脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验
实验概要本实验利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分离了大分子DNA。实验原理大分子DNA(一般长度超过20kb,在某些情况下,超过40kb)在电场作用下通过孔径小于分子大小的凝胶时,将会改变无规卷曲的构象,沿电场方向伸直,与电场平行从而才能通过凝胶。此时,大分子通过凝胶的方式相同,迁移率无差别(也称“极限迁移率”),不能分离。脉冲场凝胶电泳技术解决了这一难题,它应用于分离纯化大小在10~2000kb 之间的DNA 片段。 这种电泳是在两个不同方向的电场周期性交替进行的,DNA分子在交替变换方向的电场中作出反应所需的时间显著地依赖于分子大小,DNA越大,这种构象改变需要的时间越长,重新定向的时间也越长,于是在每个脉冲时间内可用于新方向泳动的时间越少,因而在凝胶中移动越慢。反之,较小的DNA 移动较快,于是不同大小的分子被成功分离。在许多实用的PFGE方法中,倒转电场凝胶电泳是最简单最常用的方法(FIGE)。通过把一个在不同......阅读全文
脉冲场凝胶电泳(PFGE)概述
脉冲场凝胶电泳(PFGE)的原理大致为:细菌包埋于琼脂块中,用适当的内切酶在原位对整个细菌染色体进行酶切,酶切片段在特定的电泳系统中通过电场方向不断交替变换及合适的脉冲时间等条件下而得到良好的分离。PFGE中内切酶的选用至关重要,所采用的内切酶常为寡切点酶(lowfrequencycleavager
脉冲场凝胶电泳(PFGE)概述
脉冲场凝胶电泳(PFGE)的原理大致为:细菌包埋于琼脂块中,用适当的内切酶在原位对整个细菌染色体进行酶切,酶切片段在特定的电泳系统中通过电场方向不断交替变换及合适的脉冲时间等条件下而得到良好的分离。PFGE中内切酶的选用至关重要,所采用的内切酶常为寡切点酶(low frequency cle
脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验
实验概要本实验利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分离了大分子DNA。实验原理大分子DNA(一般长度超过20kb,在某些情况下,超过40kb)在电场作用下通过孔径小于分子大小的凝胶时,将会改变无规卷曲的构象,沿电场方向伸直,与电场平行从而才能通过凝胶。此时,大分子通过凝胶的方式相同,迁移率无差别(也称“极
宿迁市疾控中心实验室通过PFGE能力验证
近日,宿迁市疾控中心从省获悉,市疾控中心实验室参加的PulseNet China网络实验室PFGE实验能力考核中,图谱质量符合“分子分型实验室PFGE实验能力考核测试结果评价标准”,记录完整,考核结果合格,具备较高水平。再次证明我市疾控中心实验室具备菌株分子分型能力,为我市细菌流行病学监测及从基
数字PCR新应用:基于S1PFGEddPCR技术的质粒介导耐药基...
病原细菌产生耐药性,能够降低细菌感染后的药物治疗效果,并增加细菌感染和传播的风险,是造成食品安全问题和健康威胁的重要因素。细菌耐药性可分为固有耐药(intrinsic resistance)和获得性耐药(acquired resistance)两种。在获得性耐药中,携带耐药基因的质粒可导至耐
脉冲电场凝胶电泳的定义
PFGE:脉冲电场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis),在脉冲电场中,DNA分子的迁移方向随着电场方向的周期性变化而不断改变。在标准的PFGE中,第一个脉冲的电场方向在另一侧成45°夹角。由于琼脂糖凝胶的电场方向、电流大小及作用时间都在交替变化,使得DNA分子
采用Agilent-Femto-Pulse系统对不同基因组DNA提取进...(二)
Femto Pulse 系统使用基因组 DNA 165 kb扩展法来分离大于 80 kb 的提取 gDNA(图 1)。使用 Agilent ProSize 数据分析软件上的 Smear Analysis 选项卡分析 gDNA 的分子量分布。弥散条带分子量分布包含整个弥散条带范围内的浓度分布。
上海市疾控中心成为PulseNet-China首家区域中心实验室
10月18日,上海市疾病预防控制中心(下称市CDC)隆重举行了“PulseNet China上海区域中心实验室”揭牌仪式,这不仅标志着市CDC成为PulseNet China首家区域中心实验室,也深刻揭示本市在传染病监测和防控领域跨上新的台阶 据专家介绍,PulseNet China是指我国细
Pulse-Field-Electrophoresis
Manipulating and analyzing DNA are fundamentals in the field of molecular biology. Indeed, separating complex mixtures of DNA into different sized fra
采用Agilent-Femto-Pulse系统对不同基因组DNA提取进...(一)
采用Agilent Femto Pulse系统对不同基因组DNA提取进行质量评估作者Chava Pocernich,Jolita Uthe,Steve Siembieda 安捷伦科技有限公司摘要Agilent Femto Pulse 系统采用革命性设计,是唯一一款能够自动进行高分子量 (HMW)
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 D
脉冲电场凝胶电泳的原理和作用
在标准的PFGE中,第一个脉冲的电场方向在另一侧成45°夹角。由于琼脂糖凝胶的电场方向、电流大小及作用时间都在交替变化,使得DNA分子能够随时调整其游动方向,以适应凝胶孔隙的无规则变化。与相对分子质量较小的DNA相比,相对分子质量较大的DNA需要更多的脉冲次数来更换其构型和方位,使其按新的方向游动。
微生物鉴定技术贯穿食品安全始终
随着人们生活水平的不断提高,食品安全问题愈发受到重视,微生物对食品的污染问题也随之备受关注。微生物包括细菌、真菌等,有些微生物还是致病菌,对人体的危害很大,因此食品中微生物的检测非常重要。 微生物鉴定技术在检验检疫,食品、化妆品等产品致病菌的检测,动物源性致病菌的检测,植物病原细菌、真菌的检测
微生物鉴定技术贯穿食品安全始终
随着人们生活水平的不断提高,食品安全问题愈发受到重视,微生物对食品的污染问题也随之备受关注。微生物包括细菌、真菌等,有些微生物还是致病菌,对人体的危害很大,因此食品中微生物的检测非常重要。 微生物鉴定技术在检验检疫,食品、化妆品等产品致病菌的检测,动物源性致病菌的检测,植物病原细菌、真菌的检测
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。实验材料 DNA 大小标准基因组 DNA试剂、试剂盒 溴化乙锭酚:氯仿仪器、耗材 水浴实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液溴化
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。 实验材料
琼脂糖凝胶栓中DNA的限制性内切核酸酶消化
从哺乳动物细胞、酵母或细菌分离的染色体 DNA 在琼脂糖栓中可用所需的内切酶消化。低熔点琼脂糖栓的孔足以使内切酶进入,与作为底物的基因组 DNA 相作用。消化后,经 PFGE 分离,然后回收或做 Southern 印迹分析。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理从哺乳动物细胞、
脉冲场凝胶电泳的分子质量标准
PFGE 用于分离很大的 DNA 分子,因而需要很高分子质量的标准。这种标准可以按照 Lauer 等(1977 ) 介绍的方法从噬菌体,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取获得。但是一个更好的覆盖范围更广的系列标准是 λ 噬菌体 DNA 的系列串联体。后面介绍的具
鼠疫有多可怕?这些检测手段来帮忙
分析测试百科网讯 2019年11月12日晚,内蒙古锡林郭勒盟卫生健康委和北京市朝阳区卫生健康委联合发布信息称内蒙古自治区锡林郭勒盟苏尼特左旗2人被诊断为肺鼠疫确诊病例。目前,患者已在北京市朝阳区相关医疗机构得到妥善救治。鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的自然疫源性疾病,通常在啮齿动物之间流行,偶尔能引起
关于卡他莫拉菌感染的检查介绍
1.实验室检查 近年来不断推出快速、准确、简易的方法,如改良糖类降解试验;产色底物快速酶试验;丁酸盐油脂水解试验;丁酸酯酶试验。其中:Bacto-TB水解试验具有特异实用、简单、费用低等优点,可对MC作出快速鉴定。基于LPS的血清学分型、β内酰胺酶蛋白等电聚焦、蛋白外膜电泳谱均已用于MC的表现
脉冲凝胶电泳和毛细管电泳仪有什么区别
脉冲凝胶电泳(PFGE,Pulsed Field Gel Electrophoresis)是一种分离大分子DNA的方法。在普通的凝胶电泳中,大的DNA分子(>10kb)移动速度接近,很难分离形成足以区分的条带。在脉冲场凝胶电泳中,电场不断在两种方向(有一定夹角,而不是相反的两个方向)变动。DNA分子
脉冲凝胶电泳和毛细管电泳仪有什么区别
脉冲凝胶电泳(PFGE,Pulsed Field Gel Electrophoresis)是一种分离大分子DNA的方法。在普通的凝胶电泳中,大的DNA分子(>10kb)移动速度接近,很难分离形成足以区分的条带。在脉冲场凝胶电泳中,电场不断在两种方向(有一定夹角,而不是相反的两个方向)变动。DNA分子
北京出入境研发出微生物“马达”快检技术
课题研发人员在进行业务研讨 俗话说,病从口入。有时人们在外面吃饭闹个肚子,最多去医院,买点消炎药就算了,根本不会想到这可能是由于致病微生物引起的食物中毒事件。对于老百姓来说,微生物引起的食源性疾病其实就在身边。 但很多时候,看不见的微生物经常会隐匿于食物和各种环境中,稍不留神就可能遭到它们的袭击
脉冲场凝胶电泳实验
实验概要了解脉冲场凝胶电泳(PFGE)的工作原理,并学习和掌握有关的操作技术。实验原理大分子DNA(一般长度超过20kb,在某些情况下,超过40kb)在电场作用下通过孔径小于分子大小的凝胶时,将会改变无规卷曲的构象,沿电场方向伸直,与电场平行从而才能通过凝胶。此时,大分子通过凝胶的方式相同,迁移率无
RiboPrinter®-在肉毒梭菌鉴定和分子分型中的应用(二)
肉毒梭菌的Ribotyping鉴定及分子分型 正因为肉毒梭菌的种内菌株的多样性及其16S序列的高度保守性使得生化鉴定和16S测序鉴定等传统技术对肉毒梭菌的鉴定存在诸多难点,所以研究者们不遗余力应用更多分子生物学技术以缩短肉毒梭菌的鉴定时间,简化鉴定流程,增加鉴定结果的准确性和重现性。
卡他莫拉菌肺炎的细菌学检测
细菌学检测应根据不同的感染部位尽早获得标本并进行细菌学鉴定。传统方法是根据糖类的降解反应及硝酸盐还原试验,此法需要大量细菌,耗时长,且易出现假阳性。 近年来不断推出快速、准确、简易的方法,如改良糖类降解试验;产色底物快速酶试验;丁酸盐油脂水解试验;丁酸酯酶试验。其中:Bacto-TB水解试验具
分子生物学在微生物检验中的应用!
中国微生物菌种查询网:21世纪是以分子生物学为代表的生命科学的时代,近年来,随着现代生物技术的快速发展,人类基因组计划的完成,尤其是生物化学、免疫学、生物仪器及计算机理论与技术的进步,分子生物学技术在医学、遗传学、法医学、生物学等各个领域广泛应用, 新的诊断技术和方法不断涌现并被广泛应用于微生物检测
酵母人工染色体的应用
实验方法原理 直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。实验材料 酿酒酵母试剂、试剂盒 甘油仪器、耗材 脉冲场凝胶电泳仪选择性培养
酵母人工染色体的应用
实验方法原理 直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。
酵母人工染色体的应用
直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理直到 20 世纪 80 年代