昆明动物所揭示温泉菌群空间分布的特征参数
生物分布的空间异质性是生态学研究的核心问题之一;对于似乎无处不在的细菌来讲,这一问题的研究难度似乎更大。近日,中国科学院昆明动物研究所计算生物与医学生态学实验室博士生李连伟发表在Molecular Ecology上的论文揭示了温泉菌群分布的重要特征参数。这是作者继年初在Frontiers in Microbiology上发文试图估计全球温泉细菌种类理论最大值后,所获得的另一项关于温泉菌群生态的重要参数。两项研究均基于Sharpe(2014)等所收集的全球160多组温泉菌群宏基因测序数据。 该研究最重要的发现是,菌群空间分布异质性随群落中平均物种大小变化的关系符合幂法则模型,而该幂法则模型的关键参数(b)是一常数,并不受温泉环境因子(例如温度、pH)的影响。因此,利用这一常数,就可以估计某一温泉中菌群分布空间异质性的高低。论文中,作者以地球上重力加速度常数(g=9.8)做类比,阐述了所发现参数的理论和实际意义。如果重力加速度......阅读全文
上海药物所周虎研究员到昆明动物所进行学术交流
4月27日上午,受中国科学院昆明动物研究所肿瘤生物学实验室陈策实研究员的邀请,中国科学院上海药物研究所周虎研究员到研究所为大家做了题为“蛋白质组学及其在药物作用机制研究中的应用 ”的精彩报告。 首先,周虎研究员简单介绍了基于质谱的蛋白质组学的科研进展及研究目标。随后具体讲解了
昆明动物所等开发完成犬类SNP数据库DoGSD
家犬作为人类生活和工作中的伙伴,其进化研究一直是遗传学研究中的一个热点。然而目前使用的家犬参考SNP数据集,不仅数量少,采样地不够广泛,而且测序覆盖度差异大,SNP数据主要只来源于两个品种的两个犬只,并不利于家犬的群体遗传研究。 目前,二代测序产生了大量高质量的家犬和其祖先物种灰狼的全基因数据
昆明动物所等识别出镇痛活性的神经毒素多肽家族
2005年,欧洲正式批准蛭类疗法为合法的治疗手段。每年仅在德国就有35万条水蛭用于医疗,从治疗效果来看,水蛭疗法效果比临床上常规疗法效果好很多。很多文献报道蛭类疗法具有镇痛作用,长期的临床实践证明蛭类疗法对多种疼痛具有良好疗效。近日,由中国科学院昆明动物研究所研究员赖仞团队识别出镇痛活性的神经
昆明动物所研究揭示新的肾损伤血清候选标志物
脊椎动物三叶因子(trefoil factors, TFFs)广泛表达和分布在上皮系统中,与上皮粘膜保护、损伤修复和肿瘤密切相关。自三叶因子发现三十多年来,揭示其生理病理功能、分子作用机制是相关领域科学家致力解决的关键问题。特别值得关注的是,近年来国内外许多科研人员的工作希望以血清三叶因子作
昆明动物所证实植物也会使用胡萝卜加大棒的策略
对于任何一个合作系统而言,总是存在投机的、不合作的行为或个体。这些投机行为或投机个体的在合作系统中的扩散将会导致合作系统的解体。然而,是什么机制能够阻止这种投机行为,从而避免合作系统的解体至今仍是一个争议很大的科学问题。 经典的、基于均衡和对称性思想发展而来的理论认为:合作系统的投机个体在
昆明动物所等发布最新版树鼩基因组注释
树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物,是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短(约6周),饲养成本低,单胎产仔数较高(每胎2-5只)等特点,在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前,树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建,是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究
昆明动物研究所关于东亚人群源流研究取得新进展
随着大量线粒体DNA(mtDNA)全基因组信息的积累,科学家对东亚人群的母系遗传结构已经有较为清晰的认识。然而,研究中仍发现有一些mtDNA类型无法识别。虽然这些未定类型的分布频率很低,但其系统发育地位究竟如何迄今仍不得而知。与此同时,由于东亚具有丰富且较为连续的古人类(the a
昆明动物所昆虫天然药物功能蛋白质合作研究再获进展
牛虻(中药材名虻虫)为专性吸血昆虫,也是传统的抗血栓中药材,在多种抗血栓中成药生产中被用作原料。近年来,中国科学院昆明动物研究所赖仞研究员领导的课题组围绕牛虻成功吸血的分子机制和发挥抗血栓的物质基础等问题对其开展了较为系统的研究,从牛虻唾液腺中识别了多种功能活性蛋白或多肽(MCP 2008,
昆明动物所揭示家鸡视觉退化的无意识选择作用机制
经过长期的驯化和人工选择作用,家鸡与其野生祖先红原鸡除了在行为、体型、生殖周期和生长速度等存在显著差异外,其视觉功能也显著衰退。目前研究理论认为这种视觉退化是由于选择压力放松导致,但是至今这种视觉退化的遗传机制并不清楚。 中国科学院昆明动物研究所张亚平研究团队基于家鸡和红原鸡的群体基因组数据,
昆明动物所等在尘螨过敏原研究方面取得进展
尘螨是导致人类室内过敏的最主要过敏原来源。目前过敏治疗的标准方法是脱敏治疗(多次微量注射过敏原于过敏病人),因此,高纯度过敏原的获得及其基本生化特征的认知是决定脱敏治疗效果和副作用强弱的关键。目前在尘螨过敏脱敏治疗过程中使用的过敏原还有相当大的比例是尘螨提取物。这些提取物是含有多种
昆明动物所等在藏族高原适应遗传机制研究中取得进展
近日,中国科学院昆明动物研究所宿兵课题组与西藏大学、青海省高原医学科学研究院开展合作,在藏族高原适应遗传机制研究中取得进展。相关研究成果发表在《分子生物学与进化》(Molecular Biology and Evolution)上,昆明动物所副研究员彭忆,西藏大学教授崔超英,昆明动物所博士生和耀
昆明动物所揭示线粒体DNA种系突变对肿瘤易感性的影响
线粒体DNA(mtDNA)在肿瘤发生发展中的作用多年来备受关注。前期研究揭示,大部分肿瘤细胞mtDNA体细胞突变很可能都是由于其线粒体氧化磷酸化功能限制降低而产生的副产品。而mtDNA种系突变不仅存在于肿瘤组织,同样也存在于正常组织中。但是目前仍不清楚肿瘤细胞mtDNA种系突变是否和体细胞突变的
昆明动物所等研究发现环境选择压力增加或导致性别失调
自然界的大多数物种的性比都是1:1,然而少数物种在进化过程出现偏雌或偏雄的性别比例。究竟什么机制或原因决定、影响一个物种的性别比例,一直是学术界未曾有效解决的科学问题。1930年发表的著名的Fisher定理认为,性别的进化就是两性合子随机结合的过程,其后代出现雄性或雌性的几率就像随机投掷硬币所出
昆明动物所:干热河谷区生物多样性不应被低估
红外相机技术在地栖大中型野生动物调查与监测研究中具有突出优势,易于统一规范技术标准,所获取数据便于管理和标准化统计分析,已成为国内外兽类监测研究网络的主要技术支撑。日前,中国科学院昆明动物研究所研究员蒋学龙课题组在红外相机监测研究中取得进展,研究成果在线发表于《多样性与分布》,李学友博士为第一作
昆明动物所从能量代谢角度揭示蝙蝠飞行起源的机制
蝙蝠是翼手目动物的通称,是唯一演化出具有真正飞行能力的哺乳动物。跟鸟类进化出飞行能力一样,蝙蝠飞行能力的进化需要一系列十分复杂的形态和生理变化,因此达尔文在《物种起源》中感叹“从不能飞的原始哺乳动物进化为能飞的蝙蝠是不可思议的”。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士及其指导的博士生沈永
昆明动物所揭示干扰素信号通路的调控新机制
干扰素(IFN)信号通路是天然免疫的主要组成部分,在宿主抵抗病原体中发挥重要作用;IFN的产生和下游通路的激活受到精密的调控。转录因子STAT1是IFN通路的关键效应因子,IFN信号通路激活时,STAT1蛋白被其激酶JAK1磷酸化修饰,进而形成异源或同源二聚体,并转移入核调控下游靶基因的转录激活
中科院昆明动物所成功揭示实验大鼠起源驯化遗传机制
近日,中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组与吴东东课题组合作,通过比较野生褐家鼠和实验大鼠的基因组和转录组数据,解析了实验大鼠的起源和驯化遗传机制。相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上。 实验大鼠作为一种广泛使用的模式动物,由野生褐家鼠驯化而来
昆明动物所天然药物功能蛋白质研究取得新进展
地鳖虫在传统中药中是重要的抗血栓药物,且被报道用于血栓治疗具有低出血风险,因而应用于多个抗血栓药物处方中。我国有大规模的地鳖虫人工养殖,但其发挥抗血栓功能的物质基础和作用机制尚不清楚。 中国科学院昆明动物研究所赖仞研究员领导的课题组采用蛋白质组学结合药理学手段,从地鳖虫中识别
昆明动物所揭示星云湖大头鲤及其它鲤鱼种质现状
星云湖是云南九大高原湖泊之一,属富营养化湖泊,其分布有很多云南特有的鲤科物种。其中大头鲤Cyprinus pellegrini由于其特有性及珍贵性,已被列为国家II级保护动物。近年来,星云湖外来物种入侵较为严重,了解目前星云湖土著鲤鱼种群构成和生存状态,可对星云湖土著鲤鱼种群保护提
昆明动物所基因家族相关性进化研究取得新进展
食物的寻找、选择和消化之间存在一定的关系,虽然宏观上的主观判断存在合理性,但缺乏遗传学上的直接证据。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、吴东东博士和David Irwin教授等研究人员分析了12种果蝇中六个和食物有关的基因家族:类胰蛋白丝氨酸蛋白酶(Tryp_SPc)(主要
昆明动物所等发现新的健康衰老促进因子ATF7
慢性低度炎症是衰老的主要特征之一,而这种炎症与诸多衰老有关疾病密切相关,如神经退行性疾病、代谢综合征、癌症、心血管疾病等。长寿老人可规避或延缓一些重大的老年疾病,这种生存优势是否与其炎症状态有关迄今并不清楚。因此,以健康长寿人群为研究对象,探索其炎症调控的机制,或能为延长生物体的健康寿命,实现健
昆明动物所等在人类大脑进化遗传机制研究中取得进展
表观遗传修饰的重要性越来越被人所认识,但是表观遗传的变化如何对表型的进化产生影响,特别是表观遗传调控在人类大脑进化中的作用仍然不是很清楚。美国乔治亚理工大学教授Soojin V.Yi 曾经对人和黑猩猩大脑进行了全基因组甲基化测序,发现了很多物种间甲基化差异区域,但这些甲基化差异区域是否属于人类特
汕头大学教授到昆明动物所进行学术交流
5月31日,应中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏研究员的邀请,汕头大学许丽艳教授和李恩民教授到研究所进行学术交流。当天下午,许丽艳教授和李恩民教授给所内师生们分别做了题为“fascin基因在食管癌中的功能、表达调控及其细胞信号传导通路”以及“桥粒糖蛋白DSC2负性调控食管癌细胞侵袭迁移的分子机制”的
西安交大医学院泌尿外科所郭鹏教授到昆明动物所进行交流
9月8日上午,西安交通大学医学院泌尿外科研究所郭鹏教授应中科院昆明动物所陈策实研究员邀请到研究所进行学术交流,并作了题为Essential role of KLF5 in the regulation of epithelial proliferation in the context of
蚌埠四所学校食堂餐具检出大肠菌群
近日,蚌埠市食品药品监督管理局公示了最新一期抽检信息,共涉及16家被抽样单位、50批次检品,46批次合格,4批次不合格。其中,4所学校所使用的餐具被检出含有大肠菌群,为不得检出成分。 抽检结果显示,蚌埠铁路中学食堂于2015年7月1日购进的饭碗,蚌埠市铁路第三小学于2017年6月1日购进的饭碗
耐热大肠菌群跟粪大肠菌群是一种菌吗
大肠菌群并非细菌学分类命名,而是卫生细菌领域的用语,它不代表某一个或某一属细菌,而指的是具有某些特性的一组与粪便污染有关的细菌,需氧及兼性厌氧、在37℃能分解乳糖产酸产气的革兰氏阴性无芽胞杆菌。 肠埃希氏菌(E. coli)通常称为大肠杆菌,根据不同的生物学特性将致病性大肠杆菌分为5类:致病性
从肠道菌群到肠道病毒群
肠道菌群早以已经成为热点科技新闻概念,其核心要点是肠道内细菌是维持健康的重要因素。其实肠道菌群自己身体内也有另外一种生命,就是细菌病毒,又称为噬菌体。最近有研究发现,肠道内细菌感染的噬菌体对人体健康也具有重要价值,这些病毒无法裸露生活,都必须隐藏在细菌体内寄生。这里形成一个非常有趣的现象,人的肠
“肠道菌群—肠—脑”互作调控动物对寒冷环境的适应机制
冬季的严寒和食物短缺对于温带地区非冬眠哺乳动物的生存是极大的挑战。恒温动物维持高而恒定的体温需要付出很高的代价。褐色脂肪组织(brown adipose tissue, BAT)产热(非颤抖性产热)是一种高效迅速的产热方式,受交感神经支配,在小型哺乳动物(包括冬眠动物)的体温调节中发挥关键作用。
揭示变温动物适应高海拔极端环境的遗传机制
日前,中国科学院成都生物研究所李家堂和中国科学院昆明动物研究所张亚平等研究团队以分布于青藏高原的温泉蛇为研究对象,解析了蛇类这种变温动物适应高海拔极端环境的遗传机制,将为人类高原病的预防和治疗提供一定参考价值。该成果于北京时间8月1日凌晨在线发表在《美国科学院院刊》上。 温泉蛇是世界上分布海拔
北京基因组所杨运桂研究员到昆明动物所进行学术交流
1月14日上午,应中国科学院、云南省动物模型和人类疾病机理重点实验室陈策实研究员邀请,中国科学院北京基因组研究所杨运桂研究员到昆明动物研究所进行学术交流,并作了题为N6-methyl-adenosine (m6A) in RNA: An Old Modification with A Nov