codonusagedatabase
AnnouncementCodon Usage Database is an extended WWW version of CUTG (Codon Usage Tabulated from GenBank). The frequency of codon use in each organism is made searchable through this World Wide Web site.CUTG was originally developed by Prof. Toshimichi Ikemura at Laboratory of Evolutionary Genetics,National Institute of Genetics.Codon Usage Database is developed and mainteined by Yasukazu Nakamura at&nb......阅读全文
codon－usage－database
AnnouncementCodon Usage Database is an extended WWW version of CUTG (Codon Usage Tabulated from GenBank). The frequency of codon use in each organism
The－Restriction－Enzyme－Database
REBASE The Restriction Enzyme Database The Restriction Enzyme data BASE A collection of information about restriction enzymes and related proteins. It
Using－GenBank
GenBank(R) is a comprehensive database of publicly available DNA sequences for more than 205,000 named organisms and for more than 60,000 within t
pEGFPC2质粒图谱及信息
多克隆位点区（MCS）Restriction Map and Multiple Cloning Site of pEGFP-C2. (Unique restriction sites are in color or bold.) Note that the Eag I site is not uni
pEGFPC1质粒图谱及信息
pEGFP-C1Restriction Map and Multiple Cloning Site of pEGFP-C1. (Unique restriction sites are in bold.) The Xba I and Bcl I sites (*) are methylated in
基因组所设计开发出检测密码子使用偏好的新算法
近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员带领其团队，成功设计开发出检测密码子使用偏好（Codon Usage Bias，简称CUB）的新算法：密码子偏差系数模型（Codon Deviation Coefficient，简称CDC）。该研
An－Introduction－to－Biocomputing
An Introduction to BiocomputingVersion 2.01October 1996David Steffen, Ph.D.President, Biomedical Computing, Inc.6626 WestchesterHouston, Texas 77005US
北京基因组所合作研究揭示密码子表的内在规律
对于绝大多数物种来说，外界所能提供的能源是有限的，如何有效利用有限的资源，往往对物种的生存起决定作用。中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室胡松年组客座研究员陈卫华以及德国杜塞尔多夫大学、欧洲分子生物实验室的合作者们从全新的角度出发，对“能量节省”压力下基因组的演化情况进行了系统研
北京基因组所合作研究揭示密码子表的内在规律
对于绝大多数物种来说，外界所能提供的能源是有限的，如何有效利用有限的资源，往往对物种的生存起决定作用。中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室胡松年组客座研究员陈卫华以及德国杜塞尔多夫大学、欧洲分子生物实验室的合作者们从全新的角度出发，对“能量节省”压力下基因组的演化情况进行了系统研
pEGFPN1质粒图谱及信息
多克隆位点区Restriction Map and Multiple Cloning Site of pEGFP-N1. (Unique restriction sites are in color or bold.) The Not I site follows the EGFP stop cod
RNAi片段siRNA设计原则
RNAi target selection rules:Targeted regions on the cDNA sequence of a targeted gene should be located 50-100 nt downstream of the start codon (ATG).S
非编码small－RNA参与缺氧下的血管生成（一）
非编码RNA是近年来转录组学研究的热点，其中，long non-coding RNA（lncRNA），microRNA，circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实，在small non-coding RNAs世界，除了我们熟知的microRNA之外，还包括piwi-interac
密码子的概念和种类
密码子（codon）：mRNA（或DNA）上的三联体核苷酸残基序列，该序列编码着一个特定的氨基酸，tRNA 的反密码子与mRNA的密码子互补。起始密码子（iniation codon）：指定蛋白质合成起始位点的密码子。最常见的起始密码子是甲硫氨酸或缬氨酸密码。终止密码子（termination co
关于密码子的简介
密码子（codon）：mRNA（或DNA）上的三联体核苷酸残基序列，该序列编码着一个特定的氨基酸，tRNA 的反密码子与mRNA的密码子互补。 起始密码子（iniation codon）：指定蛋白质合成起始位点的密码子。最常见的起始密码子是甲硫氨酸或缬氨酸密码。 终止密码子（terminat
分子遗传学词汇整码突变
中文名称：整码突变外文名称：codon mutation定义：整码突变（codon mutation）：又称密码子的插入或缺失，指在DNA链中增加或减少的碱基对为一个或几个密码子，此时基因产物多肽链中会增加或减少一个或几个氨基酸，而此部位之后的氨基酸序列无改变。
RNAi载体pSIRENDNR－Vector
Restriction Map and Cloning Site of the RNAi-Ready pSIREN-DNR Vector. Unique restriction sites are in bold. RNAi-Ready pSIREN-DNR is provided as a lin
LIG3基因突变与药物因子介绍
这个基因是DNA连接酶家族的一员。这个家族的每一个成员都编码一种蛋白质，对dna末端的连接进行催化，但它们在dna代谢中都有不同的作用。该基因编码的蛋白质参与切除修复，位于线粒体和细胞核中，翻译起始于上游起始密码子，允许向线粒体转运，翻译起始于下游起始密码子，允许向细胞核转运。此外，编码不同亚型的交
LIG3基因编码功能及结构描述
这个基因是DNA连接酶家族的一员。这个家族的每一个成员都编码一种蛋白质，对dna末端的连接进行催化，但它们在dna代谢中都有不同的作用。该基因编码的蛋白质参与切除修复，位于线粒体和细胞核中，翻译起始于上游起始密码子，允许向线粒体转运，翻译起始于下游起始密码子，允许向细胞核转运。此外，编码不同亚型的交
武夷山：改善科学测度学之科学性
2008年11月10日，我曾在科学网博客发文介绍美国国家科学基金会的“科学与创新政策学”计划（http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=46116）。该计划的主任叫Julia Jane，她在2010年3月25日出版的Nature杂志
关于起始密码子的基本介绍
起始密码子，信使RNA（mRNA）的开放阅读框架区中，每3个相邻的核苷酸为一组，代表一种氨基酸，这种存在于mRNA开放阅读框架区的三联体形式的核苷酸序列称为密码子（codon）。由A、U、C、G四种核苷酸可组成64个密码子，其中有61个密码子可编码氨基酸。AUG既编码甲硫氨酸，又作为多肽链合成的
SELEX技术
这个技术就是一个文库技术(library)加一套筛选技术(bio-panning)。当然，SELEX技术仅仅是分子进化工程的一种而已。实际上，理解了文库技术和筛选技术，不仅selex理解了，其他热门技术如Phage display等等也懂了。我知道的著作中，赵康等主编的Frontiers of Bi
SNP检测技术（测序、taqman探针和snp芯片）
snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点，如hla区域，但成本较高，工作量大，不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠，国外文章也大量应用，不过对于国内成本偏高，同类还有snpshot技术，abi和贝克曼
Using－GenBank－for－Genomic－Authentication:－A－Tutorial
The GenBank database is perhaps one of the most important repositories of genetic information. A researcher working in the field of genomic authe
直读光谱软件在查找数据时弹出数据
WinOE: Information! Maxmumdisplay limit has been reached.答：解决技巧：方法一：打开“我的电脑”C：/ARL-DATA/RESULTS将数据剪切到新建文件夹中退出即可；方法二：WinOEUtilitiesDatabases Res
密码子偏倚的定义
中文名称：密码子偏倚英文名称：codon bias定 义：编码同一氨基酸的不同密码子的非平均使用现象。应用学科：遗传学（一级学科），进化遗传学（二级学科）
PNPLA3基因编码的功能和结构描述
这个基因编码的蛋白质是一种三酰甘油脂肪酶，它介导脂肪细胞中的三酰甘油水解。编码的蛋白质似乎是膜结合的，可能参与脂肪细胞能量利用/储存的平衡。The protein encoded by this gene is a triacylglycerol lipase that mediates triac
分子遗传学词汇琥珀突变
中文名称：琥珀突变外文名称：amber mutation定 义：琥珀突变，指的是由密码子改变为UAG的无义突变。琥珀密码子（amber codon）指mRNA的多核苷酸链中的终止密码子（UAG），它引起蛋白质翻译的中止。
蛋白质的生物合成遗传密码表
在mRNA的开放式阅读框架区,以每3个相邻的核苷酸为一组,代表一种氨基酸 (amino acid) 或其他信息,这种三联体形势称为密码子(codon)。通常的开放式阅读框架区包含500个以上的密码子。
分子遗传学词汇琥珀突变
中文名称：琥珀突变外文名称：amber mutation定 义：琥珀突变，指的是由密码子改变为UAG的无义突变。琥珀密码子（amber codon）指mRNA的多核苷酸链中的终止密码子（UAG），它引起蛋白质翻译的中止。
Transcriptome－Coexpression－Analysis－Using－ATTEDII－for－Integrated－...
Transcriptome coexpression analysis is an excellent tool for predicting the physiological functions of genes. It is based on the “guilt-by-associa