中国热科院揭示香蕉亚基因组进化及功能分化规律
近日,中国热科院生物所联合华大基因、法国农业研究国际合作中心、国际生物多样性中心、美国罗格斯大学、中国热科院海口实验站等11家单位,绘制了双单倍体香蕉野生种Pisang Klutuk Wulung(BB基因组)的精细基因组图谱,揭示了香蕉A、B基因组的分化,二倍化进程中A、B基因组的特点、多倍体香蕉A、B亚基因组之间同源交换与重组规律等重要科学问题,为香蕉遗传改良奠定了重要基础。相关研究成果在线发表于Nature子刊Nature Plants(IF=13.3)上。 香蕉是芭蕉科芭蕉属重要的草本单子叶植物,因其果实营养丰富和良好口感倍受大众喜爱,是全球鲜果交易量最大的水果。芭蕉属真蕉组M. acuminate (A-基因组) 和M. balbisiana (B-基因组) 的种内或种间杂交,形成了现代丰富多样的可食香蕉类型。然而,在长期的历史进化过程中,香蕉A、B基因组的进化差异、染色体倍性变化规律、果实成熟与调控机制等重大科......阅读全文
补全中国人“拼图”-《自然》发表中国人群泛基因组参考图谱
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502872.shtm6月14日,《自然》期刊在线发表了西安交通大学、复旦大学、中国医学科学院等26家单位联合发布的中国人泛基因组联盟(CPC)一期研究进展——《基于36个族群的中国人泛基因组参考图谱》。人
探究“产胶”奥秘:橡胶树育种有望突破瓶颈期
100多年前,源自巴西的22株橡胶树魏克汉种质材料被引种到全球各产胶国,培育了很多高产品种。然而,栽培橡胶树这狭窄的遗传背景导致其如今的育种进入了瓶颈期。橡胶林鸟瞰。热科院橡胶所供图在此背景下,中国热带农业科学院橡胶研究所副研究员方永军,携手海南大学三亚南繁研究院研究员唐朝荣、兰州大学生态学院教授刘
中国科学家Nature子刊发布新基因组草图
来自中国热带农业科学院、中国科学院、华盛顿大学等10多家机构的研究人员,成功绘制出了木薯(Cassava)的基因组序列草图。研究结果发表在10月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上来自中国热带农业科学院、中国科学院、华盛顿大学等10多家机构的研究人员,成功绘制
分析比产生更快?中国“智”造全基因组组装算法
10年前,Illumina基因组测序技术进入市场时,前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。 历史总是重演。如今,第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。 12月10日,《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。 论文作者、中国农业科学院农业
中国科学家宣布完成“兰花基因组框架图”
11月15日,中国科学家在深圳宣布完成“兰花基因组框架图”。兰花基因组计划的开展,不仅揭示兰花的进化历史和奥秘,为后续兰花功能和进化基因组学研究打下坚实的基础,而且为如何保护我国宝贵的兰花种质资源提供科学的政策依据,为下一步开发和利用兰科植物基因资源宝库提供重要的资源平台。 兰科植物(兰花
中国科学家破译大黄鱼全基因组测序
由浙江海洋学院院长吴常文领衔,上海交通大学、复旦大学等机构科学家参加的研究团队最近联合破译了大黄鱼全基因组测序,构建了大黄鱼基因组图谱,并成功解析其先天免疫系统基因组特征。日前,该研究成果发表在《自然》杂志上。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基
中国科学家Nature子刊发布新基因组草图
来自中国热带农业科学院、中国科学院、华盛顿大学等10多家机构的研究人员,成功绘制出了木薯(Cassava)的基因组序列草图。研究结果发表在10月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上(延伸阅读:我国领衔完成木薯基因组测序并揭示其进化特征 )。 中国热带农业科学
科学家获取首个中国地区古人基因组数据
记者从中国科学院古脊椎动物与古人类研究所获悉,由该所研究员付巧妹、高星、同号文及博士后Melinda Yang领衔的古人类研究团队,与德国马普进化人类研究所等团队合作,于前不久获取了第一个中国地区古人的基因组数据。这也是截至目前东亚地区最为古老的人类基因组数据。 10月12日,这项成果以“4万
中国主导完成陆地棉基因组测序
由中国科学家主导完成的陆地棉基因组测序研究成果,于美国东部时间4月20日以封面论文的形式在线发表于国际著名杂志《自然—生物技术》。 这一研究由南京农业大学科学家发起和主导的项目组完成。论文显示,陆地棉基因组测序覆盖了来自棉花两个亚基因组的共52条染色体,包括6万多个编码基因;同时创建了包括50
迄今最大规模的中国人基因组测序完成
中国研究人员领导的一个国际研究团队4日说,他们完成了迄今最大规模的中国人基因组测序和分析,有助于揭示基因与生育的联系以及了解中国人口基因结构。 这项发表在新一期美国《细胞》杂志上的研究显示,深圳华大基因研究院用“无创产前基因检测”技术收集了超过14万名中国孕妇的部分基因组样本。“无创产前基因检
中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组
中国农业大学教授韩振海团队基于30份苹果属植物高质量基因组,系统解析了苹果属数千万年的演化历程,并构建了首个苹果属图形泛基因组,发布了苹果属遗传多样性全景图。日前,相关研究成果发表于《自然-遗传学》。苹果属植物倍性复杂,分布横跨欧亚、美洲等多个地理区域,是研究基因组多倍化与杂交的重要木本植物类群。全
中国科学家完成水稻5个“近亲”基因组测序
中国科学家3日说,他们完成了亚洲栽培稻(一般称为水稻)5个“近亲”的全基因组测序,获得了高质量的基因组参考序列。这有望进一步推动水稻品种的改良。 中国科学家在美国《国家科学院学报》上报告说,他们从2007年至今,自主完成了尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻和南方野生
中国首份个人基因组图谱将在1年内出炉
每个人的基因都能刻成盘? 采访人:记者 余建斌 点评人:浙江大学遗传与基因组医学中心主任 祁 鸣 来源:人民网-《人民日报》 事件 人民网综合消息诺贝尔奖获得者、被人称为“DNA之父”的吉姆·沃森得到了一份特殊奖品:一张含有组成他基因的30亿个DNA单位详细信息的光盘,颁奖仪式31
中国科学家Nature子刊公布新基因组草图
来自合肥工业大学、四川大学、四川省自然资源科学研究院、北京百迈客生物科技有限公司等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组成功绘制出了猕猴桃(Actinidia chinensis)的全基因组序列草图。相关成果发表在10月18日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志
中国科学家Nature-Genetics发表基因组研究新成果
红彤彤的现代番茄(西红柿)比起最初来自南美洲安第斯山脉区域、豌豆大小的野生祖先要大了近一百倍。为了追踪番茄育种的悠久历史,以及了解人类施加的选择如何改变了番茄的基因组,由来自中国农业科学院、华中农业大学等10多家国内外机构的研究人员组成的一个国际研究小组,对360个番茄品种,其中包括野生型和驯化
Optalysys光计算发力中国基因组学市场
“国际基因组学大会”由华大基因主办,是基因组学领域最具影响力的国际性学术年会。该盛会不仅汇聚了生物组学的专家泰斗和企业精英进行深入的学术交流,更促进了基因组学领域在全球范围内的合作、创新与应用。今年ICG-12大会更是吸引了全球领先的光计算研发公司Optalysys参加,其公司创始人兼CEO N
中国人类基因组研究有望“弯道超车”
我国科学家首次完全自主实施国家级人类全基因组项目。 属于中国人自己独特的基因“密码”有望被精准破译。近日,由哈尔滨工业大学牵头的国家重点研发计划精准医学研究重点专项之“中国十万人基因组计划暨中国人群多组学参比数据库与分析系统建设”项目正式启动,并进入为期4年的项目实施阶段。 “这是我国科学
中国科学家Nature子刊基因组测序新成果
感染结核病永远都不会有一个最合适的时间,近年来形势变得更加的糟糕。 尽管已经开展了数十年的抗生素研究,随着结核耐药菌株的增长,当前的治疗方案仍然非常的有限。在2010年,至少有65万结核病例对两种最有效的一线抗生素耐药。在2012年,在印度发现了完全耐药和无法有效治疗的结核分枝杆菌。
用菠萝根茎叶做成的纸抑菌效果显著
近日,中国热带农业科学院农产品加工研究所热带农产品采后减损与贮运保鲜研究团队在菠萝纤维功能纸开发方面取得新进展。该研究首次揭示菠萝不同部位(叶、茎、根)纤维在化学组成、微观形貌与力学性能上的差异规律,并建立其与成纸功能特性(强度、延展性、撕裂性)的关联机制。相关研究成果发表于《经济作物与产品》(In
多组分协同策略将助力甘蔗黑穗病防控
近日,中国热带农业科学院热带生物技术研究所甘蔗研究中心逆境生物学研究团队系统综述了甘蔗黑穗病病原菌致病机理、甘蔗抗性机制及综合防控技术的最新研究进展,并对相关研究的未来发展趋势进行了展望,为全球甘蔗产业安全保障提供了理论指导。相关研究成果发表于《分子植物病理学》(Molecular Plant Pa
我国科学家获得全球首个纯合基因编辑橡胶苗
近日,中国热带农业科学院橡胶研究所组培与转基因团队在全球率先获得了橡胶树CRISPR/Cas9纯合基因编辑橡胶苗。相关研究成果在线发表于《经济作物和产品》(Industrial Crops and Products)。橡胶树基因编辑植株:上排为嵌合植株;下排为纯合植株。中国热科院供图该团队前期已实现
武汉植物园等完成中国莲基因组框架图谱绘制
中科院武汉植物园与美国、澳大利亚科学家合作完成了对中国古代莲的基因组测序和分析,相关研究成果已于5月10日刊登在《基因组生物学》杂志上。 研究人员利用全基因组鸟枪测序法完成了对中国莲(Nelumbo nucifera)基因组的测序。结果显示,莲基因组大约有2.7万个基因,全长9.3亿个
中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题
中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文(Original paper)的形式,在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的
中国科学家开发出高质量基因组组装软件
高质量基因组序列对于研究一个物种基因组的结构、功能、进化、基因定位和克隆等都至关重要。目前单分子测序技术的发展,已使得构建高质量基因组草图越来越容易。然而,这些草图序列仍然存在着由于组装序列碎片化而导致的多种错误,比如不完整的基因序列、排列到染色体上之后的片段遗漏、排列顺序错误和方向错误等。这些
中国科学家启动国际“大熊猫基因组研究”项目
由中国科学家发起,加拿大、英国、美国、丹麦等国科学家联合参与的国际“大熊猫基因组研究”项目6日正式启动。中国科学家表示,将在半年之内完成大熊猫基因组的框架图。 据深圳华大基因研究院介绍,国际“大熊猫基因组研究”项目所产生的基因组信息将会对生态、进化、测序技术等众多科研领域产生深远的影响。该项目的实
中国学者连发Science,GenomeRes参与国际基因组项目
生物通报道:在2001年,人类基因组计划产生了近乎完整的人类DNA。但是研究人员还希望了解这些GS,CS,和TS是如何利用,控制或组织,比它们少得多的编码区域,造就活生生的人。9月,一个聚集了422位科学家的国际团队,在经过十年的努力后,完成了解析基因组剩余部分(非编码区域)的工作,宣布了
中国完成海带等7种海洋生物全基因组测序
中国科学家10月30日在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果,至此中国已完成7种大型海洋生物的全基因组测序,为改良这些海洋生物品质、提高产量奠定了科学基础。 中国的海洋生物基因组学研究虽然起步较晚,但现在一些研究成果已达到国际前沿水准。目前,人类完成全基因组测序的
基因组技术来了,“人人基因”时代中国产业如何争上游?
何菊虹(化名)41岁时怀上了二胎,在西安一家民营医院产检“唐氏筛查”时,被医生告知“一切正常”,但孩子出生后被确诊为唐氏综合征患者,一家人的生活从此陷入为孩子康复、治疗的绝望里。 “如果当时就有无创产前基因检测,这样的悲剧就基本不会发生了。”深圳华大基因执行副总裁朱岩梅在朋友圈如此评论。 何
中国农科院首次解码颚口线虫线粒体基因组
近日,中国农科院兰州兽医研究所朱兴全研究员领导的家畜寄生虫病创新团队,在世界上首次解码了颚口下目线虫的线粒体基因组,为颚口线虫的分子流行病学、群体遗传学和系统分类学研究奠定基础。相关研究成果发表在国际学术期刊《科学报告》上。 据悉,颚口线虫是重要的人兽共患寄生线虫,但对其分子生物学研究甚少。兰
中国成为基因组编辑领域的世界领导者了么?
对很多人来说,CRISPR+中国等同于生物物理学家贺建奎(He Jiankui)。贺建奎去年臭名昭着地利用基因组编辑改变了将成为双胞胎女孩的两个人类胚胎的DNA。在他宣布这一消息之前,他在中国的CRISPR社区中还鲜为人知。中国的CRISPR社区发展迅速,现在在使用这一强大工具方面正在挑战美国,