昆明动物所揭示温泉菌群空间分布的特征参数

生物分布的空间异质性是生态学研究的核心问题之一;对于似乎无处不在的细菌来讲,这一问题的研究难度似乎更大。近日,中国科学院昆明动物研究所计算生物与医学生态学实验室博士生李连伟发表在Molecular Ecology上的论文揭示了温泉菌群分布的重要特征参数。这是作者继年初在Frontiers in Microbiology上发文试图估计全球温泉细菌种类理论最大值后,所获得的另一项关于温泉菌群生态的重要参数。两项研究均基于Sharpe(2014)等所收集的全球160多组温泉菌群宏基因测序数据。 该研究最重要的发现是,菌群空间分布异质性随群落中平均物种大小变化的关系符合幂法则模型,而该幂法则模型的关键参数(b)是一常数,并不受温泉环境因子(例如温度、pH)的影响。因此,利用这一常数,就可以估计某一温泉中菌群分布空间异质性的高低。论文中,作者以地球上重力加速度常数(g=9.8)做类比,阐述了所发现参数的理论和实际意义。如果重力加速度......阅读全文

昆明动物所等在鼠兔系统演化领域取得进展

  青藏高原及其邻近的中国西南山地是现生鼠兔的分布中心,这一区域的鼠兔物种占整个类群物种数量的1/3以上(Hoffmann & Smith, 2005)。尽管如此,鼠兔的分类与系统演化研究并没有对这一区域的鼠兔多样性予以足够的重视。最近的研究表明,青藏高原及其邻近区域的鼠兔物种多样性被低估,继而引发

昆明动物所抗菌肽用于痤疮治疗研究取得进展

  抗菌肽作为新型抗感染候选药物近年来受到密切关注。抗菌肽具有不易导致微生物耐药、杀菌时间快、不诱发微生物产生内毒素且可以中和内毒素因而不导致脓毒症的产生(传统抗生素可诱发脓毒症)等优点。   中国科学院昆明动物研究所赖仞研究员带领的课题组围绕抗菌肽的识别、发掘以及开发利用作了大量的工作,并建立中

昆明动物所揭示肿瘤细胞分子病理新机制

  蛋白酶激活受体1 (protease-activated receptor 1, PAR1) 属于G蛋白偶联受体家族,是凝血酶、金属蛋白酶等的受体,在血液循环系统、免疫系统中发挥重要的生理作用,并参与多种人类疾病的病理发生。目前研究表明PAR1信号通路激活的失调与慢性炎症以及肿瘤的发生和肿瘤转移

中科院昆明动物所“十二五”硕果累累

   在云南昆明,有一家历史悠久的科研单位,它是我国最早开展灵长类动物驯养繁殖和研究的单位之一,曾为我国原子弹的辐射生物学研究作出过贡献。它就是中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆明动物所)。  新时期,昆明动物所立足于我国及东南亚丰富的生物多样性资源,瞄准“遗传、发育和进化交叉统一”的重大科学前沿

昆明动物所人类从头起源新基因研究取得重要进展

  基因的起源在生物界是一个普遍而又不断延续的过程,是生物由简单到复杂演化的基础。新基因产生的机制主要有基因重复、外显子重排、逆转录、基因水平转移、可移动元件、基因断裂融合和从头起源等。其中,从头起源的基因(指基因起源于没有功能的非编码区域DNA)研究甚少,主要是因为人们一直认为此机

昆明动物所与企业联合开发抗菌肽药物

   近日,中国科学院昆明动物研究所与苏州光华实业(集团)有限公司签订合作协议,拟利用昆明动物所在抗菌肽研究上的领先优势,结合江苏省生物医药相关产业良好的投资环境和医药产业化转化的良好形势,充分发挥各方优势,联合开发抗菌肽药物。   抗菌肽是由基因编码、核糖体合成的多肽,几乎存在

昆明动物所家犬嗅觉受体基因研究取得新进展

  家犬作为人类最亲密的朋友,在人类历史上一直扮演者重要的作用。更重要的是,家犬是人类最早驯化的家养动物,由于其经过了驯化和品种培育两个重要的群体历史阶段,并且在家养哺乳动物中形成了最具多样性的品种,因此家犬一直是研究人工选择和自然选择的重要模式生物。中国最为家犬的驯化地,不仅遗传多样

科技部副部长陈小娅考察昆明动物所

  7月18日,科技部副部长陈小娅一行到中科院昆明动物研究所考察。刚下车,陈小娅就热切地对前来迎接的昆明动物所所长张亚平院士说:“我给你们带好消息来了,你们的国家重点实验室评估获得了优秀的成绩,不容易啊,祝贺你们!”  简朴的会议室里,研究所的学科组长们齐聚一堂,张亚平院士向陈小娅介

昆明动物所揭示翼手目暗视觉适应性机制

  翼手目(蝙蝠)是夜行性动物,在不同的蝙蝠种类中存在着显著的感觉分化:食虫蝙蝠主要依赖回声定位来导航、捕食,其眼睛退化,而旧大陆果蝠没有回声定位能力,其眼睛很发达,主要依赖视觉和嗅觉来寻找食物。前期研究中,中国科学院副院长、中国科学院院士、中国科学院昆明动物研究所研究员张亚平课题组发现视觉通路中C

昆明动物所黑颈鹤卫星跟踪研究取得阶段性进展

  候鸟迁徙研究是鸟类学研究中非常重要的一个领域。对于一些濒危候鸟,对其开展迁徙研究,了解其迁徙路线、重要的停歇地、繁殖地和越冬地等,则具有更重要的保护意义。   黑颈鹤是世界现存15种鹤中唯一的高原特有种,繁殖于西藏、青海、甘肃、四川、新疆等省,冬季则越冬于西藏、云南、贵州等地。由

昆明动物所等家养动物线粒体DNA基因组学研究取得进展

  近年来,家养动物线粒体DNA(mtDNA)基因组学得到了迅速发展,积累了大量的mtDNA序列数据。与此同时,一些问题随之浮现出来。除了数据质量存在缺陷(Shi, et al. 2014. Mol Ecol)之外,mtDNA世系划分标准不一,世系命名混乱的问题也已开始干扰家养动物mtDNA的研究工

昆明动物所揭示两栖动物防御高原紫外辐射的分子机制

  太阳光谱中的紫外线不仅使人体皮肤晒伤老化,产生炎症、黑色素和色斑,更严重的还会诱发癌变,危害人类健康。目前动物适应高海拔环境的策略和生理生化机理研究主要集中于低氧低温适应,对动物如何抵御高原强紫外线辐射的认识非常有限。  中国科学院昆明动物研究所动物模型与人类疾病机理重点实验室生物毒素与人类疾病

昆明动物所等完成云南两栖、爬行动物物种编目工作

物种名录是进行生物多样性研究、保护、利用以及管理的重要基础资料。近年来分类学研究方法、技术手段不断提高,特别是整合分类学的发展促进了生物分类体系不断得以完善;此外,新物种不断被发现并描述,已知物种的分布和生态数据不断更新。由于分类的变动,物种的分布范围、种群数量等也随之变化,直接影响了物种的受威胁等

昆明动物所参加第四届昆明泛亚技术转移暨成果转化对接会

对接会现场   7月13日,第四届昆明泛亚技术转移暨成果转化对接会在云南创新生物产业孵化器管理有限公司召开。对接会由昆明市人民政府主办、昆明市科技局承办。中国科学院昆明分院作为协办单位应邀出席会议。   会议以生物医药产业为重点,旨在进一步推进云南省生物医药资源开发和利用,充分展示云南省

昆明动物所揭示乳腺癌细胞增殖的分子机制

  乳腺癌是一种严重危害女性身心健康的常见肿瘤,其中以ER/PR/HER2三阴性的乳腺癌恶性程度最高,至今缺乏靶向治疗的药物。   中国科学院昆明动物研究所陈策实研究员领导的肿瘤生物学实验室通过多年研究证实,KLF5在三阴性乳腺癌中高表达并促进肿瘤的增殖,是三阴性乳腺癌一个潜在治疗靶点。一般认为,

昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式

  挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法

昆明动物所研究揭示人类史前移居海南岛

  在距今约2万年前的末次盛冰期(the Last Glacial Maximum,LGM),伴随冰盖体积的增长,海平面下降。这种情况在LGM结束后的气候转暖中发生逆转,即冰盖消融,海平面上升。在大陆沿海以及海岛地区,海平面的升降造成了海陆变迁,这一过程很可能对这些地区内史前人类的迁徙

昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式

  挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法

昆明动物所揭示鸡形目新的系统发育关系

  鸡形目是一个在世界范围里广布的种类。雉科在该目里成员最多,关系最复杂。中国拥有世界上雉科近1/3的种类,其中又有大约1/3是我国的特产种,有“雉类的王国”之称。该目包含了人们所熟悉以及有重要经济价值的家鸡,火鸡,鹌鹑等;也包含了很多稀有的观赏鸟类,比如红腹锦鸡,红腹角雉,白鹇等。由

昆明动物所等在蝴蝶基因组研究中取得进展

  蝴蝶因其在自然界中多姿多彩的变异,自达尔文时期以来就是进化研究的好材料。然而,长期以来其高杂合的基因组难以解析,对其也缺乏有效的遗传操作技术体系,极大地限制了蝴蝶在进化学研究的深入广泛应用。  为了使蝴蝶成为研究宏观形态进化遗传基础的新模式生物,中国科学院昆明动物研究所的基因起源课题组与深圳华大

中科院昆明动物所家鸡矮小化研究获得系列进展

   中科院昆明动物所在家鸡矮小化研究中获得系列进展,相关研究成果发表在《分子生物学与进化》杂志上。  人类的驯化和选育使得家鸡成为表型多样性最为丰富的动物之一。在体型大小方面,大型肉鸡或斗鸡(>5 kg)和小型观赏鸡(约0.5 kg)可达到10倍以上的悬殊差异。其中,家鸡的矮小化在蛋鸡和观赏鸡选育

昆明动物所放流牛栏江滇池金线鲃2.3万尾

  9月28日下午,中国科学院昆明动物所杨君兴研究员课题组研究繁育的2.3万尾滇池金线鲃苗种在云南省沾益县德泽乡德泽水库库区放归牛栏江。   牛栏江—滇池补水工程是一项水资源综合利用工程,作为滇池流域水环境综合治理6大工程措施的关键性工程。根据国家环境保护部《关于牛栏江-滇池补水工程环境影响报告书

昆明动物所蝙蝠视觉基因通路进化研究获新进展

  蝙蝠是夜行性动物。食虫蝙蝠主要用回声定位来确定方位、捕捉昆虫,其眼睛退化;旧大陆果蝠没有回声定位能力,它们主要依赖视觉和嗅觉来寻找食物,其眼睛很发达。   在之前的研究里,中国科学院昆明动物研究所沈永义副研究员在张亚平院士的指导下,克隆了视网膜上视杆细胞视紫红质的RHO基因 (Rhodop

昆明动物所等在昆虫过敏原研究中取得进展

  蟑螂是城市人居环境常见的有害昆虫,也是一类严重的过敏原,是诱发哮喘的重要因素。1964年第一次明确记录蟑螂过敏原的皮肤反应试验,1979年证实气喘病患者与吸入蟑螂过敏原二者之间的关系。据统计在气喘好发的城市中,40-60%的病患对蟑螂过敏原产生高量的IgE。蟑螂过敏原对气喘病患是一个重要的危险因

昆明动物所等揭示家犬适应欧洲牛奶饮食的遗传机制

  家犬大约在1万五千年前到4万年前从欧亚大陆的灰狼驯化而来,现已遍布世界大部分有人类居住的地方。家犬与人类生活在相同的环境中,在很多方面存在趋同进化,家犬对环境的适应性进化遗传机制一直是进化生物学家的研究热点。经历长时间的人工选择和自然选择,欧亚大陆家犬分成欧洲家犬和东南亚两个群体,其背后的遗传机

昆明动物所揭示自噬参与帕金森疾病发生的作用机制

  帕金森疾病(Parkinson’s disease,PD)是一种常见的神经退行性疾病,患者主要表现出运动障碍,包括运动迟缓、肌强直、姿势异常与静止性震颤等。其病理特征表现为黑质致密区多巴胺神经元丢失和路易小体的形成。目前,全球有六百多万人正遭受帕金森病的折磨,随着我国人口老龄化的加剧,PD带来的

昆明动物所新基因的功能起源和进化研究取得进展

  基因复制是新基因和新功能产生的最主要的方式之一。然而,在分子水平,新产生的复制基因如何通过通路整合而获得生物学功能以及产生适应性性状却并不清楚。   为了回答以上问题,中科院昆明动物研究所中德马普进化基因组学青年科学家小组的博士生丁昀等在导师王文研究员的指导下,对黑腹果蝇亚群(Drosophi

深圳华大基因研究院石琼教授访问昆明动物所

  7月17日下午,受遗传资源与进化国家重点实验室系统进化与生物地理学组杨君兴研究员的邀请,深圳华大基因研究院海洋平台负责人石琼教授访问中国科学院昆明动物研究所,并作了题为“海洋基因科技及其产业化应用”的学术报告。  石琼首先介绍了海洋生物资源在全球的重要作用和对国家的战略意义,通过生物科技在海洋资

昆明动物所尘螨过敏原研究取得新进展

  尘螨是导致过敏性哮喘、鼻炎等呼吸系统过敏性疾病最主要的过敏原来源。2004年WHO估计全球大约有3亿哮喘和鼻炎患者,并指出这类呼吸系统过敏性疾病是儿童最常见的慢性病,其在儿童中发病率超过2%,且这类过敏性疾病的发生率仍呈上升趋势,估计到2025年将会新增1亿患者。对于此类疾病目前认为最有效的治疗

德国马普进化人类学研究所李明锟博士访问昆明动物所

  6月20日,“中国科学院第二届人才发展主题活动日”在北京拉开序幕。作为系列活动之一的“海外人才走进科学院活动周”当天同时启动。该活动旨在通过邀请海外优秀青年科技人才集中访问中科院有关研究所并进行学术交流,与海外人才建立起交流密切的联络机制,向海外人才宣传国家和中科院人才政策与举措,搭建