科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库
水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物,同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累,使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此,研究人员构建了相关的水稻数据库,主要包括RAP-DB(日本农业生物资源研究所构建的水稻注释项目)和MSU-RGAP(密歇根州立大学的水稻基因组注释项目),然而这些数据库缺乏有效手段对不同组学数据进行低成本、可持续的集成整合和维护更新。随着各类组学数据体量的不断增加,如何整合大量异质的水稻组学数据、构建集成的水稻信息存储库、实现便捷的访问和提供友好可视化界面成为水稻研究面临的关键问题。 中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室章张研究组、胡松年研究组、陈非研究组与北京大学、华中科技大学等单位的研究人员开展合作,采用可扩展和可持续的系统架构设计,设立针对不同组学数据的模块,每个模块由具体的工作小组负责数据的收集、......阅读全文
科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库
水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物,同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累,使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此,研究人员构建了相关的水稻数据库,主要包括RAP-DB(日本农业生物资源研究所构建的水稻注释
水稻多器官单细胞多组学图谱问世
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。 单细胞组学是近年来生命科学
五位大咖在线直播,与您共享多组学如何助力医学研究
2022年2月,南京医科大学杜牧龙等在Molecular Cancer(IF=27.401)发文,全面阐明了外泌体circRNA参与结直肠癌发生的生物学功能。2022年1月,上海交通大学特别研究员林关宁等在Science Advances(IF=14.136)发文,发现了强迫症的重要的风险机制。20
多组分警戒信息素的定义
中文名称多组分警戒信息素英文名称multicomponent alarm pheromone定 义由多种化合物组成的警戒信息素,其中不同化合物激发不同的警戒行为。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)
多组分警戒信息素的定义
中文名称多组分警戒信息素英文名称multicomponent alarm pheromone定 义由多种化合物组成的警戒信息素,其中不同化合物激发不同的警戒行为。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
首个菊科多组学数据平台AMIR发布
10月8日,华中农业大学果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室、药用植物资源可持续利用团队梅之南教授和杨庆勇教授课题组,发布了首个专门面向菊科植物的多组学数据库平台——Asteraceae Multi-omics Information Resource(AMIR)。该平台涵盖了74种菊科植物的多
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
多组分警戒信息素的定-义
中文名称多组分警戒信息素英文名称multicomponent alarm pheromone定 义由多种化合物组成的警戒信息素,其中不同化合物激发不同的警戒行为。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)
如何建立信息共享平台
问题一:企业信息共享平台如何建立? 5分 网站解决还是比较方便的,可以通过某几个栏目实现会员管理从而实现共享!问题二:如何建立网上可共享的数据库 推荐使用华创信息管理平台,它是一种信息共享的快速开发与运行平台,能让用户自由建表、自定义数据格式,因此能管理各种数据,能共享各种信息。利用本平台,无论想管
植物多组学比较和进化研究平台发布
近日,西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台,相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础,而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用,在
单细胞多组学高通量测序平台(一)
一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治
首个免疫衰老多组学数据库设立
记者12月17日从中国科学院基因组所(国家生物信息中心)了解到,该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作,建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory,旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老
解析肿瘤HiC多组学研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
CASMS分论坛:多组学整合与大数据
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中,哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验
单细胞多组学高通量测序平台(二)
虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F
湖南定期共享污染犯罪信息
湖南省人大常委会副主任王柯敏与省高院院长康为民日前共同为省高院环境资源审判庭揭牌。 此举标志着湖南环境资源审判工作进入专门化轨道,也标志着湖南环境资源司法保护工作步入新的历史起点。 据了解,2012年~2015年,湖南全省法院共审结各类环境资源刑事、民事、行政(含一、二审)案件3
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析(GWAS)是通过推断
单细胞多组学整合技术有了新突破
近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术,能够检测单个细
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
多组学手段揭示苦荞“不怕冷”的奥秘
苦荞 董玉梅摄低温胁迫是影响植物生化、分子、代谢调控的主要环境因素之一。长期在暴露于低温而引导植物胁迫耐受性的提高,即耐寒性或冷驯化。阐明植物对低温响应的分子机制对育种和基因发掘至关重要。有研究表明苦荞可以通过增加花色苷和原花青素的积累增强其耐寒性。苦荞的每个器官几乎都含有芦丁,包括种子
单细胞多组学整合技术有了新突破
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能
空间多组学质谱技术研讨会(2023)
空间多组学技术结合了组学技术(如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等)和组织学技术,有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。 质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一,可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子(如
P4-China-2016多组学与系统生物学论坛
P4 China 2016国际精准医疗大会将于2016年12月16-18日于北京召开,由中国生物工程学会,上海商图信息咨询有限公司(BMAP)等多家单位联合举办。峰会将会邀请近60位演讲嘉宾,预计近800位精准医疗行业与临床科研资深人士与会。 个体化精准诊疗医学是近年卫生保健领域发展最广泛、最
P4-China-2016多组学与系统生物学论坛
自从精准医学概念提出以来,它一直都是全球最热的研究领域,政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言,基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛,从系统生物学出发,对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨,并分享了科研成果应用于
研究人员建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(
动物所等建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研
科学家合作构建再生生物学多组学数据库
随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再
研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库
随全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库. 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研