NucleicAcidsResearch:ECFσ因子的σ2/σ4linker区域的结构与功能

5月27日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室张余研究组题为Structures and mechanism of transcriptioninitiation by bacterial ECF σ factors 的研究论文。该工作是张余研究组对今年早期工作的延续(Li etal., Nature communications 2019)。该文主要研究了细菌ECF σ因子的结构、ECF σ因子特异性识别启动子DNA序列,以及ECFσ因子起始转录的分子机制,重点探讨了ECF σ因子的σ2/σ4 linker区域的结构与功能。 细菌基因转录首先需要DNA-directedRNA polymerase (RNAP)与转录起始σ因子形成RNA聚合酶全酶,随后RNAP全酶识别启动子DNA,打开双链DNA形成转录泡,起始RNA......阅读全文

Nucleic-Acids-Research:ECF-σ因子的σ2/σ4-linker区域的结构与功能

  5月27日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室张余研究组题为Structures and mechanism of transcriptioninitiation by bacterial

Linker-Ligation

Linker Ligation (with T4 DNA Ligase)In a microcentrifuge tube prepare a solution of blunt ended, dephosphorylated DNA (100-500ng) in TE buffer (5-7µl)

科学家解析结核杆菌转录起始复合物的晶体结构

  基因组的遗传信息得以表达,首先需要RNA polymerase (RNAP)以DNA为模板合成RNA。基因转录不仅是基因表达第一步,还是基因表达的主要调控步骤。对RNAP分子机器结构、运行机理以及调控机制的研究能够回答基因表达调控的基础生物学问题。在转录起始阶段,细菌的RNAP与转录起始σ因子形

科学家揭示叶酸ECF转运蛋白结构和转运机制

  4月14日,《自然》杂志在线发表中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所的最新研究进展,报道了来源于乳酸杆菌的能量耦合因子型(Energy Coupling Factor,ECF)叶酸转运蛋白面向内(inward-facing)的晶体结构(见示意图a),揭示了ECF转运蛋白跨膜转运叶酸

嗜酸性粒细胞的重要作用

  一、趋化与吞噬作用  嗜酸性粒细胞的趋化因子包括过敏反应中产生的ECF-A、补体活化过程中产生的ECF-C和T细胞来源的ECF-L等;受趋化因子作用后,嗜酸性粒细胞在体外对细菌、真菌和抗原抗体复合物等的吞噬能力已经得到证明,但在体内的吞噬作用尚需更确实的证据。  二、过敏反应调节作用  嗜酸性粒

上海生科院揭示泛酸跨膜转运蛋白的结构和分子机理

  12月15日,PNAS 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所张鹏研究组题为Structure of a pantothenate transporter and implications for ECF module sharing and energy coupling o

浙江大学JBC揭示蛋白质调控新机制

  来自浙江大学生命科学学院生物化学研究所的研究人员,揭示了天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)中ECFσ因子通过蛋白降解途径调控其在细胞内水平,以及次级代谢产物作为σ因子的调控因子通过正反馈调控模式调节次级代谢过程的机制,从而深刻阐述了σ因子蛋白稳定性与细胞分化的相互

董梦秋:Observing-Protein-Unfolding-Using-Crosslinker-by-LCMS/MS

  分析测试百科网讯 2020年9月15日,2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020CMSS)进行到第二天,由北京生命科学研究所董梦秋研究员、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究员、同济大学田志新教授、中国医学科学院药物研究所张金兰研究员;吉林大学药物代谢研究中心顾景凯教授、军事医

上海生科院PNAS解析泛酸跨膜转运蛋白

  12月15日,PNAS 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所张鹏研究组题为Structure of a pantothenate transporter and implications for ECF module sharing and energy co

张鹏小组首次解析叶酸转运蛋白结构与转运机制

  中科院上海生科院植物生理生态所张鹏课题组日前在《自然》杂志网络版上,首次报道了来源于乳酸杆菌的能量耦合因子型(ECF)叶酸转运蛋白面向内的晶体结构,并揭示了ECF转运蛋白跨膜转运底物的分子机制。   ECF转运蛋白复合体属于新的ABC(ATP Binding Cassette)转运蛋白家族

人工培育富含叶酸作物瓶颈突破

  上海生命科学研究院植生生态所公布一项最新研究,提出了叶酸通过ECF转运蛋白跨膜转运机制的模型,这是膜转运蛋白研究领域的重大突破,为人们理解维生素(特别是叶酸)如何跨细胞膜转运进入细胞的过程迈出了一大步,对今后人工培育富含叶酸的作物品种具有重要作用。4月14日《自然》(Nature)在线发表了该项

Nature:张鹏等揭示ECF转运蛋白跨膜转运叶酸的分子机制

能量耦合因子型(ECF)叶酸转运蛋白面向内(inward-facing)的晶体结构  4月14日,中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所张鹏课题组首次解析了来源于乳酸杆菌的能量耦合因子型(Energy Coupling Factor,ECF)叶酸转运蛋白面向内(inward-facing)的

cell research报道钴离子ECF转运蛋白复合体的结构与机理

  ABC转运蛋白依靠分解ATP产生的能量驱动信号分子、营养物质、药物分子等的跨细胞膜转运,是生物体中最大的初级主动转运蛋白家族。ECF转运蛋白是近年来发现的一类新型ABC内向转运蛋白,结构上由膜内底物特异结合蛋白EcfS和一个由跨膜蛋白EcfT和两个胞内ATP结合蛋白组成的能量耦合模块(或ECF模

施一公小组阐明能量耦合因子转运蛋白结构

  来自清华大学生科院、医学院、普林斯顿大学Lewis Thomas实验室等单位的研究人员报道了一种重要的转运因子的蛋白结构,这一结构的6个跨膜区域以未报道过的新折叠形式出现,这一发现对于了解核黄素(维生素B2)的运输,以及进一步拓展其生物学结构具有重要意义。  文章的通讯作者是清华

4月中国学者Nature文章井喷

  四月份,国内学者在Nature及其子刊上发表文章井喷,发表了关于ICOS分子免疫新功能,能量耦合因子转运蛋白复合物四聚体的晶体结构,衰老相关酶SIRT6从所未知的新功能等多项成果。   首先清华大学的研究人员接连发表两篇文章,清华大学医学院祁海教授课题组首次揭示了ICOS共刺激分子直接控制T淋

2013年05月09日《自然》杂志精选

  封面故事:镭-224被发现有“八极变形”现象  Studies of pear-shaped nuclei using accelerated radioactive beams  原子核是一个多体量子系统,其形状由它所含核子数量及它们之间的相互作用决定。在已知的数千种稳定的和放射性的原子核中(

肥大细胞的基本定义

肥大细胞(mast cell),发育源于骨髓CD34+前体细胞,是连接神经系统和免疫系统的桥梁,因为靠近周围神经末梢而很早就可以感受神经纤维的活动。肥大细胞激活后,可以释放炎症因子并募集免疫细胞。啮齿动物的肥大细胞可分两种,黏膜肥大细胞(mucosal mast cell)与结缔组织肥大细胞(con

I型超敏反应的发病机制

1.机体致敏;2.IgE交叉连接引发细胞活化;3.释放生物活性物质⑴预先形成储备的介质;包括①组胺(histamine),引起速发相症状的主要介质,可使小血管扩张、毛细血管通透性增强、平滑肌收缩、黏膜腺体分泌增强,其作用短暂,很快被组胺酶灭活,②激肽原酶(kininogenase),可将血浆中激肽原

I型超敏反应的发病机制

1.机体致敏;2.IgE交叉连接引发细胞活化;3.释放生物活性物质⑴预先形成储备的介质;包括①组胺(histamine),引起速发相症状的主要介质,可使小血管扩张、毛细血管通透性增强、平滑肌收缩、黏膜腺体分泌增强,其作用短暂,很快被组胺酶灭活,②激肽原酶(kininogenase),可将血浆中激肽原

肥大细胞的基本信息

肥大细胞(mast cell),发育源于骨髓CD34+前体细胞,是连接神经系统和免疫系统的桥梁,因为靠近周围神经末梢而很早就可以感受神经纤维的活动。肥大细胞激活后,可以释放炎症因子并募集免疫细胞。啮齿动物的肥大细胞可分两种,黏膜肥大细胞(mucosal mast cell)与结缔组织肥大细胞(con

Ⅰ型超敏反应的三肥大细胞介绍

  和嗜酸性粒细胞  1 .肥大细胞、嗜碱性粒细胞肥大细胞和嗜碱性粒细胞是参与Ⅰ型超敏反应的主要细胞,胞浆含有嗜碱性颗粒,能释放或介导合成大致相同的活性介质,如组织胺、白三烯、血小板活化因子、缓激肽等。此二类细胞来源于髓样干细胞前体。其细胞表面均具有高亲和力的 IgE Fc 受体,能与 IgE Fc

仿生皮肤也会“痛”

 基于ECF的仿生皮肤用于应变感知增强(SPS)的触觉和痛觉管理。(受访者提供) 痛!你的中枢神经系统向大脑传来警告:快做出应激反应保护自己! 科研人员一直希望仿生皮肤也能像生物体的皮肤一样,拥有感受疼痛的能力,进而激发

仿生皮肤也会“痛”

 基于ECF的仿生皮肤用于应变感知增强(SPS)的触觉和痛觉管理。(受访者提供)    痛!你的中枢神经系统向大脑传来警告:快做出应激反应保护自己!    科研人员一直希望仿生皮肤也能像生物体的皮肤一样,拥有感受疼痛的能力,进而激发“皮肤”所在个体的自我保护反应。    近日,受生物软组

Nature新文章解析重要转运蛋白

  利用X射线晶体学,德克萨斯大学西南医学中心的研究人员确定了帮助维持固醇平衡的人类固醇转运蛋白的三维原子结构。这项研究发布在《自然》(Nature)杂志上。  论文的通讯作者、德克萨斯大学西南医学中心生物物理和生物化学助理教授Daniel Rosenbaum博士说:“确定这一蛋白质复合物的结构可帮

宁波材料所在具有疼痛感知的仿生皮肤研究中取得进展

生物系统中,软组织可以通过应变增强有效地调节其机械强度以避免损伤。这些组织结合生物体的体感系统,可以经历从触觉到痛觉的可控感觉阈值转变,从而使生物体能够主动感知到可能造成伤害的机械刺激,并进一步迅速做出反应,防止危险的发生。因此,在应变机械增强之前,主动保护功能的实现依赖于感觉系统触发的强烈且快速的

组蛋白去乙酰化酶Rpd3S核小体去乙酰化和DNA-linker收紧的分子机制

  近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院联合澳门大学,在《细胞研究》(Cell Research)上,在线发表了题为Structural basis of nucleosome deacetylation and DNA linker tightening by Rpd3S histone de

什么是酸碱平衡?

酸碱平衡是对身体细胞外液(ECF)的pH值的稳态调节。ECF中酸和碱之间的适当平衡(即pH值)对于身体的正常生理机能和细胞代谢至关重要。细胞内液和细胞外液的pH值需要保持在恒定水平。许多细胞外蛋白的三维结构,如人体细胞的血浆蛋白和膜蛋白,对细胞外pH值非常敏感。因此存在严格的机制来将pH值保持在非常

ρ因子

ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子 。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD  。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强。它能识别终止信号,使得

关于肥大细胞的基本内容介绍

  肥大细胞(mast cell)较大,呈圆形或卵圆形,胞核小而圆,多位于中央。胞质内充满异染性颗粒,颗粒易溶于水。电镜下,颗粒大小不一,圆形或卵圆形,表面有单位膜包裹,内部结构常呈多样性,在深染的基质内含螺状或网格状晶体,或含细粒状物质。肥大细胞分布很广,常沿小血管和小淋巴管分布。  肥大细胞与变

关于过敏性支气管哮喘的病因机制介绍

  过敏性支气管哮喘属于一种常见疾病,亦是难以治愈之症。医学确认其病因复杂,病机尚不清楚,但主要有变态反应与感染两大因素。  一、外源性(吸入性)哮喘  发生于儿童和青年,致敏原来自体外,如吸入粉尘、花粉等,或食入鱼、虾等。其可溶性的抗原特异性成分通过淋巴细胞,传递到特异的IgE型浆细胞,产生反应素