缺乏数据使用指导原则,基因组数据共享遇阻
基因组数据共享将生物医学研究推向快车道,但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性,另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。 在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来,这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用者对公共数据的使用有着不同的解释和持续的争论。 “根源在于缺乏数据使用的明确指导原则。”在接受《中国科学报》采访时,Kyrpides再次强调,公共数据应该被视为开放资源,不受限制地被用于分析、解释和发布。相关论文近日在线发表于《科学》。 时不时遇到“软障碍” 公共基因组数据使用自由是国际生命科学研究领域的传统与共识,自人类基因组计划实施以来,大量的开放共享基因组数据信息极大地促进了生物医学研究的进步。 1990年启动并有我国参与的人类基因组计划被看成科学史上的伟大工程,3年前,该计划负责人Eric Green、James Wa......阅读全文
加拿大对新食品全基因组测序数据指导书等征询意见
2017年5月31日,加拿大卫生部在其官方网站上发布消息,加拿大卫生部拟对全基因组测序数据来做新食品上市前评估指导书向公众征求意见。该指导书是加拿大食品检验署和卫生部制定的、根据申请者应该在组织和提交全基因组测序时应考虑的原则和良好操作规则、且作为新食品上市前申请书一部分内容而制定。评议期至20
全球共享的基因组数据库办不下去了,怎么办?
1资金困境 作为世界上最具权威性的人类疾病相关的基因目录第五十个生日时,它面临着令人不安的变化。在接下来的几年里,美国国家人类基因组研究所(NHGRI)预计退出作为基因组数据库的始祖——称为在线人类孟德尔遗传(OMIM)唯一的资助者。谁将继承标签尚未明确。当美国国家卫生研究院(NIH)评估其数
英研究者呼吁公众同意共享医疗数据
英研究人员呼吁公众同意公开医疗数据。图片来源:英国医疗研究慈善协会 1月10日,英国医学研究慈善机构建议英国居民允许科学家接触来自英国国民保健制度(NHS)的病人资料。为了能将这些科学家的请求以广告形式投放在英国各大媒体上,该慈善机构卷入了一场激烈的全国辩论中。 NHS的病人数据目前
开放课程创始人望共享数据能回馈教学
尽管收集可获得的在线学术材料的想法日益增多,如从文章和数据集到会议报告和讲座,但有一种学术文献却几乎未得到审核。那就是教学大纲:列出阅读材料、话题以及大学课程所期望的材料。 至少,在今年1月,当美国纽约哥伦比亚大学的数据科学家、社会学家和数字—人文研究人员发起一个叫作“开放课程资源管理器”的工
吴仲义蒲慕明再次呼吁及时公开共享数据
截至2020年2月10日,共有55条2019-nCoV的病毒基因组可公开获取。其中,在1月22日以前获取的31份测序数据几乎全部来自于中国(仅有1例来自于美国)。然而1月22日以后,余下的24份数据一律源于境外,包括日本、韩国、新加坡、澳大利亚、美国、法国、英国等。 国内学术界对于所谓“高影
重磅!ctDNA检测纳入医保,跨界推进数据共享
医疗保险机构Palmetto最近宣布已将体细胞变异ctDNA分析测试纳入其保险范围。“我们应该鼓励各大临床实验室向ClinVar提交体细胞变异检查报告以及有关的临床表型分析结果。”Palmetto说。ClinVar是一家免费基因型和表型数据供应机构,由NIH于3年前创立。迄今为止,已经有超过50
科研数据难共享阻碍国内生物科技发展
上海生物信息技术研究中心主任李亦学的“科研数据共享之梦”已做了13年。但在近日举行的首届金桥产业技术创新会议上,当记者向他问及相关进展时,听到的却是一声叹息。 13年前,“大数据”尚未被任何字典收录,而今却被公认是全球生命科学研究的核心工具。李亦学告诉记者,科研数据难以共享已成为国内生命科
在科技管理中,让科学数据“开放共享”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/480134.shtm 作为世界上首颗可持续发展目标监测卫星,可持续发展科学卫星1号预计今年9月向全球开放,将产生大批的科学数据。这些数据如何管理、怎么用,牵动着全球科研界的目光。 “我们承诺获得的
刘伟:生物多样性数据共享现状和建议
数据共享对于科学发展和大科学研究模式至关重要,也是各国政府部门科学决策的重要基础,备受关注。 在信息时代的背景下,生物多样性领域面临的一个重要挑战是如何有效地共享及整合生物多样性数据。 生物多样性数据共享的重要性至少体现在三个方面:一是拓展生物多样性相关领域研究的深度和广度需要数据共享;二是
闫冬梅|搭建共享桥梁的地球大数据管家
闫冬梅 中科院空天信息创新研究院供图 科学大数据,是当今时代的战略性资源,是科技创新发展的重要基础。 2018年,中国科学院正式启动“地球大数据科学工程”先导专项,为“一带一路”“数字中国”、人类命运共同体和联合国可持续发展目标等提供科技支撑和决策支持。 海量数据汇聚于此,如何管理
ETSData交通数据共享平台被DCI收录
近日,由清华大学出版社与清华大学车辆与运载学院共同设计搭建的ETS-Data交通数据共享平台(https://ets-data.sciopen.com),被基于Web of Science核心合集平台的数据引文索引数据库DCI(Data Citation Index)收录,成为该库收录的首个中国
郑国光:中国积极推动地球观测数据共享
据气象局网站消息,中国气象局局长郑国光3日表示,中国政府高度重视地球观测,在未来5年中国将积极推动地球观测数据在非洲及亚太地区共享和应用。 11月3日,地球观测组织(GEO)第七次全会新闻发布会在北京国家会议中心举行。GEO联合主席、中国气象
刘伟:生物多样性数据共享现状和建议
数据共享对于科学发展和大科学研究模式至关重要,也是各国政府部门科学决策的重要基础,备受关注。 在信息时代的背景下,生物多样性领域面临的一个重要挑战是如何有效地共享及整合生物多样性数据。 生物多样性数据共享的重要性至少体现在三个方面:一是拓展生物多样性相关领域研究的深度和广度需要数据共享;二是
研究发现狗狗与人共享“肥胖基因”
不仅人类会遇到肥胖问题,狗狗也会。 据法新社报道,在美国《科学》杂志6日发布的一篇文章中,研究人员通过收集241只拉布拉多犬的口水样本并进行全基因组关联研究,发现一种名为DENND1B的基因与宠物狗肥胖密切相关,也与人类体重增加有关。 据英国广播公司介绍,该基因同样存在于人类中,会干扰大脑中
大数据协同安全技术国家工程实验室-将共享数据资源
2017年7月4日,大数据协同安全技术国家工程实验室授牌仪式暨第二次工作会议在京举行。360企业安全集团、中电长城网际系统应用有限公司、中国信息安全测评中心、国家互联网应急中心、公安部第三研究所、国家信息中心、中国信息通信研究院、北京中测安华科技有限公司、中国科学院信息工程研究所、哈尔滨安天科技
新技术可构建细胞发育指导基因
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/481918.shtm 科技日报北京6月30日电 (记者张梦然)美国纽约大学研究人员利用新的合成DNA技术和干细胞基因工程,创造了人工Hox基因,其能规划和指导细胞去哪里发育组织或器官。近日发表在《科学
什么是化学药物用药指导基因检测
化学药物用药指导基因检测是进行个体化治疗的手段之一,就是检测个体中涉及编码药物代谢酶、转运体、作用靶点等的基因,从而确定个体对药物的敏感性、疗效、不良反应等。通过化学药物用药指导基因检测的结果,可以为实施个体化的临床用药方案奠定基础,从而降低药物不良反应的发生率、提高药物的安全性与有效性。 比
化学药物用药指导基因检测是什么
化学药物用药指导基因测定是安全用药基因检测服务,也是针对与药物反应相关的基因密码进行解读,预测患者对于不同药物的不良反应程度,对临床用药起到一定的指导作用。 参考基因检测的结果,医生可以在开处方时,在药品选择、剂量控制及联合用药等方面提出适合每个患者自己的个体化用药方案,最终达到提高药物疗效、
基因突变检测指导癌症靶向治疗
肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性,不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效,基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突
首批《海洋数据开放共享目录》和首个“海洋云”发布
6月8日,在第16个世界海洋日暨第17个全国海洋宣传日上,自然资源部公开发布首批《海洋数据开放共享目录》和全国首个国家海洋大数据服务平台(海洋云)。海洋数据的开放共享是增强海洋经济发展新动能、支撑自然资源精细化管理、深度参与全球海洋治理、构建海洋命运共同体的必然要求,是加快海洋强国和数字中国建设的重
中科院发布“地球大数据共享服务平台”
15日,中国科学院召开新闻发布会,正式发布了“地球大数据科学工程”的最新成果——地球大数据共享服务平台,构建了一种数据共享的新模式。 地球大数据共享服务平台是集成多领域海量数据,服务数据驱动的科学发现与决策支持的科学平台。该平台以共享方式为全球用户提供系统、多元、动态、连续并具有全球唯一标识
科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库
水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物,同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累,使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此,研究人员构建了相关的水稻数据库,主要包括RAP-DB(日本农业生物资源研究所构建的水稻注释
ACMG发布基因变异解读标准及指导原则
美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)联合分子病理学学会(AMP)发布了基因变异的解读标准及指导原则,发表在2015年5月的《Genetics in Medicine》上。对于那些想要确定患者的遗传变异是否与疾病相关的实验室和遗传学家而言,这是很好的指南和资源。 《标准》的主要内容
英科学家推动共享实验动物组织细胞数据
新华社电 英国利兹大学1月13日说,目前世界各国已有200多位科研人员加入该校教授领衔建立的动物细胞组织共享数据库,随着这种实验材料共享行为不断普及,未来科学实验中活体动物的使用量有望减少。 据利兹大学介绍,这个数据库自2014年正式成立以来,目前已涵盖了近90种动物模型的细胞组织资源,欧洲、
日本711等成立实验室共享大数据
日本Seven &i 控股公司建立了共享和解析各行业大数据的“Seven &i 数据实验室”。在数字化过程中,跨越企业和行业的壁垒共享已经成为“资源”的数据,有助于成为新服务等的竞争力。 日本NTT DoCoMo、东京急行电铁、三井物产等10家公司参加。设定课题,7&i和参加
鼎湖山站入选首届优秀共享开放遥感数据集
记者从中国科学院华南植物园获悉,广东鼎湖山森林生态系统国家野外科学观测研究站(以下简称鼎湖山站)于2020年底在《中国科学数据》发表的数据论文“2005–2018年鼎湖山森林生态系统定位研究站气象数据”,近日入选2021年度优秀共享开放遥感数据集优秀数据集奖名单。 据悉,这是鼎湖山站继今年2月2
美国科研新规震动学界:共享实验数据将成趋势?
科学数据共享一直是学术界的期盼,但让科学家自愿把“攥”在手心的数据交出来太难了。现在,美国国立卫生研究院(NIH)要出头当这个“恶人”。据《自然》报道,2023年1月起,NIH将要求其每年资助的30万名研究人员和2500个机构中的大多数,在其拨款申请中包括一个“数据管理和共享”(DMS)计划,并最终
我国航空遥感数据共享有了新平台
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/511284.shtm近日,记者从中国科学院空天信息创新研究院(以下简称空天院)获悉,国家对地观测科学数据中心航空遥感数据资源分中心正式揭牌成立。该中心成立后,将通过中国科学院航空遥感中心数据共享门户动态
英科学家推动共享实验动物组织细胞数据
英国利兹大学1月13日说,目前世界各国已有200多位科研人员加入该校教授领衔建立的动物细胞组织共享数据库,随着这种实验材料共享行为不断普及,未来科学实验中活体动物的使用量有望减少。 据利兹大学介绍,这个数据库自2014年正式成立以来,目前已涵盖了近90种动物模型的细胞组织资源,欧洲、美国和澳大
我国已初步建成国家级罕见病数据共享平台
【#在国家罕见病会诊平台确诊时间降至平均4周#花费降低90%】北京协和医院院长张抒扬18日在2021年中国罕见病大会上说,我国已初步建成国家级罕见病数据共享平台,以支撑罕见病患者分布及疾病负担研究;建成全国罕见病诊疗协作网,由324家医院组成的罕见病三级防控体系初步形成。作为该协作网的国家级牵头