新的基因组工具组合或可梳理疾病的因果关系
近日，奥地利科学院分子医学研究中心（CeMM）的研究人员Christoph Bock在基因组生物学会议上发言称，新的基因组工具组合可以帮助研究人员梳理疾病的因果关系。 他认为，单细胞RNA-seq和ATAC-seq等方法可以帮助人们深入了解疾病发展过程中发生的情况，但它们无法建立因果关系。Bock指出，目前有四种方法可建立因果关系。 第一种方法是生化方法，但他认为这是一种保守的方法。第二种方法依赖孟德尔随机化（Mendelian randomization），但这种方法需要大量的数据，而Bock认为有时很难获得。 Bock本人倾向于使用第三种和第四种方法，也就是分别利用时间序列分析和扰动方法来研究因果关系。时间序列分析依赖格兰杰因果检验（Granger causality）。这种方法很有用，不过限于形式化证明。他认为，基于CRISPR的扰动和单细胞测序能够大规模发现功能证据。 Bock及其同事就以慢性淋巴细胞白血病（......阅读全文
新的基因组工具组合或可梳理疾病的因果关系
近日，奥地利科学院分子医学研究中心（CeMM）的研究人员Christoph Bock在基因组生物学会议上发言称，新的基因组工具组合可以帮助研究人员梳理疾病的因果关系。 他认为，单细胞RNA-seq和ATAC-seq等方法可以帮助人们深入了解疾病发展过程中发生的情况，但它们无法建立因果关系。Bo
获取时间序列图像
获取时间序列图像 共聚焦显微镜的"Time-Series"功能，可以自动在实验者规定的时间内按照设定的时间间隔获取图像。只需设定所需的时间间隔以及所需图像数量，开启“Start T”功能键，即可进行实验。“Time-Series"功能大大减轻了实验者的劳动强度，对于荧光漂白恢复和钙离子成像等实验非
梳理疾病生物标志物最新进展
个体化医疗正越来越受到临床医学界的重视，而生物标志物是实施个体化医疗的基础。生物标志物(Biomarker)是近年来随着免疫学、分子生物学和基因组学技术的发展而提出的一类与细胞生长、增殖、疾病发生等有关的标志物；能反映正常生理过程或病理过程或对治疗干预的药物反应，在早期诊断、疾病预防、药物靶点确
JAHA：白天过度嗜睡亚型与心血管疾病风险的因果关系
先前将EDS与心血管疾病风险增加联系起来的证据可能主要是由其长EDS亚型对心肌梗死高风险的影响所致。 白天过度嗜睡(EDS)不仅是睡眠剥夺的主要症状，也是一系列罕见和常见的睡眠障碍(如阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)、发作性睡病和特发性嗜睡症)的主要症状，共影响了10%至20%或更多的成年人。ED
研究揭示南极长时间序列固定冰图
南极固定冰与冰山（李新情供图） 南极中山站固定冰Landsat-8卫星影像（影像获取时间为2015年10月7日，李新情供图） 中山大学测绘科学与技术学院极地遥感团队与国内外科研人员合作，基于高分辨率SAR影像首次获取了环南极时间序列固定冰数据集，揭示了南极固定冰的时空分布、变化特征及其与冰
用动态融合策略提高长期时间序列预测性能
在数据分析和机器学习领域，时间序列预测一直是一个关键且具有挑战性的任务。它在经济、气象、交通等多个领域发挥着重要作用，其中长期时间序列预测因其复杂性和不确定性而更受关注。近日，中国科学院软件研究所天基综合信息系统全国重点实验室研究团队提出了一种新的动态融合频率方法，显著提高了长期时间序列预测的准确性
用动态融合策略提高长期时间序列预测性能
在数据分析和机器学习领域，时间序列预测一直是一个关键且具有挑战性的任务。它在经济、气象、交通等多个领域发挥着重要作用，其中长期时间序列预测因其复杂性和不确定性而更受关注。近日，中国科学院软件研究所天基综合信息系统全国重点实验室研究团队提出了一种新的动态融合频率方法，显著提高了长期时间序列预测的准确性
基于深度学习的时间序列预测研究获进展
时间序列预测是大规模数据无损压缩和极端天气预报等领域的核心技术。随着应用场景多样化和数据复杂性提升，现有模型在异构数据的统一表达、长序列结构依赖建模、极端天气波动捕捉等方面存在挑战。中国科学院计算机网络信息中心人工智能团队围绕上述挑战开展研究，提出一系列创新算法与模型，并在实际系统部署应用。
地理资源所遥感参数时间序列重构研究获进展
太阳辐射是各种陆地表层应用模型的重要输入参数，由于云、气溶胶、太阳高度角和地物双向性反射等的影响，造成了遥感反演的太阳辐射数据在时间、空间上的缺失，会严重影响应用模型的精度。“时间序列重构”是利用多种统计和数值分析方法，模拟辐射的季节变化规律，从而插补缺失观测值，优化时间序列数据。 中国科
中国长时间序列积雪面积遥感产品数据集发布
积雪面积是研究水文和气候变化的重要因子，也是气候变化的指示器，对地表能量平衡、水体通量、水文过程、大气及其海洋循环等具有显著影响。1978年卫星数据观测表明，北半球积雪持续减少，模型模拟结果表明，温度每升高1℃，北半球积雪面积缩减100-280万平方公里。在全球升温背景下，一套长时间序列的高空间
刚刚！官方通报失踪106天的胡鑫宇事件|附时间线梳理
今日上午10时，胡某宇事件新闻发布会在江西铅山县召开，发布会上，江西省、市、县公安机关联合工作专班及市县相关部门，发布了胡某宇事件最新调查情况，并回答记者提问。胡某宇事件新闻发布会现场 据胡某宇事件最新调查情况通报，在国内权威刑事技术专家现场指导下，省、市、县公安机关联合工作专班通过开展调查访
打破因果关系，让量子电池效率更高？
日本东京大学科学家在最新一期《物理评论快报》杂志发表论文指出，量子电池是一种可以利用量子效应的储能设备，其可以绕过传统因果关系规则提升充电效率。 在量子世界里，原因并不总是先于结果出现。 图片来源：《新科学家》网站 研究人员解释说，在经典世界中，因果关系只有一个方向：如果事件A导致了事件B
Cell－Rep：DNA序列重复会引发遗传性疾病
近日，来自塔夫斯大学的研究人员通过研究揭示，DNA链中长的核苷酸重复会导致基因组的不稳定，最终会引发遗传性疾病的发生，比如Freidreich征和亨廷顿病等，相关研究刊登于国际杂志Cell Reports上。 研究者认为，当细胞分裂或细胞中DNA修复机制激活时就会在DNA复制过程中形成长的重复
Cell－Rep：DNA序列重复会引发遗传性疾病
近日，来自塔夫斯大学的研究人员通过研究揭示，DNA链中长的核苷酸重复会导致基因组的不稳定，最终会引发遗传性疾病的发生，比如Freidreich征和亨廷顿病等，相关研究刊登于国际杂志Cell Reports上。 研究者认为，当细胞分裂或细胞中DNA修复机制激活时就会在DNA复制过程中形成长的重复
Science：重磅！定制分子有望治疗DNA重复序列导致的疾病
弗里德希氏共济失调（Friedreich's ataxia）是一种罕见的致命性遗传疾病。与至少40种其他的遗传疾病（比如脆性 X 染色体综合征和一些肌肉萎缩症类型）一样，它是由阻止蛋白正确形成的DNA重复序列导致的。这些DNA重复序列能够含有上百个相同的短DNA序列（如GAAGAAGAA
长时间序列高时空分辨率城市景观动态遥感监测实现
占全球约3%的城市地表供养了55%的人类生活，复杂高强度的人类活动使城市景观剧烈变化，但当前学术界缺少长时间连续序列-高时空分辨率城市景观动态数据，导致城市景观演变的驱动机制及其产生的生态效应尚不明确，这制约了城市居民福祉提升和城市可持续发展。 中国科学院东北地理与农业生态研究所城市森林与湿地
基于单细胞数据理解细胞变化过程拟时间序列分析详解
单细胞检测技术的发展为我们理解复杂生命体中细胞的组成与各自功能及变化过程提供了强有力的工具。基于单细胞基因表达谱数据，我们可以窥探发育过程中细胞内的调控变化，发现肿瘤微环境中的各类细胞及它们的细胞间交流，理解器官组织中复杂多样的细胞类型。现有单细胞研究是一个从整体到个体，再由个体特征重建整体的过
基于单细胞数据理解细胞变化过程—拟时间序列分..（三）
此外，根据细胞类型分类，我们也可以将差异基因沿着拟时间轨迹绘制不同类型细胞基因表达散点图：图8差异基因拟时间表达轨迹图最后，根据拟时间序列轨迹，我们把特征差异基因表达变化进行聚类，以热图形式展示基因的变化过程： 图9 差异基因聚类热图因此，通过拟时间序列分析，我们可实现构建细胞变化轨迹途径，并能找到
基于单细胞数据理解细胞变化过程—拟时间序列分..（二）
图3 细胞轨迹图（按阶段分类）当然，通过以上的分析结果，我们无法判断出来轨迹的开始，因此无法确定轨迹路线。所以，我们需要结合已有认知，通过函数识别包含时间为零的大多数细胞的状态，绘制拟时间轨迹图：图4 拟时间轨迹图得到上述拟时间轨迹图后，我们就可以根据不同的阶段分类，分别进行分类绘制，得到以下结果
基于单细胞数据理解细胞变化过程——拟时间序列分析详解
单细胞检测技术的发展为我们理解复杂生命体中细胞的组成与各自功能及变化过程提供了强有力的工具。基于单细胞基因表达谱数据，我们可以窥探发育过程中细胞内的调控变化，发现肿瘤微环境中的各类细胞及它们的细胞间交流，理解器官组织中复杂多样的细胞类型。现有单细胞研究是一个从整体到个体，再由个体特征重建整体的过
基于单细胞数据理解细胞变化过程—拟时间序列分..（一）
单细胞检测技术的发展为我们理解复杂生命体中细胞的组成与各自功能及变化过程提供了强有力的工具。基于单细胞基因表达谱数据，我们可以窥探发育过程中细胞内的调控变化，发现肿瘤微环境中的各类细胞及它们的细胞间交流，理解器官组织中复杂多样的细胞类型。现有单细胞研究是一个从整体到个体，再由个体特征重建整体的过程。
凝血时间检查的相关－疾病和症状介绍
1、相关疾病 获得性循坏抗凝物质增多综合征，遗传性出血性毛细血管扩张症，血友病，卵巢肿瘤破裂，新生儿弥散性血管内凝血，小儿原发性血小板增多症，原发性血小板增多症，黄体囊肿，小儿血栓性血小板减少性紫癜，小儿出血性疾病 2、相关症状 面颊及上胸部充血，进行性肝缩小，近迫性昏迷，咯血伴有皮肤粘膜
携带严重致病基因的人也可能很健康－遗传变异与疾病之间因果关系或需重估
科学家通过对50多万人的遗传信息分析，发现有13个人虽然携带有和严重儿童疾病相关的遗传变异，却依旧很健康。这一发现于11日发表在英国《自然—生物技术》杂志的在线版中。虽然这种适应能力背后的生物原因尚不清楚，但该研究给发现对这些疾病起保护作用的基因多态性，提供了非常重要的第一步。而此前对于遗传变异
基因序列仪在感染性疾病诊断上的应用
测序技术可以精确的分析碱基序列，通过序列比对，对各种病原体直接进行鉴定、分型和溯源，明确某一感染性疾病对应病原体的基因序列，可以有针对性地用药和预防，提高用药的有效性和安全性。同时基因测序可以用于发现新型病原体，能更好地做好预防工作。
挑战常规！CAG重复序列决定着亨廷顿舞蹈病发病时间
亨廷顿舞蹈病（Huntington's disease, HD）是一种遗传性的致命性疾病。在这种疾病中，大脑中的神经细胞随着时间的推移而遭受破坏。它在生命中的任何时候都可能变得明显，但通常开始于一个人的三四十岁。在一项新的研究中，来自亨廷顿舞蹈病基因修饰物联盟（Genetic Modif
打破传统因果关系规则，量子电池提升充电效率
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511790.shtm日本东京大学科学家在最新一期《物理评论快报》杂志发表论文指出，量子电池是一种可以利用量子效应的储能设备，其可以绕过传统因果关系规则提升充电效率。 ?在量子世界里，原因并不
基因序列仪在遗传性疾病诊断上的应用
由于基因突变而导致的疾病具有遗传性和终身性的特点，一旦患上这种病，会给自身和整个家族带来痛苦。通过对被检人员进行基因测序，查看基因突变情况，判断是否存在基因遗传病，或者推断后代患病的概率为婚育提供指导，减少遗传性疾病的发病率。
研究揭示前额叶海马环路通过theta振荡支持时间序列信息的在线加工
10月17日，《神经科学通报》（Neuroscience Bulletin）在线发表了题为Theta Oscillations Support Prefrontal-hippocampal Interactions in Sequential Working Memory的研究论文。该研究由中国
梳理近期那些改写教科书的研究
随着技术的不断发展，科学家们也不断发现目前生物医学教科书中记载的很多理论知识需要改写。为此，小编针对近期发生的教科书改写研究进行一番梳理，以飨读者。 1.Science：改写教科书！在禁食期间，脂肪细胞接管尿苷产 在哺乳动物进食、睡觉和禁食期间，它们如何维持两种生物学上至关重要的代谢物平衡？
梳理近期那些不靠谱的研究
近年来，由于细胞系污染、实验技术本身存在问题而有待改进、实验结果无法重复和研究人员存在学术不端等缺陷，不少论文的实验结果广受质疑，甚至论文惨遭撤回。基于此，小编针对近期这方面的相关新闻进行梳理，以飨读者。 1.PLoS ONE：HeLa细胞幽灵---细胞系污染导致大约3.3万篇论文存在问题