对于不明原因的肝病,外显子组测序显神威

据统计,大约两成肝病患者患有“不明原因的肝病”,就是将甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病毒全查一遍,也找不到致病的原因。这让医生和患者都很郁闷。不过,最新研究表明,外显子组测序能够发现部分患者中的突变。 耶鲁大学医学院和密歇根大学的研究人员近日对19名不明原因的肝病患者进行了深度表型分析和外显子组测序分析。他们成功地对其中5名患者进行了诊断,发现了四种单基因疾病。这项成果发表在《Journal of Hepatology》杂志上。 耶鲁大学医学院的Silvia Vilarinho及其同事表示:“我们提供了数据,支持外显子组测序(WES)在不明原因肝病患者的诊断和管理中的作用,这可能涉及到其他疾病。” 耶鲁大学在2015年10月至2018年8月期间招募了19名原因不明的肝病患者,他们没有过量饮酒史,诊断时的年龄介于22岁至73岁,利用Illumina测序仪,研究人员对这些患者的蛋白质编码区域进行了测序。 他们将这些序列与人类参......阅读全文

对于不明原因的肝病,外显子组测序显神威

  据统计,大约两成肝病患者患有“不明原因的肝病”,就是将甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病毒全查一遍,也找不到致病的原因。这让医生和患者都很郁闷。不过,最新研究表明,外显子组测序能够发现部分患者中的突变。  耶鲁大学医学院和密歇根大学的研究人员近日对19名不明原因的肝病患者进行了深度表型分析和外显子组测序

对于不明原因的肝病,外显子组测序显神威

  据统计,大约两成肝病患者患有“不明原因的肝病”,就是将甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病毒全查一遍,也找不到致病的原因。这让医生和患者都很郁闷。不过,研究表明,外显子组测序能够发现部分患者中的突变。    研究人员近日对19名不明原因的肝病患者进行了深度表型分析和外显子组测序分析。他们成功地对其中5名患

Nature发布外显子组测序新成果

  一项新遗传学研究揭示了与严重儿童癫痫相关的两个新基因,并为确定治疗靶点提供了一种新策略。这项研究采用了一种称之为外显子组测序(exome sequencing)的先进遗传学技术,来搜寻不遗传的新突变。研究结果表明,它或许是发现及证实许多致病基因突变的一种高效的方法。相关论文发表在8月11日的

PNAS:外显子变异检测——全基因组测序比全外显子测序更强大

  目前,全外显子测序和全基因组测序技术在遗传分析和发现导致疾病发生的潜在基因突变方面应用越来越广泛,随着测序技术的不断迭代更新,越来越成熟,昂贵的价格会逐渐降低,那么在排除价格因素之后,全外显子测序和全基因组测序在检测外显子突变方面究竟谁更加强大呢?来自美国的科学家对这一问题进行了相关研究,其研究

精准医疗,全外显子组测序立功啦

  精准医疗计划(Precision Medicine Initiative)是美国奥巴马总统在2015年国情咨文演讲中宣布的一项新的国家项目,并称将为建立大量志愿者服用药物的生理和基因资料、建立个人基因组与癌症相关突变靶标、数据标准开发与保密等工作投资共计2.15亿美元。  精准医疗无疑是医疗技术

不必凑样品-让外显子组测序立即开展

  随着新一代测序的渐渐普及,人们对外显子组测序表现出了浓厚的兴趣,因为成本更低,而数据也更容易阐释。Life Technologies公司也顺应潮流,推出新的Ion AmpliSeq™外显子组试剂盒(Ion AmpliSeq™ Exome Kit)。此试剂盒带来了出色的外显子组覆盖度和均

全外显子组测序接近成为“新家族史”

  贝勒医学院分子和人类遗传学儿科学系、人类基因组测序中心和德克萨斯大学健康科学中心的研究人员曾经报道称,在3386名接受全外显子组检测的患者当中,有大约四分之一的患者被诊断为一种已知的遗传疾病。  最近在《Journal of the American Medical Association》(J

外显子组测序发现新的单基因疾病

  根据《美国人类遗传学杂志》本周发表的一篇文章,CHAMP1基因上新获得的突变可能导致一种疾病,具体特征为语言障碍、智力缺陷和一些罕见的面部特征。  德国和荷兰的研究小组对五名儿童开展了外显子组测序。这五个人没有亲属关系,但都有着严重的语言障碍、智力缺陷,以及罕见但类似的面部特征。将这些儿童的蛋白

NEJM发布基因组和外显子组测序的临床指南

  谁也没想到基因组测序技术这么快就进入了临床实践。现在,已经不少医生在测序的帮助下解决了之前难以确诊的疾病,尤其是罕见的儿童疾病。两位著名学者在六月十九日的《新英格兰医学》杂志上发表文章,为医生们提供了测序临床应用的入门指南,帮助他们更有效的利用这一新技术。   “这篇文章为医生们提供了可以遵循的

Nature子刊:测序循环肿瘤细胞的外显子组

  科学家们首次对循环肿瘤细胞(CTC)进行了单细胞外显子组测序,这样的技术可以为人们展示肿瘤演化、转移和应答药物的具体过程。   前列腺肿瘤很容易转移到骨组织,而这样的转移很难用传统方法进行检测。这个问题大大影响了医生们对癌症的监控和治疗。现在一项新研究指出,只需要简单抽血就可以解决这个问题,监

大批量小细胞肺癌外显子组测序完成

  本周《自然―遗传学》上的两份报告介绍了科学家针对82个小细胞肺癌样本的外显子组测序分析工作。他们为干预治疗找到了数个潜在标靶。   小细胞肺癌(SCLC)是一种侵入性癌症,其肿瘤较难被发现。这种肺癌很少能通过手术治愈,从而使得对肿瘤的基因组的系统性分析变得困难。这也是首次科学家得出82个SCL

Science:外显子组测序让“生命密码”解读更容易

        简单来说,外显子组就是遗传代码中蛋白质编码的组分,占整个基因组的1%-2%。测序仪每跑一次仅能读取一定数量的碱基,但通过测序外显子组,研究人员能更快地生成更多的碱基。与全基因组相比,它也可以用更低的成本做出更好的分辨率。   位于荷兰内梅亨的拉德伯德大学医学中心转译基因组学教授 J

汕大女博导外显子组测序发现白内障突变

  汕头大学-香港中文大学联合汕头国际眼科中心的张铭志教授,从事眼科临床专业逾30年,专业方向白内障、青光眼、视光等,是我国最早开展白内障超声乳化手术和白内障屈光手术的知名专家之一,对合并有白内障青光眼的手术治疗,其研究结果引起国际同行的高度关注,并建立手术治疗模型。近年来将临床研究与基础研究相结合

Nature子刊:外显子组测序揭示体细胞突变

  半侧巨脑综合症HME是一种罕见的严重大脑发育畸形,患者大脑两个半球之一过度生长,造成大脑发育不对称。在患有严重癫痫的儿童中常常诊断出这种疾病,而其病因还鲜为人知。目前该疾病的治疗手段是通过手术摘除大脑的患病部分,但手术会对患者的语言和认知能力造成损害。   加利福尼亚大学的研究团队发现,半侧巨

全基因组与外显子组测序在临床诊断中的应用

  全基因组或外显子组测序的临床应用,称为临床基因组和外显子测序( Clinical genome and exome sequencing,CGES)。由于该技术检测范围广,可以同时检测2000多个基因的变异,对于临床罕见病、疑难疾病、复杂疾病,特别是孟德尔遗传病的诊断是一种强大而有效的方法。  

NimbleGenSeqCap用于加拿大一4000外显子组测序项目

  最近罗氏NimbleGen的SeqCap EZ Exome产品被加拿大多伦多一医院基因组服务中心选中,用于一个癌症生物标记物研究。该中心将开展一项4000个外显子组测序项目,用于发现癌症相关的生物标记物。   第一批购买的产品还包括一台Caliper Sciclone NGS Work

NEJM:外显子组测序有助于慢性肾病的诊断

  外显子组测序在某些临床领域正成为新兴的一线诊断方法,但对于大多数成人疾病,它在诊断上的作用尚未得到验证。这其中就包括慢性肾病。据统计,全球每十个人中就有一个受到慢性肾病的困扰。  近日,美国哥伦比亚大学的肾脏科主任Ali Gharavi领导的研究团队在《新英格兰医学杂志》上发表文章称,外显子组测

关于全外显子测序技术

在过去10年里,随着高通量测序技术的出现与发展,科研与临床医学领域的遗传学检测范围不断扩大,检测速度不断加快。时至今天,DNA测序技术不仅推进了遗传学研究,也被用于各种遗传疾病的检查。特别是利用全外显子组测序(whole exomesequencing,WES)与全基因组测序(wholegenome

美国首次公布全外显子测序参保标准-但对全基因组测序拒保

  日前,美国保险公司Cigna公布了一项关于基因测序的新参保政策,该政策强调全外显子测序(WES)和全基因组测序(WGS)的参保条件等问题。该政策由美国保险公司Cigna与InformedDNA公司的遗传学专家共同制定,是美国国家健康体系首次发布全外显子测序的参保标准。  全外显子测序参保标准  

肝脏样本外显子组测序,揭示肝硬化中的复杂突变景观

  正常组织随着年龄的增长而累积遗传变化,但是在慢性退行性疾病的情况下,体细胞突变是否促进非恶性细胞的克隆扩增(clonal expansion)尚不清楚。  在一项新的研究中,来自美国国家糖尿病、消化与肾疾病研究所和德克萨斯大学西南医学中心的研究人员通过对来自82名患者的患病肝脏样本进行外显子组测

-基因外显子组测序,可以诊断近三成的临床疾病

  贝勒医学院分子和人类遗传学儿科学系、人类基因组测序中心和德克萨斯大学健康科学中心的研究人员最新一项报道称,在家族性帕金森病患者发现几个关键的突变基因,包括TNK2和TNR有稀有突变。在12个家系中,这两个基因有9个突变位点。这项研究为深入研究帕金森病的致病基因提供依据。  实际上,贝勒

JAMA:三成的脑瘫患儿可通过外显子组测序来诊断

    脑瘫(cerebral palsy)是一种常见的神经发育障碍,主要表现为运动障碍和姿势异常。通常认为脑瘫是婴儿出生时缺氧造成的,但最近的研究表明,出生时窒息的病例不到脑瘫病例的10%。相反,遗传因素也会造成脑瘫。  美国盖辛格医疗系统的研究人员利用两个队列开展脑瘫的回顾性研究。对于一个主要是

外显子组测序并不一定带来正确的诊断

  美国医学遗传学学会(ACMG)的临床遗传学年会于3月24-28日在美国盐湖城举行。埃默里遗传学实验室的研究人员在会议上表示,外显子组测序数据的初步分析并不一定能带来正确的诊断,需要再次检查。  埃默里大学医学院的教授、遗传实验室的主管Madhuri Hegde在她的报告中举了两个病例,说明研究人

外显子组测序技术用于发现急性红细胞白血病新突变应用

  急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技

外显子组测序帮助发现影响总胆固醇及心肌梗死风险的...

外显子组测序帮助发现影响总胆固醇及心肌梗死风险的TM6SF2基因突变最近在Nature Genetics上发表的一篇文章1,介绍了在挪威人群样本中进行的一项外显子组水平的变异分析,发现了TM6SF2基因上的一个异义突变(p.Glu167Lys)与血液总胆固醇水平及心肌梗死发生风险相关,并对该基因进行

外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用

孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。对于,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、表型特点进行临床判断,同时通过细胞、分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。传统的细胞或分子诊断方法包括核型分析、芯片分析、目标基因的一代Sanger测序等,而随着二代测序的发展,高通量测序

外显子组测序技术应用于发现急性红细胞白血病(AEL)...

外显子组测序技术应用于发现急性红细胞白血病(AEL)新突变中的应用急性红细胞白血病(AEL)是白血病(AML)亚型中的一种,在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML,AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是,针对A

西安交大李磊Cell-Res用单细胞外显子组测序研究肾细胞癌

  生物通报道:肾细胞癌(RCC)占成人恶性肿瘤的3%,和肾肿瘤的90%~95%。转移性疾病通常会对放疗和化疗产生耐药性。免疫治疗表现出15%至20%的有限反应率。肿瘤干细胞(CSCs)是肾癌发生、发展以及耐药性的关键参与因子。以前的研究已经表明,RCC是一种遗传学明显不同的成人癌症,具有相对较低的

外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用

  孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。对于,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、表型特点进行临床判断,同时通过细胞、分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。传统的细胞或分子诊断方法包括核型分析、芯片分析、目标基因的一代Sanger测序等,而随着二代测序的发展,高通量

全外显子组测序追踪找到了白血病复发的基因突变

  近日,来自圣犹大儿童研究医院的研究人员发表在国际著名杂志Journal of the American Medical Association上的一篇研究论文中表示,他们已经使用了全外显子组测序对急性淋巴性白血病(Acute lymphoblastic leukemia,ALL)患者机体的基因组