缺乏数据使用指导原则,基因组数据共享遇阻
基因组数据共享将生物医学研究推向快车道,但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性,另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。 在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来,这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用者对公共数据的使用有着不同的解释和持续的争论。 “根源在于缺乏数据使用的明确指导原则。”在接受《中国科学报》采访时,Kyrpides再次强调,公共数据应该被视为开放资源,不受限制地被用于分析、解释和发布。相关论文近日在线发表于《科学》。 时不时遇到“软障碍” 公共基因组数据使用自由是国际生命科学研究领域的传统与共识,自人类基因组计划实施以来,大量的开放共享基因组数据信息极大地促进了生物医学研究的进步。 1990年启动并有我国参与的人类基因组计划被看成科学史上的伟大工程,3年前,该计划负责人Eric Green、James Wa......阅读全文
缺乏数据使用指导原则,基因组数据共享遇阻
基因组数据共享将生物医学研究推向快车道,但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性,另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。 在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来,这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用
美国推进癌症基因数据共享
美国麦利亚德基因公司(Myriad Genetics)拥有关于乳腺癌和卵巢癌的两个基因的ZL,这让它们垄断乳腺癌检测的行业多年。虽然美国最高法院在去年六月已经对这两个基因的ZL做了无效判决,但该公司仍然掌握这独有的130万份的检测数据。这些信息则使得麦利亚德公司在检测结果解释上有巨大优势。但是遗
太原监测观测数据共享
山西省太原市环保局与市气象局近日就共同开展空气质量预报预警工作机制进行首次会商,确定从11月起,两部门联手对太原环境空气质量开展预报预警,以便有效控制空气污染。 太原市环保和气象部门在现有空气质量实时监测发布的基础上,建立了空气质量预报预警机制。每日由环保部门制作前日空气质量日报,双方同时
共享激光雷达数据集
3D 激光雷达数据可公开共享给众多用户和同事。共享激光雷达数据的两个主要方法是通过 Web 共享或通过文件系统共享。通过文件系统共享任何文件都可通过文件系统或 ArcCatalog 进行共享。只需记住,移动文件会使引用的数据源的链接断开。例如,复制、重命名或删除 LAS 数据集或汇总数据会导致 LA
我国超级稻基因组数据从“云端”向全球共享
“我们的3000份绿色超级稻基因组原始测序数据,覆盖了全球25万份种质基因全部遗传变异的95%。这份核心数据,将正式通过阿里云平台,向全球免费开放。”9月15日,中国农业科学院、阿里云计算有限公司、华智水稻生物技术有限公司、北京聚道科技有限公司在长沙共同启动“云之稻项目”,中国农科院农作物基因资
农科院棉花所开放棉花资源和基因数据共享
12月31日,由中国农业科学院棉花研究所生物信息与分子设计中心构建的棉花资源和网络数据库网站正式上线。用户可在该网站上进行数据挖掘和分析、可视化展示等,操作简单快捷,结果准确易懂。 该数据库网站(Gossypium Resource And Network Database,GRAND)目前主
土壤速测数据如何指导施肥?
土壤养分速测数据要想科学指导施肥必须经过以下步骤:1.首先用锦农测土仪准确测试土壤。2.依据锦农速测丰缺指标(国内多数厂家已在普遍推广使用我丰缺指标,在此鉴于大家对测土施肥事业服务的精神,我公司保留起诉的权利),判断土壤肥力水平。3.判断土壤肥力水平后,根据种植作物种类、品种、产量等,依据锦农实用配
解读美材料基因组计划:数据共享乃大势所趋
美国的材料基因组计划(MGI)启动至今已有两年,5位专家日前在《自然》杂志撰文,指出材料科学家应该如何在该计划中实施工作。 Sally Tinkle: 借鉴其他项目 华盛顿科技政策研究所政策分析师 MGI由总统巴拉克·奥巴马于2011年6月启动,旨在将应用于能源、交通和安全等领
-AACR:“GENIE”呼之欲出,志在共享癌症基因组临床数据
11月6日,Genomeweb报道,美国癌症研究协会(AACR)推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目,旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。 该项目中的“GENIE”寓意Genomics(基因组学)、Evidence(证据)、Neoplasia(肿瘤)Inform
解读美材料基因组计划:数据共享乃大势所趋
MGI于2011年6月启动,旨在将应用于能源、交通和安全等领域的先进材料的开发时间和资金成本减半。 美国的材料基因组计划(MGI)启动至今已有两年,5位专家日前在《自然》杂志撰文,指出材料科学家应该如何在该计划中实施工作。 Sally Tinkle:借鉴其他项目 华盛顿科技政策研究
保护亚洲主要河流急需共享数据
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519646.shtm
英推迟大型医疗数据共享项目
近日,一个获得很多科研团体大力支持的庞大计划被推延,该计划旨在创建一个覆盖全英国的医疗记录数据库。此举遭致很多争议,一些病人决定退出该计划。 “关怀·数据”项目原计划收集来自英国全科医生的病人数据(目前这些数据归当地机构管理)。之后,这些数据将向医学研究人员开放。研究慈善机构对该项目格外重
呼吁数据共享!数据烂手里,何谈研究话语权?
导 读 在大气、海洋、冰川等需要国际合作的研究领域,中国普遍缺乏拿得出手的高质量数据。问题出在了哪里? “我们国家在数据方面基本没有话语权。” 在谈到IPCC报告里鲜有来自中国的数据时,A学者不无感慨地告诉《知识分子》。这位要求匿名的研究者举例说,在2013年第五次IPCC报告中,为决策者
国内首个乙肝病毒基因多功能共享数据库建成
近日,国内首个乙型肝炎病毒基因多功能共享数据库在解放军302医院建成并投入使用,其收录了我国10000余例患者乙型肝炎病毒基因序列、基因克隆和相关临床资料,具有较强的生物信息学分析功能,为研究我国患者乙型肝炎病毒基因变异与耐药、分子致病机制、疫苗设计和免疫应答等提供了共享信息平台,也可
23andMe联手iPhone,共享DNA数据
业界知名基因检测公司23andMe正计划让他们的客户通过iPhone分享个人的基因信息。只要用户许可,这些信息能够与手机中储存的其他健康数据一起,交由研究机构分析。这样一来,每个人的基因信息与健康数据就能一一对应,加深我们对健康和疾病的理解。通过这些公司的不断合作与创新,相信我们的未来会变得更为
标准先行打造地区数据共享高速通道
自全国首个政务服务领域长三角区域地方标准《电子证照共享应用规范》(以下简称《规范》)发布实施以来,政务服务业务互认、数据互通、技术相容加速推进,以“软联通”推动长三角一体化进一步深度融合创新发展。《规范》规定了长三角区域电子证照跨省共享的流程、范围、接口,以及应用场景等技术要求,确保电子证照跨省共享
数据共享有很多难题待解
自科技部启动第一批科学数据共享项目,到涉及地球系统科学、人口与健康科学等领域的6个科学数据共享平台被纳入首批认定的23个国家科技基础条件平台,我国在科学数据共享运行机制和管理模式上,实现了从项目建设到“以用为主、开放共享”的长期运行服务模式的转变。 在这个过程中,我国重大科研项目产生的数据
标准先行打造地区数据共享高速通道
自全国首个政务服务领域长三角区域地方标准《电子证照共享应用规范》(以下简称《规范》)发布实施以来,政务服务业务互认、数据互通、技术相容加速推进,以“软联通”推动长三角一体化进一步深度融合创新发展。《规范》规定了长三角区域电子证照跨省共享的流程、范围、接口,以及应用场景等技术要求,确保电子证照跨省共享
CNAS能力验证数据将实现全球共享
欧洲能力验证数据库(EPTIS)是全球最大的非盈利能力验证数据库,目前年均拥有来自欧洲、美洲、亚洲、大洋洲的区域约350家能力验证提供者、逾3000项能力验证计划,年均注册用户数超5万。 目前,我国在EPTIS的注册用户数超过7000,位居全球第一,体现了我国实验室参加能力验证的强烈需求。但由
WHO加入科学数据开放共享“S计划”
8月29日,世界卫生组织(WHO)宣布加入由欧盟牵头旨在免费获取由公共资金资助的科研论文“S计划”,成为“S联盟”(Coalition-S)的一员,要求在世卫组织资助下产生的科研论文自发表之日起实现免费在线阅读。 世卫组织是联合国系统中第一个加入“S联盟”的机构,是对“S计划”的强力支持。世卫
23andMe联手iPhone,共享DNA数据
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等位[基因]共享法的定义
中文名称等位[基因]共享法英文名称allele-sharing method定 义鉴别受累者亲属获得相同等位基因或染色体区段的概率是否大于随机抽样个体的预期概率的一种遗传学研究方法。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
乔杰委员:完善健康大数据共享机制
健康医疗大数据蕴藏了丰富的居民健康状况、卫生服务利用等海量信息,是人民健康保障的数据金矿和证据源泉。然而,目前我国医院诊疗和医保等健康医疗大数据利用缺乏完善的共享机制。数据共享多局限于政府、医疗机构、科研院校等组织,尚未形成面向广大专业机构、团队开放共享的原则、规范、标准。为此,建议制定和完善相关法
24所高校签约,高校数据共享应用
2月23日下午,由教育部教育管理信息中心和北京大学联合主办的高校数据共享应用签约仪式暨工作推进研讨会在北京大学英杰交流中心阳光厅举行。此次签约标志着“高校数据共享应用平台”的正式发布,意味着高校数据要素资源体系建设再次升级,向着构建数据共建共享新生态的目标迈出了坚实的一步。教育部教育管理信息中心主任
打造面向开放科学的“数据共享”新未来
“对于全球科技期刊来讲,开放科学带来了学术交流模式的变革,从原来传统的学术交流模式,转向新型的学术交流模式。”8月25日,中国科学院文献情报中心副主任、研究馆员张智雄在第十七届中国科技期刊发展论坛“开放科学与科学数据共享下的我国科技期刊新格局、新业态”高峰论坛上表示。 我国科技期刊在开放科学与数
Nature:大型研究的数据共享陷入困境
Eric Dishman在大学时(1989年)被检出患有某种罕见的肾脏癌症,当时医生曾告诉他只有两三年可活。这么多年来,他已经接受了很多不同的治疗,这些治疗都没有很好的效果。然后他开始怀疑,自己可能并不是得了肾脏癌症,而有可能是其他病症。五年前,他请研究机构测序了自己的全基因组,并将数据寄给了肿
科学数据开放共享:打破心中的“科研围墙”
“单打独斗”式的科研既难以适应时代要求,也不利于科研人员自身成长,应当多一些合作共享的意识,形成开门搞科研的文化 最近,我国首次出台《科学数据管理办法》,意在大力推进科学数据资源的开放共享。此举一出,得到科技界广泛好评。 之所以要在国家层面来推进“开放共享”,是因为长期以来一些科研院所、高
国家海洋科学数据共享服务平台发布
我国海洋数据共享迈出重要一步。作为首批通过认定的8个重点领域科学数据共享平台之一,在19日举行的“2018中国海洋信息技术高端论坛”上,国家海洋科学数据共享服务平台正式发布。共享信息包括海洋多学科实测数据、分析预报产品和专题信息等,可以服务于海洋经济发展、环境保护、海域海岛管理、防灾减灾、权益维
医疗大数据共享及应用的浙江模式
医疗人工智能行业的快速发展对医疗大数据的需求日益增加,然而“数据孤岛”的存在一定程度上成为医疗人工智能产业发展的瓶颈。国家从14年开始相继出台多项重磅政策推动医疗大数据产业的应用。 2014年国家卫计委制定“46312”工程,其中,“4”代表4级卫生信息平台,分别是:国家级人口健康管理平台,省
基因检测指导淋巴瘤治疗
在以实验血液学进展为主题的中国青年科学家论坛上,来自国内血液系统恶性肿瘤诊疗、造血干细胞移植等领域的专家们交流了最新研究成果,其中“淋巴瘤预后相关基因”的研究引起了与会者浓厚的兴趣。 抗生素治淋巴瘤不是没可能 一项由北京大学第三医院血液科主任克晓燕教授与北大医学部病理系