蛋白质结构解析的方法简介

到目前为止,蛋白质结构解析的方法主要是两种,x射线衍射和NMR。近年来还出现了一种新的方法,叫做Electron Microscopy。其中X射线的方法产生的更早,也更加的成熟,解析的数量也更多,我们知道,第一个解析的蛋白的结构,就是用x晶体衍射的方法解析的。而NMR方法则是在90年代才成熟并发展起来的。这两种方法各有优点和缺点。首先来说一下,这两种方法的一般的步骤和各自的优点和缺点。电子显微镜(electron microscopy)作为一种新型的技术,目前的应用还是非常少,并且比较狭窄,我可能等到最后在给它作些介绍,而且相信绝大多数人也没有听说过,也不会有很大的兴趣。首先是X晶体衍射。首先要得到蛋白质的晶体。通常,都是将表达蛋白的基因PCR之后克隆到一种表达载体中,然后在大肠杆菌中诱导表达,提纯之后摸索结晶条件,等拿到晶体之后,工作便完成的80%,将晶体进行x射线衍射,收集衍射图谱,通过一系列的计算,很快就能得到蛋白质的原子......阅读全文

蛋白质结构解析的方法简介

到目前为止,蛋白质结构解析的方法主要是两种,x射线衍射和NMR。近年来还出现了一种新的方法,叫做Electron Microscopy。其中X射线的方法产生的更早,也更加的成熟,解析的数量也更多,我们知道,第一个解析的蛋白的结构,就是用x晶体衍射的方法解析的。而NMR方法则是在90年代才成熟并发展起

关于βBGT蛋白质结构的简介

  β-银环蛇毒素最初是从台湾银环蛇(Bungarus multicinctus)中分离鉴定出的为突触前碱性多肽神经毒素,由A链和B链两条链构成,其分子量为20~22kD,等电点为8.8~9.7。A链通过Cys15和B链的Cys55相连,把2条链连接起来。 [27] A链含120个氨基酸,有13个半

蛋白质三维结构解析固体核磁共振方法获进展

  中国科学院武汉物理与数学研究所波谱与原子分子物理国家重点实验室的杨俊研究组,在发展蛋白质高分辨三维结构的固体核磁共振测定新技术和新方法方面取得重要进展,相关研究结果于近日在《美国化学会》(J. Am. Chem. Soc.)上在线发表。   相对于液体核磁共振和X射线晶体衍射技术

祝贺!人工智能首次成功解析蛋白质结构

  生物学界最大的挑战之一——蛋白质三维结构解析如今有望被破解。谷歌旗下人工智能公司DeepMind开发的深度学习程序AlphaFold能够精确预测其三维形状。长久以来,人们需要借助实验确定完整的蛋白质结构,这些方法往往需要数月甚至数年时间。而现在,人工智能也有能力给出精确预测的计算方法,可能只要几

端粒的结构解析

端粒是短的多重复的非转录序列(TTAGGG)及一些结合蛋白组成特殊结构,除了提供非转录DNA的缓冲物外,它还能保护染色体末端免于融合和退化,在染色体定位、复制、保护和控制细胞生长及寿命方面具有重要作用,并与细胞凋亡、细胞转化和永生化密切相关。当细胞分裂一次,每条染色体的端粒就会逐次变短一些。构成端粒

端粒的结构解析

  端粒是短的多重复的非转录序列(TTAGGG)及一些结合蛋白组成特殊结构,除了提供非转录DNA的缓冲物外,它还能保护染色体末端免于融合和退化,在染色体定位、复制、保护和控制细胞生长及寿命方面具有重要作用,并与细胞凋亡、细胞转化和永生化密切相关。当细胞分裂一次,每条染色体的端粒就会逐次变短一些。  

端粒的结构解析

端粒是短的多重复的非转录序列(TTAGGG)及一些结合蛋白组成特殊结构,除了提供非转录DNA的缓冲物外,它还能保护染色体末端免于融合和退化,在染色体定位、复制、保护和控制细胞生长及寿命方面具有重要作用,并与细胞凋亡、细胞转化和永生化密切相关。当细胞分裂一次,每条染色体的端粒就会逐次变短一些。构成端粒

端粒的结构解析

端粒是短的多重复的非转录序列(TTAGGG)及一些结合蛋白组成特殊结构,除了提供非转录DNA的缓冲物外,它还能保护染色体末端免于融合和退化,在染色体定位、复制、保护和控制细胞生长及寿命方面具有重要作用,并与细胞凋亡、细胞转化和永生化密切相关。当细胞分裂一次,每条染色体的端粒就会逐次变短一些。构成端粒

关于蛋白质二级结构的β转角简介

  多肽链中出现的180°回折的结构称为β转角(β-bend)或β回折(β-turn),即U型转折结构。它是由四个连续氨基酸残基构成,第2个氨基酸残基多为脯氨酸,甘氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺也常出现在β转角结构中,第一个氨基酸残基的羰基与第四个氨基酸残基的亚氨基之间形成氢键以维持其稳定。  常见的转角

蛋白质沉淀浓缩方法原理及详细解析

在生化制备中,沉淀主要用于浓缩目的,或用于除去留在液相或沉淀在固相中的非必要成分。在生化制备中常用的有以下几种沉淀方法和沉淀剂:1.盐析法多用于各种蛋白质和酶的分离纯化。2.有机溶剂沉淀法多用于生物小分子、多糖及核酸产品的分离纯化,有时也用于蛋白质沉淀。3.等电点沉淀法用于氨基酸、蛋白质及其它两性物

大难题告破,蛋白质3D结构可用AI解析

  DeepMind关于确定蛋白质3D形状的深度学习技术,可能将在生物学界掀起一场新的变革。图中蓝色为计算机预测的蛋白质结构,绿色为实验验证结果,二者相似度非常高。(图片来源:DeepMind) 生物学界最大的挑战之一——蛋白质三维结构解析如今有望被破解。借由深度学习程序AlphaFold,谷歌

对于酶标仪的​结构解析

  酶标仪即酶联免疫检测仪。是酶联免疫吸附试验的专用仪器又称微孔板检测器。可简单地分为半自动和全自动两大类,但其工作原理基本上都是一致的,其核心都是一个比色计,即用比色法来进行分析。 测定一般要求测试液的最终体积在250μL以下,用一般光电比色计无法完成测试,因此对酶标仪中的光电比色计有特殊要求。

武汉物数所蛋白质动态学研究助力重要蛋白结构解析

  近日,中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳课题组利用基于973重大科学研究计划“蛋白质动态学研究的新技术新方法”建立的研究技术,协助华中农业大学教授殷平课题组首次解析了N6腺嘌呤甲基转移酶METTL3-METTL14蛋白复合体结构,该研究成果发表于《自然》杂志。  该工作揭示了RNA N6腺

武汉物数所蛋白质动态学新技术助力重要蛋白结构解析

  近日,中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳课题组利用基于973重大科学研究计划“蛋白质动态学研究的新技术新方法”建立的研究技术,协助华中农业大学教授殷平课题组首次解析了N6腺嘌呤甲基转移酶METTL3-METTL14蛋白复合体结构,该研究成果发表于《自然》杂志。  该工作揭示了RNA N6腺

蛋白质、多肽液相纯化方法简介

修饰肽纯化的一般目标和方法    首先,自然来源或者重组表达的蛋白质经过一些粗提的步骤(例如:匀浆、离心、硫酸铵沉淀等)成为稳定的可以用于色谱分离的样品。然后进行捕获色谱(capture chromatography),主要目标是浓缩和去除大量的容易去除的杂质,此步zui关心的是流速和载量,常采用高

蛋白质一级结构的测定方法(一)

   研究蛋白质的一级结构从确定组成蛋白质的单元结构棗氨基酸算起,已有150年的悠久历史,直到1955年,Sanger首次阐明胰岛素的氨基酸排列顺序,为研究蛋白质的一级结构开辟了道路。这在分子生物学的发展进程中是一个重要突破。目前关于核酸的一级结构研究,由于Sanger等发明了加减法,可以得到了突

蛋白质一级结构的测定方法(二)

   2)末端分析 其方法较多,这里我们只介绍较常用的几种。  (1)N-末端测定  A.二硝基氟苯法(FDNB,DNFB):1945年Sanger提出此方法,是他的重要贡献之一。  DNP-氨基酸用有机溶剂抽提后,通过层析位置可鉴定它是何种氨基酸。Sanger用此方法测定了胰岛素的N末端分别为甘

蛋白质一级结构的测定方法(三)

   2)酶解法  酶水解法较化学法具有更多的优越性,使用也更广泛。因其具有较高专一性,而且水解产率较高,所以可以选择各种不同专一性的酶进行专一性的断裂。  常用的酶有胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶和嗜热菌蛋白酶。  胰蛋白酶专一断裂Lys,Arg的羧基侧肽键,如果对Lys,Arg,CysH进行化学修

热解析仪的运行方法解析

热解析仪采用填充有吸附剂的玻璃管捕获的有机化合物,然后将它们导入气相色谱仪中,通过气相色谱,这些有机化合物得到分离和测定。 热解析仪的运行方法: 1.在开机自检完成界面,按运行键进入加热准备状态界面,等待解析温度、阀箱温度和管路温度分别达到各自的设定温度,然后仪器进入状态就绪界面。(按状态键可随时查

蛋白质沉淀(Protein-Precipitation)浓缩方法原理及详细解析2

二.硫酸铵的使用硫酸铵中常含有少量的重金属离子,对蛋白质巯基有敏感作用,使用前必须用H2S处理:将硫酸铵配成浓溶液,通入H2S 饱和,放置过夜,用滤纸除去重金属离子,浓缩结晶,100℃烘干后使用。另外,高浓度的硫酸铵溶液一般呈酸性(PH=5.0左右),使用前也需要用氨水或硫酸调节至所需PH。硫酸

蛋白质沉淀(Protein-Precipitation)浓缩方法原理及详细解析1

在生化制备中,沉淀主要用于浓缩目的,或用于除去留在液相或沉淀在固相中的非必要成分。在生化制备中常用的有以下几种沉淀方法和沉淀剂:1.盐析法多用于各种蛋白质和酶的分离纯化。2.有机溶剂沉淀法多用于生物小分子、多糖及核酸产品的分离纯化,有时也用于蛋白质沉淀。3.等电点沉淀法用于氨基酸、蛋白质及其它两性物

蛋白质沉淀(Protein-Precipitation)浓缩方法原理及详细解析3

二.生成盐复合物沉淀法1.金属复合盐法许多有机物质包括蛋白在内,在碱性溶液中带负电荷,能与金属离子形成沉淀。根据有机物与它们之间的作用机制,可分为羧酸、胺及杂环等含氮化合物类,如铜锌镉;亲羧酸疏含氮化合物类,如概镁铅;亲硫氢基化合物类,如汞银铅。蛋白质-金属离子复合物的重要性质是它们的溶解度对溶液的

解析蛋白质的盐溶、盐析和变性

  在中学化学教学中,在讲到油脂、蛋白质以及胶体时,经常要解释油脂皂化反应后高级脂肪酸钠与甘油的分离,为何要加细小食盐颗粒?食盐是如何使高级脂肪酸钠从溶液中析出的?在蛋白质溶液中为何加少量的硫酸铵能促进蛋白质的溶解,而加高浓度的硫酸铵却会使蛋白质析出呢?而硫酸铜溶液同样是盐溶液却使析出的蛋白质不像前

蛋白质整体的结构

 蛋白质是以氨基酸为基本单位构成的生物大分子。蛋白质分子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构构成了蛋白质结构的多样性。蛋白质具有一级、二级、三级、四级结构,蛋白质分子的结构决定了它的功能。     一级结构:蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,以及二硫键的位置。     二级结构:蛋白质分子局区域内,多肽

蛋白质的基本结构

蛋白质是以氨基酸为基本单位构成的生物高分子。蛋白质分子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构构成了蛋白质结构的多样性。蛋白质具有一级、二级、三级、四级结构,蛋白质分子的结构决定了它的功能。一级结构(primary structure):氨基酸残基在蛋白质肽链中的排列顺序称为蛋白质的一级结构,每种蛋白质都

聚集态蛋白质相互作用组的交联解析方法获揭示

近日,我所蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组(02T5组)刘宇研究员团队、生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队,以及西湖大学张鑫教授团队等合作,通过系统性调控绿色荧光蛋白发色团的骨架结构,实现分子的三重态化学活性,并用于活细胞内聚集态蛋白质的靶向交联,获得了聚集态蛋白质的相互作

探测包含体中蛋白质肽链结构的方法

由于包含体的特性,很难利用物理的方法去探测包含体中蛋白质肽链的结构。 Zetlmeissl等人利用圆二色的方法,发现聚集体的肽链保持了部分的二级结构。利用Raman测定的方法也得出了相同的结论。利用ATR-FTIR发现包含体蛋白质的结构比天然的蛋白质和盐沉淀的蛋白质含有更多的非天然状态的折叠的结构

蛋白质、多肽液相色谱纯化方法简介

 修饰肽纯化的一般目标和方法    首先,自然来源或者重组表达的蛋白质经过一些粗提的步骤(例如:匀浆、离心、硫酸铵沉淀等)成为稳定的可以用于色谱分离的样品。然后进行捕获色谱(capture chromatography),主要目标是浓缩和去除大量的容易去除的杂质,此步zui关心的是流速和载量,常采用

蛋白质、多肽液相色谱纯化方法简介

1、纯化的一般目标和方法首先,自然来源或者重组表达的蛋白质经过一些粗提的步骤(例如:匀浆、离心、硫酸铵沉淀等)成为稳定的可以用于色谱分离的样品。然后进行捕获色谱(capture chromatography),主要目标是浓缩和去除大量的容易去除的杂质,此步最关心的是流速和载量,常采用高载量、

蛋白质、多肽液相色谱纯化方法简介

1、纯化的一般目标和方法首先,自然来源或者重组表达的蛋白质经过一些粗提的步骤(例如:匀浆、离心、硫酸铵沉淀等)成为稳定的可以用于色谱分离的样品。 然后进行捕获色谱(capture chromatography),主要目标是浓缩和去除大量的容易去除的杂质,此步最关心的是流速和载量,常采用高载量、快流速