利用植物蛋白质芯片研究蛋白磷酸化实验
实验材料异丙基 β-D-硫代半乳糖苷试剂、试剂盒非变性裂解液非变性洗涤液非变性洗脱液苯甲基磺酰氟仪器、耗材超声匀浆器聚丙烯柱实验步骤3.1 非变性条件下重组激酶的纯化用于磷酸化筛选的激酶必须是可溶和有活性的,且无其他激酶参杂的纯化激酶。因此,我们可以从 cDNA 表达文库中,大量生产和纯化组氨酸标记的重组蛋白质激酶,这些 cDNA 表达文库包括,用大肠杆菌载体 PQE30NST ( 检索编号:AF074376;22 ) 构建的大麦表达文库,或用 pQE30NASTattB 载体(检索编号:AY386205;23;也可见 28.3.1 ) 构建的拟南芥表达文库。我们用以下方法从这些文库中表达并纯化蛋白激酶。表达:( 1 ) 在 Falcon 离心管(50 ml ) 中加入 10 ml 细胞培养基。( 2 ) 将培养物与表达组氨酸标记蛋白激酶的细菌一起接种到培养基中,这些细菌取自于保存于 -80°C 的 384 微孔板。( 3 ) ......阅读全文
蛋白质磷酸化的最重要的机制
蛋白质磷酸化是调节和控制蛋白质活力和功能的最基本、最普遍,也是最重要的机制。蛋白质磷酸化主要发生在两种氨基酸上,一种是丝氨酸(包括苏氨酸),另一种是酪氨酸。这两类酸磷酸化的酶不一样,功能也不一样,但也有少数双功能的酶可以同时作用于这两类氨基酸,如MEK(促丝裂原活化蛋白激酶激酶mitogen-act
渗透细胞蛋白磷酸化实验
实验方法原理 检测出目标蛋白是磷蛋白后,可将这个蛋白质的磷酸化过程在无细胞系统或天然细胞系统中进行研究。大多数蛋白激酶除了在细胞内还可在胞外进行许多底物的磷酸化。天然细胞的渗透化处理为得到满意结果提供了一个有效的实验方法,通过使用一些不同的试剂可以使细胞处于短暂的渗透状态。这个过程使反应发生在细胞内
渗透细胞蛋白磷酸化实验
基本方案 带分析 备择方案1 制备用于SDS-PAGE的天然细胞样品 备择方案2 制备用于等电聚焦的天然细胞样品 实验方法原理 检测出目标
植物或利用疯牛病蛋白形成记忆
一项日前发表于美国《国家科学院院刊》的研究表明,朊病毒—— 一种同疯牛病存在相关的蛋白——可能对植物的记忆负责。 这些蛋白可能有助于植物基于过去的事件改变它们的行为,从而帮助其决定诸如何时开花等行为。众所周知,植物拥有记忆。比如,某些植物会在长时间暴露于寒冷后开花。不过,如果经历寒冷后条件
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并...(一)
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压的病理机制慢性肾病病人一般会出现很多的并发症,其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一,但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术,对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并...(二)
Figure 2. Quantification and Gene Ontology analysis ofdifferentially phosphorylated peptides and proteins in (5/6Nx + NS)/(Sham + NS)and (5/6Nx +
DNA结合蛋白的磷酸化研究
磷酸化化学计量的确定及磷蛋白形成动力学的测定l 磷酸化作用化学计量的确定1.在冰上建立下列反应混合液:Tris-HCl(50mmol/L;pH8.0)/MgCl2(10mmol/L) 250μlATP(10mmol/L)
植物蛋白质组学和糖基化实验
实验材料链霉亲和素-过氧化物酶 牛胰核糖核酸酶 B
方案11-利用脱水胰酶亲和捕获蛋白质实验
试剂、试剂盒乙酸牛胰酶CaCl2溴化氰活化的 Sepharose 4BHClKOHNaHCO3NaOHPMSFPBS硫酸鲑精蛋白乙酸钠三氟乙酸Tris-Cl仪器、耗材透析膜烧结的玻璃漏斗水浴锅实验步骤一、ST-Sepharose 亲和树脂的制备二、脱水胰酶的制备三、脱水胰酶亲和柱的制备四、样品制备、
蛋白质组学牛人利用新技术分析蛋白质图谱
蛋白质组(proteomics)分析是针对不同条件下细胞中蛋白的功能和特性进行研究的统称,这一领域的研究一直以来都落后于基因组研究,后者在技术创新方面取得了不少成果,一些令人眼花缭乱的快速基因组图谱绘制技术,还有无需借助核心实验室设备就能完成实验的技术,都令我们印象深刻。 但是与基因组研究
植物组织蛋白质提取方法
1、植物组织蛋白质提取方法(summer)1、根据样品重量(1g样品加入3.5ml提取液,可根据材料不同适当加入),准备提取液放在冰上。2、把样品放在研钵中用液氮研磨,研磨后加入提取液中在冰上静置(3-4小时)。3、用离心机离心8000rpm40min4℃或11100rpm20min4℃4、提取上清
非标记蛋白质的磷酸化作用分析实验——免疫印迹分析
鉴定蛋白质中磷酸化的氨基酸残基是很有意义的。磷酸化作用发生在蛋白质的丝氨酸、苏氨酸和酩氨酸时,通过部分的HCl水解及接着进行双向薄层电泳,可以便利地鉴定 标记的磷酸氨基酸。实验材料蛋白质样品试剂、试剂盒钒酸钠封阻液TNTNATris·Cl叠氮钠印度墨汁染色液TBS仪器、耗材吸水纸水浴锅实验步骤1.
非标记蛋白质的磷酸化作用分析实验——化学发光法
实验材料蛋白质样品试剂、试剂盒钒酸钠封阻液TNTNATris·Cl叠氮钠印度墨汁染色液TBS仪器、耗材吸水纸水浴锅实验步骤1. 如基本方案步骤1所述,用SDS-聚丙烯醜胺凝胶电泳分离样品,使用含100 μmol/l 钒酸钠的转移液将蛋白质转印至硝酸纤维素滤膜上。 2. 在塑料容器内,膜与不含叠氮
大连化物所等磷酸化蛋白质组分析方法研究取得新进展
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)邹汉法、叶明亮等在磷酸化蛋白质组分析新方法研究方面取得新进展。该团队与加拿大西安大略大学教授李顺成研究团队利用生物分子之间的特异性识别作用建立了一种非抗体的酪氨酸磷酸化肽段富集新方法,显著提高了酪氨酸磷酸化蛋白质组的
磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研究获突破
近日,广东省农业科学院农业生物基因研究中心晏石娟团队联合加拿大约克大学、德国马普分子植物生理研究所等研究人员在磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研发方面取得重大突破,首次搭建全自动在线磷酸化蛋白质组学分析技术平台,解决了磷酸化蛋白质组学研究的一大瓶颈。相关研究以农业生物基因研究中心为第一完成单位在线发
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压
慢性肾病病人一般会出现很多的并发症,其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一,但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术,对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面系统性的分析。 Proteomic and p
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压
慢性肾病病人一般会出现很多的并发症,其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一,但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术,对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面系统性的分析。 Proteomic and p
蛋白质N磷酸化修饰富集方法进展
蛋白质N-磷酸化修饰富集方法进展 江波1, 高博2, 魏淑娴2, 梁振1, 张丽华1,*, 张玉奎1 1.中国科学院大连化学物理研究所,医学蛋白质组全国重点实验室,国家色谱研究中心, 中国科学院分离分析化学重点实验室,辽宁 大连 116023 2.中国石油大学(华东)化学化工学院,山东 青
蛋白质芯片技术探针的制备方法
低密度蛋白质芯片的探针包括特定的抗原、抗体、酶、吸水或疏水物质、结合某些阳离子或阴离子的化学集团、受体和免疫复合物等具有生物活性的蛋白质。制备时常常采用直接点样法,以避免蛋白质的空间结构改变。保持它和样品的特异性结合能力。高密度蛋白质芯片一般为基因表达产物,如一个cDNA文库所产生的几乎所有蛋白质均
蛋白质芯片对于药物筛选的应用
疾病的发生发展与某些蛋白质的变化有关,如果以这些蛋白质构筑芯片,对众多候选化学药物进行筛选,直接筛选出与靶蛋白作用的化学药物,将大大推进药物的开发。蛋白质芯片有助于了解药物与其效应蛋白的相互作用,并可以在对化学药物作用机制不甚了解的情况下直接研究蛋白质谱。还可以将化学药物作用与疾病联系起来,以及药物
植物蛋白质组学和糖基化实验(三)
3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷(见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较,电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据(见注释 11)。( 1 ) 将 1
植物蛋白质组学和糖基化实验1
实验材料链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白的总糖
植物蛋白质组学和糖基化实验2
3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷(见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较,电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据(见注释 11)。( 1 ) 将 1
植物蛋白质组学和糖基化实验(五)
1. 含高甘露糖型 N-糖苷糖蛋白的鉴定本方法是我们实验室以油菜籽为实验材料建立的,本方法也适用于其他植物材料。( 1 ) 将 6 g 植物材料放入 4°C 预冷的研钵中,加入 50 ml 预冷的 TBS 缓冲液,研磨萃取蛋白质(见注释 13),接着 10000 g 离心萃取物 30 min,去
植物蛋白质组学和糖基化实验(四)
3.3 我的糖基化蛋白在哪实验人员可通过这个方法获得关于糖苷在蛋白骨架上的分布及糖苷本身的结构信息。这类实验可在纯化的糖蛋白或者从 1D 或 2D 电泳胶上分离出来的蛋白上进行,首先,用蛋白内切酶消化蛋白质,通过高效液相色谱(HPLC) 分离消化后的肽和糖肽混合物。对含有糖苷的收集组分进行糖
植物蛋白质组学和糖基化实验(二)
刀豆球蛋白 A (ConA)- 过氧化物酶方法(根据参考文献 20 修改的方法)。( 1 ) 通过 1D 或 2D 电泳分离,并转移到硝酸纤维素膜上。( 2 ) 用 TTBS 缓冲液浸泡印迹膜 1 h。( 3 ) 将印迹膜在含有 ConA ( 25 μg/ml)的 TTBS 缓冲液中,室温下温育 2
植物蛋白质组学和糖基化实验(一)
实验材料 链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒 DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤 3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白
蛋白质组学在植物科学研究中的应用
1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen
透化细胞和退化细胞器中蛋白质的磷酸化实验—试剂制备
试剂、试剂盒胞外缓冲液胞内缓冲液透化缓冲液标准裂解缓冲液裂解缓冲液SDS-PAGE 加样缓冲液双向-PAGE 裂解緩冲液实验步骤这些试剂在后面许多地方要用到,应在进行下述实验前配好。1. 胞外缓冲液(pH 7.2,37℃)110 mmol/L NaCl10 mmol/L KCI1 mmol/L Mg
蛋白质分离实验
实验方法原理 实验材料 含10 mg蛋白质/ml 的溶于水的样品试剂、试剂盒 硼酸钠仪器、耗材 50 μm 内径的包被的融合硅毛细管柱CE 仪器实验步骤 1. 用 50 mmol/L 硼酸钠缓冲液 1/10(V/V) 稀释蛋白质样品,使终浓度 1.0 mg/ml,也可在 50 mmol/L 硼酸钠缓