RNA酶保护试验
RNA酶保护试验((RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造成样品和探针的损失,使灵敏度下降,而RPA将所有杂交体系进行电泳,故损失小,提高了灵敏度。2. 由于PCR扩增过程中效率不均一和反应“平台”问题,基于PCR产物量进行分析所得数据的可靠性将下降,而RPA没有扩增过程,因此,分析的数据真实性较高。3. 由于与反义RNA探针杂交的样品RNA仅为该RNA分子的部分片段,因此,部分降解的RNA样品仍可进行分析。4. 步骤较少,耗时短。与Northern杂交相比,省去了转膜和洗膜的过程。5. RNA-RNA杂交体稳定性......阅读全文
RNA酶保护试验
RNA酶保护试验((RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗
RNA酶保护试验方法
RNA酶保护法是近十年发展起来的一种全新的mRNA定量分析方法。其基本原理是将标记的特异RNA探针(32P或生物素)与待测的RNA样品液相杂交,标记的特异RNA探针按碱基互补的原则与目的基因特异性结合,形成双链RNA;未结合的单链RNA经RNA酶A或RNA酶T1消化形成寡核糖核酸,而待测目的基因与特
关于RNA酶保护试验的个人体会
RNA酶保护试验实际上是很早就出现的技术。在1982年出版的第一版圣经(分子克隆)还没有提到。在1989年出版的第二版中已经出现:7.71 Mapping of RNA with Ribonuclease and Radiolabeled RNA(可参见中译本P383-387)。在2001年出版的第
RNA酶保护试验((RNase-Protection-Assay,RPA)简介
RNA酶保护试验((RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。1。原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。2。应用:检测RNA表达3。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1.
RNA酶保护试验((RNase-Protection-Assay,RPA)方法
一、试剂准备1. GACU POOL:取100mM ATP、CTP、GTP各2.78μl、100mM UTP 0.06μl,加DEPC H2O至100μl。2. 杂交缓冲液IPES 0.134g、0.5M EDTA(pH8.0)20μl、5M NaCl 0.8ml、甲酰胺8ml,加DEPC H2O至
RNA酶保护试验((RNase-Protection-Assay,RPA)的优缺点
RNA酶保护试验((RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造
RNA酶保护实验(RNase-Protection-Assay,RPA)简介
简介: RNA酶保护试验(RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。 1. 原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。 2. 应用:检测RNA表达 3. 与Northern杂交和RT-PCR比较
RNA酶保护实验(RNase-Protection-Assay,RPA)简介
简介:RNA酶保护试验(RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。1. 原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。2. 应用:检测RNA表达3. 与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优
RNA酶保护法对mRNA的检测、分析及定量的方法
方法:RNA酶保护目标RNA的类型:mRNA 同时定量的目标RNA的数量:通常为一个,但是如果使用混合探针,最多可同时检测12种mRNA。用途:主要用于对不同类型细胞或组织中目标mRNA的检测和定量。缺点:需要特异性的反义杂交探针(通常带放射性)。RNA酶保护法远比Northern杂交灵敏,但灵敏度
核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记RNA探针)
实验方法原理 核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的序列被一种或几种单链特异性的核糖核酸酶裂解。
RNA酶活性的控制
为了获得高质量的真核细胞mRNA, 必须使用RNA酶的抑制剂或采用下述的破碎细胞和灭活RNA酶同步进行的方法,最大限度地降低细胞破碎过程中所释放的RNA酶的活性。同时,避免偶然引入实验室内其他潜在的痕量RNA酶也很重要。下面列举避免RNA酶法染问题的一些注意事项。大多数有经验的研究者并不拘泥于这些注
如何防止RNA酶污染
在所有RNA实验中,最关键的因素是分离得到全长的RNA。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶广泛存在而稳定,一般反应不需要辅助因子。因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解,而所制备的RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果,所
防止RNA酶污染方法
防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。2. 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。3. 有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室温10mi
RNA酶活性的控制
为了获得高质量的真核细胞mRNA, 必须使用RNA酶的抑制剂或采用下述的破碎细胞和灭活RNA酶同步进行的方法,最大限度地降低细胞破碎过程中所释放的RNA酶的活性。同时,避免偶然引入实验室内其他潜在的痕量RNA酶也很重要。下面列举避免RNA酶法染问题的一些注意事项。大多数有经验的研究者并不拘泥于这些注
限制[性酶切]位点保护试验的方法和应用
中文名称限制[性酶切]位点保护试验英文名称restriction site protection experiment定 义当一段DNA被某些蛋白质(如转录因子、组蛋白等)结合后,这段DNA上的限制性酶切位点就不会被相应的限制性酶切开。因此将待研究的DNA与蛋白质一起保温,再用该DNA链上已知的限
核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针...
核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针对RNA作图)实验方法原理 核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的序列被一种或几种单链特异性的核糖核酸酶裂解。实验材料
核酸酶保护实验
实验材料核酸酶试剂、试剂盒ATPCTPGTPMUTPEDTANaCl甲酰胺Tris-HClRNase ARNase T1RNasinDTTUTPT7RNA聚合酶DNaseⅠ饱和酚氯仿酵母tRNANaAc无水乙醇SDS蛋白酶K异丙醇丙烯酰胺亚甲双丙烯酰胺TBE尿素过硫酸胺TEMED仪器、耗材低温离心机
核酸酶保护实验
实验材料 核酸酶试剂、试剂盒 ATPCTPGTPMUTPEDTANaCl甲酰胺Tris-HClRNase ARNase T1RNasinDTTUTPT7RNA聚合酶DNaseⅠ饱和酚氯仿酵母tRNANaAc无水乙醇SDS蛋白酶K异丙醇丙烯酰胺亚甲双丙烯酰胺TBE尿素过硫酸胺TEMED仪器、耗材 低温
核酸酶保护实验
实验材料 核酸酶 试剂、试剂盒 ATP CTP GTP MUTP
多探针核糖核酸酶保护试验同时测定-mRNA-表达
实验步骤 基 本 方 案 多 探 针 核 糖 核 酸 酶 保 护 试 验材 料R i b o Q u a n t 体 外 转 录 试 剂(B D Pharmingen) 包含下面:40U /ul RNasinG A C U 库(2.75m m o l / L G T P /2.75m m o l /
RNA聚合酶的特点
RNA聚合酶催化RNA的合成,其与DNA聚合酶有许多相同的催化特点:①以DNA为模板;②催化核苷酸通过聚合反应合成核酸;③聚合反应是核苷酸形成3’,5’一磷酸二酯键的反应;④以3’→5’方向阅读模板,5’→3’方向合成核酸;⑤按照碱基配对原则忠实转录模板序列。
RNA修饰相关酶PCR芯片
应用场景:通过关键酶/蛋白的RNA表达变化,确定样品表型与特定RNA 修饰的联系 优势:预制的PCR板,覆盖68个针对不同RNA修饰的Writers/Erasers/Readers基因。精心优化的引物Tm值均一,并经过了严格的预实验验证,无须摸索引物设计和测试。工业化生产的高度均一的PCR
RNA复制酶的相关介绍
即“RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)”RNA聚合酶的一种,存在于大部分RNA病毒中。和细胞中用来转录的RNA聚合酶(DdRp)不同,RNA复制酶的模板是RNA分子。 某些RNA复制酶还有解旋酶活性,正链RNA或双链RNA病毒复制时都会产生双链RNA,RNA复制酶可以解开这些双链,保证RNA
什么是端粒酶RNA?
端粒酶RNA(TR),是端粒酶的一个组成部分,由端粒酶RNA基因(TERC)编码。端粒酶RNA在脊椎动物中,纤毛虫和酵母菌的序列和结构之间有很大的不同,但它们共享一个5'假结结构的模板序列。脊椎动物端粒酶RNA的3'H / ACA snoRNA的域。
避免RNA酶污染的方法
RNase酶非常稳定,是导致RNA降解最主要的物质。它在一些极端的条件可以暂时失活,但限制因素去除后又迅速复性。用常规的高温高压蒸气灭菌方法和蛋白抑制剂不能使所有的RNase完全失活。为了获得高质量的真核细胞mRNA,必须使用RNA酶的抑制剂或采用下述的破碎细胞和灭活RNA酶同步进行的方法,最大限度
RNA聚合酶的分类
通常可根据生物的类别,将RNA聚合酶分为原核生物RNA聚合酶、真核生物RNA聚合酶。原核生物和真核生物的RNA聚合酶有共同特点,但在结构、组成和性质等方面又不尽相同。(1)原核生物RNA聚合酶 研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体(α2ββ'ωσ)分子量约500
RNA-SI-核酸酶作图
实验材料 [γ-32P」ATP 合适的寡核苷酸 DNA 模板l 10XdNTP 混合物 KLenow 片段 合适的限 制性内切核酸酶
RNA聚合酶的类别
通常可根据生物的类别,将RNA聚合酶分为原核生物RNA聚合酶、真核生物RNA聚合酶。原核生物和真核生物的RNA聚合酶有共同特点,但在结构、组成和性质等方面又不尽相同。(1)原核生物RNA聚合酶 研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体(α2ββ'ωσ)分子量约500
RNA聚合酶的结构
为什么细菌的RNA聚合酶需要这么大和复杂的分子结构呢?而某些噬菌体特有的RNA聚合酶则要小得多,仅由一条多肽链组成。这证明RNA合成所需的机构可以远比宿主的酶小。这种情况说明,噬菌体内的转录仅需一条"最小"的机构。然而这种酶只能识别噬菌体本身所有的少数几个启动子;它们不能识别其他启动子。例如噬菌
RNA-SI-核酸酶作图
实验材料 [γ-32P」ATP合适的寡核苷酸DNA 模板l10XdNTP 混合物KLenow 片段合适的限 制性内切核酸酶X 射线胶片洗脱缓冲液tRNA 石蜡油S1 核酸酶试剂、试剂盒 10X 激酶缓冲液PNK10X 复性缓冲液6% 聚丙烯酰胺 8mol L 尿素溶液 (溶于 0.5XTBE) 及甲