植物所等破译构树基因组
构树（Broussonetia papyrifera）又称纸皮树、肥猪树，为桑科构属多年生阔叶乔木，自然分布于我国大部分地区和东南亚，是一种典型的乡土树种和先锋植物。构树雌雄异株，种子数量多，易繁殖，生长快，表型性状和遗传多样性丰富，基因组紧凑，可作木本植物研究的模式材料。同时，构树有着悠久的开发历史，是一种多用途资源植物。然而，以往关于构树的研究主要集中在构树纤维特点、制浆造纸的工艺、饲用价值和饲喂方法、生态绿化、环境适应性等方面，缺乏对构树基础生物学深入系统的研究，从而严重影响构树应用价值的开发。 近日，中国科学院植物研究所沈世华研究组与多家单位合作，利用二代Illumina和三代PacBio单分子测序技术，结合mate-pair大片段文库、光学图谱、遗传图谱以及Hi-C等辅助组装策略，报告了一个高质量的、染色体级别的构树基因组（2n = 2x = 26）。该基因组序列386.83Mb，覆盖度接近100%，其中99.2......阅读全文
Nature：水母基因组之谜
太平洋侧腕水母的基因组中缺少很多常见基因。 栉水母基因序列草图的发表揭示了一种与众不同的神经系统。 栉水母（comb jelly）——或栉水母门动物（ctenophore）——看起来就像微小的迪斯科球，它们利用特殊的纤毛推动自己在海洋中游动，并且用粘性触手来捕获更微小的猎物。圣奥古斯丁佛罗里达大
叶绿体基因组的概念
采用高盐、低pH值法提取雷蒙德氏棉叶绿体DNA;通过物理剪切法获得随机断裂的DNA片段;剪切片段末端、补平修饰后与pCC1FOS载体连接;用噬菌体包装蛋白包装重组DNA,侵染大肠杆菌EPI300,构建了雷蒙德氏棉叶绿体基因组文库。对于叶绿体DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次为最佳参数。
基因组大小如何决定？
基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关。然而，在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后，这种相关性已不再存在，主要是因为重复DNA的缘故。
基因组DNA的提取
第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中，可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部，
核基因组的概念
核基因组是指真核生物细胞核染色体所包含的的全部遗传信息即碱基对，有别于诸如叶绿体和线粒体的质体基因组，以及黏粒及质粒等其他基因组存在形式。
基因组大小如何确定？
基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关。然而，在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后，这种相关性已不再存在 ，主要是因为重复DNA的缘故。
Nature：基因组的“气味”
问问你身边的十个人，他们是如何寻找自己的伴侣的，也许你会得到十份不同的答案。不过也许他们都错了，一项最新的研究指出，嗅觉系统具有超乎想象的敏感性，能精确鉴别遗传上的相关性，这表明这种能力能为同类识别，伴侣选择，以及其它社会相互联系类型提供必要的信息。 许多方面的动物行为都需要了解
Nature公布小麦基因组
利物浦大学、加州大学戴维斯分校等9所研究机构合作对小麦基因组进行了测序，他们的研究将于十一月二十九日在Nature杂志上发表，有望帮助人们增加小麦产量，培育更适应环境变化的品种。 到2050年，世界人口预计会从七十亿增加到九十亿，在可用耕地越来越少的情况下，要满足全球对粮食持续增长的需求，
什么是基因组作图？
中文名称基因组作图英文名称genome mapping;genomic mapping定 义确定界标或基因在构成基因组的各条染色体上的位置，以及染色体上各个界标或基因之间的相对距离，绘制遗传连锁图或物理图。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级学科）
表观基因组的概念
中文名称表观基因组英文名称epigenome定 义全基因组的甲基化图谱。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
植物也有“左撇子”？
周卫明从内蒙古乌海市乌达煤田采集的缠绕化石标本。图A系第一块化石，图H系第二块。图片来源：《当代生物学》 两年前的11月，周卫明与合作者从最低气温零下20摄氏度的内蒙古乌达煤田，带回了一批植物化石标本。周卫明在中国科学院南京地质古生物研究所（以下简称中科院南古所）工作，当时他并未意识到，这批标本中
植物也有“左撇子”？
植物也有“左撇子”？据报道，现生缠绕植物超过90%都偏爱右旋。然而，中国科学院南京地质古生物研究所的科研人员，在内蒙古约3亿年前“植物庞贝城”沼泽森林中却发现一种稳定左旋的缠绕植物化石。这是地质历史上第二例缠绕植物化石，该发现将植物缠绕习性的出现追溯至3亿年前的晚古生代。相关研究成果在线发表在最
植物组织pcr
直接PCR（Direct PCR）使用未纯化的样本进行PCR扩增，无需核酸纯化步骤，为DNA扩增带来前所未有的便捷。如果您研究领域涉及基因分型、转基因、质粒检测、基因敲除分析、DNA来源鉴定、物种鉴定、SNP分析等，请看完下面的介绍吧。 直接PCR需要的试剂 样本裂解液 样本裂解液可自
植物奶油疑云
在风行世界百年之后，植物奶油突然遇到了问题。 几天前，央视《经济半小时》有关植物奶油中反式脂肪酸危害健康的报道，一下子让其成为了公众关注的焦点。 这个学名叫氢化植物油的东西具有耐高温、不易变质、提升食物口感等优点，从1910年问世起，它被加入到面包、蛋糕、饼干、薯条、冰激凌、奶茶等各
植物胚胎培养
植物胚胎培养包括胚培养、胚珠培养、子房培养、胚乳培养。 一、植物胚培养(embryo culture of plants) 1．胚培养的意义和类型 胚培养在实践中的应用意义 · 克服杂交育种中杂种胚的早期夭折 · 克服珠心胚干扰，提高育种效率 · 理论研究领域的应
植物实验——根
【目的】 掌握根尖的外形，分区和内部构造； 掌握根的初生结构并了解根毛的形成过程。 【实验内容】 一、根的形态 主根、侧根、定根、不定根、直根系、须根系 二、根尖各区的结构及其生长动态根尖的分区 根冠（root cap) 分生区(meristematic zone) 伸长区(elong
植物水势仪
Psypro水势测量系统由Psypro水势测量记录仪与相匹配的系列传感器（样品室）组成，用以在实验室或野外快捷、方便地测定土壤或叶片的水势。该系统可以自动测量、记录和存储数据。具有数字显示功能。同时可连接最多8个样品室。 Psypro数字水势测量系统是一个内含电子系统的，通过热电偶传感器来专门
植物气孔概述
植物气孔是植物形态学上的重要特征，是植物表皮所特有的结构。气孔通常多存在于植物体的地上部分，尤其是在叶表皮上，在幼茎、花瓣上也可见到，但多数沉水植物则没有。气孔是植物与外界进行气体交换的孔道和控制蒸腾的结构。通过它的开闭，调控着植物的气体交换率和水分蒸腾率，对植物的生活起着极为重要的作用。现将与
C3植物、C4植物C3－C4中间植物和CAM植物的结构对比
C3植物、C4植物C3－C4中间植物和CAM植物的结构特征C3植物C4植物C3－C4中间植物CAM植物结构BSC不发达，不含叶绿体，其周围叶肉细胞排列疏松BSC含叶绿体，其周围叶肉细胞排列紧密呈“花环型”结构（kranztype）BSC含叶绿体，但BSC的壁较C4植物的薄BSC不发达，不含叶绿体，含
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium，简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症，加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
基因组所发布表观基因组关联研究开放平台EWAS－Open－Platform
近日，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的表观基因组关联研究资源开放平台EWAS Open Platform上线。相关研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
北京基因组所等解析NK细胞白血病功能基因组
侵袭性NK细胞白血病（ANKL）起源于NK细胞异常增殖，病情进展迅速，多数患者在极短时间内发生多器官衰竭，部分患者会出现吞噬血细胞的现象，病情凶险。ANKL患者即使积极接受正规治疗，平均生存时间也仅有几个月。目前，临床上ANKL的治疗面临两大问题：患者对传统化疗方案不敏感，医学界没有统一的治疗标
北京基因组所等解析NK细胞白血病功能基因组
侵袭性NK细胞白血病（ANKL）起源于NK细胞异常增殖，病情进展迅速，多数患者在极短时间内发生多器官衰竭，部分患者会出现吞噬血细胞的现象，病情凶险。ANKL患者即使积极接受正规治疗，平均生存时间也仅有几个月。目前，临床上ANKL的治疗面临两大问题：患者对传统化疗方案不敏感，医学界没有统一的治疗标
Nature：全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日，一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中，来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析，结果发现了4种不同的亚型，这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式，该技术可以帮助
北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。
研究发现人类合子基因组激活起始于父源基因组
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和染色质高级结构等，在基因的表达调控中发挥重要作用。人类精子和卵细胞的染色质表观修饰状态存在较大差异。在受精后的早期胚胎里，来自精子的父源染色质和来自卵细胞的母源染色质会经历剧烈的表观遗传修饰重编程，最终达到两者类似的模式。人类胚胎的合子基因
Nature－Biotechnology定义病毒基因组标准：何谓高质量基因组
据说，地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量，而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上，美国能源部（DOE）联合基因组研究所（JGI）构建了重要的病毒序列数据库，同时提出了病毒基因组标准，指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未
植物版《永乐大典》：《植物分典》编撰背后秘密
一个所，一本书。以吴征镒院士为代表的一群植物研究人员，在长达10年的时间里，为了《中华大典·生物学典·植物分典》（下称《植物分典》）的完成呕心沥血，精诚团结，最终于2017年10月成功将这本书出版发行。日前，《植物分典》编纂工作总结会暨赠书仪式在中国科学院昆明植物研究所隆重举行，专家学者济济一
植物凝集素对植物病原线虫的作用
这方面研究相对较少，仅常团结等(2002)报道纯化的雪花莲外源凝集素(GNA)可以抗植物病原性线虫。
云南植物宝库新添植物新种灰岩姜
中科院东南亚生物多样性研究中心的科研人员在云南省西双版纳石灰山森林里发现了一种顶生花序的姜属植物，经过文献查阅和标本比对之后，最终确认为姜属顶花组植物一新种，命名为灰岩姜。该新种的发现为中国姜属植物增加了一个新记录组。 西双版纳的石灰岩山地约占国土面积的19%，石灰岩森林是热带雨林非常重要的组