研究发现去甲基化酶REF6是基因组中靶向的重要因素
核小体是真核生物染色质的基本单位，由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一，通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态，在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因组中特定位点的H3K27me3修饰水平由组蛋白甲基转移酶和去甲基化酶进行动态调控。中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组前期研究发现，拟南芥组蛋白H3K27me3去甲基化酶REF6/JMJ12能够通过其自身的锌指结构域特异性的识别拟南芥基因组中CTCTGYTY基序从而去除H3K27me3/me2甲基化修饰，调控基因的时空表达水平(Lu, et al. Nature Genetics, 2011； Cui, et al. Nature Genetics, 2016)。进一步研究发现，并非所有的CTCTGYTY基序都能够被REF6识......阅读全文
DNA甲基化酶的基本信息
大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶，即DNA甲基化酶，它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统（R-M系统）Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化，形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中，常用的甲基化酶属于Ⅱ型，它与相应的
我科学家改写DNA甲基化经典
近日，吉林大学人兽共患病研究所和华大基因研究院通过合作，首次在旋毛虫基因组中发现了甲基转移酶，并证实了DNA甲基化的存在，改写了长期以来认为线虫中没有该种表观遗传修饰的历史。相关成果发表于《基因组生物学》。业内专家认为，该研究为以DNA甲基化为靶标的抗旋毛虫及类似病原药物与预防制剂
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果，欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序，通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。 正确诊断肿瘤，对于癌症的治疗至关重要。但是，在已知的约100种肿瘤中，中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。 为了解决这个问题，德
DNA甲基化与癌症之NGS检测篇
摘要 DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中，DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化，大量实验研究表明，在多种类型癌症中，DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外，甲基化还与非
RNA甲基化位点分析新方法
继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后，小编看到读者们的热情度特别高。借此机会，再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心，QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
科技日报北京3月18日电 英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果，欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序，通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。 正确诊断肿瘤，对于癌症的治疗至关重要。但是，在已知的约100种肿瘤中，中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。
Dam甲基化酶的基本信息
中文名称Dam甲基化酶英文名称Dam methylase定 义由大肠杆菌染色体编码的两种甲基化酶之一，是dam基因的产物。将其识别序列GATC中的腺嘌呤转变成6-甲基腺嘌呤。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
甲基化的基因组直接测序法
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理，并以连接介导的PCR来放大信号强度，然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解，故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解
DNA甲基化研究方法的回顾与评价
摘要： DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入，各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类：基因组整体水平的甲
甲基化msap方法的引物需要筛选吗
甲基化msap方法的引物需要筛选DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它是由DNA甲基转移酶（DNA methyl-transferase,Dnmt）催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶（mC）的一种反应,在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基.CG二核苷酸
无需参考的甲基化分析新方法
分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组，而许多物种不一定有。最近，奥地利的研究人员就开发出一种方法，在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在《Cell Reports》上。 文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer
科学研究揭示DNA甲基化的秘密
甲基化指 DNA 的化学修饰，这种修饰发生在 DNA 序列的数百万个位置上。直到现在，科学家们相信这种表观遗传学的现象减少了一些基因的表达。 近日，来自UNIGE大学的研究团队们，发现 DNA 甲基化在基因调节中扮演着积极和消极的角色。 DNA 序列的变异性与基因表达之间的关系也
保持甲基化酶的基本信息
中文名称保持甲基化酶英文名称maintenance methylase定 义编号：EC 2.1.1.37。催化半甲基化的DNA双链分子内与MeCpG配对的GpC序列中的胞嘧啶甲基化，从而使甲基化在DNA复制中得以连续保持的酶。Ⅰ型、Ⅱ型DNA甲基化酶均能以半甲基化DNA为底物，而Ⅲ型DNA甲基化酶
关于DNA甲基化的酶分类的介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参
DNA甲基化与拟南芥的免疫力
DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力，它动态调控了某些基因的表达，让植物能够抵御细菌感染。近日，一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。 美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴
Nature：基于DNA甲基化的早期癌症检测
加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法，能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证，但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。 研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案，能够分析少量循环游离DN
DNA甲基化酶的基本信息
大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶，即DNA甲基化酶，它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统（R-M系统）Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化，形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中，常用的甲基化酶属于Ⅱ型，它与相应的
RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总
RNA甲基化（RNA methylation）是一类表观遗传修饰，在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methylad
影响氯甲基化反应的因素有哪些？
研究苯乙烯聚合物的氯甲基化反应速度，副交联反应，以及溶剂对反应的影响问题。研究表明，在用氯化锌作催化剂时，反应速率可用一级反应方程表示，比用无水三氯化铝和氯化亚锡作催化剂时的反应速率慢得多，但副交联反应也较少。用无水三氯化铝和氯化亚锡作催化剂时，反应初期也是一级反应，而后就逐渐偏离一级反应规律，
Dam甲基化酶的－基本信息
中文名称Dam甲基化酶英文名称Dam methylase定 义由大肠杆菌染色体编码的两种甲基化酶之一，是dam基因的产物。将其识别序列GATC中的腺嘌呤转变成6-甲基腺嘌呤。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
保持甲基化酶的基本信息
中文名称保持甲基化酶英文名称maintenance methylase定 义编号：EC 2.1.1.37。催化半甲基化的DNA双链分子内与MeCpG配对的GpC序列中的胞嘧啶甲基化，从而使甲基化在DNA复制中得以连续保持的酶。Ⅰ型、Ⅱ型DNA甲基化酶均能以半甲基化DNA为底物，而Ⅲ型DNA甲基化酶
关于甲基化特异性的PCR介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA，所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不变；随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物，如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段，则说明该位点存在甲基化；反之，说明被检测的位点不存在甲基化。
PNAS：儿童营养不良，甲基化随之改变
根据联合国儿童基金会的统计，每四名5岁以下儿童中，就有一名患有慢性营养不良。营养不良会导致持续的健康问题，包括发育迟缓、疫苗失效和认知障碍。最新的一项研究还表明，营养不良的儿童在基因组甲基化方面表现出整体的变化。 弗吉尼亚大学领导的一个国际研究小组对居住在孟加拉国达卡贫民区的儿童的甲基化模式进
DNA甲基化酶的主要类型介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
Dam－Dcm－甲基化对酶切的影响
有时质粒用别的酶都切得动，用Bcl I 、Cla I 等酶就是切不动。原因可能在于多数实验室常用的E.coli菌株都有甲基化的功能，而BclI是一个对甲基化敏感的酶。当其识别序列被甲基化后BclI就出现切不动的情况。而BamH I则对甲基化不敏感，所以甲基化与否都照切不误。当你要用BclI这
挑出CpG甲基化位点的新策略
DNA甲基化是基因表达的一种有效的调节器。DNA甲基化主要发生在富含CG的区域，所以称为CpG岛。如CpG岛位于某基因的启动子区域，CpG岛的甲基化会显著降低甚至完全沉默该基因的转录，继而影响蛋白的表达。但是，如何决定一个目标位点的甲基化是否会影响转录，是具有挑战性的。最近，约翰霍普金斯大学的研
DNA甲基化酶的主要类型介绍
DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中，主要特征
DNA甲基化酶的作用和种类
DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中，主要特征
m5C－RNA甲基化测序介绍
m5C RNA甲基化简介通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊。RNA甲基
甲基化——肿瘤检测治疗的又一靶标？
前言在测序和相关技术不断进步的今天，研究人员不仅能够获得DNA、RNA的碱基序列，更能够获得碱基修饰的复杂信息。目前已经证明DNA甲基化能够导至的肿瘤产生，而Ribomed、基准医疗和鹍远基因等公司作为该领域的先行者，已经开发出相关产品。RNA作为中心法则的下游分子，也有多种多样的修饰，特别是m6A