简并寡核苷酸诱变实验
实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS无水乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机分光光度计实验步骤 1. 设计寡核苷酸,其3‘端含有由8个核苷酸组成的回文结构,且包含某一限制性内切酶的识别位点;如果可能的话,5’端也应有一含某个限制性内切酶位点的序列。中间区段则应含目的诱变区。 图一、简并寡核苷酸的设计 2. 寡核苷酸的合成。在无需突变的位置时,用一种核苷酸前体的同质溶液进行合成,而在需要突变的位置时,则用特定的核苷酸前体混合物来控制合成反应的进行。 3. 通过HPLC和(或)含7 mol/l 尿素的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化每核苷酸,用水调整浓度至1 mg/ml。4. 取200 pmol (1~2 μg)寡核苷酸加至一个500 μl 的微量离心管中,加水至7 μl 温育5 min。 5. 加1 μl......阅读全文
简并寡核苷酸诱变实验
小段DNA序列中产生大量突变 实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒
简并寡核苷酸诱变实验
实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS无水乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机分光光度计实验步骤 1. 设计寡核苷酸,其3‘端含有由8个核苷酸组成的回文结构,且包含某一限制性内切酶的识别位点;如果可能的话,5’端也应有一含某个限制性内切酶位点的序列。中间区段则应含目
简并寡核苷酸诱变实验
本方法的一个重要特点就是将单链的简并寡核苷酸转变成同源双链分子后直接克隆进常规载体。由于不同的寡核苷酸可通过其3’末端的回文结构杂交,因此,寡核苷酸实际上起互为引物的作用,在大肠杆菌DNA聚合酶I klenow片段作用下延伸。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS
简并寡核苷酸基因混编实验
实验材料 pBSII KS 质粒大肠杆菌 DH5α试剂、试剂盒 Pfx 聚合酶碱性磷酸酶通用缓冲液覆盖液刚果红溶液脱色液桦木木聚糖底物溶液PAHBAH 储液实验步骤 我们以 DNA 重组 D.thermophilum Rt46B.1 木聚糖酶基因( xynB) 及其 5 个相关的木聚糖酶基因为例
简并寡核苷酸基因混编实验
蛋白酶生化性质的改善可以通过对该酶基因的错掺突变和 DNA 混编方法实现。混编技术可用于同一基因的一组突变体,或者对相关家族基因的片段进行新的组合,产生嵌合突变基因产物。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒编著。实验材料pBSII KS 质粒大肠杆菌 DH5α试剂、
简并寡核苷酸基因混编实验
简并寡核苷酸基因混编 实验材料 pBSII KS 质粒 大肠杆菌 DH5α
寡核苷酸介导的诱变实验
用突变的寡核苷酸引导模板的合成,从而改变DNA序列,突变效率可达50~80%。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒PEGTEATP寡核苷酸诱变引物T4多核苷酸激酶EDTASSC仪器、耗材水浴锅电泳仪培养箱实验步骤1. 将一个单链噬菌体产生的噬斑转移至含有1 ml 灭菌TY培养基的1.5 ml 微量离心管中
寡核苷酸介导的诱变实验
实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 PEGTEATP寡核苷酸诱变引物T4多核苷酸激酶EDTASSC仪器、耗材 水浴锅电泳仪培养箱实验步骤 1. 将一个单链噬菌体产生的噬斑转移至含有1 ml 灭菌TY培养基的1.5 ml 微量离心管中,60℃温育5 min,以杀灭细菌细胞,剧烈振荡以释放琼脂中的噬菌体,
寡核苷酸介导的诱变实验
基本方案 实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌试剂、试剂盒 ATPPE1缓冲液PE2 缓冲液噬菌体 T4 DNA 连接酶噬菌体 T4 多核苷酸激酶大肠杆菌 DNA 聚合酶ⅠKlenow 片段M13 噬菌体通用测序引物含 4 种 dNTP 的 dNTP 溶液诱变的 M
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
本文介绍了由 Zoller 和 Smith 的双引物技术(1984,1987) 结合 Kunkel 的诱变体产量富集方法(1985) 构成的经典方案。本方案中使用的单链 DNA 模板含有较高的尿嘧啶残基,因为它们是从生长于 dut 和 ung 基因突变大肠菌中的 M13 噬菌体中制备的(见方案 1)
寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验
实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌 试剂、试剂盒 ATP
随机寡核苷酸诱变的概念
中文名称随机寡核苷酸诱变英文名称random oligonucleotide mutagenesis定 义通过合成一系列突变寡核苷酸引物对基因组某个区域进行聚合酶链反应扩增,获得大量突变的DNA,以研究突变对功能的影响。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
简并寡核苷酸引物PCR-(DOPPCR)
实验方法原理显微切割或流式分选的染色体经过PCR扩增制备整条染色体的DNA,被认为是对某条染色体全部涂染的高质量探针的首选途径。对于单个染色体、多色FISH(M-FISH)或光谱核型分析中所有24条染色体的涂染均是此种情况。下面提供的操作程序是简并寡核苷酸引物PCR(DOP-PCR)最原始操作程序的
简并寡核苷酸引物PCR-(DOPPCR)
基本方案 实验方法原理 显微切割或流式分选的染色体经过PCR扩增制备整条染色体的DNA,被认为是对某条染色体全部涂染的高质量探针的首选途径。对于单个染色体、多
简并寡核苷酸引物PCR-(DOPPCR)
实验方法原理 显微切割或流式分选的染色体经过PCR扩增制备整条染色体的DNA,被认为是对某条染色体全部涂染的高质量探针的首选途径。对于单个染色体、多色FISH(M-FISH)或光谱核型分析中所有24条染色体的涂染均是此种情况。下面提供的操作程序是简并寡核苷酸引物PCR(DOP-PCR)最原始操作程序
寡核苷酸定点诱变的概念
中文名称寡核苷酸定点诱变英文名称oligonucleotidedirected mutagenesis定 义人工获得特定核酸定点突变的一种方案。将需要改变的核苷酸置于一段合成的寡核苷酸中部,在单链噬菌体(如M13)模板上用克列诺酶合成有指定变化的负链,再通过噬菌体复制得到含突变的双链。应用学科生物
关于寡核苷酸引物诱变的介绍
寡核苷酸引物诱变是由加拿大生物化学家Michael Smith发明的一种基因定点诱变方法。其基本原理是:合成一段寡聚脱氧核糖核苷酸作为引物,其中含有需要改变的碱基,使其与带有目的基因的单链DNA配对,合成的引物除短的错配区外,与目的基因完全互补,然后用DNA聚合酶延伸引物,完成单链DNA的复制。
定点诱变与盒式诱变的比较介绍
构建一个位点导向的文库涉及使用含有一个或多个简并密码子的合成DNA片段替代一个基因片段。这可以通过双链盒式诱变或单链寡核苷酸定向诱变来实现。我们相对倾向于寡核苷酸定向诱变,因为不同于盒式诱变,它不需要在目的区域附近有独特的限制性酶切位点,并且构建一个文库只需要一个寡核苷酸片段。因此,这个方法相当
USE-诱变实验
实验材料 带 mutS 表型(例如BMH71-18) 的转化用大肠杆菌感受态带 mut+表型的转化用大肠杆菌感受态试剂、试剂盒 退火缓冲液贮存液合成缓冲液噬菌体 T4DNA 连接酶噬菌体 T4DNA 聚合酶或测序酶单一位点的限制性内切核酸酶琼脂糖凝胶诱变引物选择引物质粒 DNA仪器、耗材 70°C
USE-诱变实验
实验材料 带 mutS 表型(例如 BMH71-18) 的转化用大肠杆菌感受态 带 mut+表型的转化用大肠杆菌感受态 试剂、试剂盒
诱变-PCR-实验
试剂、试剂盒 氯仿 异戊醇 乙醇 矿物油或者一个蜡珠 3mol L NaOAc 5 mmol L MnCl2 突变 PCR 缓冲液
USE-诱变实验
本方法中,两条寡核苷酸引物杂交到变性重组质粒 DNA 双链的同一条链上。一条引物(诱变引物)携带一个拟引进靶 DNA 序列的突变,第二条引物携带一个能破坏质粒单一限制酶位点的突变。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料带 mutS 表型(
诱变-PCR-实验
诱变 PCR 最大的优势是以一种没有偏好的方式引入了各种类型的突变,而不是获得高水平的单一的扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒氯仿 异戊醇乙醇矿物油或者一个蜡珠3mol L NaOAc5 mmol L MnCl2突变 PCR 缓冲液DNA 聚合酶Nati
诱变-PCR-实验
试剂、试剂盒 氯仿 异戊醇乙醇矿物油或者一个蜡珠3mol L NaOAc5 mmol L MnCl2突变 PCR 缓冲液DNA 聚合酶Native Taq 或 AmpliTaq DNA 聚合酶高纯度的脱氧核苷 5'-三磷酸dNTP 混合物模板 DNA引物琼脂糖凝胶用溴化乙锭染色仪器、
分子遗传学词汇寡核苷酸定点诱变
中文名称:寡核苷酸定点诱变英文名称:oligonucleotide-directed mutagenesis定 义:用人工合成的寡核苷酸在特定位点导致突变。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
定点诱变实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 TE寡核苷酸引物质粒dNTPDNA聚合酶氯仿石蜡油无水乙醇仪器、耗材 离心管热循环仪离心机实验步骤 1. 利用突变区两侧的限制性内切酶位点将待诱变的DNA片段亚克隆进高拷贝数的载体中。 2. 用小量制备的质粒提取模板DNA,用TE缓冲液重悬100 ng DNA至终浓
定点诱变实验
基本方案 利用PCR引物点突变 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
酵母菌细胞的诱变实验——甲乙硫醚诱变
实验材料酵母试剂、试剂盒YPD磷酸钠缓冲液甲乙硫醚刀豆氨酸硫代硫酸钠仪器、耗材试管摇床离心机平板实验步骤1. 将过夜培养的待诱变酵母菌株转接于5 ml YPD培养基,于30℃继续培养。检查细胞密度,记录并调整到2×108细胞/ml。2. 转移1 ml 的菌悬液到无菌的离心管中。高速离心5~10
酵母菌细胞的诱变实验——紫外光诱变
实验材料酵母试剂、试剂盒YPD刀豆氨酸仪器、耗材紫外光杀菌灯紫外光放射量测定器实验步骤1. 将过夜培养的酵母菌培养液接种到5 ml YPD培养基中,于30℃培养。离心5~10 s,用1 ml 无菌水重悬沉淀细胞,重复洗涤1次,再用1 ml 无菌水重悬。 2. 检查细胞密度,记录数据后将细胞密度调