DNA酶I超敏感位点作图

实验材料 真核细胞试剂、试剂盒 缓冲液 AEDTA乙醇裂解缓冲液磷酸盐缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I 稀释缓冲液DNA 酶 I 溶液蛋白酶 K 溶液RNA 酶溶液酚:氯仿SDS 缓冲液TE仪器、耗材 Sorvall H1000B 转头或等价物带螺帽的试管振荡水浴锅实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓冲液和试剂的组成请参见附录 1, 贮存液要稀释到适当的浓度。缓冲液 A50 mml/LTris-Cl(pH7.9)100 mmol/LNaCl3 mmol/LMgCl21 mmol/LDTT0.2 mmol/L 苯甲基磺酰氟缓冲液 A 贮存在 4°C。临用前加入 DTT 和苯甲基磺酰氟。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇裂解缓冲液50 mmol/L Tris-Cl(pH7.9)100 mmol/L KCl5 mmol/L MgCl20.05%(V/V) 皂角苷50%(V/V) 甘油200 mmol/L β-琉基乙醇裂解缓冲液......阅读全文

DNA-酶-I-超敏感位点作图

DNA 酶 I 超敏感位点作图法经常用于定位真核基因的调控区。由于还未被理解的原因,基因带有对 DNA 酶 I 切割敏感的分开的序列,而且这些所谓超敏感位点图谱是随基因的激活状态而变化的(Weintrauband Gmudine1976)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J.

DNA-酶-I-超敏感位点作图

实验材料 真核细胞试剂、试剂盒 缓冲液 AEDTA乙醇裂解缓冲液磷酸盐缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I 稀释缓冲液DNA 酶 I 溶液蛋白酶 K 溶液RNA 酶溶液酚:氯仿SDS 缓冲液TE仪器、耗材 Sorvall H1000B 转头或等价物带螺帽的试管振荡水浴锅实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓

DNA-酶-I-超敏感位点作图

            实验材料 真核细胞 试剂、试剂盒 缓冲液 A EDTA 乙醇 裂解缓冲液

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

本方案介绍在放射性标记的 DNA 片段上确定蛋白质结合位点的作图方法。本方案使用 DNA 酶 I 切割 DNA, 而在替代方案中是用羟自由基断裂 DNA。如果希望得到优化足迹法反应的建议,请参见本方案最后部分的疑难解析以及优化 DNA 酶 I 足迹法反应的栏目。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验             实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分试剂、试剂盒 细胞匀浆缓冲液细胞重悬缓冲液细胞淋洗缓冲液乙醇Ficoll 400甲酰胺染色液MgCl2 CaCl2 溶液NaClNonidetP-40酚:氯仿磷酸盐缓冲液聚乙烯醇终止液组织匀浆液组织重悬缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I

DNA作图实验——多种酶消化

主要用于显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。实验方法原理应用遗传学技术构建能显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。实验材料DNA试剂、试剂盒限制酶缓冲液仪器、耗材电泳仪实验步骤1.  用低频率切割的不同限制性内切酶分别完全消化DNA。 2.  从每个反应取小份样品作电泳分析,用已知的分

DNA作图实验——限制酶部分消化

实验材料DNA试剂、试剂盒限制酶缓冲液仪器、耗材电泳仪实验步骤1.  用低频率切割的不同限制性内切酶分别完全消化DNA。2.  用32P末端标记消化产物,5’末端可先用小牛肠碱性磷酸酶处理。3.  用T4多核苷酸激酶进行标记。4.  3’末端可先用大肠扞菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或T4 DNA

DNA作图实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 限制酶缓冲液仪器、耗材 电泳仪实验步骤   用低频率切割的不同限制性内切酶分别完全消化DNA。2.  从每个反应取小份样品作电泳分析,用已知的分子量标准作对照。剩余的样品置于冰浴。3.  比较分子量标准估算出DNA片段的长度,推导出每种限制性内切酶的酶切位点数目。4. 

DNA作图实验

多种酶消化 限制酶部分消化             实验方法原理 应用遗传学技术构建能显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。

DNA-酶-I-足迹分析实验

试剂、试剂盒 32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚 氯仿乙醇聚乙烯醇竞争 DNA 缓冲液 Z'(或缓冲液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 终止液蛋白酶 K甲酰胺加样缓冲液实验步骤 材料32P-标记 DNA 酶 I 足迹探

DNA-酶-I-足迹分析实验

试剂、试剂盒32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚 氯仿乙醇聚乙烯醇竞争 DNA 缓冲液Z'(或缓冲液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 终止液蛋白酶 K甲酰胺加样缓冲液实验步骤材料32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚/

DNA-酶-I-足迹分析实验

DNA 酶 I 足迹分析实验             试剂、试剂盒 32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针 酚 氯仿

DNA聚合酶I的简介

  DNA聚合酶I的二级结构以螺旋为主,可划分为A至R共18个螺旋肽段。螺旋肽段之间由非螺旋结构连接。其中H区与I区之间的无规则结构较长,有50个氨基酸残基,I螺旋与O螺旋之间由较大的空隙,可以容纳DNA链,而50个氨基酸的无规结构,就像一个盖子那样与I、O螺旋区共同把DNA链包围起来,使其向一个方

什么是DNA聚合酶I?

  DNA聚合酶I的二级结构以螺旋为主,可划分为A至R共18个螺旋肽段。螺旋肽段之间由非螺旋结构连接。其中H区与I区之间的无规则结构较长,有50个氨基酸残基,I螺旋与O螺旋之间由较大的空隙,可以容纳DNA链,而50个氨基酸的无规结构,就像一个盖子那样与I、O螺旋区共同把DNA链包围起来,使其向一个方

DNA酶I足迹分析法

实验方法原理 实验材料 含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒 适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol

DNA酶Ⅰ超敏感性的特征

中文名称DNA酶Ⅰ超敏感性英文名称DNase Ⅰ hypersensitivity定  义DNA极易被DNA酶Ⅰ切割的特性,是染色质活化部位的特征。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

DNA酶Ⅰ超敏感部位的特征

中文名称DNA酶Ⅰ超敏感部位英文名称DNase I hypersensitive site定  义特指由于特定蛋白质的结合或转录而使30nm染色质纤丝结构解体的染色质的活化部位。该部位的DNA序列极易被DNA酶Ⅰ所切割。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

DNA酶I足迹分析法实验——NA酶I足迹分析法

本分析方法用来检测DNA上特异的蛋白质结合位点。位点上结合的蛋白质可保护 D N A 的 磷 酸 二 酯 键 骨 架 免 于 受 D N A 酶 I 催 化 的 水 解 。 水 解 后 D N A 片 段 在 变 性DNA测序胶上分离,通过放射自显影可使结合位点显示出来。足迹法已进一步发展成为确定D

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

试剂、试剂盒 TE牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷酸激酶缓冲液TBE 加样缓冲液TBE质粒 DNA合适的限制酶粉 氯仿氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛肠碱性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸铵 乙酸钠丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED仪器、耗材 SpeedVac 旋转浓缩器

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

试剂、试剂盒TE牛肠碱性磷酸酶缓冲液T4 多核苷酸激酶缓冲液TBE 加样缓冲液TBE质粒 DNA合适的限制酶粉 氯仿氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛肠碱性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸铵乙酸钠丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED仪器、耗材SpeedVac 旋转浓缩器实验步骤

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

DNA 酶 I 足迹探针的制备实验             试剂、试剂盒 TE 牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷

DNA酶I足迹分析法实验

DNA酶I足迹分析法 用光密度及数值分析法决定蛋白质结合的平衡常数 粗制品的DNA酶足迹分析法             实验方法原理

酶的活性位点的定义

酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合,如:氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如,底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上,也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上,或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合

酶的活性位点的作用

酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合,如:氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如,底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上,也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上,或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合

细胞化学词汇DNA酶Ⅰ超敏感性

中文名称:DNA酶Ⅰ超敏感性英文名称:DNase Ⅰ hypersensitivity定  义:DNA极易被DNA酶Ⅰ切割的特性,是染色质活化部位的特征。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇DNA酶Ⅰ超敏感部位

中文名称:DNA酶Ⅰ超敏感部位英文名称:DNase I hypersensitive site定  义:特指由于特定蛋白质的结合或转录而使30nm染色质纤丝结构解体的染色质的活化部位。该部位的DNA序列极易被DNA酶Ⅰ所切割。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

DNA酶I足迹分析法实验2

实验材料含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol L 4dNTP 混合液脱氧

关于DNA聚合酶I的基本介绍

  DNA聚合酶I(DNA-pol I),分子量109kD,为单肽链组成,400分子数/细胞,是原核生物的DNA聚合酶,由于发现最早命名为DNA聚合酶I,其他原核生物的DNA聚合酶,按发现的先后顺序分别命名为DNA聚合酶Ⅱ、DNA聚合酶Ⅲ、DNA聚合酶Ⅳ和DNA聚合酶Ⅴ。

关于DNA聚合酶I的功能简介

  1)通过核苷酸聚合反应,使DNA链沿5’→3’方向延长(DNA聚合酶活性)  2)催化由3’端水解DNA链(3’→ 5’核酸外切酶活性,用于切除错配的碱基)  3)催化由5’端水解DNA链(5’→ 3’核酸外切酶活性,用于切除引物)  4)催化由3’端使DNA链发生焦磷酸解  5)催化无机焦磷酸