挑出CpG甲基化位点的新策略
DNA甲基化是基因表达的一种有效的调节器。DNA甲基化主要发生在富含CG的区域，所以称为CpG岛。如CpG岛位于某基因的启动子区域，CpG岛的甲基化会显著降低甚至完全沉默该基因的转录，继而影响蛋白的表达。但是，如何决定一个目标位点的甲基化是否会影响转录，是具有挑战性的。最近，约翰霍普金斯大学的研究人员研制出一种新方法，可以阐明这个问题。 CpG二核苷酸上的DNA甲基化，是真核生物中被充分研究过的一种表观遗传转录调控机制。通常，这种形式的甲基化涉及到多个位点，但是单个CpG位点的甲基化也会影响基因的表达。为了促进单一位点甲基化研究的发展，约翰霍普金斯大学的Marc Ostermeier和他以前的研究生Brian Chaikind，开发出一种新技术，可以选择优化的位点特异性DNA甲基转移酶，相关研究结果发表在最近的《PLoS One》。 Ostermeier的这种最新方法以其研究小组以前描述过的一种方法为基础，利用一种裂开的......阅读全文
挑出CpG甲基化位点的新策略
DNA甲基化是基因表达的一种有效的调节器。DNA甲基化主要发生在富含CG的区域，所以称为CpG岛。如CpG岛位于某基因的启动子区域，CpG岛的甲基化会显著降低甚至完全沉默该基因的转录，继而影响蛋白的表达。但是，如何决定一个目标位点的甲基化是否会影响转录，是具有挑战性的。最近，约翰霍普金斯大学的研
RNA甲基化位点分析新方法
继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后，小编看到读者们的热情度特别高。借此机会，再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心，QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se
甲基化干扰法鉴定与蛋白结合的DNA位点
放射性标记DNA探针的制备l 聚丙烯酰胺凝胶的制备1．按照（三）中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决于待测DNA片段的大小，200bp左右的片段需要4～5％的凝胶，小于100bp的片段应灌制6～8％的凝胶。 l DN
特异性位点的DNA甲基化的检测方法
相关专题1 甲基化敏感性限制性内切酶 (methylation-sensitive restriction Endonuclease，MS-RE)-PCR/Southern法这种方法利用甲基化敏感性限制性内切酶 对甲基化区的不切割的特性，将DNA消化为不同大小的片段后再进行分析。常使用的甲基化敏感的
基本方案2－确定甲基化特异性－PCR－产物中－CpG－位点的甲基化
实验材料甲基化特异性PCR (MSP) 产物试剂、试剂盒适合的限制性内切核酸酶和缓冲液牛血清白蛋白糖苷配糖基1 X 甲酰胺上样缓冲液乙醇实验步骤1.在 1.5 ml 管中加入 10ul MSP 产物。加入 15ul 10 X 限制性内切核酸酶和缓冲液，需要的话加 BSA，加水至 150ul。加入 1
剪接位点
中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定 义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
识别位点
中文名称识别位点英文名称recognition site定 义限制性内切酶特异结合的核苷酸序列。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
我国学者揭示SUVH家族的CHG位点甲基化序列分子基础
8月28日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组和美国加州大学洛杉矶分校Steven Jacobsen研究组合作完成的题为Mechanistic insights into plant SUVH
研究揭示植物SUVH6酶催化位点特异H3K9甲基化的分子基础
《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心段成国研究组与南方科技大学杜嘉木研究组合作完成的题为Molecular Basis of Locus-specific H3K9 Methylation Catalyzed by SUVH6 in Plants的研究论
研究揭示植物SUVH6酶催化位点特异H3K9甲基化的分子基础
2022年12月29日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心段成国研究组与南方科技大学杜嘉木研究组合作完成的题为Molecular Basis of Locus-specific H3K9 Methylation Catalyzed by SUVH6 i
进入位点
中文名称进入位点英文名称entry site定 义特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
加帽位点
中文名称加帽位点英文名称cap site定 义mRNA中加帽结构的部位，该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
在含氧阴离子调控催化位点配位环境研究中获进展
为实现零碳经济，设计高效、低成本的阳极催化剂是达成电解水绿色制氢和生物质电氧化升级的关键。由于固有的氧化还原特性，镍基非贵金属电催化剂被认为是潜在的候选者，但关于镍位点配位环境的活性调控机制尚缺乏深入研究。 近日，中国科学院上海硅酸盐研究所研究员王家成团队前期研究发现磷酸根阴离子可有效调控镍
nut－位点的定义
中文名称nut 位点英文名称nut site定 义噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用，使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
什么是活性位点
者一般用在大分子化学中，活性位点指的是可以发生化学反应的集团。活性位点少，发生有效碰撞的机率就少，也就是说反应比较单一，容易被控制
研究团队开发糖结合位点预测精准新算法
6月17日，中国科学院上海药物研究所研究员程曦、文留青等与临港实验室青年研究员王鼎言合作，通过开发基于深度学习模型的糖结合位点预测算法DeepGlycanSite，精准预测了蛋白质结构上的糖类结合位置，有助于解决糖类与蛋白质相互作用的难题。相关研究发表于《自然—通讯》。糖类不仅为生物体提供能量供应和
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6月17日，中国科学院上海药物研究所研究员程曦、文留青等与临港实验室青年研究员王鼎言合作，通过开发基于深度学习模型的糖结合位点预测算法DeepGlycanSite，精准预测了蛋白质结构上的糖类结合位置，有助于解决糖类与蛋白质相互作用的难题。相关研究发表于《自然—通讯》。 糖类不仅为生物体提供能
磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定
磷酸肽的化学测序 磷酸肽的质谱分析 源后衰变 用酶和化学方法去磷酸化 实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一
磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定
实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一些通用方法；磷酸化蛋白质被纯化，如果可能蛋白质要均一；磷蛋白被特异性的化学或酶反应切断、产生肽混合物，其中含有一到两个磷酸肽不同之处在干其分离磷酸肽的策略是为了确定氨基酸序列，定位肽段内磷酸化的残基。上面所述的分离方法， 2D-PP 作图、 HPLC 或 l
研究揭示本征介孔沸石酸位点调控机制
沸石分子筛作为石油化工和精细化学品合成中广泛应用的固体酸催化剂，其催化性能受到传统微孔结构的限制。近年来，研究者虽已开发出多种超大孔沸石材料，但普遍存在水热稳定性差或难以引入活性铝中心等问题，制约了其在大分子催化中的应用。 中国科学院青岛生物能源与过程研究所研究团队此前报道了一种新型沸石材料Z
研究确定IgA肾病－30个独立显著的风险位点
IgA肾病（IgAN）是一种常见的原发性肾小球疾病，由IgA免疫球蛋白在肾小球异常沉积而得名。美国哥伦比亚大学研究团队通过全基因组关联分析，揭示IgAN的致病信号通路和潜在药物靶点。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Genome-wide associatio
研究提出离子补偿重构策略强化催化位点构筑
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498817.shtm
加帽位点的概念
中文名称加帽位点英文名称cap site定 义mRNA中加帽结构的部位，该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
无嘧啶位点的概念
中文名称无嘧啶位点英文名称apyrimidinic site定 义核酸中脱去嘧啶碱的部位。产生的醛基，易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇nut－位点
中文名称：nut 位点英文名称：nut site定 义：噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用，使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
阴离子位点显示实验
实验方法原理 实验材料 组织样品试剂、试剂盒 磷酸缓冲液阳离子化铁蛋白液体戊二醛锇酸实验步骤 1. 0.1 mol/L磷酸缓冲液配制阳离子化铁蛋白，浓度为0.2～0.5 mg/ml。2. 组织样品悬浮于阳离子化铁蛋白液体中，室温下反应30 min。3. 0.1 mol/L磷酸缓冲液充分漂洗。4. 3
序列标签位点的定义
序列标签位点（sequence-tagged site），是已知核苷酸序列的DNA片段，是基因组中任何单拷贝的短DNA序列，长度在100～500bp之间。
无碱基位点的定义
中文名称无碱基位点英文名称abasic site定 义核酸中失去碱基的部位。该部位碱基失去后，产生一个醛基，易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
SNP位点的选择原则
1，如果是检测基因的所有已知的SNP，那么首先要去了解并查询到这些SNP位点，SNP位点可以通过查询dbSNP数据库（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/）和TSC（The SNP Consortium）数据库（http://snp.cshl.org/），可以获知基因及上
无嘌呤位点的定义
中文名称无嘌呤位点英文名称apurinic site定 义核酸中脱去嘌呤碱的部位。产生的醛基，易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）