DNAImmunoprecipitationfortheDeterminationofDNABindingSpecificity

Andrea J. Gossett and Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Corresponding author (jlieb@bio.unc.edu)INTRODUCTIONKnowledge of the DNA-binding specificity of a transcription factor aids in understanding the function of that factor in the regulation of gene transcription. One popular method ofidentifying the genomic DNA sites boun......阅读全文

SOX21基因编码的功能和结构描述

SRY相关的HMG-box(SOX)基因编码一个DNA结合蛋白家族,该家族含有79个氨基酸HMG(高迁移率基团)结构域,与SRY蛋白(MIM 480000)的DNA结合HMG-box具有至少50%的序列同源性根据hmg域内外的序列相似性,sox蛋白被分成6个亚群。有关sox基因的其他背景信息,请参见

SOX21基因突变因子与药物介绍

SRY相关的HMG-box(SOX)基因编码一个DNA结合蛋白家族,该家族含有79个氨基酸HMG(高迁移率基团)结构域,与SRY蛋白(MIM 480000)的DNA结合HMG-box具有至少50%的序列同源性根据hmg域内外的序列相似性,sox蛋白被分成6个亚群。有关sox基因的其他背景信息,请参见

SMARCE1基因编码的功能和结构描述

该基因编码的蛋白质是大的atp依赖性染色质重塑复合物swi/snf的一部分,它是染色质正常抑制的基因转录激活所必需的。编码的蛋白质,单独或当在SWI/SNF复合物中,可以结合到4位连接DNA,这被认为在进入或退出核小体时模仿DNA的拓扑结构。该蛋白含有一个dna结合的hmg结构域,但该结构域的破坏并

SMARCE1基因突变因子与药物介绍

该基因编码的蛋白质是大的atp依赖性染色质重塑复合物swi/snf的一部分,它是染色质正常抑制的基因转录激活所必需的。编码的蛋白质,单独或当在SWI/SNF复合物中,可以结合到4位连接DNA,这被认为在进入或退出核小体时模仿DNA的拓扑结构。该蛋白含有一个dna结合的hmg结构域,但该结构域的破坏并

LMO1基因编码功能及结构描述

这个位点编码一个转录调节因子,它包含两个富含半胱氨酸的lim结构域,但缺少一个dna结合结构域。lim结构域可能在蛋白质相互作用中发挥作用,因此编码的蛋白质可能通过竞争性结合到特定的dna结合转录因子来调节转录。该位点的改变与急性淋巴细胞性t细胞白血病有关。在这个位点和至少两个位点(t细胞抗原受体基

LIMO1基因突变与药物因子介绍

这个位点编码一个转录调节因子,它包含两个富含半胱氨酸的lim结构域,但缺少一个dna结合结构域。lim结构域可能在蛋白质相互作用中发挥作用,因此编码的蛋白质可能通过竞争性结合到特定的dna结合转录因子来调节转录。该位点的改变与急性淋巴细胞性t细胞白血病有关。在这个位点和至少两个位点(t细胞抗原受体基

免疫相关信号通路LMO1基因的临床解释

这个位点编码一个转录调节因子,它包含两个富含半胱氨酸的lim结构域,但缺少一个dna结合结构域。lim结构域可能在蛋白质相互作用中发挥作用,因此编码的蛋白质可能通过竞争性结合到特定的dna结合转录因子来调节转录。该位点的改变与急性淋巴细胞性t细胞白血病有关。在这个位点和至少两个位点(t细胞抗原受体基

与免疫相关信号通路相关因子介绍LMo1

这个位点编码一个转录调节因子,它包含两个富含半胱氨酸的lim结构域,但缺少一个dna结合结构域。lim结构域可能在蛋白质相互作用中发挥作用,因此编码的蛋白质可能通过竞争性结合到特定的dna结合转录因子来调节转录。该位点的改变与急性淋巴细胞性t细胞白血病有关。在这个位点和至少两个位点(t细胞抗原受体基

TSN基因突变因子与药物介绍

该基因编码一种DNA结合蛋白,该蛋白在染色体易位的断点处特异识别保守的靶序列易位蛋白多肽形成一个多聚体结构,负责其DNA结合活性重组相关的基序和易位结合位点存在于重组热点,可作为易位融合基因断点的标志。这些结合活性可能在淋巴肿瘤染色体易位中起重要作用由该基因编码的蛋白质与转译相关蛋白X复合时,也形成

与丝裂原活化蛋白激酶反应相关因子介绍ETV1

这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因,这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域,该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外,在N末端

丝裂原活化蛋白激酶相关信号通路介绍ETV1

这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因,这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域,该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外,在N末端

ETV1基因突变与药物因子介绍

这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因,这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域,该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外,在N末端

与肺癌相关的ETV1基因编码功能描述

这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因,这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域,该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外,在N末端

ETV1与癌症相关的基因编码功能描述

这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因,这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域,该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外,在N末端

ETV1基因编码功能及结构描述

这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因,这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域,该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外,在N末端

与食管癌相关的ETV1基因编码功能描述

这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因,这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域,该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外,在N末端

ChIP-using-plant-samples-–-Arabidopsis

实验概要This protocol describes how chromatin is prepared from Arabidopsis, which can subsequently be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). T

DNA结合模体的结构特点

中文名称DNA结合模体英文名称DNA-binding motif定  义DNA结合蛋白中与DNA发生相互作用的区域所具有的特定的结构模式。如锌指结构、亮氨酸拉链、螺旋-转角-螺旋、螺旋-环-螺旋等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

与受体酪氨酸激酶反应相关因子介绍FUBP1

该基因编码的蛋白质是一种单链dna结合蛋白,与多种dna元素结合,包括c-myc上游的远上游元素(fuse)。融合结合发生在非编码链上,对未分化细胞中c-myc的调节具有重要意义。该蛋白包含三个结构域,一个双亲螺旋N-末端结构域,一个DNA结合中心结构域,以及一个包含三个富含酪氨酸基序的C-末端反式

IKZF1基因编码功能及结构描述

该基因编码属于与染色质重塑相关的锌指DNA结合蛋白家族的转录因子。这种蛋白的表达仅限于胎儿和成人的血液淋巴细胞生成系统,并作为淋巴细胞分化的调节器。一些选择性剪接转录变异体编码不同亚型已被描述为这个基因。大多数亚型共享一个共同的C端结构域,其中包含两个锌指基序,这两个基序是异二聚或同二聚以及与其他蛋

丝裂原活化蛋白激酶相关信号通路介绍FUBP1

该基因编码的蛋白质是一种单链dna结合蛋白,与多种dna元素结合,包括c-myc上游的远上游元素(fuse)。融合结合发生在非编码链上,对未分化细胞中c-myc的调节具有重要意义。该蛋白包含三个结构域,一个双亲螺旋N-末端结构域,一个DNA结合中心结构域,以及一个包含三个富含酪氨酸基序的C-末端反式

与PI3K/AKT/mTOR细胞增殖相关因子介绍FUBP1

该基因编码的蛋白质是一种单链dna结合蛋白,与多种dna元素结合,包括c-myc上游的远上游元素(fuse)。融合结合发生在非编码链上,对未分化细胞中c-myc的调节具有重要意义。该蛋白包含三个结构域,一个双亲螺旋N-末端结构域,一个DNA结合中心结构域,以及一个包含三个富含酪氨酸基序的C-末端反式

FUBP1基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白质是一种单链dna结合蛋白,与多种dna元素结合,包括c-myc上游的远上游元素(fuse)。融合结合发生在非编码链上,对未分化细胞中c-myc的调节具有重要意义。该蛋白包含三个结构域,一个双亲螺旋N-末端结构域,一个DNA结合中心结构域,以及一个包含三个富含酪氨酸基序的C-末端反式

与丝裂原活化蛋白激酶反应相关因子介绍FUBP1

该基因编码的蛋白质是一种单链dna结合蛋白,与多种dna元素结合,包括c-myc上游的远上游元素(fuse)。融合结合发生在非编码链上,对未分化细胞中c-myc的调节具有重要意义。该蛋白包含三个结构域,一个双亲螺旋N-末端结构域,一个DNA结合中心结构域,以及一个包含三个富含酪氨酸基序的C-末端反式

与免疫相关信号通路相关因子介绍IKZF1

该基因编码属于与染色质重塑相关的锌指DNA结合蛋白家族的转录因子。这种蛋白的表达仅限于胎儿和成人的血液淋巴细胞生成系统,并作为淋巴细胞分化的调节器。一些选择性剪接转录变异体编码不同亚型已被描述为这个基因。大多数亚型共享一个共同的C端结构域,其中包含两个锌指基序,这两个基序是异二聚或同二聚以及与其他蛋

受体酪氨酸激酶信号通路相关FUBP1

该基因编码的蛋白质是一种单链dna结合蛋白,与多种dna元素结合,包括c-myc上游的远上游元素(fuse)。融合结合发生在非编码链上,对未分化细胞中c-myc的调节具有重要意义。该蛋白包含三个结构域,一个双亲螺旋N-末端结构域,一个DNA结合中心结构域,以及一个包含三个富含酪氨酸基序的C-末端反式

免疫相关信号通路IZKF1基因的临床解释

该基因编码属于与染色质重塑相关的锌指DNA结合蛋白家族的转录因子。这种蛋白的表达仅限于胎儿和成人的血液淋巴细胞生成系统,并作为淋巴细胞分化的调节器。一些选择性剪接转录变异体编码不同亚型已被描述为这个基因。大多数亚型共享一个共同的C端结构域,其中包含两个锌指基序,这两个基序是异二聚或同二聚以及与其他蛋

与白血病相关的IKZF1基因编码功能描述

该基因编码属于与染色质重塑相关的锌指DNA结合蛋白家族的转录因子。这种蛋白的表达仅限于胎儿和成人的血液淋巴细胞生成系统,并作为淋巴细胞分化的调节器。一些选择性剪接转录变异体编码不同亚型已被描述为这个基因。大多数亚型共享一个共同的C端结构域,其中包含两个锌指基序,这两个基序是异二聚或同二聚以及与其他蛋

FUBP1基因突变与药物因子介绍

该基因编码的蛋白质是一种单链dna结合蛋白,与多种dna元素结合,包括c-myc上游的远上游元素(fuse)。融合结合发生在非编码链上,对未分化细胞中c-myc的调节具有重要意义。该蛋白包含三个结构域,一个双亲螺旋N-末端结构域,一个DNA结合中心结构域,以及一个包含三个富含酪氨酸基序的C-末端反式

IZKF1基因编码功能及结构描述

该基因编码属于与染色质重塑相关的锌指DNA结合蛋白家族的转录因子。这种蛋白的表达仅限于胎儿和成人的血液淋巴细胞生成系统,并作为淋巴细胞分化的调节器。一些选择性剪接转录变异体编码不同亚型已被描述为这个基因。大多数亚型共享一个共同的C端结构域,其中包含两个锌指基序,这两个基序是异二聚或同二聚以及与其他蛋