用DNA芯片技术检测基因的表达

实验概要生物芯片是将生命科学研究中所涉及的不连续的分析过程(如样品制备、化学反应和分析检测),利用微电子、微机械、化学、物理技术、计算机技术在固体芯片表面构建的微流体分析单元和系统,使之连续化、集成化、微型化。生物芯片技术主要包括四个基本要点:芯片方阵的构建、样品的制备、生物分子反应和信号的检测。1、芯片制备,先将玻璃片或硅片进行表面处理,然后使DNA片段或蛋白质分子按顺序排列在片芯上。2、样品制备,生物样品往往是非常复杂的生物分子混合体,除少数特殊样品外,一般不能直接与芯片反应。可将样品进行生物处理,获取其中的蛋白质或DNA、RNA,并且加以标记,以提高检测的灵敏度。3、生物分子反应,芯片上的生物分子之间的反应是芯片检测的关键一步。通过选择合适的反应条件使生物分子间反应处于最佳状况中,减少生物分子之间的错配比率。4、芯片信号检测,常用的芯片信号检测方法是将芯片置入芯片扫描仪中,通过扫描以获得有关生物信息。实验步骤一、芯片制备基......阅读全文

DNA转染

DNA转染·         Transfection of Mammalian Cells Using Lipofectamine (LTI)·         Guide to Eukaryotic Transfections with Cationic Lipid Reagents (PDF)

DNA转化

DNA转化Chemical Transformation·         Transformation of Competent Cells (RbCl2 Method) (Goldberg Lab)Very nice protocol for E. Coli transformation inc

electrophoresis-of-DNA

Agarose Gel Electroporesis of DNA Making the gel: 1.  Place casting platform with well former sideways in gel stand where you wish to  pour 

DNA测序

                自动测序法 双脱氧链末端终止法 非同位素银染 鸟枪法 Maxam-Gilbert化学修饰法             实验方法

DNA指纹图谱分析[DNA-Fingerprinting-]

一. 实验目的1. 掌握DNA指纹图谱技术的概念、原理和基本操作过程2. 学习DNA的限制性酶切的基本技术3. 掌握琼脂糖凝胶电泳的基本操作技术,学习利用琼脂糖凝胶电泳测定DNA片段的长度,并能对实验结果进行分析。二. 实验原理1984年英国莱斯特大学的遗传学家Jefferys及其合作者首次将分离的

DNA凝胶电泳(DNA-agarose-gel-electrophoresis)

实验原理琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分

循环肿瘤DNA比循环正常DNA矮半截

  如今,人们开始利用液体活检技术来诊断癌症,以及监测治疗效果,不过灵敏度是个问题。美国犹他州大学和华盛顿大学的研究人员近日在《PLOS Genetics》上发表文章,称来源于肿瘤的DNA片段比来源于正常细胞的片段要短,这个特征可用于改善液体活检。  犹他州大学的Hunter Underhill及其

A型DNA与B型DNA的结构差异

A型DNA与B型DNA是在两种环境下同种物质不同的形式。B型DNA:92%RH,钠盐,溶液和细胞中天然状态中的DNA多以此状态存在A型DNA:75%RH,钠盐A型DNA也是由反向的两条多核苷酸链组成的双螺旋,为右手螺旋,但螺旋体较宽而短,碱基与中心轴之倾角也不同,呈19度。

Quick-Yeast-DNA-Prep:-Isolation-of-Total-DNA-(genomic-and-plasmid)

Grow a 5 ml YPD O/N culture inoculated with a single yeast colony at 30 deg.Transfer culture to a small 13 x 100 glass tube. Spin down cells 2 min. in

高变区DNA与DNA指纹的关系

人的卫星DNA 或称随体DNA 是由一些短的DNA 片段(10bp 左右)多次重复所构成的。重复片段的组成和拷贝数在不同的个体及基因组的不同位置上不一样。提取不同个体的基因组DNA 后,用其切点能识别序列为4 个碱基而又不切割该重复片段的限制性内切酶在重复片段的两侧切割基因组DNA ,然后将样品进行

可以DNA结合的酶DNA连接酶

DNA连接酶:是能够使用来自ATP或NAD的化学能将先前切割或断裂的DNA链聚集在一起的酶。连接酶在DNA滞后链复制中特别重要,因为它们将冈崎碎片组合成DNA链。连接酶在DNA修复和基因重组中也发挥重要作用。

DNA的酶切与连接——DNA片段连接

实验方法原理核酸片段可以通过连接酶的作用连接起来而获得重组分子。实验材料λDNA EcoT14I:由11条DNA片段组成试剂、试剂盒T4 DNA连接酶及其配套的10×连接缓冲液 0.5×TBE电泳缓冲液 6×Loading Buffer Goldview 琼脂糖仪器、耗材电泳仪 水浴锅 移液器 微波

DEPHOSPHORYLATION-OF-LINEARIZED-DNA

DEPHOSPHORYLATION OF LINEARIZED DNAALKALINE PHOSPATASE(CIP) DIGESTIONDigestion of protruding 5'-ends1. Precipitate digested DNA and resuspend in a

Gel-Electrophoresis-of-DNA

What is Electrophoresis?Electrophoresis is a technique used in the laboratory that results in the separation of charged molecules. In this CyberLab we

DNA疫苗定义

DNA疫苗(DNA vaccine),又称“裸”DNA疫苗(naked DNA vaccine)、基因疫苗(genetic vaccine),亦有核酸疫苗(nucleic acid immunizaiton)、多核苷酸疫苗(poly nucleotide vaccine)等相关名称,是近年来基因治疗

重组DNA转化

目的:在体外连接组装而成的重组DNA分子只能转入合适的受体细胞,才能大量地进行复制、增殖和表达。通过实验学会重组DNA转化的最基本的操作以及如何提高转化效率的基本思路。 原理:带有外源DNA片段的重组体分子在体外构建成后,需要导入适当的宿主细胞内进行繁殖或表达出具有一定生物活性的蛋白。能够作为重组体

DNA作图实验

多种酶消化 限制酶部分消化             实验方法原理 应用遗传学技术构建能显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。

DNA提取原则

1.保证核酸一级结构的完整性;2.核酸样品中不应存在对酶有抑制作用的有机溶剂和过高浓度的金属离子;3.其他生物大分子如蛋白质、多糖和脂类分子的污染应降低到最低程度;4.其他核酸分子,如RNA,也应尽量去除。

DNA-methyltransferase-Assay

Methylated CpG island Amplification Protocol written by Minoru Toyota2. Materials2.1. MCARestriction enzymes SmaI, XmaIT4 DNA ligaseTaq DNA polymerase

纯化DNA实验

从哺乳动物细胞或组织分离DNA 基因组DNA的快速纯化 纯化质粒(碱裂解法)             实验材料 细胞

Yeast-DNA-Prep

Protocolgrow up yeast culture to appropriate density (near saturation)spin 1.5 mls of culture for 1 min in microfuge and aspirate off supernatantresus

Lambda-DNA-Preparation

Lambda DNA PreparationThis is a plate method that gives very good yield for cloning. I have combined the Promega and Maniatis protocols.Solutions T-TY

DNA重组技术

连接反应的策略    可以采用几种策略来进行外源DNA片段和质粒载体的连接。对此,可依据外源DNA片段未的性质,以及质粒载体与外源DNA上限制酸切位点的性质来作出选择。(一)外源DNA片段未的性质带有各种未的外源DNA的克隆方法见下表:────────────────────────────────

DNA-mobility-in-gels

1. Migration of marker dyes in native polyacrylamide non-denaturing gels Gel % Bromophenol blue (BP) Xylene cyanole (XC)   3.5  100 460   5.0

DNA提取仪

DNA提取仪也叫核酸纯化仪,是应用配套的核酸提取试剂来自动完成样本核酸的提取工作的仪器。

DNA-Sequencing-Gels

DNA Sequencing GelsBuffers and gel solutionsLong Ranger: we started using this in early 1995. Great stuff; the best thing is that the gels are not sti

DNA指纹法

DNA Fingerprinting (David F. Betsch)the theory, procedures and applications  ·         DNA Fingerprinting (Polyarylamide Gel) (Caltech)BAC DNA sample

怎样鉴定dna

DNA亲子鉴定流程:1、DNA提取把样本细胞核中所含有DNA提取出来,然后进行一定的纯化,化除样本中的杂质。2、PCR扩增PCR的中文名为聚合酶链式反应,简单的说,PCR扩增这一步就是把我们所需要的片段通过酶促反应,在PCR仪上进行大量复制,放大到通过某些专用仪器可以看到的程度。3、后PCR反应这一

Chromosomal-DNA-Isolation

Chromosomal DNA IsolationMETHOD:Grow cells in 2-5 ml broth to late log phase.Pellet 1-2 ml cells in microfuge.Resuspend cells in 400 µl TES (50 mM Tri

DNA测序仪

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今dna序列分析的主流。美国peabi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型