细菌RNA制备实验——革兰氏阴性细菌中提取

实验材料RNA试剂、试剂盒STET氯仿乙酸钠氯化铯无水乙醇EDTA仪器、耗材离心机分光光度计摇床实验步骤1. 培养100 ml 大肠杆菌或500 ml 蓝细菌至对数生长期,加入1/20体积终止缓冲液,置于冰上。2. 于4℃用JA-10转子17 700 g 离心5 min 收集细胞。3. 用2 ml STET裂解液重悬细胞,加入100 μl 0.2 mol/l 的VRC,移入15 ml 聚丙烯管子。4. 加入1 ml 缓冲液平衡酚,振荡1 min 再加1 ml 氯仿,振荡1 min,于4℃用JA-17转子10 000 g 离心10 min,收集水相。5. 加入1/10体积3 mol/l 乙酸钠和2倍体积冰冷无水乙醇,于4℃ 10 000 g 离心10 min。6. 用2 ml 0.2 mol/l VRC溶液重溶沉淀。7. 用1:1酚/氯仿抽提2遍后......阅读全文

细菌RNA制备实验

革兰氏阴性细菌中提取 革兰氏阳性细菌中提取             实验材料 RNA 试

细菌RNA制备实验

实验材料 RNA试剂、试剂盒 STET氯仿乙酸钠氯化铯无水乙醇EDTA仪器、耗材 离心机分光光度计摇床实验步骤 1.  培养100 ml 大肠杆菌或500 ml 蓝细菌至对数生长期,加入1/20体积终止缓冲液,置于冰上。2.  于4℃用JA-10转子17 700 g 离心5 min 收集细胞。3.

细菌RNA制备实验——革兰氏阴性细菌中提取

实验材料RNA试剂、试剂盒STET氯仿乙酸钠氯化铯无水乙醇EDTA仪器、耗材离心机分光光度计摇床实验步骤1.  培养100 ml 大肠杆菌或500 ml 蓝细菌至对数生长期,加入1/20体积终止缓冲液,置于冰上。2.  于4℃用JA-10转子17 700 g 离心5 min 收集细胞。3.  用2

采用Trizol-溶液提取细菌总RNA

实验概要了解用Trizol 溶液提取细菌总 RNA的方法。实验原理Trizol主要物质是异硫氰酸胍,它可以破坏细胞使RNA释放出来的同时,保护RNA的完整性。加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。RNA存在于水样层中。收集上面的的水样层后,RNA  可以通过异丙醇沉淀来还原。无论是人、动物、植物还

反义RNA调控细菌基因的表达功能介绍

  反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补,因此在体外m

反义RNA的调控细菌基因的表达功能

反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补,因此在体外mic

BIOG细菌RNA提取试剂盒使用说明

特点◎提取RNA纯度高,无抑制剂,A260/A280为1.8-2.0;◎产率高,同样的样本量提取的RNA更多。◎不含苯酚和氯仿等有毒溶剂,安全无毒。◎对于革兰氏阴性菌和一般的革兰氏阳性菌有较好的提取效果。试剂盒组成 组分 50次

科学家发现首个细菌中的RNA修复系统

  美国伊利诺伊大学香槟分校生物化学系教授Raven H. Huang及其同事首次在细菌中发现了RNA修复系统。这是迄今为止发现的第二个RNA修复系统,第一个为噬菌体(可攻击细菌的一种病毒)中的带有2个蛋白的RNA修复系统。相关文章发表在本月的美国《科学》杂志以及《美国国家科学院院刊》上。  

抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验

            实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。 实验材料 N-表达质粒 E.coi

抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验

一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒储

抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验

实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料 N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒 储存液缓冲液仪器、耗材 蛋白胨培养基蛋白胨平板N-表达质粒组合文库培养板实验步骤 ―、材料与设备1. 通过比较 β-半乳糖苷酶表达

RNASeq,区分细菌和病毒感染新工具

  在临床治疗中,准确鉴定细菌感染和病毒感染至关重要,这关系到治疗干预方案选择和抗生素耐药隐患预防。  例如下呼吸道感染(lower respiratory tract infections,LRTIs),不同病原体引起的不同疾病有着相似的临床症状,让医生很难做出正确诊断。  如今,罗切斯特大学医学

ATM机器究竟暗藏多少细菌?让RNA测序来告诉你

  比起在银行柜台排队取钱,使用自动柜员机(ATM)算是一种非常便捷的方式。不过,大家要小心,ATM可是暗藏了不少的细菌。近日,纽约大学的研究人员对纽约市多台ATM键盘上的细菌和真菌进行测序分析,发现了一系列微生物代表,不过总体多样性较低。  纽约大学的Maria Gloria Dominguez-

武汉病毒所在病原细菌小RNA调控机制研究中取得进展

  小RNA(Small non-coding RNA, sRNA)是细菌重要的转录后调控因子,广泛参与调控细菌各方面的功能。由于不同sRNA调控的靶标及其调控机制不相同,多数已鉴定sRNA 的靶基因未知,且一些已知靶基因的sRNA 是否存在新的调控靶标及调控机制也不清楚,因此sRNA一直是原核生物

RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)

早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上,但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足,Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动,将目的基因之标的序列以反向重复的方式,由

RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)

1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果

RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)

基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育

RNA提取时RNA降解原因

1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存

定量PCR方法对水源中细菌RNA进行精确定量-人elisa试剂盒

 定量PCR方法对水源中细菌RNA进行精确定量 人elisa试剂盒前 言水源中病源微生物的存在情况与人类健康息息相关(21,28)。传统的细菌培养检测方法不仅耗时,而且无法确定细菌的存活情况;PCR方法的应用便使上述问题得到了解决,并由此发展出多种针对水体病源微生物的检测方法(7,9,13)。但由于

RNA提取心得(组织RNA提取和培养细胞的RNA提取)

一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80℃或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4℃,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后

RNA干扰相关知识RNARITS)

RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质,通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。

RNA分离与分析实验_分离RNA

实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀,每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚,充分混匀,于 60

RNA干扰相关知识RNARISC

RNA-induced silencing complex(RISC):一种RNA-蛋白质复合物,通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC,miRNA组装miRISC。RISCs(无论siRISC还是miRISC)包括两种类型:切割型和不切割型。

反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)

最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA

RNA标记

RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes  32P-pCp 3' End-labeling

RNA-Electrophoresis

Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th

Quantitating-RNA

RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an

指导RNA

中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定  义一种小分子RNA,约含60~80个核苷酸,在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息,可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调

RNA-剪接

中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定  义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

RNA提取

RNA提取(主要内容如下)Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum  Basic Procedures for Handing