就这样做轻松搞定实时PCR探针设计

除了为克隆基因、预测编码蛋白而需要研究基因的构成外,当前在基因组学上的努力也包括对基因组构成的研究,以分析具有结构和调控因子插入的基因。近源物种分析成为比较基因组学的主要内容,被认为是研究进化、基因功能和人类疾病的重要方法。 利用该方法分析微生物,特别是细菌的基因组,早在 1996 年就已开始识别出细菌中的保守基因和与亚种相关的毒性基因(Fredricks and Reiman 1996)。这方面的进展促生了新的、大规模的检测和识别致病菌的方法。近源种 PCR 可以用来研究进化上相关的种,它们在基因组上有一 些共同的特点,这些保守的区域可被用于在基因组水平识别新种。还可以用该技术在尚未测序的物种的基因组中扩增同源基因。 设计策略 根据多元序列比较和引物设计的一般规律来设计近源种 PCR 引物。通过比较少数几个大的相近序列识别出保守区域,这些区域即是近源种引物的可能结合位点。近源种的比较需要对少数大的相近序列......阅读全文

晶圆测试与探针台

  晶圆测试是在半导体器件制造过程中执行的一个步骤。在此步骤中,在将晶圆送至芯片准备之前执行,晶圆上存在的所有单个集成电路都通过对其应用特殊测试模式来测试功能缺陷。晶圆测试由称为晶圆探针器的测试设备执行。晶圆测试过程可以通过多种方式进行引用:晶圆最终测试 (WFT)、电子芯片分类 (EDS) 和电路

关于探针标记方法的介绍

  ①缺口平移标记法。利用的是DNA聚合酶I能修复DNA链的功能。该法先由DNaseI在DNA双链上随机切出切口,然后DNA聚合酶I沿缺口水解5´;端核苷酸,同时在3´;端修复加入被标记核苷酸,切口平行推移。缺口平移法快速、简便、成本相对较低、比活性相对较高、标记均匀,多用于大分

核酸分子杂交探针的介绍

  若杂交的目的是识别靶DNA中的特异核苷酸序列,这需要牵涉到另一项核酸操作的基本技术─探针(probe)的制备。探针是指带有某些标记物(如放射性同位素32P,荧光物质异硫氰酸荧光素等)的特异性核酸序列片段。若我们设法使一个核酸序列带上32P,那么它与靶序列互补形成的杂交双链,就会带有放射性。以适当

电子探针的功能介绍

电子探针是一种利用电子束作用样品后产生的特征X射线进行微区成分分析的仪器,可以用来分析薄片中矿物微区的化学组成。除H、He、Li、Be等几个较轻元素外,还有U元素以后的元素以外都可进行定性和定量分析。电子探针的大批量是利用经过加速和聚焦的极窄的电子束为探针,激发试样中某一微小区域,使其发出特征X射线

细菌感染检测细菌遗传物质

  通过检测病原体遗传物质来确认病原体也许是检查病原体为直接的方法了。目前比较成熟的技术包括基因探针技术和PCR技术。  (一)基因探针技术  用标记物标记细菌染色体或质粒DNA上的特异性片段制备成细菌探针,待检标本经过短时间培养后,经过点膜、裂解变性、预杂交和杂交后,利用探针上标记物发出的信号可以

建立一个实时-PCR-定量分析实验

            试剂、试剂盒 MgCl2 探针 HotStmMix 正向和反向扩增引物 模板 DNA 仪器、耗材

cccDNA的定量检测

在定性检测的基础上,可以进一步对cccDNA进行定量检测。仍以PCR定量分析技术中,尤其是竞争PCR技术的敏感性和精确度高。方法是在PCR反应管中加入一种已知量的、能与野生模板等效扩增的内参照,内参照是经过突变处理的,其两端尤其是引物退火区的序列与野生模板相同。PCR扩增后通过一定的方法将野生片段与

关于共价闭合环状DNA(cccDNA)的定量检测介绍

  在定性检测的基础上,可以进一步对共价闭合环状DNA(cccDNA)进行定量检测。仍以PCR定量分析技术中,尤其是竞争PCR技术的敏感性和精确度高。方法是在PCR反应管中加入一种已知量的、能与野生模板等效扩增的内参照,内参照是经过突变处理的,其两端尤其是引物退火区的序列与野生模板相同。PCR扩增后

新冠病毒核酸检测PCR技术知识点梳理(一)

近日,由于全国复工复产复学的大量需求,阿里健康、美团App 等线上平台联合各大第三方检测机构,陆续开放了线上预约新冠病毒核酸检测服务。 开通服务的地区,人们可以拿起手机即可便捷的预约核酸检测,最快24小时即可拿到结果。如此便捷的服务,让广大民众欢欣鼓舞,科技的发展又一次为人们的生活带来翻天覆地的变化

荧光标记基团的选择及其在荧光定量PCR中的应用

PCR实验室产品选择指南 荧光  基团是吸收一定波长的光子后发射特定波长的光波,可以作为抗体等分子的标记物,实时荧光定量PCR中的Taqman探针常用荧光基团FAM标记荧光基团和TAMRA标记。 荧光基团 吸收特定波长的光子后荧光染料(通常称为“荧光基团”或简称为“荧光素”)的化

荧光定量PCR试剂盒

荧光定量PCR试剂盒 荧光定量PCR又可以分为TaqMan探针和SYBR Green I荧光染料两种方法。比较而言,探针杂交技术在原理上更为严格,所得数据更为精确;荧光染料技术则成本更为低廉,实验设计更为简便。在选择实验方案时要根据实验目的和对数据精度的要求来决定。1. TaqMan探针法是高度特异

荧光定量PCR检测方法

  所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。  检测方法  1.SYBRGreenⅠ法:  在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信

实时荧光定量PCR(Realtime-PCR,QPCR,荧光定量)分类以...

实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)分类以及实验步骤介绍实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)技术(Real-time quantitative PCR),是指在(QPCR,荧光定量)反应体系中加入荧光基因,利用荧光信号积累实时监测整个(

一文读懂分子诊断技术、PCR技术、基因测序技术

  四、定量PCR(quantitative PCR,qPCR)  相比于其他分子诊断检测技术,qPCR具有2项优势,即核酸扩增和检测在同一个封闭体系中通过荧光信号进行,杜绝了PCR后开盖处理所带来扩增产物的污染;同时通过动态监测荧光信号,可对低拷贝模板进行定量。正是由于上述技术优势,qPCR已经成

探针的非放射性标记技术2

一;仪器:同上 二:试剂:ECL标记盒,其余同上 三:操作:1:将待标记的DNA稀释至10ng/ml 2:将上述DNA在100℃5分钟,冰浴5分钟 3:离心后加入10ulECL标记混合物,混合均匀 4:加10ul戊二醛溶液混匀,37℃20分钟,此反应

定量PCR技术

  定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术有广义概念和狭义概念。广义概念的定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR起始模板量的定量。  广义概念下的定量PCR技术可以分为五种类型:  (1)外参法+终产物分析。所谓“外

定量PCR(Polymerase-Chain-Reaction)技术

定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术有广义概念和狭义概念。广义概念的定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行 PCR起始模板量的定量。广义概念下的定量PCR技术可以分为五种类型:(1)外参法+终产物分析。所谓“外参法”是指

定量PCR技术

 定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术有广义概念和狭义概念。广义概念的定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR起始模板量的定量。  广义概念下的定量PCR技术可以分为五种类型:(1)外参法+终产物分析。所谓“外参法”

实时定量PCR技术综述(原理、荧光标记、TaqMan-Probes和...1

一.实时定量PCR基本原理1.PCR反应动力学右图为PCR反应曲线(横坐标为循环数,纵坐标表征产物量),不同的曲线代表初始模板量不同的 PCR反应。PCR反应的动力学公式为:Cn=C0(1+E)n其中C0和Cn分别为初始模板和n循环的拷贝数,n为循环数,E为扩增效率(0≤E≤1),理想状态下(即每个

实时荧光定量PCR简介

荧光定量PCR检测技术从诞生到现在已经有 8 年了,但是其应用在近四年才迅猛增长。在 Medline 数据庫中,用“ Taqman” 或 ”real time PCR” 作为关键词检索,在1996 年仅有 19 篇,在 1997 年仅有 28 篇,在 98 、 99 、2000 年分别达到了

荧光定量PCR技术的检测原理和方法

1.SYBRGreenⅠ法:在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。SYBR定量PCR扩增荧光曲线图PCR产物熔解曲线图(单一峰图表明P

qpcr荧光染料降解会让阴性对照出现扩增吗

qpcr荧光染料降解会让阴性对照出现扩增实时定量PCR是通过产物发出荧光,根据荧光强度来定量的.激发荧光的方式有荧光染料法和探针法.荧光探针比荧光染料更具特异性,可检测特定序列的扩增产物的量.荧光染料可以检测PCR中获得的全部双链DNA,但不能区分不同的双链DNA.可以说荧光PCR包括探针法和染料法

实时荧光定量PCR技术介绍

实时荧光定量PCR (real time fluorogenetic quantitative PCR, FQ-PCR),是在PCR定性技术基础上发展起来的核酸定量技术。它是一种在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时检测整个PCR过程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方

qRTPCR

实验概要实时定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。目前,实时定量PCR所使用的荧光化学组分一般可分为两种:荧光探针和荧光染料。1)TaqMan荧光探针:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的

qRTPCR

实验概要实时定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。目前,实时定量PCR所使用的荧光化学组分一般可分为两种:荧光探针和荧光染料。1)TaqMan荧光探针:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的

荧光定量PCR的原理

PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;刚开始时, 探针结合在DNA任意一条单链上;PCR扩增时,Tap酶的5’端-3’端外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和

RealTime-PCR-(qPCR)常见问题及解决方案

Real Time PCR(qPCR),即实时荧光定量核酸扩增检测系统,是一种利用荧光染剂检测每次PCR循环后产物总量的方法技术,是常规PCR的衍生反应。主要是通过荧光信号的变化实时监测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过ct值和标准曲线的关系对起始模板进行定量分析。因其具有灵敏、特异、

实验室HIV检测技术概述及进展(三)

       2.2.1  多聚酶链反应检测法       PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性—退火—延伸三个基本反应步骤构成。           ① 模板DNA的变性:模板DNA经加热至93 ℃左右一定时间后,使模板DNA双

非同位素探针进行原位杂交实验地高辛标记探针信号放大

试剂、试剂盒10μg ml 羊抗地筒辛抗体 Fab 片段 溶于 4×SSC 1% m VBSA (组分V)地高辛信号放大溶液:3. 5〜7. 0 ug ml荧光素标记的兔抗羊IgG (Sigma) 溶于 4×SSC 1% m V BSA (组分 V)仪器、耗材Parafilm 膜玻片实验步骤1) 用

原子力显微镜探针、原子力显微镜及探针的制备方法

原子力显微镜探针、原子力显微镜及探针的制备方法。原子力显微镜探针包括探针本体和设置在探针本体的针尖一侧的接触体,接触体具有连接段和接触段,接触段具有接触端面;接触段为二维材料,且接触端面为原子级光滑且平整的单晶界面。本发明ZL技术的原子力显微镜探针可精确地检测受测样品的各种性质。介绍随着微米纳米科学