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4D组学新时代!更精确的磷酸化修饰组学

离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。更精确的磷酸化修饰组学磷酸化是研究最广泛的翻译后修饰类型,在多种生命活动的调控包括生物的生长发育、信号转导以及疾病进程等过程中发挥至关重要的功能。当下蛋白质组学研究正如火如荼地发展,随着技术的不断成熟,依赖于质谱的蛋白质磷酸化的检测,极大地推动了磷酸化蛋白质组学的发展。然而对于传统的质谱技术来说,磷酸化深度并精确的鉴定主要有两大挑战,1)生物样品中不同的磷酸化肽段丰度会呈现出几个数量级的差异,这需要更高的质谱扫描速度和灵敏度来鉴定到低丰度的磷酸化肽段;2)同一个肽段发生磷酸化位点......阅读全文

蛋白质浓缩和溶质的去除实验

蛋白质浓缩和溶质的去除实验             实验步骤 一、层

质谱检测法如何进行蛋白质分析?

  MS/MS操作模式  串联质谱仪通常使用的都是离子模式来鉴定蛋白质的氨基酸序列。目前所有的MS/MS质谱仪都具有该功能。不过其它特殊的质谱仪也具有MS/MS功能。如果要发现蛋白质中的某个功能基团则需要用到母离子扫描功能或者中性丢失扫描功能,而这就必须用到三重四级杆质谱仪,如Q-Q-Q质谱仪,或四

2011年北京质谱年会隆重召开

  2012年3月30-31日,北京理化分析测试技术学会北京质谱学会举办的“2011年度北京质谱年会”在北京外研社国际会议中心隆重召开。来自科研院所、检测机构、仪器厂商等五百余位质谱界专家学者、实验室人员、技术工程师等参加了本次年会,共同探讨了质谱技

赛默飞世尔科技“蛋白质组学解决方案”网络视频讲座

  3月30日下午,赛默飞世尔科技蛋白质组学市场专员唐佳向大家作了题为《蛋白质组学研究方法和Thermo蛋白质组学解决方案》的报告

“干细胞及转化研究”等6个重点专项2018年项目申报发布

  5月22日,科技部官网发布了《关于对国家重点研发计划干细胞及转化研究等6个重点专项2018年度项目申报指南征求意见的通知》,其中,“干细胞及转化研究”重点专项、“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项、“纳米科技”重点专项 与生物医学领域相关。  关于对国家重点研发计划干细胞及转化研究等6个重点专项

质谱沙龙第二十一期活动报道

【导语】在药物分析的技术讨论之外,拓展了质谱沙龙的涉及范围:增加了质谱相关新技术MassWorks的讨论;GC/MS在公安法医中的应用;以及蛋白质组学同位素标记、磷酸化翻译后修饰鉴定的最新研究进展。   2009年7月25日下午,质谱沙龙第二十一期活动在第二炮兵总医院胃食管返流中心示教室举行。除了

蛋白质组学实用分析技术一览

分析其实也属于技术的一部分,且在蛋白质组学研究中显得尤为重要,因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的,而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性,因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。

“空间定位组学”和“4D组学”建起科学研究与疾病治疗的桥梁

  分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球,并已在成像领域占据领导地位;自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后,在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展,并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列,已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大

2014质谱沙龙年末巨献 再掀质谱临床应用热潮

  2014年12月28日,“北京市继续教育-质谱沙龙2014报告会”在首都医科大学附属北京朝阳医院举行。本次质谱沙龙活动由首都医科大学附属北京朝阳医院、AB SCIEX公司主办,北京艾米诺医学研究有限公司、分析测试百科网、默沙东

百家争鸣,质谱之花绽放杭州

  2018年5月7日,中国化学会第31届学术年会质谱分析分会进展到第三天,分为报告部分和墙报展部分,当天共有十位专家携自己精彩的报告与众多专家学者交流学习。清华大学教授 欧阳证  清华大学教授欧阳证带来了题为“分子结构分析在临床质谱分析仪器的实现与应用”的报告。欧阳证介绍了清谱科技生产的Miniβ

国内外蛋白质组学大腕云集 聚焦生物质谱前沿技术

  2014年7月3日,全国生物质谱学术报告会--生物质谱前沿技术邀请报告会在上海复旦大学隆重召开。此次活动旨在积极促进我国生物质谱技术的发展和应用,加强国内外相关研究领域的专家学者之间的交流与合作,特邀瑞士苏黎世联邦技术学院分子系统生物学

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

  一、 前言[1,2]   基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量

近期《自然》期刊系列中发挥关键作用的赛默飞质谱仪

  6、The endonuclease activity of Mili fuels piRNA amplification that silences LINE1 elements          Mili核酸内切酶的活性刺激piR

质谱仪

最近又有几项有关质谱仪的最新进展问世,这些新成果的出现又给我们的生物大分子研究工作补充了“弹药”。在蛋白质测序方面,基于碰撞诱导裂解技术(CID),又新出现了可变裂解技术(Alternate fragmentation technique),该新技术是基于处在碰撞池中的离子具有的电子传递特性开发出来

2019中国生命科学领域CNS盘点:曹雪涛 颜宁 施一公上榜

  截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结:  按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie

蛋白质组学概念的起源和发展

  蛋白质组学的诞生和发展,离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括(但不限于)基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来,分子医学、大数据技术和人工智能的发展,进一步加速推动了蛋白质组学的成长,使之在精准医疗领域展示出越来越大的应

质谱检测法与蛋白质分析(二)

传统的和最新的蛋白质组学研究策略虽然到目前为止,还没有一种蛋白质组学研究策略能够对某个蛋白质组进行常规的、完整的分析,但是现在的技术已经非常强大,我们相信,很快就能进行全蛋白质组学研究了。而且,对某个亚蛋白质组(比如某个细胞器或亚细胞结构的蛋白质组)进行研究早就已经不是什么难题了,这已经成为了一种常

AB Sciex视频讲座“AB Sciex 电喷雾质谱在蛋白质组学中的应用”

  4月12日,AB Sciex 公司在分析测试百科网成功举办了题为“AB Sciex 电喷雾质谱在蛋白质组学中的应用”的网络视频讲座。AB Sciex 亚太应用支持中心的靳文海博士首先为大家简单介绍了蛋白质组学和质谱技术发展方向,接下来重

质谱检测法与蛋白质分析(一)

质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质

质谱检测法与蛋白质分析

在生命科学研究工作中有一个重要问题,就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息,我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来,从原则上来说,也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗,透过这个窗口,我们就能够对复杂的细胞调控网

蛋白质微阵列技术

微阵列技术在单个实验中能同时分析数千个参数。捕获分子微点在固体支持物上固定成行列并暴露在含相应结合分子的样品中。基于荧光、化学发光、质谱、放射性或电化学的读出系统能检测每个微点形成的复合物。这些微小化和平行的结合分析高度灵敏,方法的分析能力又能被微阵列基因表达分析所放大。在这些系统中,检测固定的DN

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

质谱检测法与蛋白质分析(二)

  离子回旋加速器与轨道离子阱质谱仪   随着功能强大的带有外部离子源的傅里叶变换-离子回旋加速器(FT-ICR)质谱仪的出现以及商业化,我们在质谱仪的分辨率与准确性方面取得了质的飞跃。有了这种新型的质谱仪,我们现在可以对ppm级乃至亚ppm级的样品进行分析了。该质谱仪的高分辨率特性不

Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果

  基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据,一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”( proteogenomic)研究,将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起,并帮助确定了一些驱动癌症的基因。  这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然

甜蜜而富有挑战性的糖基化蛋白质组学研究

   写在前面的话:对于研究糖基化蛋白质组学的学者们来讲,很多人喜欢用sweet这个词来形容自己的研究课题。我个人也很喜欢这个单词,这是一个让人感到幸福而温暖的词语,会让你对你的课题充满了爱意。但回头想想,当初懵懵懂懂读到研究生,误打误撞进入蛋白质组学圈,好像也就是随大流的主动抑或是被动选择了博士阶

2018年全国糖生物学会议闭幕 2020年相约美丽大连

  分析测试百科网讯 2018年9月23日,由中国生物化学与分子生物学会糖复合物专业委员会主办,复旦大学承办的2018年全国糖生物学会议圆满闭幕。本次会议就糖化学生物学合成、糖生物学、糖药物、糖组学、糖链结构分析、糖生物工程与技术等糖相关领域展开多视角、跨学科的交流和探讨,吸引了400余位业内同仁参

李灵军:CASMS 薪火相传 让华人在国际质谱舞台上更闪耀

  分析测试百科网讯 2016 ASMS举办期间,北美华人质谱学会(CASMS)组织举办了一系列活动,尤其是首次成功承办了第6届世界华人质谱会。为使大家更多地了解CASMS的工作特点,以及为每位质谱工作者提供的帮助,我们采访了现任CASMS会长李灵军

《细胞》子刊11篇文章重磅回顾,这些年兴起的大牛技术

  还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。  Cell出版社旗下Molecular Cell杂志推出了技术特刊,介绍了新技术

2012中国医学科学院蛋白质组学研讨会大会报告

  中国医学科学院基础医学研究所 高友鹤教授  来自中国医学科学院基础医学研究所的高友鹤教授以幽默诙谐的方式为与会者阐述了《尿蛋白质组和生物标志物研究》的内容。   高教授首先介绍了尿蛋白具有以下特点:1.正常尿蛋白质组相对简单,病理状态下比较复杂;2.尿蛋白的影响因素比较多;3.对泌尿系