植物所等破译构树基因组

构树(Broussonetia papyrifera)又称纸皮树、肥猪树,为桑科构属多年生阔叶乔木,自然分布于我国大部分地区和东南亚,是一种典型的乡土树种和先锋植物。构树雌雄异株,种子数量多,易繁殖,生长快,表型性状和遗传多样性丰富,基因组紧凑,可作木本植物研究的模式材料。同时,构树有着悠久的开发历史,是一种多用途资源植物。然而,以往关于构树的研究主要集中在构树纤维特点、制浆造纸的工艺、饲用价值和饲喂方法、生态绿化、环境适应性等方面,缺乏对构树基础生物学深入系统的研究,从而严重影响构树应用价值的开发。 近日,中国科学院植物研究所沈世华研究组与多家单位合作,利用二代Illumina和三代PacBio单分子测序技术,结合mate-pair大片段文库、光学图谱、遗传图谱以及Hi-C等辅助组装策略,报告了一个高质量的、染色体级别的构树基因组(2n = 2x = 26)。该基因组序列386.83Mb,覆盖度接近100%,其中99.2......阅读全文

菊科植物为何是进化最为成功的植物?

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506504.shtm科技日报记者 马爱平菊科植物丰富的物种多样性和超强的环境适应性,常被视为在进化上最为成功的植物,但是其背后的分子遗传机制尚不明确。近日,北京市农林科学院杨效曾团队和北京大学李磊团队在权

蕨类植物鉴定实验——蕨类植物鉴定

实验材料石松标本卷柏(或中华卷柏)腊叶标本石松茎横切片石松卷柏抱子叶穗纵切片问荆(或节节草)新鲜叶片(或腊叶标本)蕨腊叶标本蕨地下茎横切片蕨孢子囊群水封 片(或永久封片)蕨原叶体装片常见蕨类植物的标本仪器、耗材显微镜解剖镜放大镜镊子解剖针载玻片盖玻片培养皿滴瓶实验步骤(一)石松亚门 Lycophyt

被子植物(V)单子叶植物纲

实验材料:慈姑                                                                  泽泻                                                                  鸢尾      

植物水势测定的仪器——植物水势压力室

     植物水势是客观表示植物组织水分状况的一个重要指标,也是作为指导合理灌溉的重要生理指标。在现代农业科研和生产指导中,植物水势的测定需求越来越高,为 满足需要,植物水势的测定方式也在不断更新和优化,并最终以仪器的形式展现在了用户的面前,那么植物水势测定的仪器是什么?它就是植物水势压力室。   

植物细胞结构与植物徒手切片观察试验

实验方法原理1.  了解植物细胞形态的多样性;简易染色技术。 2.  掌握植物细胞的结构和植物徒手切片技术。 3.  识别和鉴定植物细胞中常见的后含物。  实验材料洋葱                                                                

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

基因组所肝癌全基因组合作研究取得新进展

  近日,由中国科学院北京基因组研究所所长吴仲义及其科学团队与国立台湾大学医学院陈定信院士、陈培哲院士共同合作开展的“肝癌癌症基因组合作研究”计划获最新进展,相关学术论文在在最新出版的PNAS杂志上发表。  “肝癌癌症基因组合作研究”计划于2009启动,作为基因组所一项长期的癌症基因

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成

9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。

北京基因组研究所Plant-cell基因组研究新成果

  来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组,通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上

美国百万基因组PK英国十万基因组-只为助力“精准医疗”?

  1月下旬,美国总统奥巴马在2015年国情咨文演讲中深情地说道,美国已经消灭了小儿麻痹症、绘制出人类基因组等举措,这意味着美国已经 使人类医学迈入一个新的时代……接下来,我们致力于治愈癌症和糖尿病等疾病,让所有人获得需要保障自己和家人健康的个性化的信息,并宣布了新的项目——精 准医疗计划(Pr

科学家进行基因组测序-成功破译金雕基因组

   作为一种知名度极高的猛禽,金雕经常以威猛霸气的形象出现在影视作品和小说中。现在,英国研究人员完成了对金雕的基因组测序工作,希望从基因层面深入了解这一物种,以便更好地保护它们。 金雕以巨大的体型和敏捷有力的飞行等特征而著名,其成鸟的翼展平均超过2米,体长可达1米。金雕一般生活于多山或丘陵地区

北京基因组所揭示线粒体基因组氧化损伤修复分子机制

  线粒体是真核生物细胞主要的能量代谢场所,其中呼吸链氧化磷酸化过程伴随有高水平的氧自由基(ROS)的产生。线粒体基因组缺乏组蛋白结合保护,所以容易受到ROS攻击而发生损伤,其突变的累积已证实与多种人类疾病(如神经退行性病变、糖尿病、心血管疾病和癌症等)的发生密切相关。有关核基因组DNA损伤修复分子

聚焦基因组组装-至今最大组装竞赛寻找最优基因组指标

  2013年7月23日,由华大基因和BioMed Cental联合创办的开放式期刊《GigaScience》发表了当前最大、最系统的基因组组装过程及评价结果。在第二届Assemblathon竞赛中,共有21个团队基于由三种不同的测序技术所得的鸟、鱼和蛇的未组装基因组数据,提交了43个组装结果,

植物也有“左撇子”?

  植物也有“左撇子”?据报道,现生缠绕植物超过90%都偏爱右旋。然而,中国科学院南京地质古生物研究所的科研人员,在内蒙古约3亿年前“植物庞贝城”沼泽森林中却发现一种稳定左旋的缠绕植物化石。这是地质历史上第二例缠绕植物化石,该发现将植物缠绕习性的出现追溯至3亿年前的晚古生代。相关研究成果在线发表在最

植物也有“左撇子”?

周卫明从内蒙古乌海市乌达煤田采集的缠绕化石标本。图A系第一块化石,图H系第二块。图片来源:《当代生物学》  两年前的11月,周卫明与合作者从最低气温零下20摄氏度的内蒙古乌达煤田,带回了一批植物化石标本。周卫明在中国科学院南京地质古生物研究所(以下简称中科院南古所)工作,当时他并未意识到,这批标本中

植物水势仪

  Psypro水势测量系统由Psypro水势测量记录仪与相匹配的系列传感器(样品室)组成,用以在实验室或野外快捷、方便地测定土壤或叶片的水势。该系统可以自动测量、记录和存储数据。具有数字显示功能。同时可连接最多8个样品室。  Psypro数字水势测量系统是一个内含电子系统的,通过热电偶传感器来专门

植物奶油疑云

  在风行世界百年之后,植物奶油突然遇到了问题。   几天前,央视《经济半小时》有关植物奶油中反式脂肪酸危害健康的报道,一下子让其成为了公众关注的焦点。   这个学名叫氢化植物油的东西具有耐高温、不易变质、提升食物口感等优点,从1910年问世起,它被加入到面包、蛋糕、饼干、薯条、冰激凌、奶茶等各

植物实验——根

【目的】 掌握根尖的外形,分区和内部构造; 掌握根的初生结构并了解根毛的形成过程。 【实验内容】 一、根的形态 主根、侧根、定根、不定根、直根系、须根系 二、根尖各区的结构及其生长动态根尖的分区 根冠(root cap) 分生区(meristematic zone) 伸长区(elong

植物胚胎培养

植物胚胎培养包括胚培养、胚珠培养、子房培养、胚乳培养。 一、植物胚培养(embryo culture of plants) 1.胚培养的意义和类型 胚培养在实践中的应用意义 · 克服杂交育种中杂种胚的早期夭折 · 克服珠心胚干扰,提高育种效率 · 理论研究领域的应

植物组织pcr

   直接PCR(Direct PCR)使用未纯化的样本进行PCR扩增,无需核酸纯化步骤,为DNA扩增带来前所未有的便捷。如果您研究领域涉及基因分型、转基因、质粒检测、基因敲除分析、DNA来源鉴定、物种鉴定、SNP分析等,请看完下面的介绍吧。  直接PCR需要的试剂  样本裂解液   样本裂解液可自

植物气孔概述

  植物气孔是植物形态学上的重要特征,是植物表皮所特有的结构。气孔通常多存在于植物体的地上部分,尤其是在叶表皮上,在幼茎、花瓣上也可见到,但多数沉水植物则没有。气孔是植物与外界进行气体交换的孔道和控制蒸腾的结构。通过它的开闭,调控着植物的气体交换率和水分蒸腾率,对植物的生活起着极为重要的作用。现将与

C3植物、C4植物C3-C4中间植物和CAM植物的结构对比

C3植物、C4植物C3-C4中间植物和CAM植物的结构特征C3植物C4植物C3-C4中间植物CAM植物结构BSC不发达,不含叶绿体,其周围叶肉细胞排列疏松BSC含叶绿体,其周围叶肉细胞排列紧密呈“花环型”结构(kranztype)BSC含叶绿体,但BSC的壁较C4植物的薄BSC不发达,不含叶绿体,含

基因组重排的定义

基因组重排将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组,可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。

前基因组的概念

中文名称前基因组英文名称pregenome定  义某些病毒基因组DNA进入细胞核后,在宿主RNA聚合酶作用下产生的一条作为遗传信息载体的信使核糖核酸(mRNA)。可以通过逆转录形成双链的病毒基因组DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

基因组DNA的提取

基因组DNA的提取概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分

Nature:基因组的“气味”

  问问你身边的十个人,他们是如何寻找自己的伴侣的,也许你会得到十份不同的答案。不过也许他们都错了,一项最新的研究指出,嗅觉系统具有超乎想象的敏感性,能精确鉴别遗传上的相关性,这表明这种能力能为同类识别,伴侣选择,以及其它社会相互联系类型提供必要的信息。   许多方面的动物行为都需要了解

叶绿体基因组的概念

采用高盐、低pH值法提取雷蒙德氏棉叶绿体DNA;通过物理剪切法获得随机断裂的DNA片段;剪切片段末端、补平修饰后与pCC1FOS载体连接;用噬菌体包装蛋白包装重组DNA,侵染大肠杆菌EPI300,构建了雷蒙德氏棉叶绿体基因组文库。对于叶绿体DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次为最佳参数。

线粒体基因组的概念

线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,这些基因组统称为线粒体基因组。线粒体内的DNA,可参与蛋白质的合成,转录,与复制,具有较高的研究价值。