AluPCR:用重复序列引物扩增来源复杂的人DNA

引言 聚合酶链反应PCR使不同来源的特异核酸片段的分离及分析发生了革命,但应用PCR分 离,分析特定DNA区域需要了解靶区域的边侧序列,这使扩增局限于已知DNA序列。我 们研究了从复杂的人和其他种DNA混合物中扩增未知DNA序列。特别是,我们应用PCR 分离出了在啮齿类细胞背景中含有人染色体片段的体细胞杂合体中的人DNA。使存留 在杂合子中的人特异区域序列得到分离和鉴定,避免了克隆DNA库和用人特异重复序 列探针他离人序列克隆。我们所用的方法,即AluPCR,也已被证明可从克隆中快速分 离插入的人类DNA,这将PCR的应用扩大到克隆于Lambda和酵母人工染色体(YAC)载体 上的基因组DNA,PCR在大基因组区域上的应用为分析人基因提供了另一个工具。 AluPCR方法特点在于利用人DNA中普遍存在的Alu重复序列,这种300bp序列的拷贝约 900.000个,分布于整个人基因组。虽然Alu重复序列各拷贝间有很大差别,但已确......阅读全文

AluPCR:用重复序列引物扩增来源复杂的人DNA

引言  聚合酶链反应PCR使不同来源的特异核酸片段的分离及分析发生了革命,但应用PCR分 离,分析特定DNA区域需要了解靶区域的边侧序列,这使扩增局限于已知DNA序列。我 们研究了从复杂的人和其他种DNA混合物中扩增未知DNA序列。特别是,我们应用PCR 分离出了在啮齿类细胞背景中含有人染色体片段的

重复[DNA]序列的概念

中文名称重复[DNA]序列英文名称repetitive [DNA] sequence定  义DNA分子中重复出现的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

设计引物用cds序列和cdna序列的区别

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。

Nature:DNA重复序列是否致病取决于什么?

  DNA重复序列在人类基因组中是很常见的。重复序列已经被提出作为一种进化机制,但是它们可能与人类疾病相关。现在,马克斯-普朗克分子遗传学研究所和Charité – Universitätsmedizin Berlin的科学家已经证明,DNA重复序列是否与人类疾病相关,取决于它们在基因组中的位置,序

用PCR扩增cDNA库中的特异序列

最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库,然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因,但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时.费力的工作,而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应(PCR)方法可使一种特

SSR分子标记技术及其在构建玉米DNA指纹库上的应用1

SSR分子标记技术及其在构建玉米DNA指纹库上的应用 康丽丽 周鸿飞(沈阳农业大学农学院) 玉 米是一种重要的饲用、粮用和工业加工作物,在国民经济中占有重要的地位。玉米育种方法的改进对农业发展具有重要意义。长期以来,育种家们大多数是借用易于 鉴别的形态学和同工酶等遗传标记来辅助育种,并取得了很大成功

DNA和RNA靶序列的原位PCR扩增实验

实验材料 样品试剂、试剂盒 双氧水PBS蛋白酶KRNA酶DTTdNTPKClMgCl2Tris·Cl仪器、耗材 加湿盒热循环仪实验步骤 1.  将载有固定样品的载玻片置105℃加热块上5~120 s。 2.  载玻片放入含0.3%H2O2中,于37℃或室温温育过夜,以灭活内源性过氧化物酶活性,然后以

《科学》:首次不使用酶扩增得到目的DNA序列

来自加州理工大学计算与神经系、牛津大学物理学系和贝尔实验室(Bell Laboratories)的研究人员在DNA环路(DNA-based circuits)设计上获得了一项重要的飞跃性成果:首次不使用酶扩增得到目的DNA序列,这是迈向创造细胞内人工生化环路(artificial biochemic

DNA和RNA靶序列的原位PCR扩增实验

原位PCR是Hasse等于1990年建立的技术,就是在组织细胞里进行PCR反应,它结合了具有细胞定位能力的原位杂交和高度特异敏感的PCR技术的优点,是细胞学科研与临床诊断领域里的一项有较大潜力的新技术。实验材料样品试剂、试剂盒双氧水PBS蛋白酶KRNA酶DTTdNTPKClMgCl2Tris·Cl仪

启动子克隆方法研究进展(5)

2 讨论  以上介绍的几种方法基本代表了现有的启动子克隆方法,它们分别具有不同的特点和适用范围。  利用启动子探针载体筛选启动子时,不需要知道具体的基因序列,避免了引物设计,并能获得大量的启动子片段;其缺点是需要构建1个穿梭质粒,建库、转化、筛选,工作量大,费时费力,而且克隆、亚克隆的过程繁琐。因此

特异引物的PCR标记的相关介绍

  特异引物的PCR标记所用引物是针对已知序列的 DNA 区段而设计的,具有特定核苷酸序列(通常为 18—24 bp),可在常规PCR复性温度下进行扩增,对基因组 DNA 的特定区域进行多态性分析。  ①序列标志位点  (Sequence Tagged Sites,STS)  STS是对以特定对引物

chipseq-扩增用的PCR引物是什么

PCR引物说通俗点就是一段基因片段,一般是在NCBI上查找的

PCR技术应用四:遗传病诊断

 自从1985年PCR技术首次应用于遗传病基因诊断以来,已有近百种遗传病可用PCR 技术进行诊断和产前诊断,利用PCR技术诊断遗传病的途径有五个,①基因突变位点 的直接检出②筛查与遗传病③④有关的点突变③遗传多态性标记连锁分析间接诊断④ 利用cmRNA逆转录为cDNA进行分析或直接分析cmRNA. 

PCR技术直接诊断遗传病

自从1985年PCR技术首次应用于遗传病基因诊断以来,已有近百种遗传病可用PCR 技术进行诊断和产前诊断,利用PCR技术诊断遗传病的途径有五个,①基因突变位点 的直接检出②筛查与遗传病③④有关的点突变③遗传多态性标记连锁分析间接诊断④ 利用cmRNA逆转录为cDNA进行分析或直接分析cmRN

PCR技术遗传病诊断上的应用

自从1985年PCR技术首次应用于遗传病基因诊断以来,已有近百种遗传病可用PCR 技术进行诊断和产前诊断,利用 PCR技术诊断遗传病的途径有五个,①基因突变位点 的直接检出②筛查与遗传病③有关的点突变④遗传多态性标记连锁分析间接诊断⑤ 利用cmRNA逆转录为cDNA进行分析或直接分析cmRN

等温扩增技术LAMP和CPA的“孪生兄弟相”

想了很久,还是决定将LAMP和CPA放在一起进行介绍。主要是因为两者的引物设计都相对比较复杂,但却有着比较相似的工作原理,有异曲同工之妙。 背景:LAMP,loop-mediatedisothermal amplification,环介导等温扩增技术LAMP是Notomi等于2000年首先提出来的一

PacBio-HiFi助力破译高度复杂的LPA串联重复序列的变异

背景介绍Lp (a)脂蛋白是冠状动脉疾病风险的重要因素,其表达与LPA基因的长度有关。不同种族/民族之间血浆中 LP (a)的水平存在显著差异性。个体之间在LP (a)水平上的差异也是巨大的,其变化范围能达到平均水平的3倍。例如,非洲人后裔的血浆LP (a)水平是欧洲或亚洲人的2-3倍。之前的研究证

RAPD分子标记的实验原理及操作流程

RAPD标记RAPD技术的全称是随机扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA),此技术建立于PCR基础之上,使用一系列具有10个左右碱基的单链随机引物,对基因组的DNA全部进行PCR扩增,以检测多态性。由于整个基因组存在众多反向重复序列,因此须对每一随机

Alu聚合酶链反应的方法及应用介绍

中文名称Alu聚合酶链反应英文名称Alu-PCR定  义从复杂来源样品中特异扩增人基因组DNA的方法。Alu是人基因组中特有的高度重复序列,散布于整个人的基因组中。设计能识别Alu保守区序列的聚合酶链反应引物,就能特异地扩增获得人基因组DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二

启动子克隆方法研究进展(2)

 1.3 环状PCR  环状PCR包括I-PCR(Inverse-PCR)和P-PCR(Panhandle-PCR)。这2种PCR都是根据一端已知序列设计的嵌套式引物进行PCR。  1.3.1 I-PCR I-PCR是1988年由Triglia最早提出的一种基于PCR的改进的染色体步行方法。    

ISSR分子标记的实验原理及操作流程

ISSR(inter-simple sequence repeat)标记是一种类似RAPD,但利用包含重复序列并在3’或5’锚定的单寡聚核酸引物对基因组进行扩增的标记系统,即用SSR引物来扩增重复序列之间的区域。其原理具体是,ISSR标记根据生物广泛存在SSR的特点,利用在生物基因组常出现的SSR本

PCR原理及常见问题解答

  PCR (Polymerase Chain Reaction),中文翻译为聚合酶链式反应,是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制。 由1983年美国Mullis首先提出设想,1985年由其发明了聚合酶链反应,即简易DNA扩增法,意味着PCR技术的真

PCR原理及常见问题解答

PCR (Polymerase Chain Reaction),中文翻译为聚合酶链式反应,是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制。 由1983年美国Mullis首先提出设想,1985年由其发明了聚合酶链反应,即简易DNA扩增法,意味着PCR

PCR)聚合酶链式反应

 PCR技术可用于:(1)检验感染性疾病是否处于隐性或亚临床状态;(2)有效检测癌基因的突变,准确检测癌基因的表达量;(3)临床应用于检测地中海贫血的基因突变。  实验方法原理 PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。  PCR由变性--退火--

随机引物的PCR标记的相关内容

  所用引物的核苷酸序列是随机的,其扩增的 DNA 区域事先未知。随机引物PCR扩增的 DNA 区段产生多态性的分子基础是模板 DNA 扩增区段上引物结合位点的碱基序列的突变,不同来源的基因组在该区段上表现为扩增产物有无差异或扩增片段大小的差异。随机引物PCR标记表现为显性或共显性。  ①随机扩增多

PCR技术

 PCR常见问题总汇 PCR产物的电泳检测时间  一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模

常用的βactin-引物序列

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核糖体DNA的重复单元的序列同质性

在大型的rDNA序列,rDNA的重复单元之间的多态性非常低,这表明rDNA的串联阵列通过协同进化演变。在对9种果蝇的5S串联重复序列区域彼此进行比较后得出的结果表明,因这一区域插入和删除较为频繁,在5'端以及3'端两侧发现有保守序列。他们可能在DNA复制或通过基因转换的过程中发生新合

Cell-Rep:DNA序列重复会引发遗传性疾病

  近日,来自塔夫斯大学的研究人员通过研究揭示,DNA链中长的核苷酸重复会导致基因组的不稳定,最终会引发遗传性疾病的发生,比如Freidreich征和亨廷顿病等,相关研究刊登于国际杂志Cell Reports上。  研究者认为,当细胞分裂或细胞中DNA修复机制激活时就会在DNA复制过程中形成长的重复