陈柱成/李雪明/李明组揭示SNF2染色质重塑中DNA滑移的机理

染色质重塑复合物利用ATP的能量移动核小体在基因组上的位置和组成成分,在控制染色质结构、调节基因转录等方面具有重大作用,主要可以分四大类:SWI/SNF、CHD、ISWI和INO80【1】。这些分子机器的运行机理,即如何利用ATP水解的能量推动核小体移动和组蛋白交换,一直是一个未解的科学问题。利用冷冻电镜技术,近年来对于这个问题的解答有了突飞猛进【2-6】,其中清华大学陈柱成实验室在领域也做出了重要的工作【2】。此外,美国哈佛大学Cigall Kadoch课题组在Cell上的工作还揭示了mSWI/SNF复合物的模块组织和组装通路,并分析了人类疾病相关的突变影响mSWI/SNF的分子机制【7】。(专家解读Science+Cell丨近期系列染色质重塑复合物相关重大成果) 陈柱成实验室长期从事染色质重塑的相关分子机理研究,近几年该课题组发表了一系列重要成果,包括解析了Snf2蛋白基态晶体结构,阐释了Snf2的自抑制机理【8】;解......阅读全文

陈柱成/李雪明/李明组揭示SNF2染色质重塑中DNA滑移的机理

  染色质重塑复合物利用ATP的能量移动核小体在基因组上的位置和组成成分,在控制染色质结构、调节基因转录等方面具有重大作用,主要可以分四大类:SWI/SNF、CHD、ISWI和INO80【1】。这些分子机器的运行机理,即如何利用ATP水解的能量推动核小体移动和组蛋白交换,一直是一个未解的科学问题。利

陈柱成/李雪明-SNF2介导的染色质重塑中DNA滑移的机理

  2019年3月13日,清华大学生命科学学院陈柱成课题组、李雪明课题组以及中科院物理所李明课题组合作在Nature上发表了题为Mechanism of DNA translocation underlying chromatin remodeling by Snf2的研究论文,析了不同核苷酸状态下

不同核苷酸状态下Snf2核小体复合物的冷冻电镜结构

SWI/SNF家族蛋白利用ATP水解产生的能量移动核小体在基因组DNA的位置,重塑染色质。这对于控制遗传物质的开放性,调节基因转录等方面发挥重要作用。陈柱成实验室近期报道了Snf2与核小体结合的结构。但这个早期的工作并没有明确检测到DNA移位。 染色质重塑蛋白如何利用ATP水解的能量推动核小体滑移依

时隔两年-清华大学青年学者再发Nature解析染色质重塑

  在真核生物细胞内,DNA缠绕着组蛋白八聚体形成染色质的基本组成单位,核小体。染色质在包装、保护遗传物质方面发挥着关键作用。  染色质形成同时对细胞内的一些生理过程,如DNA复制、转录、修复等产生了巨大的障碍。为此SWI/SNF家族染色质重塑复合物通过利用ATP水解的能量调控染色质的结构,广泛参与

清华大学生科院在Nature上发表论文阐述染色质重塑机理

  2017年4月19日,清华大学生命科学学院陈柱成课题组和李雪明课题组合作在《自然》(Nature)杂志上以长文(Research Article)形式在线发表题为《Snf2-核小体复合物结构揭示的染色质重塑机理》(Mechanism of chromatin remodelling reveal

清华大学生科院最新Nature子刊文章

  2016年7月11日,清华大学生命科学学院陈柱成课题组在《Nature Structural & Molecular Biology》在线发表题为《染色质重塑因子SWI/SNF基态的结构》(Structure of chromatin remodeler Swi2/Snf2 in the res

CHD1蛋白的结构特点及作用

CHD蛋白家族的特征是存在染色质组织修饰域和SNF2相关的螺旋酶/ATPase结构域chd基因可能通过改变染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体dna模板的访问。

CHD1基因突变与药物因子介绍

CHD蛋白家族的特征是存在染色质组织修饰域和SNF2相关的螺旋酶/ATPase结构域chd基因可能通过改变染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体dna模板的访问。[由RefSeq提供,2008年7月]The CHD family of proteins is characterized

CHD1基因编码功能及结构描述

CHD蛋白家族的特征是存在染色质组织修饰域和SNF2相关的螺旋酶/ATPase结构域chd基因可能通过改变染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体dna模板的访问。[由RefSeq提供,2008年7月]The CHD family of proteins is characterized

​DNA损伤修复信号通路CHD4基因的临床解释

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。

CHD2基因的结构特点和作用

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。

DNA修饰CHD2基因信号通路介绍

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。

CHD8-基因的结构特点和作用

该基因编码一个色域螺旋酶DNA结合蛋白家族成员,其特征是一个SNF2样结构域和两个染色质组织修饰结构域编码的蛋白质还包含婆罗门和基斯米特结构域,这些结构域是该蛋白质所属的色域螺旋酶DNA结合蛋白亚家族的共同结构域。该基因在转录调控、表观遗传重塑、促进细胞增殖和RNA合成等过程中发挥着重要作用该基因的

CHD2基因突变与药物因子介绍

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD

与DNA白修饰相关因子介绍CHD2

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD

CHD2基因编码功能及结构描述

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD

CHD2基因编码功能及结构描述

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD

DNA损伤修复信号通路相关因子CHD2

CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。 [由RefSeq提供,2008年7月]The CHD

清华大学陈柱成课题组Nature发表结构生物学重要研究成果

  生物通报道:染色质重塑蛋白ISWI与Snf2、Chd1、Ino80同属于SWI2/SNF2 家族。ISWI是一些染色质重塑复合体的催化亚基,这些复合物沿着基因组DNA移动核小体,协助复制前进、转录抑制、异染色质形成和其他细胞核过程。  ISWI的ATPase马达是一个自主的重塑机器,其C端HSS

CHD8基因编码功能及结构描述

该基因编码一个色域螺旋酶DNA结合蛋白家族成员,其特征是一个SNF2样结构域和两个染色质组织修饰结构域编码的蛋白质还包含婆罗门和基斯米特结构域,这些结构域是该蛋白质所属的色域螺旋酶DNA结合蛋白亚家族的共同结构域。该基因在转录调控、表观遗传重塑、促进细胞增殖和RNA合成等过程中发挥着重要作用该基因的

CHD8基因突变与药物因子介绍

该基因编码一个色域螺旋酶DNA结合蛋白家族成员,其特征是一个SNF2样结构域和两个染色质组织修饰结构域编码的蛋白质还包含婆罗门和基斯米特结构域,这些结构域是该蛋白质所属的色域螺旋酶DNA结合蛋白亚家族的共同结构域。该基因在转录调控、表观遗传重塑、促进细胞增殖和RNA合成等过程中发挥着重要作用该基因的

韩国研发出新型钠离子电池材料

  韩国科学技术研究院(KIST)发布消息称,该院能源融合研究组成功开发出以新型纳米复合体(氟化锡SnF2)和碳素为基础的钠离子电池用负极材料。该研究结果刊登在纳米技术领域《Nano Energy》杂志上。   研究组通过调节制造环境,用较厚的碳素层制作密封的纳米复合体后,将SnF2和高导电性乙炔在

韩国研发出新型钠离子电池材料

  韩国科学技术研究院(KIST)发布消息称,该院能源融合研究组成功开发出以新型纳米复合体(氟化锡SnF2)和碳素为基础的钠离子电池用负极材料。该研究结果刊登在纳米技术领域《Nano Energy》杂志上。   研究组通过调节制造环境,用较厚的碳素层制作密封的纳米复合体后,将SnF2和高导电性乙炔在

著名学者庄小威Nature解析核小体重塑

  来自哈佛大学的研究人员在新研究中探究了ISWI染色质重塑因子协调重塑核小体的机制。研究结果发表在6月29日的《自然》(Nature)杂志上。  文章的通讯作者之一是著名的华裔女科学家,哈佛大学庄小威(Xiaowei Zhuang)教授,庄教授早年毕业于中国科技大学少年班,34岁的时候就成为了哈佛

酵母双杂交系统的研究过程

  Fields等人的工作标志双杂交系统的正式建立。他们以与调控SUC2基因有关的两个蛋白质Snf1和Snf2为模型,将前者与Gal4的BD结构域融合,另外一个与Gal4的AD结构域的酸性区域融合,由BD和AD形成的融合蛋白一般分别称之为“诱饵”(bait)和“猎物”或靶蛋白(prey or tar

酵母双杂交系统的研究过程

Fields等人的工作标志双杂交系统的正式建立。他们以与调控SUC2基因有关的两个蛋白质Snf1和Snf2为模型,将前者与Gal4的BD结构域融合,另外一个与Gal4的AD结构域的酸性区域融合,由BD和AD形成的融合蛋白一般分别称之为“诱饵”(bait)和“猎物”或靶蛋白(prey or targe

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定2

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多种)特定的残基,形成一系列以某一特定核苷酸

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1

㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定3

2.利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可通过上述同

DNA重组技术(DNA-Recombination)

一、DNA 的酶切与连接(1)酶切反应:同质粒DNA 的鉴定,只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切,则成比例增加。(2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。(3)15000rpm离心15min,弃上清。(4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃