脉冲场凝胶电泳(PFGE)概述

脉冲场凝胶电泳(PFGE)的原理大致为:细菌包埋于琼脂块中,用适当的内切酶在原位对整个细菌染色体进行酶切,酶切片段在特定的电泳系统中通过电场方向不断交替变换及合适的脉冲时间等条件下而得到良好的分离。PFGE中内切酶的选用至关重要,所采用的内切酶常为寡切点酶(lowfrequencycleavagerestric-tionendonucleases),这种酶切后的片段少而大,适合于作PFGE电泳。McClelland等[8]通过对细菌的PFGE电泳图谱的内切酶的选择研究发现,四核苷酸CTAG在许多GC含量>45%的细菌染色体中是很少见的,在他们所试验的16个细菌的染色体中,被1个或多个可识别CTAG位点的内切酶酶切,每100000bps中不到一次,这些酶的识别序列分别为:XbaⅠ(TCTAGA),SepⅠ(ACTAGT),AvrⅡ(CCTAGG)和NheⅠ(GCTAGC)。同样地,在许多含G+C<45%的基因组,CCG......阅读全文

脉冲电场凝胶电泳的定义

脉冲电场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis),在脉冲电场中,DNA分子的迁移方向随着电场方向的周期性变化而不断改变。

交变脉冲电场凝胶电泳

一般琼脂糖凝胶电泳只能分离小于20kb的DNA。这是因为在琼脂糖凝胶中,DNA分子的有效直径超过凝胶孔径时,在电场作用下,迫使DNA变形挤过筛孔,而沿着泳动方向伸直,因而分子大小对迁移率影响不大。如此时改变电场方向,则DNA分子必须改变其构象,沿新的泳动方面伸直,而转向时间与DNA分子大小关系极为密

采用Agilent-Femto-Pulse系统对不同基因组DNA提取进...(一)

采用Agilent Femto Pulse系统对不同基因组DNA提取进行质量评估作者Chava Pocernich,Jolita Uthe,Steve Siembieda 安捷伦科技有限公司摘要Agilent Femto Pulse 系统采用革命性设计,是唯一一款能够自动进行高分子量 (HMW)

脉冲场电泳系统的详细描述

  脉冲场电泳系统能够提供可程序化的交变电场,用于分离数百万碱基大小的DNA分子,并且获得优化控制后高分辨的电泳谱带,脉冲场电泳系统包括脉冲电源,电泳槽(内置循环泵和温度传感器),恒温循环器,专用制胶器.  ·电压梯度:最大9.5V/cm 增量 0.1v/cm  ·最大电流:0.5A  ·最大功率:

酵母人工染色体的应用

            实验方法原理 直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。

酵母人工染色体的应用

实验方法原理 直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。实验材料 酿酒酵母试剂、试剂盒 甘油仪器、耗材 脉冲场凝胶电泳仪选择性培养

脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收

实验方法原理 低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠胚胎干细胞(Choi et al. 1993) 时是非

脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收

低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠胚胎干细胞(Choi et al. 1993) 时是非常有效的。本实验来源「

脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收

            实验方法原理 低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠

关于脉冲变角凝胶电泳的简介

  脉冲变角凝胶电泳将带有凝胶块的蛋白酶K缓冲液于50℃保持2~3天。每个盛有50ml蛋白酶缓冲液的Falcon管可容纳多达100个凝胶块。  1、收集10ml全血,加入30ml细胞裂解液。置冰浴中至少20min直至红细胞完全溶解。  2、2000r/min离心10min,移去红色上清液,再次用细胞

脉冲电场凝胶电泳的原理和作用

在标准的PFGE中,第一个脉冲的电场方向在另一侧成45°夹角。由于琼脂糖凝胶的电场方向、电流大小及作用时间都在交替变化,使得DNA分子能够随时调整其游动方向,以适应凝胶孔隙的无规则变化。与相对分子质量较小的DNA相比,相对分子质量较大的DNA需要更多的脉冲次数来更换其构型和方位,使其按新的方向游动。

脉冲[交变]电场凝胶电泳的定义

中文名称脉冲[交变]电场凝胶电泳英文名称pulse [alternative] field gel electrophoresis定  义利用脉冲电场的作用在凝胶介质中分离大分子DNA的一种电泳方法。由于超过一定大小(大于40 kb)的线状DNA分子在琼脂糖凝胶中电泳的速度几乎相同,无法在恒场强凝胶

数字PCR新应用:基于S1PFGEddPCR技术的质粒介导耐药基...

病原细菌产生耐药性,能够降低细菌感染后的药物治疗效果,并增加细菌感染和传播的风险,是造成食品安全问题和健康威胁的重要因素。细菌耐药性可分为固有耐药(intrinsic resistance)和获得性耐药(acquired resistance)两种。在获得性耐药中,携带耐药基因的质粒可导至耐

凝胶电泳概述

以淀粉胶、琼脂或琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶等作为支持介质的区带电泳法称为凝胶电泳。其中聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis,PAGE)普遍用于分离蛋白质及较小分子的核酸。琼脂糖凝胶孔径较大,对一般蛋白质不起分子筛作用,但适用于分离同工酶及其

酵母人工染色体的应用

直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理直到 20 世纪 80 年代

脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收

低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 D

脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收

            实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。 实验材料

脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收

实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。实验材料 DNA 大小标准基因组 DNA试剂、试剂盒 溴化乙锭酚:氯仿仪器、耗材 水浴实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液溴化

小量培养物中分离-BAC-DNA

            实验方法原理 小量 BAC DNA 是从 5 ml BAC 转化细胞培养物中制备的。DNA 的制备采用碱裂解法。BAC DNA 的产量可达 0.1~0.4  μg,足够用于限制酶切分析、PCR 或 Southern 印迹。

小量培养物中分离-BAC-DNA

实验方法原理 小量 BAC DNA 是从 5 ml BAC 转化细胞培养物中制备的。DNA 的制备采用碱裂解法。BAC DNA 的产量可达 0.1~0.4  μg,足够用于限制酶切分析、PCR 或 Southern 印迹。实验材料 限制性内切核酸酶大肠杆菌试剂、试剂盒 乙醇异丙醇DNA提取液碱性裂解

脉冲[交变]电场凝胶电泳的技术介绍

中文名称脉冲[交变]电场凝胶电泳英文名称pulse [alternative] field gel electrophoresis定  义利用脉冲电场的作用在凝胶介质中分离大分子DNA的一种电泳方法。由于超过一定大小(大于40 kb)的线状DNA分子在琼脂糖凝胶中电泳的速度几乎相同,无法在恒场强凝胶

细菌人工染色体的应用

            实验方法原理 细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome, RAC ) 是以大肠杆菌致育因子 (fertility, F)为基础的合成载体。 实验材料

细菌人工染色体的应用

实验方法原理 细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome, RAC ) 是以大肠杆菌致育因子 (fertility, F)为基础的合成载体。实验材料 限制性内切核酸酶大肠杆菌培养物电转感受态大肠杆菌细胞试剂、试剂盒 LB 冷冻缓冲液仪器、耗材 脉冲场凝胶电泳仪LB

上海市疾控中心成为PulseNet-China首家区域中心实验室

  10月18日,上海市疾病预防控制中心(下称市CDC)隆重举行了“PulseNet China上海区域中心实验室”揭牌仪式,这不仅标志着市CDC成为PulseNet China首家区域中心实验室,也深刻揭示本市在传染病监测和防控领域跨上新的台阶  据专家介绍,PulseNet China是指我国细

关于卡他莫拉菌感染的检查介绍

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细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome, RAC ) 是以大肠杆菌致育因子 (fertility, F)为基础的合成载体。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome

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小量 BAC DNA 是从 5 ml BAC 转化细胞培养物中制备的。DNA 的制备采用碱裂解法。BAC DNA 的产量可达 0.1~0.4  μg,足够用于限制酶切分析、PCR 或 Southern 印迹。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理小量 BAC DNA 是从 5

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  随着人们生活水平的不断提高,食品安全问题愈发受到重视,微生物对食品的污染问题也随之备受关注。微生物包括细菌、真菌等,有些微生物还是致病菌,对人体的危害很大,因此食品中微生物的检测非常重要。  微生物鉴定技术在检验检疫,食品、化妆品等产品致病菌的检测,动物源性致病菌的检测,植物病原细菌、真菌的检测

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脉冲磁场测量仪的概述

  脉冲磁场测量仪的是测量材料的饱和磁滞回线的仪器。其原理是用一个高能电容器或电容器组向中空的磁化线圈脉冲放电,用以获得10T甚至100T的瞬间强磁场,记录此磁场及材料的磁极化强度变化,即可得到该材料的饱和磁滞回线。  现代稀土水磁工业已可以生产出大量用于永磁电机的高矫顽力磁体。例如EH牌号的永磁体