RNA蛋白复合物中寡核苷酸靶向的RNaseH切割保护实验

寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合物(RNP,核糖核蛋白颗粒)的方法,无论是对于粗提物还是提纯后的样品,对分析 RNP 的结构域的结构都非常有效。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合物(RNP,核糖核蛋白颗粒)的方法,无论是对于粗提物还是提纯后的样品,对分析 RNP 的结构域的结构都非常有效。实验材料蛋白酶 KAMV 反转录酶试剂、试剂盒缓冲液DNase ⅠDNase Ⅰ 缓冲液酚氯仿溶液乙酸钠RNasinE.coli RNase HTBE 缓冲液过硫酸铵溶液尿素凝胶点样缓冲液转移缓冲液SSPE 缓冲液核苷酸溶液琼脂糖丙烯酰胺RNP 凝胶点样缓冲液仪器、耗材变性聚丙烯酰胺凝胶电泳电转移设备尼龙膜实验步骤一、材料与设备所有的缓冲液和溶液必须无 RNA 酶污染。1. RNP 制备和 DEAE 层析(1) 缓冲液 D ......阅读全文

光活化的核苷酸类似物介导的RNA蛋白的交联实验

实验方法原理 光化学交联技术是研究核搪核蛋内复合物中 RNA 与蛋白的相互作用的有效手段。 其基本原理是未经任何化学修饰的 RNA -蛋白天然复合物在短波长紫外线(254 nm ) 照射时,RNA 中的核苷酸和蛋白质中的氨基酸会产生光化学反应,转变为活性状态,进而形成分子间共价交联。实验材料

酵母三杂交系统检测和分析RNA蛋白相互作用实验

酵母三杂交系统(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中,RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录,可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方

酵母三杂交系统检测和分析RNA蛋白相互作用实验

实验方法原理 酵母三杂交系统(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中,RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录,可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。试剂、试剂盒 YPD 和 SD 培养基鲑

RNAseq综述(九)

通过研究RNA分子内的相互作用来研究RNA的结构核糖体RNA和tRNA构成细胞的大部分RNA。它们与其他结构非编码RNA一起在细胞中发挥各种作用,例如从基因调节到翻译。现存主要有两种研究RNA结构的方法:基于核酸酶的方法和化学探针方法。核糖核酸酶消化于1965年首次用于研究RAN(tRNA(Ala)

不均一核糖核蛋白复合物的制备实验

            实验方法原理 在核内,RNA 聚合酶 Ⅱ 的转录产物同大量不同类型的核前体 mRNA/mRNA 结合蛋白,不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucUoprotein,hnRNP)  结合形成 hnRNP 复

不均一核糖核蛋白复合物的制备实验

实验方法原理 在核内,RNA 聚合酶 Ⅱ 的转录产物同大量不同类型的核前体 mRNA/mRNA 结合蛋白,不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucUoprotein,hnRNP)  结合形成 hnRNP 复合物。实验材料 HeLa S3 细胞抗体试剂、试剂盒 免疫

不均一核糖核蛋白复合物的制备实验

在核内,RNA 聚合酶 Ⅱ 的转录产物同大量不同类型的核前体 mRNA/mRNA 结合蛋白,不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucUoprotein,hnRNP)  结合形成 hnRNP 复合物。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理在核内

RNA蛋白质印迹法的技术应用

中文名称RNA-蛋白质印迹法英文名称Northwestern blotting定  义将经过电泳分离的蛋白质转移到膜上再与某种特异的RNA探针杂交,是研究蛋白质与RNA特异结合的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

Core-RISC的概念

Core RISC:是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。

Core-RISC的概念

Core RISC:是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。

RNA干扰相关知识Core-RISC

Core RISC:是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。

Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

   RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,

Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。 其基本原理是蛋白质可以与末端标记的核酸探针

RIP技术简介

由于miRNA被发现在癌症机理中起重要的作用,尤其是与肿瘤转移相关联,因此对于miRNA的研究来说,最让人兴奋的是有希望应有于癌症治疗中的RNA 抑制疗法或模拟miRNA表达疗法,尤其是对于出现肿瘤转移的癌症病人的治疗。但是miRNA具有成百上千个靶标,所以要完全理解一个miRNA和靶标的特异性反应

RNA蛋白免疫沉淀技术简介

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合

RIP-技术——研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具-二

但是miRNA具有成百上千个靶标,所以要完全理解一个miRNA和靶标的特异性反应与肿瘤发生之间的联系,是一项非常具有挑战性的工作,尤其是在癌症研究中鉴别出miRNA的准确靶点仍然是一大难题。现已知道miRNA的调节功能是通过结合不同的蛋白质或RNA来实现的,因此研究miRNA与蛋白的结合情况对于揭示

激光切割机在切割过程中的问题叙述

  激光切割机在切割过程中,光束经切割头的透镜聚焦成一个很小的焦点,使焦点处达到高的功率密度,其中切割头固定在z轴上。这时,光束输入的热量远远超过被材料反射、传导或扩散的部分热量,材料很快被加热到熔化与汽化温度,与此同时,一股高速气流从同轴或非同轴侧将熔化及汽化了的材料吹出,形成材料切割的孔洞。随着

激光切割中的高压制氮机

  激光切割机在切割钢板或不锈钢等材料时,会用到铺助气体,比如使用氧气作为铺助气体时,会产生放热反应,在切割碳钢时特别明显,这类方案被广泛认知。  在这一进程中,氧气用于金属表面的激光束投射点,使钢板加热,带来放热反应,使区域温度到达熔点,融化的金属被吹风吹出去,与材料脱离,终究构成一个平滑,带有氧

采用PACE分析RNA肽相互作用实验

实验方法原理 聚丙烯酰胺共电泳(poiyacrylamide coelectrophuresis,PACE ) 检测是相对较晚发展起来的定量分析蛋白质、肽与 DNA 或 RNA 相互作用的方法。实验材料 低放射性标记物RNA 底物试剂、试剂盒 TBE 凝胶储存缓冲液电泳缓冲液丙烯酰胺储存液过硫酸铵考

采用PACE分析RNA肽相互作用实验

聚丙烯酰胺共电泳(poiyacrylamide coelectrophuresis,PACE ) 检测是相对较晚发展起来的定量分析蛋白质、肽与 DNA 或 RNA 相互作用的方法。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理聚丙烯酰胺共电泳(poiyacrylamide coelec

采用PACE分析RNA肽相互作用实验

            实验方法原理 聚丙烯酰胺共电泳(poiyacrylamide coelectrophuresis,PACE ) 检测是相对较晚发展起来的定量分析蛋白质、肽与 DNA 或 RNA 相互作用的方法。

《癌症基因治疗》-李明远小组-siRNA基因治疗新方法

来自四川大学华西医学中心微生物学教研室,成都生物制品研究所(Institute of Chengdu Biological Products)的研究人员通过构建质粒pAd-hTR证明了hTR siRNA在HeLa细胞系中有效和特异的端粒酶的敲除,从而指出了这种siRNA表达重组腺病毒系统在癌症基因治

寡核苷酸介导的诱变实验

用突变的寡核苷酸引导模板的合成,从而改变DNA序列,突变效率可达50~80%。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒PEGTEATP寡核苷酸诱变引物T4多核苷酸激酶EDTASSC仪器、耗材水浴锅电泳仪培养箱实验步骤1.  将一个单链噬菌体产生的噬斑转移至含有1 ml 灭菌TY培养基的1.5 ml 微量离心管中

寡核苷酸介导的诱变实验

实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 PEGTEATP寡核苷酸诱变引物T4多核苷酸激酶EDTASSC仪器、耗材 水浴锅电泳仪培养箱实验步骤 1.  将一个单链噬菌体产生的噬斑转移至含有1 ml 灭菌TY培养基的1.5 ml 微量离心管中,60℃温育5 min,以杀灭细菌细胞,剧烈振荡以释放琼脂中的噬菌体,

寡核苷酸介导的诱变实验

基本方案             实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒

蛋白质易位之共翻译易位

大多数分泌蛋白和膜结合蛋白是共翻译易位的。驻留在内质网(ER)、高尔基体或内体中的蛋白质也使用共翻译易位途径。这个过程开始于蛋白质在核糖体上合成时,此时信号识别粒子(SRP)识别新生蛋白质的N端信号肽。SRP的结合会暂时停止合成,而核糖体-蛋白质复合物会转移到真核生物ER上的SRP受体和原核生物的质

免疫沉淀法的主要类型

个别免疫沉淀法(IP):用来分离某个细胞萃取物中的已知特定蛋白质免疫共沉淀法(Co-IP):研究整个蛋白质复合体染色质免疫沉淀法(ChIP):用来研究DNA上的特定蛋白质RNA免疫沉淀法(RIP):和ChIP相近,但RNA免疫沉淀法是用来研究会与RNA结合的蛋白质RIP技术(RNA Binding

简并寡核苷酸诱变实验

实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS无水乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机分光光度计实验步骤 1.  设计寡核苷酸,其3‘端含有由8个核苷酸组成的回文结构,且包含某一限制性内切酶的识别位点;如果可能的话,5’端也应有一含某个限制性内切酶位点的序列。中间区段则应含目

简并寡核苷酸诱变实验

小段DNA序列中产生大量突变             实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒