Oligo芯片的构建及数据分析

实验概要本实验在生物素标记cRNA片段化的基础上,提供了小鼠全基因组Oligo芯片的构建及数据分析流程。实验步骤1. 芯片杂交使用Affmetrix Hybridization Oven 640,先进行Test芯片的杂交、清洗染色、扫描和分析,根据Test芯片的结果再杂交Real芯片。 1) 根据表1配制杂交液(己将杂交过程中会损失部分(10-20ul)考虑在内,例如芯片是49/64 Format,需要配制杂交液300ul)。 2) 轻弹管壁数次使其充分混匀,瞬时离心(约5 sec)收集溶液于管底。 3) 将杂交液置于加热块上,99℃温育5 min。 4) 其间,用一次性吸头通过芯片上septa注入相应体积1×Hybridization Buffer,将芯片置于杂交炉中,45oC温育1......阅读全文

Simple-javascript-Oligo-Calculator

Oligo CalculatorEnter Oligo Sequence in BoxLength Melting Temperature (Tm)  °C%GC contentMolecular Weight:  daltons (g/M)OD of 1 is equal to  picoMola

siRNA-Oligo设计原则

1. 希望软件可以在 web 上使用。 即用户可以访问我们的网站, 输入基因代码, 即可自行在网上设计 siRNA Oligo 。2. 可参照的软件形式: 见如下网站:www.dharmacon.comwww.ambion.comwww.qiagen.com3. 希望能就每一个所指定的基因找到至少四

Yeast-Gene-knockout-using-Oligo/PCR

Universal primers for gene knock-out using dominant drug markers: Kan, Clonat, and Hygromisin-B. Forward primer: 5’ TCAGGGGCATGATGTGACT 3’Reverse prim

BLOCKiT™-Fluorescent-Oligo-as-RNAi-Transfection-Control

实验概要Intended UseDynabeads®  Streptavidin are ideal for numerous applications, including  purification of proteins, nucleic acids purification, protein

Oligo芯片的构建及数据分析

实验概要本实验在生物素标记cRNA片段化的基础上,提供了小鼠全基因组Oligo芯片的构建及数据分析流程。实验步骤1. 芯片杂交使用Affmetrix Hybridization Oven 640,先进行Test芯片的杂交、清洗染色、扫描和分析,根据Test芯片的结果再杂交Real芯片。    1)

单链Oligo合成与DNA组装技术-(二)

2.2 Golden Gate组装Golden Gate组装技术是基于非同源重组的代表性技术,其利用Ⅱ型限制性酶 BsaⅠ在识别位点外部切割的特性,设计特异的突出序列同时组装多个片段,且酶切和酶连可以同时进行,原理如图3所示。首先,扩增目的片段,在两端加上BsaⅠ识别序列,同时在识别序列内侧

单链Oligo合成与DNA组装技术-(一)

合成生物学作为迅速发展的交叉学科,已在生物医药、新材料、诊断、能源和数据储存等领域展现越来越广泛的应用潜力。合成基因组学作为合成生物学的重要研究方向,着重于新生命体系的从头设计与合成,其以Oligo(寡核苷酸链)合成、拼装和转移等核心技术为支撑。新生命体系的从头设计与合成不仅需要合成组成基因组的小片

oligo(dT)纤维素层析法提取poly(A)-+-RNA

实验方法原理 与 rRNA, 5SRNA, 5.8 SRNA 和 tRNA 相比,大多数真核生物的 mRNA 在其 3' 端带有 poly(A) 尾巴。因此,mRNA 能用 oligo(dT)-纤维素亲和层析法从细胞总 RNA 中分离 (Edmonds et al. 1971; Av

oligo(dT)纤维素层析法提取poly(A)-+-RNA

            实验方法原理 与 rRNA, 5SRNA, 5.8 SRNA 和 tRNA 相比,大多数真核生物的 mRNA 在其 3' 端带有 poly(A) 尾巴。因此,mRNA 能用 oligo(dT)-纤维素亲和层析法从细胞总 RNA 中

Oligo(dT)纤维素层析分离Poly(A)+-RNA

Selection of Poly(A)+ RNA by Oligo(dT)-Cellulose ChromatographyJoseph SambrookPeter Maccallum Cancer Institute and The University of Melbourne, Austra

oligo(dT)纤维素层析法提取poly(A)-+-RNA

与 rRNA, 5SRNA, 5.8 SRNA 和 tRNA 相比,大多数真核生物的 mRNA 在其 3' 端带有 poly(A) 尾巴。因此,mRNA 能用 oligo(dT)-纤维素亲和层析法从细胞总 RNA 中分离 (Edmonds et al. 1971; Aviv and Lede

primer5和Oligo结合设计引物步骤及心得

一、引物设计step by step1、在NCBI上搜索到目的基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。2、用Primer Premier5搜索引物①打开Primer Premier5,点击File-New-

primer5和Oligo结合设计引物步骤及心得

一、引物设计step by step1、在NCBI上搜索到目的基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。2、用Primer Premier5搜索引物①打开Primer Premier5,点击File-New-

从细胞中提取mrna时,为什么常用oligo纤维粉

大多数真核生物的mRNA在其3’端带有poly(A)尾巴,因此mRNA能用oligo(dT)-纤维素亲和层析法从细胞总RNA中分离。

mRNA-的分离实验_oligo(dT)纤维素亲和层析法

实验方法原理 哺乳动物细胞的绝大部分mRNA在其3‘ 端均有一poly(A)尾,因此可以用oligo(dT)-纤维素亲和层析法从大量的细胞RNA中分离mRNA。实验步骤1.  用0.1 mol/L NaOH悬浮0.5~1.0 goligo(dT)-纤维素。 2.  将悬浮液装入灭菌的一次性层析柱或装

Cytiva-助力奥锐特建设千克级Oligo-FlexFactory产线

  2023年1月3日,全球生命科学领域的先行者Cytiva与奥锐特药业股份有限公司(奥锐特)达成合作,将共同建设扬州小核酸灵活工厂(Oligo FlexFactory)产线,加速小核酸药物商业化发展的进程。从左至右:奥锐特药业股份有限公司董事长彭志恩、上海奥锐特生物科技有限公司总经理李金亮、Cyt

Oligopull-down结合质谱、蛋白解构技术等研究实体瘤膀胱癌

  m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一,但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究,发现m5C通过细胞质内

mRNA的分离和纯化实验(二)

(三) mRNA的分离1、mRNA与Oligo(dT)-纤维素结合:用移液器重新悬浮oligo(dT)-纤维素,取适量的oligo(dT)-纤维素到RNA样品中,盖上盖子,颠倒数次将oligo(dT)-纤维素与RNA混匀。于37℃水浴保温并温和摇荡15min。oligo(dT)-纤维素与RNA所需量

知识分享:mRNA的分离和纯化

  实验原理   从细胞或组织中得到RNA是一种混合物,其中包括tRNA,rRNA和mRNA,其中RNA为75%~ 85%,tRNA占10%~16%,而mRNA仅占1%~5%,并且mRNA基因序列不同,分子量大小不均一,各基因的表达丰度也不一样。每克细胞可分离出5-10mg RNA。   真核生

DNA合成:你应该知道的秘密

  说起DNA合成,几位前辈师兄师姐们犹会提起上世纪90年代世行贷款买仪器,好些单位甚至医院都赶时髦买了DNA合成仪,买回来才发现自己那点合成需求和费用,委实买得起用不起,那昂贵的设备成了摆设。彼时国外DNA合成虽然质量好纯度高,可寄回来海关不好过,时间上实在伤不起,幸亏国内迅速崛起的几家

DNA合成:你应该知道的秘密

  说起DNA合成,几位前辈师兄师姐们犹会提起上世纪90年代世行贷款买仪器,好些单位甚至医院都赶时髦买了DNA合成仪,买回来才发现自己那点合成需求和费用,委实买得起用不起,那昂贵的设备成了摆设。彼时国外DNA合成虽然质量好纯度高,可寄回来海关不好过,时间上实在伤不起,幸亏国内迅速崛起的几家DNA定制

引物溶解稀释方法

在实验室进行分子克隆实验时,经常需要合成大量的引物,而这些合成的引物首先要进行适当的稀释才能使用。如果不稀释就使用引物,往往造成引物的浪费和过早的活性丧失,更有一些被污染而不能使用。因此,建议对合成的引物先进行稀释,然后使用。稀释的引物利于保存和应用。现将方法简单叙述如下:1. Oligo DNA是

Human-FastTrack-mRNA-Isolation

Preparation of Cells1.Prepare or collect between 2x107 cells for each mRNA prep (will yield about 10-20µg of mRNA). If PBMCs from a whole blood sample

寡核苷酸的相关操作

In this section, you will find techniques related to oligonucleotides, such as oligo purification by acrylamide gel, annealing two oligos to make doub

Experimental-Protocol-for-cDNA-Library-Construction

Experimental Protocol for cDNA Library ConstructionIdentify appropriate celltype over-expressing corresponding gene.Find out if transcription can be s

怎样从总rna中进行mrna的分离和纯化

真核生物的mRNA分子是单顺反子,是编码蛋白质的基因转录产物。真核生物的所有蛋白质归根到底都是mRNA的翻译产物,因此,高质量mRNA的分离纯化是克隆基因、提高cDNA文库构建效率的决定性因素。哺乳动物平均每个细胞含有约1x10-5?g RNA,理论上认为每克细胞可分离出5~10mg RNA。其中

怎样从总rna中进行mrna的分离和纯化

真核生物的mRNA分子是单顺反子,是编码蛋白质的基因转录产物。真核生物的所有蛋白质归根到底都是mRNA的翻译产物,因此,高质量mRNA的分离纯化是克隆基因、提高cDNA文库构建效率的决定性因素。哺乳动物平均每个细胞含有约1x10-5?g RNA,理论上认为每克细胞可分离出5~10mg RNA。其中

怎样从总rna中进行mrna的分离和纯化

真核生物的mRNA分子是单顺反子,是编码蛋白质的基因转录产物。真核生物的所有蛋白质归根到底都是mRNA的翻译产物,因此,高质量mRNA的分离纯化是克隆基因、提高cDNA文库构建效率的决定性因素。哺乳动物平均每个细胞含有约1x10-5?g RNA,理论上认为每克细胞可分离出5~10mg RNA。其中

怎样从总rna中进行mrna的分离和纯化

真核生物的mRNA分子是单顺反子,是编码蛋白质的基因转录产物。真核生物的所有蛋白质归根到底都是mRNA的翻译产物,因此,高质量mRNA的分离纯化是克隆基因、提高cDNA文库构建效率的决定性因素。哺乳动物平均每个细胞含有约1x10-5?g RNA,理论上认为每克细胞可分离出5~10mg RNA。其中

mRNA的分离和纯化实验(一)

实验原理从细胞或组织中得到RNA是一种混合物,其中包括tRNA,rRNA和mRNA,其中RNA为75%~ 85%,tRNA占10%~16%,而mRNA仅占1%~5%,并且mRNA基因序列不同,分子量大小不均一,各基因的表达丰度也不一样。每克细胞可分离出5-10mg RNA。真核生物mRNA具