科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组测序都已完成，越来越多的物种都在种内水平有了多个样本的群体基因组数据。如果能将多物种群体水平的遗传多态和物种水平的进化相结合进行分析，将有助于解析物种（尤其是近缘种）产生过程中适应性进化和特有表型形成的机制。迄今为止，尚缺乏此类方法。 中国科学院北京基因组研究所陈华研究组与中国科学院昆明动物研究所合作，首次开发了能够同时分析多个物种的群体基因组数据的方法HDMKPRF。该方法以Hartl、Bustamante等的泊松随机场模型和McDonald-Kreitman检验为框架，通过多个物种的联合等位基因频谱理论构建群体遗传学模型，有效整......阅读全文
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组
高原鱼类进化与功能基因组学科组
青海湖裸鲤（Gymnocypris przewalskii），隶属于鲤科裂腹鱼亚科，是国家二级保护动物，仅分布于典型高原咸水湖泊—青海湖中，是维持青海湖“水-鸟-鱼”生态链稳定的核心物种。青海湖裸鲤是鲤科鱼类中唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的自然群体，是研究高原鱼类适应进化的良好素材。青海湖裸鲤
平行进化和趋同进化差异分析
平行进化和趋同进化有些类似，二者的主要区别是：平行进化一般指亲缘关系较近的植物种或植物类群，经过平行进化产生相似的特征；而趋同进化是指亲缘关系较远的植物种或
病毒所蝙蝠飞行和免疫适应进化基因组学获进展
近期，由5个国家9个实验室组成的联合研究团队解析了2种蝙蝠的全基因组序列。这2种蝙蝠分别来自澳大利亚的大蝙蝠狐蝠(Pteropus.alecto)和中国的小蝙蝠大卫鼠耳蝠(Myotis.davidii)。分析结果提供了蝙蝠飞行、免疫系统及其它独特生物学特性的适应性进化的生物信息学证据。相关成果发
基因组学分析揭示
英国《自然》杂志18日在线公开的一篇基因组学论文显示，来自西伯利亚阿尔泰山脉东部尼安德特人的祖先，和现代人祖先的相遇与交融繁殖可能比原先认为的更早。已有证据显示，尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向现代人贡献了遗传物质。这项新研究还显示，大约在10万年前，现代人和尼安德特人之间
武汉病毒所蝙蝠飞行和免疫适应进化基因组学研究获进展
近期，由5个国家9个实验室组成的联合研究团队解析了2种蝙蝠的全基因组序列。这2种蝙蝠分别来自澳大利亚的大蝙蝠狐蝠（Pteropus.alecto）和中国的小蝙蝠大卫鼠耳蝠（Myotis.davidii）。分析结果提供了蝙蝠飞行、免疫系统及其它独特生物学特性的适应性进化的生物信息学
武汉病毒所在蝙蝠飞行和免疫适应进化基因组学研究获进展
近期，由5个国家9个实验室组成的联合研究团队解析了2种蝙蝠的全基因组序列。这2种蝙蝠分别来自澳大利亚的大蝙蝠狐蝠(Pteropus.alecto)和中国的小蝙蝠大卫鼠耳蝠(Myotis.davidii)。分析结果提供了蝙蝠飞行、免疫系统及其它独特生物学特性的适应性进化的生物信息学证据。相关成果发
“真菌基因组学与进化小型国际学术研讨会”在京举行
10月22日，由中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室（筹）及中国菌物学会主办的“真菌基因组学与进化小型国际学术研讨会-庆祝真菌学国家重点实验室（筹）成立”在京举行。 随着国际真菌基因组学研究的快速发展，国内不同真物学研究实验室已完成或正开展基因组测序的真菌达60种以上。中
昆明动物所等揭示动物适应性进化的第二套基因组学机制
动物适应青藏高原极端环境的过程中，逐渐形成了耐低氧、耐高寒、耐粗饲料等复杂性状的适应性。以往针对高原适应遗传机制的研究大多数局限在动物自身遗传物质的变异，很少了解与动物宿主共进化的第二套基因组（即肠道微生物组）的重要贡献，特别是能量代谢方面。 中国科学院昆明动物研究所研究员施鹏领导的团队和中国
PCR技术（十三）：PCR用于进化分析
进化遗传学具有两个并列的研究方向：系统发育的重建和种群分析。自1962年， Zuckerkandl和Pauling提出蛋白质序列和基因序列的比较可以象分子种一样用于标志 现存物种分化的时间以来，各种生化方法被用于系统发育的研究。在最初二十年内， 同功酶的电泳分析、免疫学比较和蛋白质序列分析被广泛地应
海峡两岸“非模式生物进化基因组学”学术研讨会召开
研讨会现场 3月20日至23日，在中国科学院的支持下，由中国科学院昆明动物研究所和台湾成功大学联合主办的海峡两岸“非模式生物进化基因组学”学术研讨会在昆明召开。来自台湾五所大学的11位专家和大陆9个单位的21位专家参加了本次学术研讨会。 参会专家围绕会议主题“非模式生物进化基因组
基因组学常规流程中SPIA通路分析方法
基因组学常规流程中通过实验样本组与组之间的比较得到成千上百的差异基因，再通过通路分析，从生物学角度探究差异基因的功能。但是常规的ORA、FCS方法往往忽视了基因在通路中复杂的相互作用关系，所以给大家介绍一种考虑更周全的分析方法SPIA。 SPIA整合了差异倍数、基因集显著性和拓扑分析，为每条通路计算
对猪进行比较分析，揭示转录的进化差异
对猪进行全面的转录组调查，可以从机理上了解经济上有价值的性状背后的组织特化过程，并加速其作为生物医学模型的使用。 2021年6月17日，四川农业大学李明洲及唐茜子共同通讯在Nature Communications上在线发表了题为“Apig Body Map transcriptome rev
基因组系统解析工具开发研究取得重要进展
近日，中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具（PanSyn，https://github.com/yhw320/PanSyn）。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方
你，还在进化
近700万年前，现代人类从黑猩猩祖先进化中分离出来，但今天人们仍在继续进化。在人类谱系中，已经有155个新基因被鉴定出来，这是由人类DNA的微小部分自发产生的。这些新基因中的一些可以追溯到哺乳动物的古老源头，其中一些“微基因”被预测与人类特有的疾病有关。相关研究近日发表于《细胞报告》。 “这个项
遗传分析揭示出食肉细菌病原体的进化
科研人员确定了把一种温和的微生物变成导致坏死性筋膜炎的病原体的进化路径。尽管已经进行了数十年的研究，流行病为人类健康带来了相当大的威胁，这部分是由于科研人员一直无法确定把一些微生物变成有毒力的病原体的关键分子事件的本质与时间安排。 James Musser及其同事把焦点放在了一种
分析海拉细胞发现，它们或已进化成新“物种
2016年，《自然》杂志做的一项调查显示，超过70%的研究者称无法再现其他科学家的实验[1]。这让科学界出现了“再现危机”，也严重阻碍了科学的进步和科研成果的转化。 去年8月，我们曾报道，科学家在数据库中发现，科研机构的癌细胞系竟然在偷偷进化，甚至对药物的反应也产生了大幅度的变化，严重影响了抗
进化枝的概念
进化枝（Clade）是指生命进化树上包括祖先分枝和所有子代分枝（branch）总和的一个群体分枝。比如说，概述图中蓝色和红色区域可以称为clade，而绿色区域不可以，因为他是一个不完整的群体，蓝色群体也是其子代。
“分子”掌控生命进化
如果能及时掌控SARS病毒分子进化规律，病情就会有效地得到控制；如果能准确掌控其他分子进化规律，人类的生命将会得到自我最大可能的把握。 安徽师范大学朱国萍教授在美国《科学》杂志上发表了她的研究论文《一件古老进化事件的自然选择机制》，获得自然科学界一致高度的评价，她的这篇论文，在进化生物学研究方
分子进化的概念
分子进化（molecular evolution），生物进化过程中生物大分子的演变现象。主要包括蛋白质分子的演变、核酸分子的演变和遗传密码的演变。
进化趋势的概念
中文名称进化趋势英文名称trend of evolution定 义在相对较长的时间尺度上，一个线系或一个单源群的成员表型进化改变的趋向。应用学科遗传学（一级学科），进化遗传学（二级学科）
微观进化的定义
微观进化通常是较小的进化变化的积累，这种较小的变化可能小至单个等位基因的突变，这被称为微观进化。
揭示伴侣进化之谜
无论是配对还是成组，灵长类动物社会系统的成功也可能为人类社会生活的组织提供洞见。 研究人员分析了不同灵长类社会是如何进化的，以及哪些因素可能导致它们之间的转变。研究结果表明，从独居到群居的进化通常是从结对生活开始的。因此，结对生活是群体生活的基础，在社会制度演变中起着至关重要的作用。相关论文近
种系进化的定义
中文名称种系进化英文名称phyletic evolution定 义一个物种没有经过系谱分裂而整体逐渐形成新种的进化模式。应用学科遗传学（一级学科），进化遗传学（二级学科）
分子进化的起源
在漫长的进化过程中生物的 DNA经历了各种各样的变化。包括基因突变、基因重组、染色体易位等。碱基置换突变常导致蛋白质中一个氨基酸的改变。例如正常血红蛋白第 6位的谷氨酸改变为缬氨酸便成为镰形细胞贫血症的血红蛋白 HbS，为赖氨酸替代则成为HbC，前者的碱基是从GAA（谷氨酸）→GUA（缬氨酸），后者
化学进化的定义
化学进化就是指在原始地球条件下，由无机物以及简单有机物逐渐演变出原始细胞的过程，之后的进化就是物种的进化。
肠道的进化起源
消化系统、皮肤、肌肉组织是如何进化的呢？这个问题困扰了科学家一个多世纪。维也纳大学的研究人员对海葵（一种非常古老的动物）胚胎发育的研究结果质疑了150年前提出的形成所有器官和组织的胚层具有同源性的假说。 该假说认为，身体中所有的器官和组织都来源于三个胚层之一，这些胚层在胚胎形成早期出现。这
进化节奏的定义
中文名称进化节奏英文名称tempo of evolution定 义进化过程中，物种在各个不同阶段有不同的进化速率。应用学科遗传学（一级学科），进化遗传学（二级学科）
什么是分子进化？
分子进化（molecular evolution），生物进化过程中生物大分子的演变现象。主要包括蛋白质分子的演变、核酸分子的演变和遗传密码的演变。