寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验

Jabobs等 ( 1988)介绍了在含季铵盐缓冲液中杂交的方法与原理。下述为该法的简单变通方案。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标记的寡核苷酸探针仪器、耗材杂交装置振荡培养器实验步骤材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。寡核苷酸杂交液6XSSC(或 6XSSPE)0.05mol/L 磷酸钠(pH6.8)1 mmol/LEDTA(pH8.0)5XDenhardt’s 液100ug/ml 变性、断裂的鲑精 DNA(Pharmacia 公司或按第 6 章的方案 10 所述制备)100 mg/ml 硫酸右族糖酐(见箄 16 章信息栏 DEAE-右旋糖酐)寡核苷酸预杂交液6XSSC(或 6XSSPE)0.05mol/L 磷酸钠(pH6.8)1 mmol/L EDTA(pH......阅读全文

寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验

            试剂、试剂盒 寡核苷酸杂交液 寡核苷酸预杂交液 SSC 或 SSPE TEAC1 洗涤液 TMAC1或 TEACl TMAC1 洗涤液

寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验

Jabobs等 ( 1988)介绍了在含季铵盐缓冲液中杂交的方法与原理。下述为该法的简单变通方案。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标

寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验

试剂、试剂盒 寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标记的寡核苷酸探针仪器、耗材 杂交装置振荡培养器实验步骤 材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。寡核苷酸杂交液6XSSC(或 6XSSPE)0.05mol/

DNA片段探针的应用实验——水溶液中杂交

实验材料DNA试剂、试剂盒杂交液洗膜液仪器、耗材培养箱实验步骤1.  除了于65℃在杂交液Ⅰ中温育的条件外,预杂交按甲酰胺法进行。 2.  按甲酰胺法制备探针并用2 ml 杂交液Ⅰ稀释。3.  滤膜在65℃杂交过夜,然后移去杂交液,用低严紧性洗膜液Ⅰ洗膜2次。4.  用高严紧性洗膜液Ⅰ在65℃迅速洗

DNA及寡核苷酸探针在原位杂交组织化学

一、DNA探针的应用  虽然一般认为DNA探针敏感度不如cRNA探针,但在病毒的检测等领域中DNA探针仍得到广泛的应用。  在原位杂交细胞化学的操作步骤方面与cRNA探针基本相同,所不同的是:(1)杂交时需先在高温80~95℃短时处理,使DNA探针及细胞内靶DNA变性,解离成单链,迅置于冰上冷却。然

杂交探针的检测实验

实验步骤 1.  暗室中,以42~45℃水浴,温育盛有4盎司(113.3 g)Kodak NTB-2放射自显影胶乳瓶30 min。同时,在500 ml 三角瓶中预热等体积的水至相同温度。 2.  胶乳熔化后,缓慢沿三角瓶壁(以一角度)倒入瓶中

杂交探针的检测实验

1.  将载玻片以胶带固定于硬纸板或废胶片上。2.  将Du Pont Cronex 成像胶片(MRF 34 Clear) 轻压在玻片上4℃曝光。3.  当用这种胶片时,应注意以胶片的胶乳面正对样品。

杂交探针的检测实验2

实验材料胶乳试剂、试剂盒显影剂仪器、耗材浸泡盒水浴锅玻片架实验步骤1.  在42℃~45℃水浴溶化小份稀释的胶乳10 min,将胶乳倒入或吸入洁净的玻片包装盒中(浸泡盒)。 2.  将玻片缓慢并轻柔地浸入浸泡盒中,缓慢取出并垂直放置在试管架上或将玻片置于干燥器中2 h,使其干燥。3.  将充分干燥的

杂交探针的检测实验3

实验步骤1.  暗室中,以42~45℃水浴,温育盛有4盎司(113.3 g)Kodak NTB-2放射自显影胶乳瓶30 min。同时,在500 ml 三角瓶中预热等体积的水至相同温度。2.  胶乳熔化后,缓慢沿三角瓶壁(以一角度)倒入瓶中并混匀(轻旋1~2次,防止气泡产生)。 3.  分装胶乳于尼龙

杂交探针的检测实验1

放射自显影胶片用于检测与细胞学样品进行杂交的32P或35S-标记探针,并可应用于在大的器官或组织进行的实验,欲获得单细胞水平结果,需要用乳胶放射自显影。实验步骤1.  将载玻片以胶带固定于硬纸板或废胶片上。2.  将Du Pont Cronex 成像胶片(MRF 34 Clear) 轻压在玻片上4℃

缓冲溶液在实验中的作用

缓冲液是一种能在加入少量酸或碱时抵抗pH改变的溶液.PH缓冲系统对维持生物的正常pH值,正常生理环境起重要作用.多数细胞仅能在很窄的pH范围内进行活动,而且需要有缓冲体系来抵抗在代谢过程中出现的pH变化.在生物体中有三种主要的pH缓冲体系,它们时蛋白质、重碳酸盐缓冲体系.每种缓冲体系所占的分量在各类

使用合成核苷酸作探针实验——在绿化四甲胺中(TMAC)杂交

实验材料寡核苷酸试剂、试剂盒LBSDSEDTATMAC仪器、耗材水浴锅离心机培养箱尼龙膜实验步骤1.  按“在氯化钠/柠檬酸钠中杂交”介绍的方法处理已影印细菌菌落的滤膜。2.  按下列方法制备带扩增噬斑的滤膜(1)从文库中以渐减密度〔15 000~8 000噬斑 / 150 mm 平板)的方式将噬菌

寡核苷酸探针的简介

  基因探针,即核酸探针,是一段带有检测标记,且顺序已知的,与目的基因互补的核酸序列(DNA或RNA)。基因探针通过分子杂交与目的基因结合,产生杂交信号,能从浩瀚的基因组中把目的基因显示出来。根据杂交原理,作为探针的核酸序列至少必须具备以下两个条件:①应是单链,若为双链,必须先行变性处理。②应带有容

杂交探针的概念

杂交探针是一小段单链DNA片段(十几到几百个碱基),用于检测与其互补的核酸序列。

使用合成核苷酸作探针实验——在氯化钠/柠檬酸钠中杂交

基因探针(probe)又称“寡核苷酸探针”,简称“探针”,就是一段与目的基因或DNA互补的特异核苷酸序列,它可以包括整个基因,也可以仅仅是/基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之转录而来的RNA。实验材料核苷酸试剂、试剂盒SSC焦磷酸钠SDS仪器、耗材培养箱水浴锅实验步骤1.  制备双份的转印

杂交信号的放大实验——地高辛标记探针的信号

实验材料杂交信号试剂、试剂盒地高辛SSCBSA荧光素仪器、耗材加湿盒水浴锅培养箱实验步骤1.  用地高辛标记的探针与切片杂交并洗片(见“荧光原位杂交实验”基本方案步骤1~6)。 2.  加50 μl 10 μg/ml 的羊抗地高辛抗体Fab片段于玻片上,盖以22 mm2 大小的Parafilm 膜,

寡核苷酸探针的制备方法

寡核苷酸探针是人工合成的,与已知基因DNA互补的,长度可从十几到几十个核苷酸的片段。如仅知蛋白质的氨基酸顺序量,也可以按氨基酸的密码推导出核苷酸序列,并用化学方法合成。

寡核苷酸探针的来源介绍

  DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe);另一种是从相应的基因转录获得了mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNA探针(cDNA probe)。与基因组探针不同的是,cDNA探针不含有内含子序列。此外,还可在体外人工合成碱基数不

寡核苷酸探针的用途介绍

寡核苷酸探针还有一个重要用途。在用于检测单个碱基差异时尚可采用一种称为寡核苷酸限制(oligonucleotiderestriction)的技术。该技术只有在突变点位于某一限制性内切酶识别位点时才有效。例如,镰刀状红细胞贫血是因β珠蛋白基因的第6个寡码子由GAG变成GTG,从而导致所编码氨基酸由酪氨

寡核苷酸探针技术介绍

利用寡核苷酸探针可检测到靶基因上单个核苷酸的点突变。常用的寡核苷酸探针主要有两种:单一已知序列的寡核苷酸探针和许多简并性寡核苷酸探针组成的寡核苷酸探针库。单一已知序列寡核苷酸探针能与它们的目的序列准确配对,可以准确地设计杂交条件,以保证探针只与目的序列杂交而不与序列相近的非完全配对序列杂交,对于一些

合成的寡核苷酸探针的优点

合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克

合成的寡核苷酸探针的优点

合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克

合成的寡核苷酸探针的优点

合成的寡核苷酸探针具有一些独特的优点:一.由于链短,其序列复杂度低,分子量小,所以和等量靶位点完全杂交的时间比克隆探针短,如20nt的寡核苷酸探针在浓度为100ng/ml,靶序列为1~100pg、1kb片段或3×10-18~3×10-16mol/L时,达到最大程度的杂交只需10min,而用2kb的克

cRNA探针在原位杂交组织化学

Angerer及其同事们首先应用RNA探针于原位杂交(见Cox et al 1984),核酸探针为单链的RNA分子,产生自具有质粒逆转录系统的cDNA克隆(图20-2)。由于它是单链的,不像双链的DNA探针,在溶液中不会再退火(reanneal),因此,较大百分比的探针可参与杂交反应,较cDNA探针

合成寡核苷酸探针的技术步骤

首先使支持物羟基化,并用光敏保护基团将其保护起来。每次选取择适当的蔽光膜(mask)使需要聚合的部位透光,其它部们不透光。这样,光通过蔽光膜照射到支持物上,受光部位的羟基解保护。因为合成所用的单体分子一端按传统固相合成方法活化,另一端受光敏保护基的保护,所以发生偶联的部位反应后仍旧带有光敏保护基团。

关于寡核苷酸探针的标记介绍

  为了确定探针是否与相应的基因组DNA杂交,有必要对探针加以标记,以便在结合部位获得可识别的信号,通常采用放射性同位素32P标记探针的某种核苷酸α磷酸基。但近年来已发展了一些用非同位素如生物素-亲合素系统  、地高辛配体等作为标记物的方法。非同位素标记的优点是保存时间较长,而且避免了同位素的污染。

一种适于大鼠牙周膜I型胶原mRNA原位杂交的方法

实验概要本实验方法是选用大鼠为对象建立动物模型,采用地高辛标记的寡核苷酸探针的原位杂交。实验步骤1. 标本制备 选用80只体重为250±20g的雄性Wistar成年大鼠,给大鼠注射过量麻药后,左心室用4%多聚甲醛灌注。解剖出下颌骨,仅保留磨牙区骨段,浸泡于4%多聚甲醛中再固定6小时。将标本移入脱钙液

用检测和驱动-DNA-探针进行差异杂交实验

下面 4 个探针用于差异筛选杂交。1. 检测者特异性消减探针(正向消减探针)。2. 驱动者特异性消减探针(反向消减探针)。3. 从检测者 mRNA(或检測者基因组 DNA) 直接合成的 cDNA 探针。4. 从驱动者 mRNA(或驱动者基因组 DNA) 直接合成的 cDNA 探针。本实验来源于 PC

用检测和驱动-DNA-探针进行差异杂交实验

            试剂、试剂盒 洗涤缓冲液 SDS SSC Blocking 溶液 经过剪切的鲑鱼精 DNA探针

用检测和驱动-DNA-探针进行差异杂交实验

试剂、试剂盒 洗涤缓冲液SDSSSCBlocking 溶液经过剪切的鲑鱼精 DNA探针仪器、耗材 沸水浴杂交炉实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂高严格性洗涤缓冲液(0.2XSSC,5 g/LSDS),预热到 68°C(可选,见第 9 步)低严格性洗涤缓冲液(2XSSC,5 g/LSDS),预