中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组

中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组

中国农业大学教授韩振海团队基于30份苹果属植物高质量基因组，系统解析了苹果属数千万年的演化历程，并构建了首个苹果属图形泛基因组，发布了苹果属遗传多样性全景图。日前，相关研究成果发表于《自然-遗传学》。苹果属植物倍性复杂，分布横跨欧亚、美洲等多个地理区域，是研究基因组多倍化与杂交的重要木本植物类群。全

苹果锈果类病毒属基本特性

苹果锈果类病毒属成员基因组为一条环状单链RNA，长329～330nt，具有5个功能区，形成稳定的杆状或拟杆状二级结构。具有中央保守区（CCR）和一个末端保守区（TCR），负链不能通过锤头状结构进行自我切割。该属类病毒可能通过不对称滚环模式进行复制，基因组不编码蛋白质。苹果锈果类病毒主要寄主局限于苹果

研究人员绘出苹果基因组草图

　　一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》（Nature Genetics）杂志上报告说，他们绘出了苹果的基因组草图，这将有助于从基因水平上分析苹果性状，培育更多苹果新品种。　　意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说，他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果

Nature－Genetics－|－中国农大等单位合作通过泛基因组分析揭示苹果属（Malus）的进化与多样性

　　近日，Nature Genetics在线发表中国农业大学等团队合作的题为“Pan-genome analysis reveals the evolution and diversity of Malus”的研究论文，该论文首次对30个苹果属物种（涵盖二倍体与多倍体）进行高质量基因组测序与组装，构

图形泛基因组为苹果精准育种“加码”

　　人生尝到的第一口水果很可能就是苹果。它不仅口感大众化，而且营养颇为丰富，是全世界最受欢迎的水果之一。　　中国工程院院士、中国农业科学院作科所研究员刘旭指出，当前我国苹果种业面临优异种质资源匮乏、核心性状改良周期长、现代分子技术应用不足等“瓶颈”问题，严重制约了苹果新品种的选育及产业的持续提质增效

榕属叶绿体基因组比较研究获进展

　　近年来，叶绿体基因组因基因组小、突变率和重组率低的特点，被广泛用于植物系统发育、分子进化、谱系地理学的研究。榕属（Ficus）作为桑科的最大属，且是热带雨林的关键物种，而其系统发育关系仍需进一步研究。榕属物种具有多样的生态型，体现了对不同生境的高度适应性。尽管近年来关于榕属叶绿体基因组的研究有所

多个秋海棠属植物基因组被破译

秋海棠属植物叶型与叶斑的多样性    仙湖植物园供图近日，由深圳市仙湖植物园与深圳华大生命科学研究院牵头完成的秋海棠属植物基因组研究成果在植物学领域国际权威刊物《新植物学家》（New Phytologist）正式发表。最新发布的研究成果中，研究团队完成了桑寄生状秋海棠、铁十字秋海棠、黑武士秋海棠、和

关键基因组被破解有望加速苹果矮化品种选育

目前占我国苹果产量70%上的主栽品种“富士”，其实是礼泉短富、“玉华早富”等100余个富士系芽变品种群的总称。这些品种芽变的基因组基础是什么？其广受欢迎的短枝型性状，即就是矮化品种类型是哪个关键基因在起作用？  a.苹果短枝型和标准型形态观察；b.苹果短枝型和标准型MdTCP11基因启动子序列对比；

科学家构建鹰嘴豆属超级泛基因组

　　鹰嘴豆是世界第三大豆类作物，具有重要的经济价值和营养价值，其固氮能力能改善土壤肥力，具有独特的生态价值。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄、抵抗生物或非生物胁迫的能力不足，限制了它的育种改良。　　5月29日，华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位的研究成果发表于《自

科学家构建鹰嘴豆属超级泛基因组

鹰嘴豆是世界第三大豆类作物，具有重要的经济价值和营养价值，其固氮能力能改善土壤肥力，具有独特的生态价值。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄、抵抗生物或非生物胁迫的能力不足，限制了它的育种改良。5月29日，华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位的研究成果发表于《自然—遗传

酸浆属果实进化发育基因组变异机制研究获进展

近日，中科院植物研究所研究员贺超英团队与合作者在酸浆属果实进化发育基因组变异机制上取得新进展，他们提出了“中国灯笼”这一形态创新起源的原创性模型，即“雄性育性遗传腐蚀-恢复”模型。相关研究成果发表于《园艺研究》。茄科酸浆属宿存花萼在受精后随浆果发育迅速膨大，形成“中国灯笼”或膨大花萼综合征（ICS）

首个玉蜀黍属超级泛基因组助力玉米遗传改良

 玉蜀黍属超级泛基因组特征    受访者供图8月24日，《基因组生物学》（Genome Biology）在线发表华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室和洪山实验室玉米团队最新研究成果。该团队利用721份玉蜀黍属材料的基因组数据，构建了首个玉蜀黍属“超级泛基因组（super pan-genome）”图

昆明植物所破译稻属植物5个物种全基因组

　　亚洲栽培稻（一般称为水稻）是世界上最重要的粮食作物之一，是中国第一大粮食作物，养活了80％以上的中国人口。在水稻与其它约23个物种共同组成的稻属植物中，它和7个稻种（普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻、长雄蕊野生稻和南方野生稻）都是AA基因组类型，这些水稻近缘物种间断分

基因组学助力芸薹属抗性基因挖掘与育种

　　芸薹属包含许多重要的蔬菜、油料和饲料作物，如白菜、甘蓝、油菜、芥菜等。与其它农作物一样，芸薹属作物在生产中不断受到病毒、细菌和真菌等的侵害，造成巨大经济损失。　　近日，《园艺学研究》在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝课题组方智远院士团队的综述文章。该文针对芸薹属作物主要病害芜菁花叶病毒病

酸浆属果实进化发育基因组变异机制研究新进展

　　茄科酸浆属（Physalis）宿存花萼在受精后随浆果发育迅速膨大，形成“中国灯笼”或膨大花萼综合征（ICS）这一创新形态，包裹浆果。然而，酸浆属果实形态、生化特性及其起源背后的遗传基础有待探究。　　中国科学院植物研究所研究员贺超英研究组等合作完成了毛酸浆（Physalis pubescens s

NGO追踪苹果“中毒门”－苹果道歉不够积极

　　“2011年新年伊始，公众环境研究中心、达尔问、自然之友、环友科技中心等36家环保NGO发布了《IT行业重金属污染调研报告（第四期）苹果特刊》，针对苹果公司的代工厂污染导致多名员工中毒事件，提出了“拯救‘白雪公主’，为‘苹果’清毒”的倡议。早在2010年4月，这36家环保组织便已就该问题向苹果等

LabOS：打败苹果

壳斗科锥属物种间相似基因组变异模式获揭示

中国科学院华南植物园研究员王宝生团队在广东省基础与应用基础研究旗舰项目和广东省重点实验室项目资助下，研究揭示了壳斗科锥属物种间相似基因组变异模式形成的进化机制。相关成果发表于《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）。遗传变异的形成与维持机制是进化生物学研

新研究构建出小麦属全基因组遗传变异图谱

　　小麦是人类历史上最成功的作物之一，它起源于新月沃地一个狭小的核心区域，一万年间，从地区性的野生植物迅速转变成为全球种植面积最广的作物之一，在多种多样的环境下为人类提供大量的碳水化合物和蛋白质。然而，小麦对自然环境和人类粮食需求两方面同时适应的遗传机制尚不清楚，理解小麦适应性进化对气候变化条件下小

植物所揭示丁香属全基因组、演化历史及花香形成机制

　　丁香属为温带起源的木本芳香植物，是木犀科（Oleaceae）中较为古老的类群，全属30余种（变种），除3种在巴尔干半岛和北海道分布以外，其余在中国均有野生分布。作为观赏植物，丁香拥有约1400年的栽培历史和约200年的育种历史，其药用功能的开发和芳香精油的利用由来已久。然而，丁香属全基因组信息的

我国科学家首次绘制出葡萄属超级泛基因组图谱

2月26日，记者从北京大学现代农业研究院获悉，该院叶文秀研究员和郭立研究员团队绘制了全球首个涵盖葡萄属的欧亚、北美和东亚世界三大种群的72个葡萄种质材料的单倍型超级泛基因组图谱，从而揭示葡萄属丰富遗传多样性和杂交历史。相关成果发表在国际期刊《自然·遗传学》上。葡萄样品全球地理分布及其果实和叶片形态。

华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展

　　报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物，具有非常丰富的物种多样性和特有性，是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图　　中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下，以报春苣苔属植物为材料，率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行

酸浆属果实进化发育基因组变异机制取得的研究进展

　　茄科酸浆属（Physalis）宿存花萼在受精后随浆果发育迅速膨大，形成“中国灯笼”或膨大花萼综合征（ICS）这一创新形态，包裹浆果。然而，酸浆属果实形态、生化特性及其起源背后的遗传基础有待探究。　　中国科学院植物研究所研究员贺超英研究组等合作完成了毛酸浆（Physalis pubescens s

华南植物园揭示锥属物种基因组变异的驱动机制

遗传变异的形成与维持机制是进化生物学研究的重要议题。已有研究表明，不同物种间的基因组变异模式存在一定的相似性，并受到多种进化力量的影响。然而，关于不同进化机制对相似基因组变异景观形成的贡献以及不同机制间复杂的互作模式尚不清楚。此外，已有研究多是基于近期快速辐射产生的物种或者少量分化时间较长的物种对，

十字花科蔊菜属质体基因组研究获进展

近日，陕西省西安植物园植物多样性监测与保护团队研究发现蔊菜属质体基因组在基因数量和顺序、总长度、基因组结构、密码子使用、长重复序列和SSR方面是保守的；14个突变热点区可作为区分该属植物的候选DNA条形码；基于质体基因组和nrDNA ITS序列的系统发育树也清晰地表明，10个蔊菜属物种在碎米荠族（C

苹果为什么红？

果园里的苹果      吴婷供图苹果果实成熟的外观标志之一是叶绿素降解和花青苷积累引起的果皮色泽变化，且果皮着色受光诱导而叶绿素降解则在黑暗中促进。然而，到目前为止，对于果实果皮褪绿和着色这两个过程是否偶联且这两个过程是否存在昼夜分工协作仍不清楚。近日，《植物细胞》（The Plant Cell）在

基因测序证明栽培苹果起源于新疆

　　15日，国际著名学术期刊《自然·通讯》以《基因组重测序揭示苹果起源演化历史及果实大小的二步驯化模型》为题发表了山东农业大学陈学森教授研究团队与美国康奈尔大学费章君研究团队的合作研究成果，证明世界栽培苹果起源于我国新疆。　　苹果是世界温带地区栽培面积最大的果树之一，其起源演化与人类文明进步密不可分

我科学家主导完成全球首个梨基因组解析

　　由南京农业大学梨工程技术研究中心、深圳华大基因研究院、浙江省农业科学院等多家科研院所合作完成的砀山酥梨基因组研究成果于 11月 13日在《基因组研究》(Genome Research)上发表。全球首个梨基因组的成功解析及其基因组层面的功能研究将为培育高产、优质和抗病的新品种梨奠定坚实的遗

科学家主导完成梨基因组研究，为新品种培育提供宝贵资源

　　由南京农业大学梨工程技术研究中心、深圳华大基因研究院、浙江省农业科学院等多家科研院所合作完成的砀山酥梨基因组研究成果于2012年 11月13日在《基因组研究》(Genome Research)上发表。全球首个梨基因组的成功解析及其基因组层面的功能研究将为培育高产、优质和抗病的新品种梨奠定

中国科学家主导完成梨基因组研究

　　由南京农业大学梨工程技术研究中心、深圳华大基因研究院、浙江省农业科学院等多家科研院所合作完成的砀山酥梨基因组研究成果于 2012年11月13日在《基因组研究》(Genome Research)上发表。全球首个梨基因组的成功解析及其基因组层面的功能研究将为培育高产、优质和抗病的新品种梨奠定