DNAImmunoprecipitationfortheDeterminationofDNABindingSpecificity
Andrea J. Gossett and Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Corresponding author (jlieb@bio.unc.edu)INTRODUCTIONKnowledge of the DNA-binding specificity of a transcription factor aids in understanding the function of that factor in the regulation of gene transcription. One popular method ofidentifying the genomic DNA sites boun......阅读全文
The-Determination-of-Proteinprotein-Interactions-by-the-Matingbased-...
Dynamic and reversible protein–protein interactions have a pivotal function in all living cells. For instance, protein–protein interactions are in
与细胞代谢信号通路相关因子介绍ARID1A
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
与DNA白修饰相关因子介绍ARID1A
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
与胃癌相关的ARID1A基因编码功能描述
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
ARID1A基因突变与药物因子介绍
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
与肺癌相关的ARID1A基因编码功能描述
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
细胞代谢信号通路相关的基因介绍ARID1A基因
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
实体肿瘤检测ARID1A基因介绍
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
与肝癌相关的ARID1A基因编码功能描述
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
与肾癌相关的ARID1A基因编码功能描述
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
与肺癌相关的ARID1A基因编码功能描述
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
ARID1A基因编码功能及结构描述
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合
蛋白质定量分析(Protein-determination)
Bradford 的dye-binding method 是利用Coomassie brilliant blue G-250 (CBG) 可与蛋白质结合而变色的特性来定量 (Bradford, 1976);若试样中的蛋白质量较多,则结合到蛋白质而变色的CBG 也多,因而呈色较深。下例是以一组
蛋白质定量分析(Protein-determination)
实验概要本文介绍了蛋白质定量分析(Protein determination) Bradford 的dye-binding method的原理、样品配制及操作步骤等。实验原理Bradford 的dye-binding method 是利用Coomassie brilliant blue G-250
免疫沉淀(Immunoprecipitation,-IP)实验方法
基本实验步骤 (1)收获细胞,加入适量细胞IP裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂),冰上或者4℃裂解30min, 12,000g离心30 min后取上清; (2) 取少量裂解液以备Western blot分析,剩余裂解液将1μg相应的抗体和10-50 μl protein A/G-beads加入到细胞裂解
免疫沉淀(Immunoprecipitation)实验材料和方法
免疫沉淀是利用特异性抗体识别并分离抗原的方法。材料:上样buffer的配方(用前现配):2ul 1.25M Tris-HCL , pH 6.835ul distilled water2.5ul 2-mercaptoethanol12.5ul 10%SDS10ul 80% glycerol2ul br
Methylation-Specific-PCR
Methylation Specific PCRProtocol written by James Herman*Methylation Specific PCR (MSP) is a simple rapid and inexpensive method to determine the meth
Crosslinking-chromatin-immunoprecipitation-(XChIP)-protocol
实验概要ChIP is a powerful tool that allows the specific identification of proteins or histone modifications to regions of the genome. Chromatin is isol
采用生物信息学和实验方法联合分析转录组信息
The wealth of transcript information that has been made publicly available in recent years requires the development of high-throughput functional geno
抗体特异性检测提议问答国际抗体验证工作组
The International Working Group on Antibody Validation: 国际抗体验证工作组 Proposal for Antibody Specificity Testing Q&A 关于抗体特异性检测提议的常见问题及回答 1.What is th
ChIPChip-E.-coli
AbstractChIP-Chip stands for Chromatin Immunoprecipitation and chip in the sense of DNA microarray. It is a technique to determine the genome-wide bin
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描
Scanning the human genome with combinatorial transcription factor librariesPublished online: 18 February 2003, doi:10.1038/nbt794March 2003 Volume 21
ChIP-using-plant-samples
实验概要 The immunoprecipitation (IP) of cross-linked chromatin with antibodies specific for certain histone modifications (chromatin immunoprecipitati
Realtime-PCR
实验概要The exponential amplification via reverse transcription polymerase chain reaction provides for a highly sensitive technique in which a very low
GFPTrap如何设计成功的IP实验?
借助Chromotek公司GFP-Trap如何设计成功的IP实验?How to plan an immunoprecipitation of your GFP-fusion protein when using the ChromoTek GFP-Trap®PreambleThis document
分子遗传学词汇单链DNA结合蛋白
中文名称:单链DNA结合蛋白外文名称:Single-stranded DNA-binding protein定义:单链DNA结合蛋白(Single-stranded DNA-binding protein,缩写SSB或SSBP)又称单链结合蛋白,是专门负责与DNA单链区域结合的一种蛋白质,为DNA复
GenomeWide-Identification-of-Transcription-FactorBinding-Sites-in...
Genome-Wide Identification of Transcription Factor-Binding Sites in Plants Using Chromatin Immunoprecipitation Followed by Microarray (ChIP-chip)
PCR-Primer-Design(一)
Molecular Biology Today 2001. 2(2): 27-32. Vinay K. Singh and Anil Kumar Bioinformatics Sub-centr
Twohybrid-analysis-of-genetic-regulatory-networks
1. Introduction and BackgroundThere is a great need for general methods to characterize the proteins that contemporary biology makes available. The li
Identification-of-a-Mutant-Kinase/ATP-Analog-Pair2
Cellular Transfection and Immunoprecipitation Before proceeding with the experiments outlined below, all kinase pocket mutants should be characterize