3.8脱氧核酶切割RNA专一位点
脱氧核酶是一类由三十几个脱氧核苷酸构成的寡聚脱氧核糖核苷酸,制备容易,使用方便,是体外在特定位点切割 RNA 的有效方法。常用于体外切割 RNA 底物的脱氧核酶是「10~23」型脱氧核酶。实验材料脱氧核酶无RNA酶的DMA酶切割底物RNA试剂、试剂盒5X反应缓冲液5X乙酸镁或氯化镁无水乙醇水饱和酚实验步骤一、材料与设备1) 脱氧核酶 (其设计与制格参见脱氧核酶相关章节)2)5X 反应缓冲液:750Tnmol/LNaCl,200 mmol/LTris-HCl (pH8.0)3)5X 乙酸镁或氯化镁:300 mmol/L4) 无 RNA 酶的 DMA 酶5) 切割底物 RNA6) 无水乙醇7) 水饱和酚二、操作方法1) 脱氧核酶切割底物 RNA 反应体系:加入底物 RNA(终浓度为 1~10umol/L、脱氧核酶 (终浓度为 30umol/L)、反应缓冲液 (终浓度为 15 mmol/LNaCl),4 mmol/LTris-HCl(......阅读全文
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸。其中,丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点,因为其结构末端含有羟基,羟基很活泼,可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说,蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话,很大程度上就是磷酸化位点。
METTL16介导通过阻碍对剪接位点的识别从而抑制RNA剪接
RNA m6A修饰是目前RNA表观遗传领域研究的热点,对于m6A的甲基化酶和去甲基化酶,相信大家也是耳熟能详。事实上,大名鼎鼎的METTL3仅能结合约22%的m6A位点,这提示还有其他m6A甲基化酶。确实,在METTL3之后,METTL16也被鉴定为m6A甲基化酶,但是它的底物远不如METTL3
改善RNA提取的4点建议
在分离RNA时,良好的实验室技术很关键。与DNA相比,RNA更加娇贵,也更不稳定。RNA含有高反应性的羟基(C-OH)基团,确保链不断合成、分解和再次利用。分离出的RNA迅速降解,并很容易受到核糖核酸酶(RNase)的污染。RNase似乎随处可见。 加利福尼亚州科学院(Calif
JACS:“量子点”助力RNA干扰技术
15年前,科学家发现了一种阻碍基因表达路径的方法——RNA干扰(简称RNAi)。这项荣膺2006年诺贝尔奖的发现承载着医学科学的迫切希望,它可以通过沉默基因来阻碍特定蛋白制造,从而达到疾病治疗的效果。不过到目前为止,RNA干扰技术很难在活体细胞中取得应用。 图片说明:由不同尺寸的相同物质构成的
今日技术解析RNA点杂交实验
实验步骤纯化的RNA的点杂交和狭线杂交:1. 安装印迹装置 1) 切一张合适大小的带正电荷尼龙膜。用铅笔标上表示方向的记号。用水把膜简单弄湿,在20×SSC中室温泡1 h。 2) 在膜浸泡期间,先用0.1 mol/L NaOH小心清洗印迹装置,再用无菌水洗干净。 3) 把两片厚滤纸用20
多克隆位点的常见载体
常见的基因工程载体都具有多克隆位点,有些载体,如λEMBL4、Charon40等甚至有两个。
宁夏设341个土壤风险点位
《宁夏重点区域土壤环境质量监测风险点位布设申请方案》近日通过中国环境监测总站技术审核,标志着宁夏初步完成土壤环境质量监测风险点位的布设工作。 据了解,2016年环保部印发《关于开展重点区域土壤环境质量监测风险点位布设工作的通知》。根据相关要求,宁夏以重点防控重金属污染为主线,共选择污染行业企业
核糖体结合位点的形成
真核细胞的大小亚基是在核中形成的,在核仁部位rDNA转录出45SrRNA,是rRNA的前体分子,与胞质运来的蛋白质结合,再进行加工,经酶裂解成28S,18S和5.8S的rRNA,而5SrRNA则在核仁外合成28S,5.8S及5SrRNA与蛋白质结合,形成RNP分子团。为大亚基前体,分散在核仁颗粒
细胞化学词汇无嘌呤嘧啶位点
所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。AP位点所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位
核糖体结合位点的形成
真核细胞的大小亚基是在核中形成的,在核仁部位rDNA转录出45SrRNA,是rRNA的前体分子,与胞质运来的蛋白质结合,再进行加工,经酶裂解成28S,18S和5.8S的rRNA,而5SrRNA则在核仁外合成28S,5.8S及5SrRNA与蛋白质结合,形成RNP分子团。为大亚基前体,分散在核仁颗粒区,
核糖体结合位点生物合成
抗体是由核糖体合成细胞内定位核糖体的功能就是将mRNA上的遗传密码(核苷酸顺序)翻译成多肽链上的氨基酸顺序。因此,它是肽链的装配机,即细胞内蛋白质合成的场所,细胞合成的蛋白质可分为两类:外输性蛋白和内源性蛋白。1.外输性蛋白:主要在固着核糖体上合成,分泌到细胞外发挥作用,如抗体蛋白、蛋白类激素、酶原
DNA-酶-I-超敏感位点作图
实验材料 真核细胞试剂、试剂盒 缓冲液 AEDTA乙醇裂解缓冲液磷酸盐缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I 稀释缓冲液DNA 酶 I 溶液蛋白酶 K 溶液RNA 酶溶液酚:氯仿SDS 缓冲液TE仪器、耗材 Sorvall H1000B 转头或等价物带螺帽的试管振荡水浴锅实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓
DNA-酶-I-超敏感位点作图
实验材料 真核细胞 试剂、试剂盒 缓冲液 A EDTA 乙醇 裂解缓冲液
DNA-酶-I-超敏感位点作图
DNA 酶 I 超敏感位点作图法经常用于定位真核基因的调控区。由于还未被理解的原因,基因带有对 DNA 酶 I 切割敏感的分开的序列,而且这些所谓超敏感位点图谱是随基因的激活状态而变化的(Weintrauband Gmudine1976)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J.
位点特异性重组的简介
位点特异性重组(site-specific recombination)是遗传重组的一类。这类重组依赖于小范围同源序列的联会,重组也只发生在同源的短序列的范围之内,需要位点特异性的蛋白质分子参与催化,重组的蛋白不是rec 系统而是int 等,如噬菌体l 的定点插入。重组时发生精确的切割、连接反应
治癌症不可忽视-非肿瘤位点
瑞典卡罗琳医学院和中国研究人员日前发布最新研究成果,揭示了肿瘤如何对身体多个器官功能造成系统性影响,表明治疗癌症不能只关注抑制肿瘤本身的生长,还需针对其他器官的症状进行综合治疗。 这一成果发表在美国期刊《细胞报告》上。研究小组成员、瑞典卡罗琳医学院华人教授曹义海10日接受新华社记者采访时说,这
多克隆位点的应用特点
多克隆位点(multiple cloning site, MCS),是包含多个(最多20个)限制性酶切位点(restriction site)的一段很短的DNA序列。也称为多位点接头(polylinker),是基因工程中常用到的载体质粒的标准配置序列。MCS中,每个限制性酶切位点通常是唯一的,即它们
基因插入位点和模式实验(一)
实验材料 dCTP试剂、试剂盒 乙醇次氯酸钠β-葡萄糖醛酸酶基因活性测定液溴化乙锭仪器、耗材 培养室MS 培养基实验步骤 一、转基因插入位点的数目第一代( T0)转基因植株外源基因的插入位点数目,一般都是通过遗传方法进行鉴定。虽然遗传分析可以在任何世代进行,但是一般选择转基因植株自交,或与野
核糖体结合位点的定义
核糖体结合位点(ribosomebinding site,简称RBS),是指mRNA的起始AUG上游约8~13核苷酸处,存在一段由4~9个核苷酸组成的共有序列-AGGAGG-,可被16SrRNA通过碱基互补精确识别的序列。
骨桥蛋白的结合位点的介绍
OPN分布广泛并受多种因素的调控,能与许多物质结合。 (1)结合多种整合素受体:已发现αvβ1、αvβ3、αvβ5、α5β1、α8β1、α4β1和α9β1等7种整合素能与OPN结合,2个α4β1整合素结合部位位于OPN的N-末端凝血酶片酸的38 aa结构域上,α9β1能结合凝血酶断裂的OPN
染色体整合位点的概念
中文名称染色体整合位点英文名称chromosomal integration site定 义染色体上能接纳外源遗传物质的位点。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)
核糖体结合位点理化特性
核糖体的主要成份为蛋白质和rRNA,二者比例在原核细胞中为1.5:1,在真核细胞中为1:1,每个亚基中,以一条或二条高度折叠的rRNA为骨架,将几十种蛋白质组织起来,紧密结合,使rRNA大部分围在内部,小部分露在表面。由于RNA的磷酸基带负电荷超过了蛋白质带的正电荷/负电性,易与阳离子和碱性染料结合
载体多克隆位点(MCS)改造
加、减、换一个载体 的MCS的位点 (给一个表达 载体加、减、换小表达标签,如His6, His10,strep II等,和MCS改造是一样的),其实技术 不是问题,问题在于位点的选择 ,因为载体设计 时应该设计者也考虑过mcs的问题,应该给使用者越多的选择越好,但为什么有的载体只给有
核糖体结合位点的简介
核糖体结合位点是指起始密码子AUG上游的一段富含嘌呤的非翻译区。包含SD(Shine-Dalgarno)序列。 RBS序列(生物):所谓RBS,是指起始密码子AUG上游的一段非翻译区.在RBS中有SD(Shine-Dalg-arno)序列,长度一般为5个核苷酸,富含 G,A,该序列与核糖体16
蛋白质结合位点的定义
分子中能与配体形成稳定相互作用的特定部位。蛋白质的结合位点通常是由多肽链上的一些相互分离的氨基酸残基通过肽链折叠在空间上聚集到一起,形成特定的空间排布方式。
位点特异重组的重组机制介绍
位点特异性重组本质上是两个重组位点的四股DNA发生两次切割和两次连接的过程,所需的关键成分是重组酶( recombinase),此外还需要一些蛋白因子。这里以入噬菌体DNA与大肠杆菌DNA整合而进入溶原状态为例,介绍位点特异性重组机制(图2-33)。 1.第一次切割重组酶(又称入噬菌体整合酶,
α微管蛋白:新的药物结合位点
微管(Microtubule)是抗肿瘤药物研发的重要靶点。微管是“细胞的骨架”主要成分之一,在许多细胞重要事件中起着关键作用。微管是由α-和β-微管蛋白(Tubulin)异二聚体可逆地组装成而成的线性管装结构(图1)。 图1:微管蛋白已知的六个结合位点及微管蛋白组装形成微管示意图 目前,微管
基因插入位点和模式实验(二)
3. 跨世代 Southern 分析Southern 分析一般用于鉴定各个转基因插入位点的排列形式(见 3 .2 节中“ Southern分析” )。当然,通过对不同世代转基因植株杂交检测结果的比较,它也可以用于转基因插入位点数的测定。例如,根 据 T。代和自交所得到凡代植株的 Sout
凝血酶切割位点的定义
中文名称凝血酶切割位点英文名称thrombin cleavage site定 义基因工程表达系统中融合蛋白常用的连接序列,凝血酶处理可将融合蛋白中目的蛋白与非目的蛋白的肽段分离,最适切割位点是:P4-P3-P2-Arg↓-P1′-P2′,式中P4和P3为疏水氨基酸,P1′和P2′为非酸性氨基酸,↓
揭示新的药物靶点:KRAS蛋白的构象控制位点
控制KRAS:揭示关键癌症蛋白的变构位点研究人员在基因组调控中心和威康萨克研究所利用深度突变扫描技术全面识别了蛋白质KRAS中的变构控制位点,该蛋白质是许多类型的癌症中最常见的突变基因之一。科学家们使用深度突变扫描技术来量化超过26,000个突变对KRAS的折叠和其与六个相互作用伙伴结合的影响。KR