Cell重磅:人类病毒蛋白质相互作用图谱面世

图片来源:《寄生虫》海报 近日,一部豆瓣评分9.2的韩国电影《寄生虫》广受大家的好评。故事也正如片名一样,讲述了一个贫困家庭“寄生”于富人家庭的故事。说到寄生,其实人体内的寄生事件更是数不胜数,最常见的便是病毒的感染。 病毒是一种比真菌和细菌小得多的感染性微生物,要想生存,它就必须找到合适的活体细胞作为“宿主”寄生于其内部,再利用复杂的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)来强占宿主细胞的生存功能来汲取养分。宿主细胞也不甘示弱,也通过PPI来启动激活先天抗病毒防御和适应性免疫系统来控制病毒复制。但在这场较量中,一旦被寄生的宿主细胞“战亡”,在其体内迅速繁殖的大量“寄生”病毒便会倾斜而出,重新踏上新的“寄生”之旅,感染更多健康细胞。图片来源:参考资料[1] 因此,蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)的相关知识对于理解病毒与宿主之间的关系至关重要。目前,科学家主要通过高通量方法来研究蛋白质间的相互作用,虽然获取了很多新发现,但这种方法在......阅读全文

Cell重磅:人类病毒蛋白质相互作用图谱面世

图片来源:《寄生虫》海报  近日,一部豆瓣评分9.2的韩国电影《寄生虫》广受大家的好评。故事也正如片名一样,讲述了一个贫困家庭“寄生”于富人家庭的故事。说到寄生,其实人体内的寄生事件更是数不胜数,最常见的便是病毒的感染。  病毒是一种比真菌和细菌小得多的感染性微生物,要想生存,它就必须找到合适的活体

肠道细胞综合图谱面世

  肠道是人体重要的消化器官,肠道由不同的解剖区域组成,这些区域发育速度不同,在消化、营养吸收、代谢和免疫调节中也发挥着不同的作用。正确认识肠道细胞的分化过程对于肠道疾病的研究至关重要。  近期,英国桑格研究所的研究团队发布了人体肠道细胞综合图谱。相关研究在《Nature》发表,题为:Cells o

Cell头条:首张人类蛋白复合物图谱

  来自加拿大多伦多大学,英国伦敦大学的研究人员采用了一种综合性整体蛋白质组分析方法,构建了三千多个人可溶性蛋白之间多达上万个高可信度的物理相互作用,这添补了之前科学家们对于人类蛋白复合物知之甚少的空白,为深入了解核心生物进程提供了重要信息。相关成果公布在Cell杂志上。   领导这项研究的是包括

人类首张黄种人基因组图谱有望在深面世

人类第一张“黄种人基因组图谱”有望在深面世,并计划在今年高交会期间向全世界发布。目前,深圳华大基因研究院近百位科学家已进驻盐田。市区两级政府正着手将沙头角海山街道辖区的恩上村整体搬迁改造成“生物研发加速器”,作为该项目基地。 人们对基因工程技术应用于制药和医学治疗的信心在不断增强。2006年底,

Cell重要成果:绘制凋亡蛋白质组图谱

  斯克里普斯研究所的科学家们同时绘制出了细胞中两种最重要的蛋白质修饰类型的图谱,揭示了在凋亡这一重要细胞过程中它们之间广泛的协同作用。相关论文发表在7月20日的《细胞》(Cell)杂志上。   磷酸化(Phosphorylation)和蛋白质水解(proteolysis)几乎总是被独立开展研究。

Cell:绘制人类单细胞染色质可及性图谱

  在人类细胞中,总长约2米的基因组DNA通过与组蛋白缠绕形成核小体,并经过螺旋折叠等方式盘绕形成染色体进而团聚于直径10微米的细胞核中。在细胞内的DNA需要进行转录等活动的时候,DNA才会从组蛋白中释放出来,裸露出需要与转录因子结合的位点从而便于转录,染色质的这种特性叫做染色质可及性,暴露的区域被

Cell:新研究揭示人类5000多个必需基因表型图谱

  在一项新的研究中,来自美国怀特海德研究所和布罗德研究所的研究人员利用一种新颖的、集合的、基于成像的筛选方法系统性地评估了5000多个人类必需基因的功能。  他们的分析利用CRISPR/Cas9来敲除基因活性,并形成了一种首创的资源,能够通过空间和时间分辨率了解和可视化观察基因在一系列细胞过程中的

第一张人类器官蛋白质组图谱

在广州南方医科大学举行的第五届中国蛋白质组学大会暨首届粤港蛋白质组学学术交流会上,由中国科学家领衔的“人类蛋白质组计划”有望实现肝癌诊治突破性进展。 据了解,该计划实施3年来,围绕人类肝脏蛋白质组的表达谱等九大科研任务,我国科学家成功测定出6788个高可信度的中国成人肝脏蛋白质,系统构建了国际上

Cell:构建人类免疫细胞图谱,确定遗传变异对基因影响

  比较任何两个人的DNA,你会发现他们的遗传密码中的数百万个位点存在着不同。如今,在一项新的研究中,来自美国拉霍亚免疫学研究所(LJI)的研究人员分享了大量数据,这些数据对于破译这种自然遗传变异如何影响免疫系统保护我们健康的能力至关重要。相关研究结果于2018年11月15日在线发表在Cell期刊上

Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱

  来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了,我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究,将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件,最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。  这些变异存在于非直接负责编码基因,而是发

Nature重要成果:大型致癌病毒人类相互作用图谱

  新兴的外显子组和完整基因组测序工作鉴别出了大量与癌症易感体质相关的生殖系变异,并记录了数以千计的体细胞基因组变异。癌症相关的基因组变异目录需要功能性信息来注释它们在肿瘤形成中的作用。鉴于这些基因组方法揭示了庞大数量的癌症相关基因组变异,鉴别出特异的致癌基因仍是一个挑战。   由美国达纳法癌症研

华人学者Cancer-Cell:首张人类癌症非编码RNA综合图谱

  随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加,从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因(占总数的不到2%),而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发

Cell:最大规模的蛋白质互作组网络图谱

  人类大约有2万个蛋白质编码基因,尽管自十年前首次完成人类基因组测序以来取得了一些显著的进展,对于这些蛋白质如何在细胞内发挥功能,科学家们仍然只详细了解了其中的一小部分。  作为人类基因组计划的延伸,蛋白质组学领域正在致力揭示蛋白质是如何执行由生成它们的基因所编码的过程的。一些先进的工具已帮助鉴别

人类神经元研究新模型面世

科技日报北京4月8日电 (记者刘霞)美国威尔·康奈尔医学院科学家开发出一种创新性人类神经元模型,详细模拟了tau蛋白聚集体在大脑内的传播,这一过程会导致阿尔茨海默病和额颞叶痴呆症患者认知能力下降。新模型有助科学家找到可能阻断tau蛋白传播的新治疗靶点,是阿尔茨海默病研究领域的一项重大进展。相关论文发

人类神经元研究新模型面世

美国威尔·康奈尔医学院科学家开发出一种创新性人类神经元模型,详细模拟了tau蛋白聚集体在大脑内的传播,这一过程会导致阿尔茨海默病和额颞叶痴呆症患者认知能力下降。新模型有助科学家找到可能阻断tau蛋白传播的新治疗靶点,是阿尔茨海默病研究领域的一项重大进展。相关论文发表于5日出版的最新一期《细胞》杂志。

科学家全面绘制人类健康与疾病蛋白质组图谱

复旦大学附属华山医院教授郁金泰、毛颖团队与复旦大学类脑智能科学与技术研究院研究员程炜、教授冯建峰团队合作,全面绘制了人类健康与疾病蛋白质组图谱,并结合人工智能大数据分析方法构建了疾病诊断预测模型以及发现了26个药物治疗新靶点,为精准医学的实施提供了重要科学依据。11月22日,相关研究发表于《细胞》。

Cell:首次构建出人类大脑皮层神经发生的基因调控图谱

  在一项新的研究中,来自美国加州大学洛杉矶分校等研究机构的研究人员首次构建出人类神经发生(neurogenesis)的基因调控图谱,其中在神经发生中,神经干细胞转化为脑细胞并且大脑皮层在尺寸上扩大。他们鉴定出调控我们的大脑生长并且在某些情形下为在生命后期出现的几种大脑疾病奠定基础的因子。相关研究结

Cell:发现流感病毒蛋白质的致命弱点

  美国NIH国家过敏和传染病研究所(NIAID)资助的一项最新研究表明,流感病毒蛋白质的不断变化的“头部”具有意想不到的致命弱点。这一团队发现并鉴定了一种天然存在人体抗体中的结构,该抗体可以识别和破坏病毒进入机体、感染细胞的一部分血凝素(HA)蛋白。  这一研究成果公布在5月16日的Cell杂志上

汤富酬Nature-Cell-Biology发文-揭示人类消化道发育细胞图谱

  人类胚胎发育过程中食道、胃、小肠、大肠的细胞类型图谱及其关键生物学特征。  消化系统是人体中最重要的器官系统之一,而消化道作为消化系统最重要的组成部分,其在食物消化、营养吸收、废物排泄、抵抗微生物入侵等多个方面起着极其重要的作用。消化道主要由食道、胃、小肠、大肠组成。揭示这四种器官在人类胚胎发育

蛋白质组学牛人Cell发表病毒研究新工具

  科学家们在质谱分析的基础上,开发了一种全新的蛋白质组学技术——QTV(quantitative temporal viromics)。这一技术能够在病毒感染的过程中,对宿主和病毒蛋白的实时动态进行系统性定量分析,展现病毒与宿主的具体互作过程。这一技术发表在六月五日的Cell杂志上。  在QTV技

Cell-stem-cell:纯化人类细胞新技术

  多能干细胞研究之所以流行是因为在生物医学研究中,多能干细胞能够分化为任意细胞类型。但一些代表性的分化方法会导致异质性细胞群体的出现,这时候就需要将目的细胞进行纯化分离。  目前对这类细胞进行分离主要根据细胞表面的特征性受体不同,利用抗体进行分离筛选。但在一些情况下,这种分离方法的纯化水平很低,并

高绍荣Cell-Reports:小鼠植入前胚胎蛋白质组动态图谱

  近日,同济大学高绍荣课题组与华东师范大学廖鲁剑课题组合作在Cell子刊《Cell Reports》杂志在线发表题为“Protein Expression Landscape of Mouse Embryos during Pre-implantation Development”的文章。首次报道

人类血浆蛋白质组遗传图谱公开-有助鉴定新的治疗靶点

  英国《自然》杂志6月6日发表了一项遗传学最新成果:剑桥大学研究团队量化了人体血浆中的3000多种蛋白质,成功绘制出人类血浆蛋白质组遗传图谱,其中89%前所未知。该研究发现的遗传变异与个体蛋白水平之间的联系,或意味着可以借此鉴定出新的治疗靶点,并将现有药物用于治疗新的疾病。  血浆蛋白是指血浆中的

十年大型项目,绘制人类蛋白质组图谱

  由瑞典皇家理工学院的Mathias Uhlén领导的一项长达十年之久的研究项目——人类蛋白质图集(Human Protein Atlas,HPA)项目,在本周发布了1300万张全身人类蛋白质“图像”。通过制备出荧光标记抗体,将其应用于保存组织的薄切片,观察组织的颜色以及附着在组织上的抗体,研究人

Science绘制人类融合史遗传图谱

  来自牛津大学和伦敦大学学院的研究人员绘制出了一张人类遗传史交互图,详细地描述了跨越4千年历史长河整个欧洲、非洲、亚洲和南美95个种群之间的遗传融合史。   这项发表在本周《科学》(Science)杂志上的研究,确定及标识出了种族之间遗传融合发生的时间及特征。为此,研究人员开发出了一些先进的统计

Science:首个!人类肾脏免疫图谱绘制

  根据最近一项研究,科学家通过绘制了将近70,000个来自早期生命和成年个体的肾脏细胞图谱之后,创建了首个人类肾脏免疫系统图谱。这项研究由来自剑桥大学、Wellcome-Sanger研究所的研究人员等机构研究者完成,它首次显示了我们的肾脏免疫系统早在胚胎时期是如何发展,并如何在出生后和成年后逐渐增

古DNA-图谱描绘人类农业“黎明”

考古学和遗传学证据表明,1.2万年前的某个时候,中东的游牧狩猎采集者完成了人类历史上最重要的转变之一——不再游荡,开始定居务农。这种转变后来也独立出现在世界其他地区,被称为新石器革命(农业及畜牧出现)。古代基因组学研究曾暗示,这些“中东农民”起源复杂,涉及不同地方的狩猎采集群体,具有不同的遗传序列。

人类中枢神经早阶三维模型面世

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518220.shtm

Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比

人类发育中肝脏的细胞图谱揭秘人类胎儿肝脏造血

  在一项新的研究中,英国研究人员在世界上首次构建出人类发育中肝脏的细胞图谱,它提供了关于胎儿中血液和免疫系统如何产生的重要见解。这种图谱描绘了在妊娠的头三个月和第二个三个月之间的发育中肝脏的细胞景观变化,包括来自肝脏的干细胞如何播种到其他组织,以支持生长所需的高氧气需求。相关研究结果近期发表在Na