光活化的核苷酸类似物介导的RNA蛋白的交联实验

实验方法原理 光化学交联技术是研究核搪核蛋内复合物中 RNA 与蛋白的相互作用的有效手段。 其基本原理是未经任何化学修饰的 RNA -蛋白天然复合物在短波长紫外线(254 nm ) 照射时,RNA 中的核苷酸和蛋白质中的氨基酸会产生光化学反应,转变为活性状态,进而形成分子间共价交联。实验材料 FPLC纯化的核苷酸Sephadex G-50试剂、试剂盒 缓冲液A甘油乙酰化牛血清白蛋白缓冲液B缓冲液C 肝素缓冲液F酚氯仿异戊醇无RNase的DNaseI叠氮苯酰溴缓冲液D缓冲液CTBE缓冲液蛋白上样缓冲液SDS变性聚丙烯酰胺凝胶转移缓冲液银染试剂仪器、耗材 紫外光源号离心管X 射线片增感屏硝酸纤维素膜电转移装实验步骤―、材料与设备1. 全长含核苷酸类似物的 RNA 合成所有的缓冲液配制均需采用经过蒸馏并灭菌的去离子水(1) 缓冲液 A:20 mmol/L Tris-HAc ( pH 8.0 ),10 mmol/L Mg(Ac)......阅读全文

光活化的核苷酸类似物介导的RNA蛋白的交联实验

            实验方法原理 光化学交联技术是研究核搪核蛋内复合物中 RNA 与蛋白的相互作用的有效手段。 其基本原理是未经任何化学修饰的 RNA -蛋白天然复合物在短波长紫外线(254 nm ) 照射时,RNA 中的核苷酸和蛋白质中的氨基酸会产生光

光活化的核苷酸类似物介导的RNA蛋白的交联实验

光化学交联技术是研究核搪核蛋内复合物中 RNA 与蛋白的相互作用的有效手段。 其基本原理是未经任何化学修饰的 RNA -蛋白天然复合物在短波长紫外线(254 nm ) 照射时,RNA 中的核苷酸和蛋白质中的氨基酸会产生光化学反应,转变为活性状态,进而形成分子间共价交联。本实验来源「RNA 实验指导手

光活化的核苷酸类似物介导的RNA蛋白的交联实验

实验方法原理 光化学交联技术是研究核搪核蛋内复合物中 RNA 与蛋白的相互作用的有效手段。 其基本原理是未经任何化学修饰的 RNA -蛋白天然复合物在短波长紫外线(254 nm ) 照射时,RNA 中的核苷酸和蛋白质中的氨基酸会产生光化学反应,转变为活性状态,进而形成分子间共价交联。实验材料

寡核苷酸介导的诱变实验

基本方案             实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒

寡核苷酸介导的诱变实验

实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 PEGTEATP寡核苷酸诱变引物T4多核苷酸激酶EDTASSC仪器、耗材 水浴锅电泳仪培养箱实验步骤 1.  将一个单链噬菌体产生的噬斑转移至含有1 ml 灭菌TY培养基的1.5 ml 微量离心管中,60℃温育5 min,以杀灭细菌细胞,剧烈振荡以释放琼脂中的噬菌体,

寡核苷酸介导的诱变实验

用突变的寡核苷酸引导模板的合成,从而改变DNA序列,突变效率可达50~80%。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒PEGTEATP寡核苷酸诱变引物T4多核苷酸激酶EDTASSC仪器、耗材水浴锅电泳仪培养箱实验步骤1.  将一个单链噬菌体产生的噬斑转移至含有1 ml 灭菌TY培养基的1.5 ml 微量离心管中

RNA蛋白复合物中寡核苷酸靶向的RNaseH切割保护实验

寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合物(RNP,核糖核蛋白颗粒)的方法,无论是对于粗提物还是提纯后的样品,对分析 RNP 的结构域的结构都非常有效。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合

RNA蛋白复合物中寡核苷酸靶向的RNaseH切割保护实验

实验方法原理 寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合物(RNP,核糖核蛋白颗粒)的方法,无论是对于粗提物还是提纯后的样品,对分析 RNP 的结构域的结构都非常有效。实验材料 蛋白酶 KAMV 反转录酶试剂、试剂盒 缓冲液DNase ⅠDNase Ⅰ 缓冲液酚氯仿溶液乙酸钠R

RNA蛋白复合物中寡核苷酸靶向的RNaseH切割保护实验

            实验方法原理 寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合物(RNP,核糖核蛋白颗粒)的方法,无论是对于粗提物还是提纯后的样品,对分析 RNP 的结构域的结构都非常有效。

核苷酸类似物的临床应用

核苷酸类似物的临床应用。核苷酸类似物6-巯基嘌呤(6MP)及5-氟尿嘧啶(5FU)用于肿瘤的化学治疗。6-巯基嘌呤的结构与次黄嘌呤相似,其一磷酸核苷对于AMP及GMP合成有关的几个酶有抑制作用,从而选择性地阻止肿瘤的生长。5-氟尿嘧啶的结构与胸腺嘧啶相似,它在体内可转变为一磷酸脱氧核糖氟尿嘧啶核苷(

补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间作用实验

基于补骨脂素光化学反应的 RNA-蛋白分子复合物分析法,能够在数据相对缺乏的情况下分析生理条件下的 RNA-蛋白复合物的拓扑构象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验材料蛋白酶K试剂、试剂盒变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙

蛋白质与核酸的紫外交联实验

实验方法原理含有胸苷卤代物如溴脱氧尿苷(BrdU)的DNA比非取代的DNA对紫外线诱导的 交联更为敏感。本方案中的紫外交联效率是0.1%〜10%,而且在单一复合物中出现1 次以上交联事件的情况十分罕见。实验材料含有所研究结合位点的M13单链载体试剂、试剂盒17 bp 的 M13 通用引物1×和10×

蛋白质与核酸的紫外交联实验

用溴脱氧尿苷(BrdU)取代的探针进行紫外交联             实验方法原理 含有胸苷卤代物如溴脱氧尿苷(BrdU)的DNA比非取代的DNA对紫外线诱导的 交联更为敏感。本方

蛋白质与核酸的紫外交联实验

实验方法原理 含有胸苷卤代物如溴脱氧尿苷(BrdU)的DNA比非取代的DNA对紫外线诱导的 交联更为敏感。本方案中的紫外交联效率是0.1%〜10%,而且在单一复合物中出现1 次以上交联事件的情况十分罕见。实验材料 含有所研究结合位点的M13单链载体试剂、试剂盒 17 bp 的 M13 通用引物1×和

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

            实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋

凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验

凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别的序列,建立反应常数(如亲

补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作...

补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用实验实验材料 蛋白酶K试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙二胺过硫酸铵AMV 反转录酶及反应缓冲液磷酸钠8-羟基补骨脂素13-二碘丙烷碳酸钾丙酮石油醚乙酸乙酯硫酸钠硅胶三氟乙

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互...

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。实验材料 RNA试剂、试

补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用

            实验材料 蛋白酶K 试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液 非变性胶电泳缓冲液 结合缓冲液

RNAseq综述(九)

通过研究RNA分子内的相互作用来研究RNA的结构核糖体RNA和tRNA构成细胞的大部分RNA。它们与其他结构非编码RNA一起在细胞中发挥各种作用,例如从基因调节到翻译。现存主要有两种研究RNA结构的方法:基于核酸酶的方法和化学探针方法。核糖核酸酶消化于1965年首次用于研究RAN(tRNA(Ala)

RNA-蛋白质的相互作用1

叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l      DNA模板的线性化1.根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板(如亚克隆在转录载体如pBluescript®(Stratagene)上的菠菜叶绿体psbA基因)的质粒(Schuster and Gruissem1991)。2

RNA-蛋白质的相互作用2

叶绿体mRNA3’末端的体外加工l      RNA加工反应1.在1.5ml微量离心管中加入下列反应液:缓冲液IVT(20×)                            0.5μl叶绿体蛋白提取物(20μg)                      Lμl缓冲液E           

胶原蛋白的交联改性方法介绍

指使胶原分子内部和分子间通过共价健结合提高胶原纤维的张力和稳定性的方法。该法又分为物理方法、化学方法和低温等离子体法,生物学方法;其中物理方法、化学方法是最常用的交联改性方法,生物学方法改性胶原蛋白主要在研究有关动物老化的生命现象中涉及,在研制胶原基生物医学材料中少见报道。

亚甲基蓝介导光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用

亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA相互作用

            实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。

RNA蛋白质印迹法的技术应用

中文名称RNA-蛋白质印迹法英文名称Northwestern blotting定  义将经过电泳分离的蛋白质转移到膜上再与某种特异的RNA探针杂交,是研究蛋白质与RNA特异结合的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

通道蛋白介导的易化扩散

运输过程借助于穿越脂双分子层的通道蛋白完成。通道蛋白中心是亲水性小孔,不同种类的通道蛋白可分别运输离子,水等小分子。主要运输离子的通道蛋白也称为离子通道,对离子具有高度亲和力和高度选择性。离子通道运输速率高,每秒运输离子数量多达几百万个,载体蛋白每秒运载的分子数目则不足一千个。某些离子通道蛋白星关闭

内含肽介导的蛋白连接

通过改变裂解条件以及对内含肽进行适当修饰,可以生物合成c端带有硫酯键或N端带有半光氨酸的蛋白质分子。两种蛋白质混合以后,硫酯键和半光氨酸利用“自然化学连接”(native chemical ligation)的原理进行自发的连接反应,在硫酯和半光氨酸之间形成肽键,从而将两种蛋白质连接起来。自然化学连

通道蛋白介导的易化扩散

运输过程借助于穿越脂双分子层的通道蛋白完成。通道蛋白中心是亲水性小孔,不同种类的通道蛋白可分别运输离子,水等小分子。主要运输离子的通道蛋白也称为离子通道,对离子具有高度亲和力和高度选择性。离子通道运输速率高,每秒运输离子数量多达几百万个,载体蛋白每秒运载的分子数目则不足一千个。某些离子通道蛋白星关闭