cDNA文库组标准流程六:电转化流程

1.电转化感受态细胞的制备1. 用枪头挑取单克隆菌落,投入盛有10ml LB液体培养基的50ml离心管中。(同时做培养基和枪头的空白对照)2. 37℃,220rpm,培养14-16个小时。3. 第二天,以1:100的比例将这10ml菌液倒入1000ml LB液体培养基中,37度,220rpm,振摇2-3小时,每半小时测一次OD,当OD值达到0.3-0.4时,停止培养。4. 将菌液在冰上预冷30分钟,随后将菌液分装到500ml 预冷的离心杯中,4℃,2500rpm离心10分钟。5. 弃上清,离心杯中加入少量ddH2O,使沉淀悬浮后,再将......阅读全文

cDNA-文库的构建

            实验材料 λ噬菌体臂 大肠杆菌菌株 用于λ噬菌体的包装抽提物 试剂、试剂盒 放线菌素 D

转录组测序流程步骤

以真核转录组测序为例,实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。

免疫组化流程

实验步骤 第一天:1、组织切片置于60℃烘烤1hr2、二甲苯1、2 分别浸泡15min,脱蜡3、水化:100% Etoh 10min X 295% Etoh 5min X 185% Etoh 5min X 170% Etoh 5min X 1注:以下步骤切勿让组织处于干燥状态!4、将切片置于修复盒,

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚仪器、耗材 热循环仪水浴箱琼脂糖凝胶电泳所需的试剂与设备实验步骤 第1阶段:RNA和DNA的分离一次双向消减,需要总量为2ug的基因组DNA或cDNA。大多数分离RNA和基因组DNA的方法都适用于本实验(Sambrooketal

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

            试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 仪器、耗材

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

一次双向消减,需要总量为 2ug 的基因组 DNA 或 cDNA。大多数分离 RNA 和基因组DNA 的方法都适用于本实验(Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试

cDNA-文库的构建2

阶段 3:cDNA 的甲基化材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿10XEcoRⅠ 缓冲液1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用)如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)NaCl(5mol/L)

cDNA文库的构建1

分为六个阶段:阶段1:反转录酶催化合成cDNA第一链阶段2:cDNA第二链的合成阶段3:cDNA的甲基化阶段4:接头或衔接子的连接阶段5:Sepharose CL-4B凝胶过滤法分离cDNA阶段6:cDNA与λ噬菌体臂的连接 [阶段1:反转录酶催化合成cDNA第一链] 1.在置于冰上的无菌微

cDNA文库的物化方法

  基因工程初始阶段所用的方法,已不用。利用核酸双螺旋之间存在着碱基G C,A T配对特性,分离目的基因。  例如:海胆rDNA分子内其G C含量可以达63%(其稳定性高,溶解温度高),通过热变性和S1酶解处理可得到提纯50倍的rDNA,最后经氯化铯平衡梯度离心,得到相对分子量为1.9X107Dal

cDNA文库的构建2

10. Sephadex G-50用含有10 mmol/L NaCl的TE(pH7.6)溶液进行平衡,然后通过离子柱层析将未掺入的dNTP和 cDNA分开。11. 加入0.1倍体积的3mol/L乙酸钠(pH5.2)和2倍体积的乙醇,沉淀柱层析洗脱下来的cDNA,将样品置于冰上至少15分钟,然后在微量

cDNA-文库的构建(二)

7. 尽可能快地进行 cDNA 合成的下一步骤阶段 2:cDNA 第二链的合成材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿EDTA(0.5mol/LpH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)(NH4)2SO4(1mol/L)将 1.3 g 固体硫酸铵溶解于终体积为 10 ml 的水中,溶液经滤膜过滤

cDNA文库的构建3

接头-衔接子与cDNA的连接8.将下列试剂加入到已削成平末端的DNA中:10×T4噬菌体DNA聚合酶修复缓冲液 2μl800~1000 ng 的磷酸化接头或衔接子 2μlT4噬菌体DNA连接酶(105 Weiss单位/ml) 1μl10 mmol/L ATP 2μl混匀后,在16℃温育8~12h。9

关于cDNA文库的简介

  cDNA文库(cDNA library):是指某生物某一发育时期所转录的mRNA全部经反转录形成的cDNA片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。  cDNA文库是以特定的组织或细胞mRNA为模板,逆转录形成的互补DNA(cDNA)与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌形成重组DNA

差减cDNA文库法

差减cDNA文库法[第一条链cDNA合成]1.合成第一条cDNA链时,所有试剂应按下列顺序依次加入:10×第一条链合成缓冲液                 5.0μl10mM dNTP Mix(1.4μg/μl)               2.5μl(终浓度1.25mM)Linker prime

cDNA-文库的构建(一)

实验材料 λ噬菌体臂大肠杆菌菌株用于λ噬菌体的包装抽提物试剂、试剂盒 放线菌素 D二硫苏糖醇EDTATris-ClMgCl2反转录酶RNase 抑制剂用于 cDNA 合成的寡核苷酸引物poly(A)+RNA[a-32P]dCTPEDTA乙醇(NH4)2SO4β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸T4

cDNA-文库的构建3

阶段 5:SepharseCL-4B 凝胶过滤法分离 cDNA材料缓冲液和溶液乙醇乙酸钠(3 ml/L,pH5.2)TE(pH7.6)含 0.1mol/LNaCl 的 TE(pH7.6)Tris-HCl(1mol/L,pH8.0)凝胶琼脂糖凝胶(1%)见步骤 8。核酸和寡核苷酸cDNA阶段 4 中步

cDNA-文库的构建(三)

阶段 3:cDNA 的甲基化材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿10XEcoRⅠ 缓冲液1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用)如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)NaCl(5mol/L)

cDNA-文库的构建(四)

方法cDNA 末端的削平1.cDNA样品(来自步骤 11)于 68°C 加热5 min。这一步骤是使cDNA分子的单链突出端可能形成的双链结构发生变性。2. 将cDNA溶液冷却至37°C并加入下列试剂:5xT4噬菌体DNA聚合酶修复缓冲液                              

组织库冷冻样本管理流程(六)

附件C.生物样本库编号规则建议标本库编号命名规则:总原则:唯一性,共享性辅原则:在满足总原则基础上,尽量精简。编号长度尽量保持统一。一.组织生物样本采集和常规采集的编号规则组织编号规则。组织编号规则标签类型:BRADY THT-163-499-3-IP 长方形为25.4mm*9.525mm, 圆直径

检测标准化流程

检测标准化所谓检测标准化,就是对检测活动系统分析的基础上,将检测活动的每一流程、每一操作程序进行分解,以规章制度、科学技术和实践经验为依据,以安全、质量效益为目标,对检测过程进行改善,从而形成一种优化作业程序,逐步达到安全、准确、稳健、高效、省力的检测效果。 创新改善与标准化是实验室管理水平的两大指

构建cDNA文库的层析柱cDNA分级

  这一步稍不注意会影响成功性或影响获得的cDNA的片段分布特点。这一步的操作要小心,尤其要在加入cDNA之前通过反复悬浮和试滴保证柱子能正常工作,cDNA的加入和收集要精力集中。获得的每一级的cDNA量很少,检测时带型很暗,所以要用新鲜做的透明薄胶检测,根据检测结果一定要舍弃太短的cDNA(一般4

cDNA文库构建技术cDNA链的反转合成

实验概要构建cDNA文库是一种获得目标基因并进一步进行基因重组,基因克隆的重要方法,而在该文库构建中有mRNA 逆转录出cDNA是一步极为关键的操作。mRNA的逆转录主要由MMLV、AMV两种逆转录酶催化合成cDNA,在这个逆转录过程中,模板mRAN及逆转录酶是两个最重要的影响因素。对于mR

cDNA文库构建技术cDNA链的反转合成

构建cDNA文库是一种获得目标基因并进一步进行基因重组,基因克隆的重要方法,而在该文库构建中有mRNA 逆转录出cDNA是一步极为关键的操作。mRNA的逆转录主要由MMLV、AMV两种逆转录酶催化合成cDNA,在这个逆转录过程中,模板mRAN及逆转录酶是两个最重要的影响因素。对于mRNA来讲,一

差减cDNA文库法1

[第一条链cDNA合成] 1.合成第一条cDNA链时,所有试剂应按下列顺序依次加入: 10×第一条链合成缓冲液5.0μl 10mMdNTPMix(1.4μg/μl)2.5μl(终浓度1.25mM) Linkerprimer(1.4μl,终浓度100μg/μl) DEP

差减cDNA文库法3

[大量制备生产单链噬菌体DNA]1.新鲜过夜培养的宿主菌XLI-Blue,以1:20稀释在LB培养液中,在37℃培养扩增2小时。2.加1ml含单链cDNA的上清液。3.再于37℃继续培养2小时。4.然后将全部溶液转到500~1000mlLB中,生长5~6小时。5.9500rpm离心60分钟,除去细菌

差减cDNA文库法2

[cDNA末端磷酸化]1.70℃灭活反应后,稍微离心一下,置室温5分钟。2.在反应混合物(10μl)中加入:1μl10×连接缓冲液2μl10mMATP1μl(10μ)DNA激酶 [限制性内切酶消化]以得到粘性末端 1.限制性内切酶消化DNA和载体。 2.在37℃保温1~5小时,然后冷却到

cDNA文库的构建和筛选

材料许多生物是疾病研究或探索使细胞和机体应对和存活于不同刺激下的分子适应机制的优良模型。 cDNA 文库的构建和随后目的基因的筛选可促使研究者发现在调节和响应某些外部特定环境压力中有重要作用,而在其他体系中可能不表达或者不存在的新基因。确定这些新基因的可读框,进一步分析其编码蛋白质的功能可以开创全新

关于cDNA文库的原理介绍

  一、定义  (cDNA Library)某种生物基因组转录的全部mRNA经反转录产生的cDNA片段分别与克隆载体重组,并将其引入到相应的宿主细胞中(一般为E.coli.)繁殖和扩增,理论上此群体就包含有该物种的全部mRNA信息,称该生物基因组的cDNA文库。  二、原理  经典cDNA文库构建的

TECAN洗板机标准操作流程

1.目的使洗板机正常运转,达到预期使用要求。 2.职责 检验科具体操作人员负责。3.操作流程: a.打开电源,启动洗板机,待自动停止后,视屏显示[Run]:A,-+,洗板机启动运行Other yes.b.按Other键,视屏出现Prime:Ch1即第一通道(蒸馏水清洗通道),通过-+键可调节Ch1和

旋转蒸发仪标准操作流程

一般来说旋转蒸发仪的操作流程主要分为抽真空、加料、加热、旋转、接通冷却水和回收溶媒等几个重要的步骤。下面我们来具体看看都是什么1、我们先说抽真空请打开真空泵后如果发现真空打不上,应检查各瓶口是否密封好、检查真空泵自身是否漏气、检查旋转轴处密封圈是否完好,外接真空管中串联一只真空开关可以提高蒸发速度和