗，她痊愈了。 国家蛋白质科学中心·上海
图为蛋白质科学研究（上海）设施核磁共振分析系统 生活中的乌云总是不期而至。一位正值花季的美国女孩，突然被告知患上了一种非常难治的癌症。基因检测结果显示，她所患癌症的亚型发生率极低。 在患同一大类癌症的人群中，只有2%的人所患亚型和她一样。幸运的是，针对这一亚型恰好有一种特效药。经过不到3个月
Cory J. Gerdts, Mark Elliott, Scott Lovell, Mark B. Mixon, Alberto J. Napuli, Bart L. Staker, Peter Nollert and Lance StewartMPCS是一项全新的半自动基于液滴的结晶技术，他可
X射线晶体学技术是人们了解原子世界的利器，人们通过这一技术获得了许多重要的生物学结构。在晶体学技术百年诞辰之际，Cell杂志发表了清华大学施一公教授的前沿文章。这篇综述性文章全面介绍了X射线晶体学技术和结构生物学的历史和现状，读者现在可以在Cell网站免费获取全文。 1914年，德国科学家Ma
5-羟色胺是大脑中一种至关重要的神经递质，广泛影响着人类的生理机能和行为活动，包括睡眠、情绪、认知、疼痛、饥饿和攻击性。5-羟色胺转运蛋白负责在神经传导之后将5-羟色胺回收再利用，被认为是大脑最重要的转运蛋白。俄勒冈健康与科学大学的研究人员四月六日在Nature杂志上发表文章，揭示了5-羟色胺转
2月3日，《中国科学报》获悉，为共同抗击疫情，“上海光源”特别开通“新型冠状病毒研究专项课题”绿色通道，并于2月2日提前开机，助力科学家深入了解新冠病毒微观结构、打开新冠病毒感染人体的“黑匣子”。 记者2月2日在上海同步辐射光源官网“用户开放—运行实时状态”一栏也看到，BL17U1、BL19U
在英国剑桥市一座钢结构建筑深处的地下室里，一场大规模的“叛乱”正在上演。 一个约3米高的庞大金属箱正通过消失在屋顶上的橙色粗电缆，静悄悄地发射兆兆字节的数据。这是全球最先进的冷冻电子显微镜之一：一台利用电子束为冷冻的生物分子成像并揭秘其分子形状的设备。英国医学研究委员会分子生物学实验室（LM
美国伊利诺伊理工大学一个实验室正利用纤维衍射分析人类大脑和心脏以及霸王龙化石中的组织结构。极少有研究人员利用这种X射线衍射，因为完成实验需要大量时间和人力。但由于该校Joseph Orgel实验室专门从事相关研究，因此其开展了很多定制项目。Orgel团队制作的结缔组织、神经组织和恐龙组织中细丝状
美国伊利诺伊理工大学一个实验室正利用纤维衍射分析人类大脑和心脏以及霸王龙化石中的组织结构。极少有研究人员利用这种X射线衍射，因为完成实验需要大量时间和人力。但由于该校Joseph Orgel实验室专门从事相关研究，因此其开展了很多定制项目。Orgel团队制作的结缔组织、神经组织和恐龙组织中细丝状
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc
X射线晶体学技术是人们了解原子世界的利器，人们通过这一技术获得了许多重要的生物学结构。在晶体学技术百年诞辰之际，Cell杂志发表了清华大学施一公教授的前沿文章。这篇综述性文章全面介绍了X射线晶体学技术和结构生物学的历史和现状，读者现在可以在Cell网站免费获取全文。 1914年，德国科学家Ma
3.1 MPCS实验使用MPCS microbatch-style结晶实验形成液滴，这里蛋白质和结晶试剂融合并且使用油（氟化合物FC40; Li et al., 2006; Yadav et al., 2005)包被培养。MPCS有两种类型的结晶筛选：fine-gradient screen
科学家们的一大目标就是为一系列的致命疾病设计新型药物。但是这并不容易，不仅开发成本高，而且费时费力，甚至有时是徒劳的，其中一个关键挑战在于理解一类特殊的蛋白，这也就是大多数药物的靶标。 来自亚利桑那州立大学，浙江大学，由张海涛（Haitao Zhang）研究员，Wei Liu以及Vadim C