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农作物种子纯度鉴定方法综述4

4．2 SSR(Simple sequence repeat，简单序列重复标记)由Moore等于1991年创立。SSR即微卫星DNA，是一类由几个(多为1～5个)碱基组成的基序(motif)串联重复而成的DNA串联重复序列，其长度一般较短，广泛分布于基因组的不同位置，如(cA)n、(AT)n、(GGC)n等重复。不同遗传材料重复次数的可变性，导致了SSR长度的高度变异性，这一变异性正是SSR标记产生的基础。尽管微卫星DNA分布于整个基因组的不同位置，但其两端序列多是保守的单拷贝序列，因此可以根据这两端的序列设计一对特异引物，通过PCR技术将其间的核心微卫星DNA序列扩增出来，利用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析技术比较扩增带在胶板的不同距离，来判断不同生物体的特定SSR座位多态性，就可获得其长度多态性即SSR标记。SSR标记的主要特点有：(1)数量丰富，广泛分布于整个基因组；(2)具有较多的等位性变异；(3)共显性标记，可鉴别出杂合子和纯......阅读全文